163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1857 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1857  hydrogenase maturation protease  100 
 
 		 171 aa  321  3e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4827  hydrogenase maturation protease  50.33 
 
 		 166 aa  128  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1139  hydrogenase maturation protease  42.57 
 
 		 157 aa  107  8.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4495  peptidase M52, hydrogen uptake protein  43.61 
 
 		 177 aa  92  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3415  peptidase M52, hydrogen uptake protein  44.03 
 
 		 166 aa  90.1  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.100638  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3478  hydrogenase maturation protease  44.03 
 
 		 166 aa  90.1  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.314685  normal  0.0224154 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2659  hydrogenase maturation protease  33.57 
 
 		 148 aa  88.6  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.196186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3426  hydrogenase maturation protease  42.97 
 
 		 166 aa  86.3  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.141018 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0508  hydrogenase maturation protease  37.09 
 
 		 180 aa  84.3  7e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3432  hydrogenase maturation protease  38.06 
 
 		 191 aa  79.3  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2591  hydrogenase maturation protease  47.73 
 
 		 149 aa  78.6  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.584226  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1020  hydrogenase maturation protease  36.67 
 
 		 180 aa  77.4  0.00000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00482421 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4092  peptidase M52, hydrogen uptake protein  35.61 
 
 		 174 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0783921  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2012  hydrogenase maturation protease  38.12 
 
 		 160 aa  75.1  0.0000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3804  hydrogenase maturation protease  38.16 
 
 		 157 aa  74.7  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04410  soluble hydrogenase processing peptidase, HoxW  40.13 
 
 		 160 aa  72  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0477  peptidase M52, hydrogen uptake protein  37.86 
 
 		 175 aa  71.6  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2386  hypothetical protein  31.13 
 
 		 159 aa  71.2  0.000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2531  hypothetical protein  30.46 
 
 		 159 aa  70.1  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00344  hydrogenase 2 maturation protease  31.94 
 
 		 184 aa  70.1  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0542  hydrogenase expression/formation protein  30.81 
 
 		 169 aa  68.6  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.995345  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0380  hydrogenase maturation protease  31.91 
 
 		 176 aa  68.6  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0857  hydrogenase maturation protease  29.3 
 
 		 157 aa  68.2  0.00000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.685665  normal  0.316463 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4241  peptidase M52, hydrogen uptake protein  33.11 
 
 		 182 aa  67.8  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0259  hydrogenase maturation protease  28.76 
 
 		 160 aa  67.8  0.00000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1414  hydrogenase expression/formation protein  36.3 
 
 		 166 aa  67.4  0.00000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3329  peptidase M52, hydrogenase maturation peptidase  35.04 
 
 		 172 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0333  hydrogenase maturation protease  26.35 
 
 		 161 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.835463 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0326  hydrogenase maturation protease  26.35 
 
 		 161 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3323  peptidase M52, hydrogen uptake protein  37.01 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3367  hydrogenase maturation protease  27.03 
 
 		 157 aa  65.1  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.239776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_119  Ni/Fe hydrogenase maturation protease  28.1 
 
 		 160 aa  65.5  0.0000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1859  hydrogenase maturation protease  29.66 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2131  hydrogenase maturation protease  33.11 
 
 		 181 aa  65.1  0.0000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.829671 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1650  hydrogenase maturation protease  40.8 
 
 		 161 aa  63.9  0.0000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1590  hydrogenase maturation protease  30.28 
 
 		 160 aa  63.9  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0472  hydrogenase maturation protease  35.33 
 
 		 173 aa  63.5  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.196333 
 
 
-
 
NC_002936  DET0109  hydrogenase maturation protease  27.89 
 
 		 160 aa  62.8  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3225  hydrogenase maturation protease  34.87 
 
 		 271 aa  62.8  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.679402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2053  hydrogenase maturation protease  31.16 
 
 		 152 aa  63.2  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52965  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3969  hydrogenase maturation protease  36.49 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000953733 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1556  hydrogenase maturation protease  35.71 
 
 		 176 aa  62.4  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0505  hydrogenase maturation protease  37.04 
 
 		 175 aa  62  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0510  hydrogenase maturation protease  37.04 
 
 		 175 aa  62  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3881  hydrogenase maturation protease  35.14 
 
 		 156 aa  61.2  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2879  hydrogenase maturation protease  37.96 
 
 		 158 aa  60.1  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.980378 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3281  hydrogenase maturation protease  37.96 
 
