164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2257 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2257  hydrogenase maturation protease  100 
 
 		 178 aa  360  8e-99  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3881  hydrogenase maturation protease  36.94 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3969  hydrogenase maturation protease  38.22 
 
 		 156 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000953733 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3760  hydrogenase maturation protease  32.67 
 
 		 158 aa  65.5  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1293  HyaD peptidase  30.3 
 
 		 221 aa  65.1  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000175592  normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1556  hydrogenase maturation protease  36.15 
 
 		 176 aa  65.5  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2422  hydrogenase maturation protease  33.6 
 
 		 155 aa  65.1  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.873028  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3323  peptidase M52, hydrogen uptake protein  31.25 
 
 		 154 aa  64.3  0.0000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2890  peptidase M52, hydrogen uptake protein  30.82 
 
 		 1053 aa  62.8  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1153  hydrogenase expression/formation protein  32.21 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.838065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0853  hydrogenase maturation protease  35.82 
 
 		 157 aa  61.6  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2822  Ni-Fe hydrogenase maturation factor-like protein  30.36 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0705  hydrogenase maturation protease  35.82 
 
 		 157 aa  61.6  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.862619  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2740  hydrogenase maturation protease  26.83 
 
 		 164 aa  61.6  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000112894  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0162  hydrogenase expression/formation protein  32.1 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.793155  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3281  hydrogenase maturation protease  33.97 
 
 		 158 aa  60.5  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2879  hydrogenase maturation protease  33.97 
 
 		 158 aa  60.5  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.980378 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1014  hydrogenase maturation protease  30.72 
 
 		 158 aa  60.5  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00768049  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50560  hydrogenase expression/formation protein, HoxM  31.78 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00480221  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2951  hydrogenase expression/formation protein  31.85 
 
 		 170 aa  58.5  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.585714 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1233  hydrogenase maturation protease  27.91 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.120838  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0542  hydrogenase expression/formation protein  32.9 
 
 		 169 aa  57.8  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.995345  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7262  hydrogenase expression/formation protein  31.41 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.356245 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3329  peptidase M52, hydrogenase maturation peptidase  32.26 
 
 		 172 aa  56.6  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0380  hydrogenase maturation protease  32.53 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2012  hydrogenase maturation protease  32.68 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2176  hydrogenase expression/formation protein  29.45 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0123485  normal  0.201269 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2136  peptidase M52, hydrogen uptake protein  39.13 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1165  hydrogenase expression/formation protein  30.47 
 
 		 203 aa  54.7  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.464172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3415  peptidase M52, hydrogen uptake protein  30.46 
 
 		 166 aa  54.3  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.100638  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3478  hydrogenase maturation protease  30.46 
 
 		 166 aa  54.3  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.314685  normal  0.0224154 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1971  hydrogenase expression/formation protein  26.79 
 
 		 223 aa  54.3  0.0000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.814536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2340  hydrogenase 1 maturation protease  28.4 
 
 		 195 aa  54.3  0.0000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.732485  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1247  hydrogenase maturation protease  38.04 
 
 		 156 aa  53.9  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.188771 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1640  hydrogenase expression/formation protein  30.37 
 
 		 202 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3372  hypothetical protein  30.19 
 
 		 206 aa  53.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.288217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0269  hydrogenase expression/formation protein  29.76 
 
 		 168 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0820491 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1800  hydrogenase expression/formation protein  30.37 
 
 		 202 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1648  hydrogenase expression/formation protein  30.37 
 
 		 202 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1635  hydrogenase expression/formation protein  30.37 
 
 		 202 aa  52.8  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2139  hydrogenase expression/formation protein  38.95 
 
 		 165 aa  52.8  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1090  hydrogenase 1 maturation protease  28.4 
 
 		 195 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0557672  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1707  hydrogenase expression/formation protein  30.37 
 
 		 202 aa  52.8  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.460815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1211  hydrogenase 1 maturation protease  32.8 
 
 		 195 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3432  hydrogenase maturation protease  31.33 
 
 		 191 aa  52  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3101  hydrogenase expression/formation protein  28.57 
 
 		 222 aa  52  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3426  hydrogenase maturation protease  32.52 
 
 		 166 aa  52  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.141018 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0173  hydrogenase maturation protease  32.06 
 
 		 170 aa  52  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3986  HyaD peptidase  27.17 
 
 		 204 aa  52  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3970  HybD peptidase  29.81 
 
 		 159 aa  51.6  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1345  hydrogenase 1 maturation protease  32.03 
 
 		 198 aa  51.6  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1590  hydrogenase maturation protease  30.71 
 
 		 160 aa  51.6  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1276  hydrogenase 3 maturation protease  33.33 
 
