212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0477 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_0477  peptidase M52, hydrogen uptake protein  100 
 
 
175 aa  341  2.9999999999999997e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0505  hydrogenase maturation protease  97.71 
 
 
175 aa  313  8e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0510  hydrogenase maturation protease  97.14 
 
 
175 aa  313  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0522  hydrogenase maturation protease  65.9 
 
 
177 aa  221  3e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4241  peptidase M52, hydrogen uptake protein  42.86 
 
 
182 aa  145  4.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3329  peptidase M52, hydrogenase maturation peptidase  41.98 
 
 
172 aa  103  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4305  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  38.65 
 
 
164 aa  101  5e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.227122  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1947  hydrogenase maturation protease  32.1 
 
 
166 aa  101  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3462  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  38.65 
 
 
164 aa  101  5e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0703  hydrogenase expression/formation protein  38.65 
 
 
164 aa  100  9e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3173  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  38.65 
 
 
164 aa  100  9e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0700  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  38.65 
 
 
164 aa  100  9e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3279  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  38.65 
 
 
164 aa  100  9e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3328  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  38.12 
 
 
164 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.581349  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3494  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  38.12 
 
 
164 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.627392  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3399  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  38.12 
 
 
164 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3393  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  38.12 
 
 
164 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.441153 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3319  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  38.12 
 
 
164 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00237916  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02869  predicted maturation element for hydrogenase 2  38.04 
 
 
164 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3420  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  38.04 
 
 
164 aa  99.4  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02818  hypothetical protein  38.04 
 
 
164 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0786  hydrogenase maturation protease  34.38 
 
 
160 aa  97.8  7e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.177407  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0542  hydrogenase expression/formation protein  38.55 
 
 
169 aa  95.1  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.995345  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3970  HybD peptidase  34.78 
 
 
159 aa  92.8  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3372  hypothetical protein  34.76 
 
 
206 aa  91.7  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.288217  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1127  hydrogenase maturation protease  30.07 
 
 
159 aa  89  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3135  hydrogenase maturation protease  30.07 
 
 
159 aa  89.4  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1414  hydrogenase expression/formation protein  38.31 
 
 
166 aa  88.6  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0834  hydrogenase maturation protease  34.97 
 
 
177 aa  88.2  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.850937  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1090  hydrogenase 1 maturation protease  34.38 
 
 
195 aa  87.8  7e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0557672  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0499  HyaD peptidase  33.33 
 
 
206 aa  87.4  8e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2131  hydrogenase maturation protease  39.29 
 
 
181 aa  86.7  1e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.829671 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1293  HyaD peptidase  33.73 
 
 
221 aa  87  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000175592  normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0148  hydrogenase maturation protease  31.58 
 
 
161 aa  86.3  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1233  hydrogenase maturation protease  33.78 
 
 
172 aa  84.7  6e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.120838  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2150  hydrogenase expression/formation protein  33.33 
 
 
206 aa  84.7  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.133093  normal  0.20367 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2740  hydrogenase maturation protease  33.77 
 
 
164 aa  84.3  8e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000112894  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2340  hydrogenase 1 maturation protease  33.75 
 
 
195 aa  82.8  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.732485  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2026  HyaD peptidase  35.33 
 
 
208 aa  83.2  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.462165  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2822  Ni-Fe hydrogenase maturation factor-like protein  32.1 
 
 
224 aa  83.2  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0380  hydrogenase maturation protease  35.03 
 
 
176 aa  81.6  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1345  hydrogenase 1 maturation protease  35 
 
 
198 aa  80.9  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0051  hydrogenase maturation protease  30.25 
 
 
166 aa  80.1  0.00000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0212564  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1529  hydrogenase 1 maturation protease  35 
 
 
198 aa  80.1  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.468604  normal  0.329104 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1876  hydrogenase maturation protease  33.33 
 
 
165 aa  79.7  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252899  normal  0.719205 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1987  hydrogenase 1 maturation protease  35 
 
 
198 aa  79  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3101  hydrogenase expression/formation protein  36 
 
 
222 aa  79  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1931  hydrogenase 1 maturation protease  35 
 
 
198 aa  78.2  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3281  hydrogenase maturation protease  36.36 
 
 
158 aa  78.2  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2879  hydrogenase maturation protease  36.36 
 
 
158 aa  78.2  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.980378 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1927  hydrogenase 1 maturation protease  35 
 
 
198 aa  78.2  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.822664  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1211  hydrogenase 1 maturation protease  34.38 
 
 
195 aa  77.8  0.00000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4092  peptidase M52, hydrogen uptake protein  30.57 
 
