205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1650 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1650  hydrogenase maturation protease  100 
 
 		 161 aa  309  1e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2012  hydrogenase maturation protease  52.83 
 
 		 160 aa  146  9e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3393  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  34.87 
 
 		 164 aa  88.2  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.441153 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3319  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  34.87 
 
 		 164 aa  88.2  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00237916  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3328  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  34.87 
 
 		 164 aa  88.2  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.581349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3494  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  34.87 
 
 		 164 aa  88.2  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.627392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3399  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  34.87 
 
 		 164 aa  88.2  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1014  hydrogenase maturation protease  33.96 
 
 		 158 aa  85.1  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00768049  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02869  predicted maturation element for hydrogenase 2  34.21 
 
 		 164 aa  84.7  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3420  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  34.21 
 
 		 164 aa  84.7  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02818  hypothetical protein  34.21 
 
 		 164 aa  84.7  4e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4305  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  34.21 
 
 		 164 aa  84.7  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.227122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_119  Ni/Fe hydrogenase maturation protease  30.46 
 
 		 160 aa  84.7  5e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3462  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  34.21 
 
 		 164 aa  84.7  5e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0703  hydrogenase expression/formation protein  34.21 
 
 		 164 aa  84.3  6e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0109  hydrogenase maturation protease  31.13 
 
 		 160 aa  84.3  6e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3279  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  34.21 
 
 		 164 aa  84.3  6e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0700  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  34.21 
 
 		 164 aa  84.3  6e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3173  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  34.21 
 
 		 164 aa  84.3  6e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1247  hydrogenase maturation protease  31.58 
 
 		 156 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.188771 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0259  hydrogenase maturation protease  30.46 
 
 		 160 aa  82.8  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0272  hydrogenase maturation protease  32.03 
 
 		 159 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.268401 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0477  peptidase M52, hydrogen uptake protein  41.06 
 
 		 175 aa  78.6  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1590  hydrogenase maturation protease  31.01 
 
 		 160 aa  77.4  0.00000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1233  hydrogenase maturation protease  29.68 
 
 		 172 aa  76.6  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.120838  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0857  hydrogenase maturation protease  29.94 
 
 		 157 aa  77  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.685665  normal  0.316463 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1859  hydrogenase maturation protease  31.45 
 
 		 194 aa  77  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2136  peptidase M52, hydrogen uptake protein  29.03 
 
 		 156 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0858  hydrogenase maturation protease  33.33 
 
 		 157 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0975  hydrogenase maturation protease  30 
 
 		 167 aa  75.1  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0660111  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0542  hydrogenase expression/formation protein  33.99 
 
 		 169 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.995345  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2053  hydrogenase maturation protease  36.91 
 
 		 152 aa  74.3  0.0000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52965  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0380  hydrogenase maturation protease  38.4 
 
 		 176 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3329  peptidase M52, hydrogenase maturation peptidase  36.36 
 
 		 172 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1293  HyaD peptidase  31.61 
 
 		 221 aa  72.4  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000175592  normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0522  hydrogenase maturation protease  38.85 
 
 		 177 aa  72.4  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3323  peptidase M52, hydrogen uptake protein  30.87 
 
 		 154 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0267  hydrogenase expression/formation protein  30.97 
 
 		 165 aa  71.2  0.000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.312911  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2422  hydrogenase maturation protease  30.52 
 
 		 155 aa  70.9  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.873028  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2740  hydrogenase maturation protease  29.3 
 
 		 164 aa  69.3  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000112894  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3769  hydrogenase expression/formation protein  33.33 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.645157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0269  hydrogenase expression/formation protein  30.97 
 
 		 168 aa  68.9  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0820491 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2951  hydrogenase expression/formation protein  29.3 
 
 		 170 aa  68.6  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.585714 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0510  hydrogenase maturation protease  42.02 
 
 		 175 aa  68.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0505  hydrogenase maturation protease  42.02 
 
 		 175 aa  68.6  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1280  hydrogenase maturation protease  32.48 
 
 		 166 aa  68.2  0.00000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.172644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3145  hydrogenase expression/formation protein  31.37 
 
 		 159 aa  68.2  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00208925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1449  peptidase M52, hydrogen uptake protein  29.68 
 
 		 158 aa  68.2  0.00000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.230112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2879  hydrogenase maturation protease  32.47 
 
 		 158 aa  68.2  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.980378 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3281  hydrogenase maturation protease  32.47 
 
