190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2220 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2220  hydrogenase maturation protease  100 
 
 
170 aa  340  4e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.861671  normal  0.717829 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3530  hydrogenase maturation protease  40 
 
 
164 aa  124  6e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224586  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0616  hydrogenase maturation protease  39.58 
 
 
167 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0589  hydrogenase maturation protease  39.73 
 
 
167 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00428951  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_554  hydrogenase maturation protease  39.73 
 
 
167 aa  115  3e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0777  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  32.9 
 
 
158 aa  97.1  1e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.470969  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0451  coenzyme F420-reducing hydrogenase, delta subunit  33.95 
 
 
159 aa  90.9  7e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0085  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  34.36 
 
 
181 aa  89  3e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0501687  normal  0.0549727 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2331  peptidase M52, hydrogenase maturation peptidase  33.95 
 
 
183 aa  88.2  4e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0648  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  33.33 
 
 
166 aa  87.4  9e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1044  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  29.94 
 
 
182 aa  86.7  1e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2175  hydrogenase maturation protease  35.4 
 
 
186 aa  85.5  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0014  coenzyme F420-reducing hydrogenase, delta subunit  36.24 
 
 
160 aa  83.2  0.000000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0074  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  32.32 
 
 
166 aa  82  0.000000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0648  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  32.69 
 
 
160 aa  75.9  0.0000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.194531  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1336  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  31.41 
 
 
160 aa  75.1  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.291091  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0628  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  32.03 
 
 
174 aa  74.3  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.836359 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0195  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  31.25 
 
 
174 aa  72.8  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0693  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  31.72 
 
 
171 aa  72.8  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.845339  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0478  hydrogenase maturation protease  27.78 
 
 
181 aa  72.4  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1290  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  31.25 
 
 
174 aa  72  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.673562  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0582  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  37.1 
 
 
159 aa  71.2  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.724194  normal  0.0407733 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0256  coenzyme F420-reducing hydrogenase, delta subunit  35.48 
 
 
160 aa  69.3  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3329  peptidase M52, hydrogenase maturation peptidase  35.81 
 
 
172 aa  67  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1211  hydrogenase 1 maturation protease  37.7 
 
 
195 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00978  HyaD  37.7 
 
 
195 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.106803  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2669  hydrogenase expression/formation protein  37.7 
 
 
195 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.112067  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00985  hypothetical protein  37.7 
 
 
195 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112928  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2340  hydrogenase 1 maturation protease  37.7 
 
 
195 aa  66.6  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.732485  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2621  hydrogenase 1 maturation protease  37.7 
 
 
195 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00823631 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1083  hydrogenase 1 maturation protease  37.7 
 
 
195 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1090  hydrogenase 1 maturation protease  37.7 
 
 
195 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0557672  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1153  hydrogenase expression/formation protein  35.44 
 
 
218 aa  65.1  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.838065  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1075  peptidase M52, hydrogen uptake protein  41.07 
 
 
188 aa  64.3  0.0000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0439307  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1971  hydrogenase expression/formation protein  38.1 
 
 
223 aa  64.7  0.0000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.814536  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2176  hydrogenase expression/formation protein  32.53 
 
 
208 aa  64.3  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0123485  normal  0.201269 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0542  hydrogenase expression/formation protein  33.11 
 
 
169 aa  63.9  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.995345  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2142  hydrogenase 1 maturation protease  36.89 
 
 
195 aa  63.9  0.0000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.152456  normal  0.47053 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1927  hydrogenase 1 maturation protease  34.65 
 
 
198 aa  63.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.822664  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1987  hydrogenase 1 maturation protease  34.65 
 
 
198 aa  63.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1529  hydrogenase 1 maturation protease  34.65 
 
 
198 aa  63.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.468604  normal  0.329104 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_119  Ni/Fe hydrogenase maturation protease  29.94 
 
 
160 aa  63.5  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1345  hydrogenase 1 maturation protease  34.65 
 
 
198 aa  63.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2822  Ni-Fe hydrogenase maturation factor-like protein  37.21 
 
 
224 aa  63.9  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0380  hydrogenase maturation protease  33.33 
 
 
176 aa  63.5  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1931  hydrogenase 1 maturation protease  34.65 
 
 
198 aa  63.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1999  hydrogenase maturation  35.25 
 
 
195 aa  63.2  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.116789  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3372  hypothetical protein  32.89 
 
 
206 aa  62  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.288217  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0259  hydrogenase maturation protease  29.94 
 
 
160 aa  62  0.000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1293  HyaD peptidase  35.16 
 
