132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2422 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2422  hydrogenase maturation protease  100 
 
 		 155 aa  311  1.9999999999999998e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.873028  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3323  peptidase M52, hydrogen uptake protein  76.47 
 
 		 154 aa  239  1e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1556  hydrogenase maturation protease  60.15 
 
 		 176 aa  160  6e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3881  hydrogenase maturation protease  56.38 
 
 		 156 aa  157  4e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3969  hydrogenase maturation protease  57.45 
 
 		 156 aa  155  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000953733 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2012  hydrogenase maturation protease  33.77 
 
 		 160 aa  75.1  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1153  hydrogenase expression/formation protein  33.57 
 
 		 218 aa  71.2  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.838065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2257  hydrogenase maturation protease  33.6 
 
 		 178 aa  65.1  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3101  hydrogenase expression/formation protein  33.1 
 
 		 222 aa  63.9  0.0000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2053  hydrogenase maturation protease  29.53 
 
 		 152 aa  63.9  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52965  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3804  hydrogenase maturation protease  32.69 
 
 		 157 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2131  hydrogenase maturation protease  34.04 
 
 		 181 aa  63.2  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.829671 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1650  hydrogenase maturation protease  32.48 
 
 		 161 aa  62.8  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0705  hydrogenase maturation protease  31.33 
 
 		 157 aa  60.5  0.000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.862619  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0853  hydrogenase maturation protease  31.33 
 
 		 157 aa  60.5  0.000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3986  HyaD peptidase  27.27 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3329  peptidase M52, hydrogenase maturation peptidase  29.5 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_119  Ni/Fe hydrogenase maturation protease  27.03 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3372  hypothetical protein  30.52 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.288217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3909  hydrogenase maturation protease  30.61 
 
 		 168 aa  60.5  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2150  hydrogenase expression/formation protein  31.72 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.133093  normal  0.20367 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0499  HyaD peptidase  31.03 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0259  hydrogenase maturation protease  27.03 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4092  peptidase M52, hydrogen uptake protein  29.87 
 
 		 174 aa  57.8  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0783921  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0109  hydrogenase maturation protease  29.66 
 
 		 160 aa  57.4  0.00000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1857  hydrogenase maturation protease  37.04 
 
 		 171 aa  57.4  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0777  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  33.33 
 
 		 158 aa  57  0.00000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.470969  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2176  hydrogenase expression/formation protein  29.8 
 
 		 208 aa  57  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0123485  normal  0.201269 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1819  hydrogenase maturation protease  26.32 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3432  hydrogenase maturation protease  35.92 
 
 		 191 aa  57  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1020  hydrogenase maturation protease  36.05 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00482421 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1999  hydrogenase maturation  30 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.116789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0542  hydrogenase expression/formation protein  30.92 
 
 		 169 aa  53.9  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.995345  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7262  hydrogenase expression/formation protein  29.87 
 
 		 214 aa  53.9  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.356245 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1233  hydrogenase maturation protease  33.05 
 
 		 172 aa  53.1  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.120838  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1164  HyaD peptidase  29.93 
 
 		 198 aa  53.1  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2822  Ni-Fe hydrogenase maturation factor-like protein  28.19 
 
 		 224 aa  53.1  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0380  hydrogenase maturation protease  30.08 
 
 		 176 aa  53.1  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0162  hydrogenase expression/formation protein  28.85 
 
 		 201 aa  52.8  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.793155  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2026  HyaD peptidase  28.39 
 
 		 208 aa  52.8  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.462165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0173  hydrogenase maturation protease  33.33 
 
 		 170 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1971  hydrogenase expression/formation protein  28.08 
 
 		 223 aa  52  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.814536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1590  hydrogenase maturation protease  29.86 
 
 		 160 aa  52  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0857  hydrogenase maturation protease  27.45 
 
 		 157 aa  52.4  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.685665  normal  0.316463 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0051  hydrogenase maturation protease  26.8 
 
 		 166 aa  52.4  0.000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0212564  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4291  hydrogenase maturation protease  30.77 
 
 		 171 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4313  hydrogenase maturation protease  30 
 
 		 173 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0858  hydrogenase maturation protease  32.41 
 
 		 157 aa  51.6  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4161  peptidase M52, hydrogen uptake protein  29.77 
 
 		 156 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0284488  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1075  peptidase M52, hydrogen uptake protein  33.09 
 