 		 158 aa  60.1  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0834  hydrogenase maturation protease  34.33 
 
 		 177 aa  60.1  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.850937  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2422  hydrogenase maturation protease  36.13 
 
 		 155 aa  60.1  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.873028  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2951  hydrogenase expression/formation protein  31.16 
 
 		 170 aa  60.1  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.585714 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03840  hydrogenase maturation protease  23.53 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1819  hydrogenase maturation protease  29.93 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0362  hydrogenase maturation protease  32.14 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120918 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0499  HyaD peptidase  30.46 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2740  hydrogenase maturation protease  24.83 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000112894  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3101  hydrogenase expression/formation protein  30.19 
 
 		 222 aa  57.4  0.00000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1293  HyaD peptidase  30.14 
 
 		 221 aa  57.4  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000175592  normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0120  hydrogenase maturation protease  34.07 
 
 		 144 aa  57.4  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50560  hydrogenase expression/formation protein, HoxM  32.45 
 
 		 207 aa  57  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00480221  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0975  hydrogenase maturation protease  28.89 
 
 		 167 aa  57  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0660111  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2150  hydrogenase expression/formation protein  31.08 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.133093  normal  0.20367 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1054  hydrogenase maturation protease  33.74 
 
 		 172 aa  57  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.402831 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0936  hydrogenase maturation protease  33.74 
 
 		 172 aa  57  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2103  hydrogenase maturation protease  31.65 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0938724  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0858  hydrogenase maturation protease  28.87 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0694  hydrogenase maturation protease  28.47 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0173  hydrogenase maturation protease  30.13 
 
 		 170 aa  55.1  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2530  hydrogenase expression/formation protein  32.62 
 
 		 169 aa  55.5  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.780336  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1075  peptidase M52, hydrogen uptake protein  38.56 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0439307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0765  hydrogenase expression/formation protein  29.1 
 
 		 161 aa  55.1  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1318  hydrogenase maturation protease  28.47 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3970  HybD peptidase  27.15 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1449  peptidase M52, hydrogen uptake protein  25.66 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.230112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0522  hydrogenase maturation protease  31.58 
 
 		 177 aa  54.7  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3947  peptidase M52, hydrogen uptake protein  29.93 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.974859  normal  0.0407707 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3372  hypothetical protein  31.48 
 
 		 206 aa  54.3  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.288217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0269  hydrogenase expression/formation protein  28.36 
 
 		 168 aa  53.9  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0820491 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0051  hydrogenase maturation protease  24.84 
 
 		 166 aa  53.9  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0212564  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1271  peptidase M52, hydrogen uptake protein  31.72 
 
 		 167 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.813931  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0272  hydrogenase maturation protease  28.39 
 
 		 159 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.268401 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1971  hydrogenase expression/formation protein  27.33 
 
 		 223 aa  52.8  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.814536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1233  hydrogenase maturation protease  26.24 
 
 		 172 aa  52.8  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.120838  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1247  hydrogenase maturation protease  28.1 
 
 		 156 aa  52.4  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.188771 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2257  hydrogenase maturation protease  34.87 
 
 		 178 aa  52.4  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3462  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  33.09 
 
 		 164 aa  52.4  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4305  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  33.09 
 
 		 164 aa  52.4  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.227122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2367  hydrogenase maturation protease  34.16 
 
 		 257 aa  52  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0307441 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2136  peptidase M52, hydrogen uptake protein  28.93 
 
 		 156 aa  51.6  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1014  hydrogenase maturation protease  31.88 
 
 		 158 aa  51.6  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00768049  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0703  hydrogenase expression/formation protein  33.09 
 
 		 164 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3319  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  33.09 
 
 		 164 aa  51.2  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00237916  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08060  hydrogenase maturation protease  29.38 
 
 		 176 aa  51.6  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1947  hydrogenase maturation protease  26.32 
 
 		 166 aa  51.2  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3173  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  33.09 
 
 		 164 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0700  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  33.09 
 
 		 164 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3279  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  33.09 
 
 		 164 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3399  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  33.09 
 
 		 164 aa  51.2  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3328  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  33.09 
 
 		 164 aa  51.2  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.581349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2949  hydrogenase maturation protease  36 
 
 		 146 aa  51.2  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0109087  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7262  hydrogenase expression/formation protein  31.79 
 
 		 214 aa  51.2  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.356245 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>