 		 159 aa  51.2  0.000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.482581  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1449  peptidase M52, hydrogen uptake protein  29.68 
 
 		 158 aa  51.2  0.000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.230112  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00978  HyaD  32 
 
 		 195 aa  50.8  0.000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.106803  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1414  hydrogenase expression/formation protein  32.79 
 
 		 166 aa  51.2  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2669  hydrogenase expression/formation protein  32 
 
 		 195 aa  50.8  0.000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.112067  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1529  hydrogenase 1 maturation protease  31.58 
 
 		 198 aa  50.8  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.468604  normal  0.329104 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1083  hydrogenase 1 maturation protease  32 
 
 		 195 aa  50.8  0.000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00985  hypothetical protein  32 
 
 		 195 aa  50.8  0.000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112928  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2621  hydrogenase 1 maturation protease  32 
 
 		 195 aa  50.8  0.000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00823631 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2220  hydrogenase maturation protease  42.31 
 
 		 170 aa  50.4  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.861671  normal  0.717829 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3145  hydrogenase expression/formation protein  28.03 
 
 		 159 aa  50.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00208925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1931  hydrogenase 1 maturation protease  35.64 
 
 		 198 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1157  hydrogenase expression/formation protein  30.83 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.486513  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1927  hydrogenase 1 maturation protease  35.64 
 
 		 198 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.822664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1987  hydrogenase 1 maturation protease  35.64 
 
 		 198 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2026  HyaD peptidase  29.55 
 
 		 208 aa  49.7  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.462165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0335  hydrogenase expression/formation protein  31.25 
 
 		 191 aa  49.7  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00352637  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1999  hydrogenase maturation  27.16 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.116789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0777  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  28.57 
 
 		 158 aa  50.1  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.470969  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0272  hydrogenase maturation protease  28.03 
 
 		 159 aa  49.7  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.268401 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3681  hydrogenase maturation protease  30.49 
 
 		 163 aa  50.1  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.157783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2131  hydrogenase maturation protease  34.38 
 
 		 181 aa  49.7  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.829671 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03840  hydrogenase maturation protease  22.86 
 
 		 137 aa  49.7  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2053  hydrogenase maturation protease  33.61 
 
 		 152 aa  49.7  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52965  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0259  hydrogenase maturation protease  27.52 
 
 		 160 aa  49.3  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0834  hydrogenase maturation protease  40.28 
 
 		 177 aa  49.3  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.850937  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0857  hydrogenase maturation protease  27.22 
 
 		 157 aa  49.3  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.685665  normal  0.316463 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3225  hydrogenase maturation protease  28.97 
 
 		 271 aa  49.3  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.679402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0975  hydrogenase maturation protease  25.48 
 
 		 167 aa  48.9  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0660111  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2142  hydrogenase 1 maturation protease  31.2 
 
 		 195 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.152456  normal  0.47053 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2530  hydrogenase expression/formation protein  34.43 
 
 		 169 aa  48.9  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.780336  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0765  hydrogenase expression/formation protein  35 
 
 		 161 aa  47.8  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2717  hydrogenase 3 maturation protease  29.61 
 
 		 165 aa  47.8  0.00009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.391136  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3769  hydrogenase expression/formation protein  30.16 
 
 		 209 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.645157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3367  hydrogenase maturation protease  25.17 
 
 		 157 aa  47.4  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.239776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2150  hydrogenase expression/formation protein  26.59 
 
 		 206 aa  47  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.133093  normal  0.20367 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1650  hydrogenase maturation protease  30.43 
 
 		 161 aa  47.4  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0499  HyaD peptidase  26.59 
 
 		 206 aa  46.6  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1857  hydrogenase maturation protease  34.13 
 
 		 171 aa  46.6  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1271  peptidase M52, hydrogen uptake protein  32.03 
 
 		 167 aa  46.6  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.813931  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0109  hydrogenase maturation protease  26.09 
 
 		 160 aa  45.8  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2606  hydrogenase maturation protease  29.73 
 
 		 150 aa  45.8  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0209681  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1844  hydrogenase expression/formation protein  32.03 
 
 		 161 aa  46.2  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0267  hydrogenase expression/formation protein  26.71 
 
 		 165 aa  45.8  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.312911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4161  peptidase M52, hydrogen uptake protein  33.83 
 
 		 156 aa  45.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0284488  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0648  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  33.33 
 
 		 166 aa  45.8  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1859  hydrogenase maturation protease  31.25 
 
 		 194 aa  46.2  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2331  peptidase M52, hydrogenase maturation peptidase  32.65 
 
 		 183 aa  45.4  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>