 		 188 aa  51.2  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0439307  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50560  hydrogenase expression/formation protein, HoxM  25.97 
 
 		 207 aa  50.8  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00480221  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0272  hydrogenase maturation protease  27.45 
 
 		 159 aa  50.4  0.000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.268401 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1247  hydrogenase maturation protease  29.6 
 
 		 156 aa  50.4  0.000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.188771 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0975  hydrogenase maturation protease  26.8 
 
 		 167 aa  50.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0660111  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0472  hydrogenase maturation protease  31.91 
 
 		 173 aa  49.7  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.196333 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0335  hydrogenase expression/formation protein  31.82 
 
 		 191 aa  50.1  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00352637  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2322  hydrogenase expression/formation protein  27.15 
 
 		 166 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.659738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3281  hydrogenase maturation protease  35.62 
 
 		 158 aa  49.7  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3399  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  31.25 
 
 		 164 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3393  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  31.25 
 
 		 164 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.441153 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3328  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  31.25 
 
 		 164 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.581349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3319  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  31.25 
 
 		 164 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00237916  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3494  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  31.25 
 
 		 164 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.627392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2879  hydrogenase maturation protease  35.62 
 
 		 158 aa  49.7  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.980378 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0120  hydrogenase maturation protease  32.8 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3970  HybD peptidase  26.8 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1414  hydrogenase expression/formation protein  28.76 
 
 		 166 aa  49.3  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2530  hydrogenase expression/formation protein  28.85 
 
 		 169 aa  49.3  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.780336  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1271  peptidase M52, hydrogen uptake protein  32.26 
 
 		 167 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.813931  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3819  hydrogenase maturation protease  34.42 
 
 		 167 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.704224  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3681  hydrogenase maturation protease  33.02 
 
 		 163 aa  48.5  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.157783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2136  peptidase M52, hydrogen uptake protein  26.75 
 
 		 156 aa  48.5  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4495  peptidase M52, hydrogen uptake protein  34.96 
 
 		 177 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1165  hydrogenase expression/formation protein  25.97 
 
 		 203 aa  48.5  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.464172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3415  peptidase M52, hydrogen uptake protein  28.67 
 
 		 166 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.100638  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3478  hydrogenase maturation protease  28.67 
 
 		 166 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.314685  normal  0.0224154 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2546  hydrogenase maturation protease  35.79 
 
 		 170 aa  48.5  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.316612  normal  0.0941351 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3947  peptidase M52, hydrogen uptake protein  26.8 
 
 		 153 aa  48.1  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.974859  normal  0.0407707 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3367  hydrogenase maturation protease  26.14 
 
 		 157 aa  47.8  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.239776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1139  hydrogenase maturation protease  32.05 
 
 		 157 aa  47.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3769  hydrogenase expression/formation protein  30.08 
 
 		 209 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.645157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1293  HyaD peptidase  26.35 
 
 		 221 aa  47.8  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000175592  normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3426  hydrogenase maturation protease  28.81 
 
 		 166 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.141018 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4827  hydrogenase maturation protease  33.33 
 
 		 166 aa  47.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2890  peptidase M52, hydrogen uptake protein  29.53 
 
 		 1053 aa  46.6  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3145  hydrogenase expression/formation protein  27.21 
 
 		 159 aa  47  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00208925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3760  hydrogenase maturation protease  30 
 
 		 158 aa  47  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1449  peptidase M52, hydrogen uptake protein  25.49 
 
 		 158 aa  45.4  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.230112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0477  peptidase M52, hydrogen uptake protein  32.24 
 
 		 175 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0936  hydrogenase maturation protease  37.72 
 
 		 172 aa  45.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1859  hydrogenase maturation protease  27.66 
 
 		 194 aa  45.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1707  hydrogenase expression/formation protein  24.78 
 
 		 202 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.460815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1635  hydrogenase expression/formation protein  24.78 
 
 		 202 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1054  hydrogenase maturation protease  37.72 
 
 		 172 aa  45.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.402831 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0703  hydrogenase expression/formation protein  29.86 
 
 		 164 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0451  coenzyme F420-reducing hydrogenase, delta subunit  34.34 
 
 		 159 aa  45.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3173  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  29.86 
 
 		 164 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3462  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  28.17 
 
 		 164 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1800  hydrogenase expression/formation protein  24.78 
 
 		 202 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4305  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  28.17 
 
 		 164 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.227122  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>