180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4241 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_4241  peptidase M52, hydrogen uptake protein  100 
 
 		 182 aa  366  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0477  peptidase M52, hydrogen uptake protein  42.86 
 
 		 175 aa  145  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0510  hydrogenase maturation protease  44 
 
 		 175 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0505  hydrogenase maturation protease  43.43 
 
 		 175 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0522  hydrogenase maturation protease  41.21 
 
 		 177 aa  134  5e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1947  hydrogenase maturation protease  34.64 
 
 		 166 aa  92.8  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1127  hydrogenase maturation protease  32.28 
 
 		 159 aa  89  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3135  hydrogenase maturation protease  32.28 
 
 		 159 aa  89  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2530  hydrogenase expression/formation protein  31.37 
 
 		 169 aa  84.7  6e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.780336  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0051  hydrogenase maturation protease  30.06 
 
 		 166 aa  83.2  0.000000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0212564  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0380  hydrogenase maturation protease  29.34 
 
 		 176 aa  82.4  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3328  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  28.57 
 
 		 164 aa  78.2  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.581349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3319  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  28.57 
 
 		 164 aa  78.2  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00237916  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3393  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  28.57 
 
 		 164 aa  78.2  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.441153 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3494  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  28.57 
 
 		 164 aa  78.2  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.627392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3399  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  28.57 
 
 		 164 aa  78.2  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4305  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  28.57 
 
 		 164 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.227122  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50560  hydrogenase expression/formation protein, HoxM  31.17 
 
 		 207 aa  77.4  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00480221  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3462  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  28.57 
 
 		 164 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02869  predicted maturation element for hydrogenase 2  28.57 
 
 		 164 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0703  hydrogenase expression/formation protein  27.92 
 
 		 164 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3420  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  28.57 
 
 		 164 aa  77  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02818  hypothetical protein  28.57 
 
 		 164 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1414  hydrogenase expression/formation protein  28.76 
 
 		 166 aa  76.3  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2951  hydrogenase expression/formation protein  29.7 
 
 		 170 aa  76.6  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.585714 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3173  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  27.92 
 
 		 164 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0700  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  27.92 
 
 		 164 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3279  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  27.92 
 
 		 164 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0259  hydrogenase maturation protease  31.82 
 
 		 160 aa  75.9  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0786  hydrogenase maturation protease  28.67 
 
 		 160 aa  75.5  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.177407  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0834  hydrogenase maturation protease  28.12 
 
 		 177 aa  74.3  0.0000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.850937  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0109  hydrogenase maturation protease  29.33 
 
 		 160 aa  73.9  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0148  hydrogenase maturation protease  30.92 
 
 		 161 aa  72.4  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1293  HyaD peptidase  28.1 
 
 		 221 aa  72.8  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000175592  normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0542  hydrogenase expression/formation protein  28.95 
 
 		 169 aa  72.8  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.995345  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_119  Ni/Fe hydrogenase maturation protease  29.87 
 
 		 160 aa  71.2  0.000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3970  HybD peptidase  28.1 
 
 		 159 aa  70.1  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3329  peptidase M52, hydrogenase maturation peptidase  28.1 
 
 		 172 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0362  hydrogenase maturation protease  29.41 
 
 		 176 aa  69.3  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120918 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0267  hydrogenase expression/formation protein  27.27 
 
 		 165 aa  68.9  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.312911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3406  hydrogenase maturation protease  36.67 
 
 		 191 aa  69.3  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1090  hydrogenase 1 maturation protease  25.16 
 
 		 195 aa  68.6  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0557672  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2740  hydrogenase maturation protease  26.54 
 
 		 164 aa  67.8  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000112894  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2733  hydrogenase maturation protease  29.87 
 
 		 165 aa  67.8  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1211  hydrogenase 1 maturation protease  25.34 
 
 		 195 aa  67.4  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3101  hydrogenase expression/formation protein  32.2 
 
 		 222 aa  67.4  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00978  HyaD  25.34 
 
 		 195 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.106803  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2669  hydrogenase expression/formation protein  25.34 
 
 		 195 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.112067  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2340  hydrogenase 1 maturation protease  24.68 
 
 		 195 aa  66.6  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.732485  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00985  hypothetical protein  25.34 
 