 
174 aa  77.8  0.00000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0783921  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00344  hydrogenase 2 maturation protease  30.77 
 
 
184 aa  77.8  0.00000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00978  HyaD  34.81 
 
 
195 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.106803  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2669  hydrogenase expression/formation protein  34.81 
 
 
195 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.112067  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3986  HyaD peptidase  33.54 
 
 
204 aa  76.6  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3406  hydrogenase maturation protease  40.27 
 
 
191 aa  77  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2621  hydrogenase 1 maturation protease  34.81 
 
 
195 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00823631 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00985  hypothetical protein  34.81 
 
 
195 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112928  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1971  hydrogenase expression/formation protein  32.1 
 
 
223 aa  76.6  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.814536  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1999  hydrogenase maturation  31.55 
 
 
195 aa  77  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.116789  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7262  hydrogenase expression/formation protein  34.18 
 
 
214 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.356245 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2530  hydrogenase expression/formation protein  33.77 
 
 
169 aa  77  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.780336  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1083  hydrogenase 1 maturation protease  34.81 
 
 
195 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1164  HyaD peptidase  35.26 
 
 
198 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2176  hydrogenase expression/formation protein  35.8 
 
 
208 aa  75.5  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0123485  normal  0.201269 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2142  hydrogenase 1 maturation protease  34.18 
 
 
195 aa  75.1  0.0000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.152456  normal  0.47053 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0267  hydrogenase expression/formation protein  29.94 
 
 
165 aa  74.3  0.0000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.312911  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1139  hydrogenase maturation protease  36.91 
 
 
157 aa  73.9  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50560  hydrogenase expression/formation protein, HoxM  31.9 
 
 
207 aa  74.3  0.0000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00480221  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0120  hydrogenase maturation protease  36.62 
 
 
144 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2012  hydrogenase maturation protease  38.46 
 
 
160 aa  73.2  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2733  hydrogenase maturation protease  32.7 
 
 
165 aa  72.8  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0162  hydrogenase expression/formation protein  32.9 
 
 
201 aa  71.6  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.793155  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0272  hydrogenase maturation protease  32.68 
 
 
159 aa  71.2  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.268401 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1153  hydrogenase expression/formation protein  32.45 
 
 
218 aa  71.2  0.000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.838065  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2036  peptidase M52, hydrogen uptake protein  24.86 
 
 
190 aa  70.9  0.000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2053  hydrogenase maturation protease  31.58 
 
 
152 aa  70.9  0.000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52965  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3145  hydrogenase expression/formation protein  32.08 
 
 
159 aa  71.2  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00208925  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2322  hydrogenase expression/formation protein  32.47 
 
 
166 aa  70.1  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.659738  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3769  hydrogenase expression/formation protein  32.12 
 
 
209 aa  70.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.645157  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0975  hydrogenase maturation protease  33.33 
 
 
167 aa  69.7  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0660111  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0259  hydrogenase maturation protease  31.97 
 
 
160 aa  69.3  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1157  hydrogenase expression/formation protein  27.61 
 
 
195 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.486513  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1590  hydrogenase maturation protease  31.76 
 
 
160 aa  68.6  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1650  hydrogenase maturation protease  41.18 
 
 
161 aa  68.6  0.00000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0857  hydrogenase maturation protease  30.92 
 
 
157 aa  68.2  0.00000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.685665  normal  0.316463 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1247  hydrogenase maturation protease  29.41 
 
 
156 aa  67.8  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.188771 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3804  hydrogenase maturation protease  29.68 
 
 
157 aa  67.4  0.00000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1857  hydrogenase maturation protease  36.76 
 
 
171 aa  66.6  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_119  Ni/Fe hydrogenase maturation protease  30.61 
 
 
160 aa  67.4  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0109  hydrogenase maturation protease  30.61 
 
 
160 aa  66.2  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3225  hydrogenase maturation protease  30.43 
 
 
271 aa  65.9  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.679402  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08520  hydrogenase maturation protease  35.9 
 
 
175 aa  65.9  0.0000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0335  hydrogenase expression/formation protein  35.19 
 
 
191 aa  65.9  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00352637  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0858  hydrogenase maturation protease  31.25 
 
 
157 aa  65.9  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2139  hydrogenase expression/formation protein  31.58 
 
 
165 aa  65.5  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1859  hydrogenase maturation protease  31.03 
 
 
194 aa  63.9  0.0000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0472  hydrogenase maturation protease  33.57 
 
 
173 aa  63.5  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.196333 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>