44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1054 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_1054  hydrogenase maturation protease  100 
 
 		 172 aa  332  1e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.402831 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0936  hydrogenase maturation protease  100 
 
 		 172 aa  332  1e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2531  hypothetical protein  36.49 
 
 		 159 aa  95.1  4e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2386  hypothetical protein  35.29 
 
 		 159 aa  93.2  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1139  hydrogenase maturation protease  33.76 
 
 		 157 aa  68.2  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3432  hydrogenase maturation protease  33.33 
 
 		 191 aa  66.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1844  hydrogenase expression/formation protein  36.51 
 
 		 161 aa  64.7  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2131  hydrogenase maturation protease  36.55 
 
 		 181 aa  63.2  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.829671 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04410  soluble hydrogenase processing peptidase, HoxW  38.61 
 
 		 160 aa  61.2  0.000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2012  hydrogenase maturation protease  39.17 
 
 		 160 aa  57  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2659  hydrogenase maturation protease  37.5 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.196186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3478  hydrogenase maturation protease  29.53 
 
 		 166 aa  54.7  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.314685  normal  0.0224154 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3415  peptidase M52, hydrogen uptake protein  29.53 
 
 		 166 aa  54.7  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.100638  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1857  hydrogenase maturation protease  38.71 
 
 		 171 aa  54.7  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4827  hydrogenase maturation protease  37.12 
 
 		 166 aa  50.8  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385637  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3969  hydrogenase maturation protease  39.47 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000953733 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3426  hydrogenase maturation protease  30.65 
 
 		 166 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.141018 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1556  hydrogenase maturation protease  33.33 
 
 		 176 aa  50.4  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1075  peptidase M52, hydrogen uptake protein  36.36 
 
 		 188 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0439307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2322  hydrogenase expression/formation protein  29.41 
 
 		 166 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.659738  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2422  hydrogenase maturation protease  37.72 
 
 		 155 aa  45.8  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.873028  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3881  hydrogenase maturation protease  36.84 
 
 		 156 aa  45.8  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0508  hydrogenase maturation protease  30.66 
 
 		 180 aa  45.8  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03840  hydrogenase maturation protease  28.7 
 
 		 137 aa  45.1  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3367  hydrogenase maturation protease  32.03 
 
 		 157 aa  44.7  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.239776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2822  Ni-Fe hydrogenase maturation factor-like protein  30.56 
 
 		 224 aa  44.3  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3323  peptidase M52, hydrogen uptake protein  35.9 
 
 		 154 aa  44.3  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4495  peptidase M52, hydrogen uptake protein  32.77 
 
 		 177 aa  44.3  0.0009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0326  hydrogenase maturation protease  29.84 
 
 		 161 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0333  hydrogenase maturation protease  29.84 
 
 		 161 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.835463 
 
 
-
 
NC_002936  DET0109  hydrogenase maturation protease  28.24 
 
 		 160 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3909  hydrogenase maturation protease  26.15 
 
 		 168 aa  42.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_119  Ni/Fe hydrogenase maturation protease  27.48 
 
 		 160 aa  43.1  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0380  hydrogenase maturation protease  29.41 
 
 		 176 aa  43.5  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3804  hydrogenase maturation protease  36.09 
 
 		 157 aa  42.7  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2890  peptidase M52, hydrogen uptake protein  32.21 
 
 		 1053 aa  42.4  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1971  hydrogenase expression/formation protein  30.82 
 
 		 223 aa  42  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.814536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2591  hydrogenase maturation protease  39.1 
 
 		 149 aa  42.4  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.584226  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0259  hydrogenase maturation protease  27.48 
 
 		 160 aa  42  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3145  hydrogenase expression/formation protein  31.62 
 
 		 159 aa  41.6  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00208925  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3225  hydrogenase maturation protease  31.21 
 
 		 271 aa  41.6  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.679402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2257  hydrogenase maturation protease  33.06 
 
 		 178 aa  41.6  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1650  hydrogenase maturation protease  33.08 
 
 		 161 aa  41.6  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0522  hydrogenase maturation protease  32.48 
 
 		 177 aa  40.8  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>