 		 158 aa  68.2  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3909  hydrogenase maturation protease  27.7 
 
 		 168 aa  67.8  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3406  hydrogenase maturation protease  35.29 
 
 		 191 aa  67  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3372  hypothetical protein  31.61 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.288217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2322  hydrogenase expression/formation protein  31.82 
 
 		 166 aa  67  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.659738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2131  hydrogenase maturation protease  31.21 
 
 		 181 aa  66.6  0.0000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.829671 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1139  hydrogenase maturation protease  34.16 
 
 		 157 aa  66.2  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1844  hydrogenase expression/formation protein  39.1 
 
 		 161 aa  65.5  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3225  hydrogenase maturation protease  34.72 
 
 		 271 aa  65.5  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.679402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1999  hydrogenase maturation  32.56 
 
 		 195 aa  65.5  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.116789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1876  hydrogenase maturation protease  31.37 
 
 		 165 aa  65.5  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252899  normal  0.719205 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7262  hydrogenase expression/formation protein  32.26 
 
 		 214 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.356245 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2139  hydrogenase expression/formation protein  28.75 
 
 		 165 aa  65.1  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0777  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  29.11 
 
 		 158 aa  65.1  0.0000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.470969  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2733  hydrogenase maturation protease  32.03 
 
 		 165 aa  64.7  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1857  hydrogenase maturation protease  40.8 
 
 		 171 aa  64.3  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2530  hydrogenase expression/formation protein  32.03 
 
 		 169 aa  64.3  0.0000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.780336  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0765  hydrogenase expression/formation protein  29.75 
 
 		 161 aa  63.9  0.0000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3970  HybD peptidase  32.26 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0786  hydrogenase maturation protease  27.45 
 
 		 160 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.177407  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1556  hydrogenase maturation protease  33.88 
 
 		 176 aa  62.8  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50560  hydrogenase expression/formation protein, HoxM  31.58 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00480221  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3367  hydrogenase maturation protease  31.88 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.239776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1020  hydrogenase maturation protease  38.36 
 
 		 180 aa  62.8  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00482421 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0333  hydrogenase maturation protease  24.84 
 
 		 161 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.835463 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0326  hydrogenase maturation protease  24.84 
 
 		 161 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0472  hydrogenase maturation protease  37.27 
 
 		 173 aa  62  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.196333 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0499  HyaD peptidase  30.32 
 
 		 206 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08520  hydrogenase maturation protease  28.29 
 
 		 175 aa  62  0.000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1414  hydrogenase expression/formation protein  31.47 
 
 		 166 aa  62  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0120  hydrogenase maturation protease  34.27 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3804  hydrogenase maturation protease  36.79 
 
 		 157 aa  61.6  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2150  hydrogenase expression/formation protein  31.21 
 
 		 206 aa  60.8  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.133093  normal  0.20367 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2176  hydrogenase expression/formation protein  34.46 
 
 		 208 aa  60.8  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0123485  normal  0.201269 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0853  hydrogenase maturation protease  30.67 
 
 		 157 aa  60.8  0.000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0705  hydrogenase maturation protease  30.67 
 
 		 157 aa  60.8  0.000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.862619  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2502  HybD peptidase  31.61 
 
 		 183 aa  60.5  0.000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0644035 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1968  hydrogenase maturation protease  31.17 
 
 		 155 aa  60.1  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2106  hydrogenase maturation protease  25.64 
 
 		 184 aa  60.1  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3986  HyaD peptidase  33.74 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4241  peptidase M52, hydrogen uptake protein  31.01 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1157  hydrogenase expression/formation protein  29.46 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.486513  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2367  hydrogenase maturation protease  34.4 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0307441 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2257  hydrogenase maturation protease  29.75 
 
 		 178 aa  59.3  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1090  hydrogenase 1 maturation protease  25.79 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0557672  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3947  peptidase M52, hydrogen uptake protein  30.5 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.974859  normal  0.0407707 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3881  hydrogenase maturation protease  33.11 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3681  hydrogenase maturation protease  31.06 
 
 		 163 aa  58.2  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.157783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1211  hydrogenase 1 maturation protease  26.71 
 
 		 195 aa  57.8  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2822  Ni-Fe hydrogenase maturation factor-like protein  27.27 
 
 		 224 aa  57.8  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1165  hydrogenase expression/formation protein  27.56 
 
 		 203 aa  57.4  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.464172  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>