 		 195 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112928  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1083  hydrogenase 1 maturation protease  25.34 
 
 		 195 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2621  hydrogenase 1 maturation protease  25.34 
 
 		 195 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00823631 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3372  hypothetical protein  27.92 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.288217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00344  hydrogenase 2 maturation protease  29.79 
 
 		 184 aa  65.1  0.0000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0499  HyaD peptidase  27.92 
 
 		 206 aa  64.3  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0162  hydrogenase expression/formation protein  27.95 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.793155  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1529  hydrogenase 1 maturation protease  25.9 
 
 		 198 aa  64.3  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.468604  normal  0.329104 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1139  hydrogenase maturation protease  31.87 
 
 		 157 aa  63.5  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3804  hydrogenase maturation protease  29.68 
 
 		 157 aa  63.5  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2142  hydrogenase 1 maturation protease  24.66 
 
 		 195 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.152456  normal  0.47053 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1927  hydrogenase 1 maturation protease  25.9 
 
 		 198 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.822664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0765  hydrogenase expression/formation protein  27.22 
 
 		 161 aa  62.8  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2822  Ni-Fe hydrogenase maturation factor-like protein  26.8 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2150  hydrogenase expression/formation protein  27.92 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.133093  normal  0.20367 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1931  hydrogenase 1 maturation protease  25.9 
 
 		 198 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2322  hydrogenase expression/formation protein  27.78 
 
 		 166 aa  63.2  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.659738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1905  hydrogenase expression/formation protein  27.54 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0136333 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2012  hydrogenase maturation protease  33.55 
 
 		 160 aa  62.4  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2026  HyaD peptidase  25.6 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.462165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7262  hydrogenase expression/formation protein  25.16 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.356245 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3225  hydrogenase maturation protease  31.21 
 
 		 271 aa  62.4  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.679402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1987  hydrogenase 1 maturation protease  26.03 
 
 		 198 aa  62  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0937  hydrogenase maturation protease HydD  29.01 
 
 		 179 aa  62.4  0.000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.353395  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1707  hydrogenase expression/formation protein  24.81 
 
 		 202 aa  62  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.460815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1345  hydrogenase 1 maturation protease  25.18 
 
 		 198 aa  62  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1635  hydrogenase expression/formation protein  24.81 
 
 		 202 aa  62  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1648  hydrogenase expression/formation protein  24.81 
 
 		 202 aa  62  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1157  hydrogenase expression/formation protein  27.66 
 
 		 195 aa  61.6  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.486513  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1971  hydrogenase expression/formation protein  27.54 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.814536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2175  hydrogenase maturation protease  30.89 
 
 		 186 aa  61.6  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1640  hydrogenase expression/formation protein  24.81 
 
 		 202 aa  62  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1800  hydrogenase expression/formation protein  24.81 
 
 		 202 aa  62  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2053  hydrogenase maturation protease  25.33 
 
 		 152 aa  60.8  0.000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52965  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1999  hydrogenase maturation  27.73 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.116789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3145  hydrogenase expression/formation protein  25.16 
 
 		 159 aa  60.5  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00208925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3819  hydrogenase maturation protease  32.43 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.704224  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0715  Ni/Fe hydrogenase, expression/formation protein  27.98 
 
 		 177 aa  60.1  0.00000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.930335  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2131  hydrogenase maturation protease  28.78 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.829671 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3769  hydrogenase expression/formation protein  28.69 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.645157  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1857  hydrogenase maturation protease  33.83 
 
 		 171 aa  59.3  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1590  hydrogenase maturation protease  27.89 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1900  hydrogenase maturation protease superfamily  30.25 
 
 		 179 aa  58.5  0.00000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2139  hydrogenase expression/formation protein  28.67 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0472  hydrogenase maturation protease  30 
 
 		 173 aa  58.2  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.196333 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0120  hydrogenase maturation protease  28.87 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0857  hydrogenase maturation protease  26.9 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.685665  normal  0.316463 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0858  hydrogenase maturation protease  31.25 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2030  hydrogenase expression/formation protein  25.93 
 
 		 185 aa  57.8  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2106  hydrogenase maturation protease  26.38 
 
 		 184 aa  57.4  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2502  HybD peptidase  26.55 
 
 		 183 aa  57.4  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0644035 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>