 
221 aa  61.6  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000175592  normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0499  HyaD peptidase  35.14 
 
 
206 aa  61.6  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50560  hydrogenase expression/formation protein, HoxM  36.08 
 
 
207 aa  60.8  0.000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00480221  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2053  hydrogenase maturation protease  38.61 
 
 
152 aa  60.5  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52965  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3101  hydrogenase expression/formation protein  37.1 
 
 
222 aa  60.1  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2150  hydrogenase expression/formation protein  35.14 
 
 
206 aa  60.5  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.133093  normal  0.20367 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2322  hydrogenase expression/formation protein  37.11 
 
 
166 aa  60.1  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.659738  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3225  hydrogenase maturation protease  40.7 
 
 
271 aa  59.7  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.679402  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7262  hydrogenase expression/formation protein  38.14 
 
 
214 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.356245 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3145  hydrogenase expression/formation protein  32.84 
 
 
159 aa  59.7  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00208925  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0109  hydrogenase maturation protease  29.3 
 
 
160 aa  59.3  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1157  hydrogenase expression/formation protein  31.33 
 
 
195 aa  59.3  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.486513  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3804  hydrogenase maturation protease  42.05 
 
 
157 aa  58.2  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0267  hydrogenase expression/formation protein  33.64 
 
 
165 aa  58.2  0.00000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.312911  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0162  hydrogenase expression/formation protein  30.25 
 
 
201 aa  57.8  0.00000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.793155  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0335  hydrogenase expression/formation protein  34.42 
 
 
191 aa  57.4  0.00000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00352637  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1635  hydrogenase expression/formation protein  32.68 
 
 
202 aa  57  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2139  hydrogenase expression/formation protein  35.29 
 
 
165 aa  56.6  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0472  hydrogenase maturation protease  37 
 
 
173 aa  56.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.196333 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3367  hydrogenase maturation protease  39.22 
 
 
157 aa  55.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.239776  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1165  hydrogenase expression/formation protein  31.54 
 
 
203 aa  55.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.464172  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2502  HybD peptidase  33.65 
 
 
183 aa  55.8  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0644035 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1640  hydrogenase expression/formation protein  34.92 
 
 
202 aa  55.5  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1648  hydrogenase expression/formation protein  34.92 
 
 
202 aa  55.5  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1800  hydrogenase expression/formation protein  34.92 
 
 
202 aa  55.5  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16559  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3769  hydrogenase expression/formation protein  30.77 
 
 
209 aa  55.1  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.645157  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3393  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  36.11 
 
 
164 aa  54.7  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.441153 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3494  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  36.11 
 
 
164 aa  54.7  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.627392  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1707  hydrogenase expression/formation protein  36.73 
 
 
202 aa  54.7  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.460815  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3319  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  36.11 
 
 
164 aa  54.3  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00237916  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3399  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  36.11 
 
 
164 aa  54.3  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3328  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  36.11 
 
 
164 aa  54.3  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.581349  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02869  predicted maturation element for hydrogenase 2  37.04 
 
 
164 aa  54.3  0.0000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3420  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  37.04 
 
 
164 aa  54.3  0.0000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4305  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  37.04 
 
 
164 aa  54.3  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.227122  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02818  hypothetical protein  37.04 
 
 
164 aa  54.3  0.0000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3462  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  37.04 
 
 
164 aa  54.3  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0703  hydrogenase expression/formation protein  37.04 
 
 
164 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3279  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  37.04 
 
 
164 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0700  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  37.04 
 
 
164 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3986  HyaD peptidase  31.75 
 
 
204 aa  53.9  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2367  hydrogenase maturation protease  40.26 
 
 
257 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0307441 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1244  hydrogenase expression/formation protein  35.24 
 
 
165 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.791163  normal  0.298279 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3173  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  37.04 
 
 
164 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2026  HyaD peptidase  32.06 
 
 
208 aa  53.5  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.462165  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2951  hydrogenase expression/formation protein  36.27 
 
 
170 aa  53.1  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.585714 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0269  hydrogenase expression/formation protein  33.01 
 
 
168 aa  52.8  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0820491 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0834  hydrogenase maturation protease  36.59 
 
 
177 aa  52  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.850937  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1819  hydrogenase maturation protease  35.64 
 
 
157 aa  52  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4241  peptidase M52, hydrogen uptake protein  33.68 
 
 
182 aa  52  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1037  hydrogenase expression/formation protein  31.07 
 
 
161 aa  51.6  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0456714  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>