148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0451 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0451  coenzyme F420-reducing hydrogenase, delta subunit  100 
 
 		 159 aa  323  8.000000000000001e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0085  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  67.31 
 
 		 181 aa  217  3.9999999999999997e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0501687  normal  0.0549727 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2331  peptidase M52, hydrogenase maturation peptidase  62.66 
 
 		 183 aa  207  3e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2175  hydrogenase maturation protease  59.87 
 
 		 186 aa  194  3e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0478  hydrogenase maturation protease  48.73 
 
 		 181 aa  159  1e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0014  coenzyme F420-reducing hydrogenase, delta subunit  46.2 
 
 		 160 aa  150  7e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1044  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  45.96 
 
 		 182 aa  128  3e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0195  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  44.65 
 
 		 174 aa  127  9.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0693  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  45.57 
 
 		 171 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.845339  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0777  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  43.87 
 
 		 158 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.470969  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0628  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  44.65 
 
 		 174 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.836359 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1290  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  44.03 
 
 		 174 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.673562  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0648  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  38.65 
 
 		 166 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0256  coenzyme F420-reducing hydrogenase, delta subunit  43.87 
 
 		 160 aa  107  8.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1336  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  42.31 
 
 		 160 aa  107  1e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.291091  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0582  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  44.52 
 
 		 159 aa  106  2e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.724194  normal  0.0407733 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0648  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  40.65 
 
 		 160 aa  99  2e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.194531  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0074  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  40 
 
 		 166 aa  95.1  3e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2220  hydrogenase maturation protease  33.95 
 
 		 170 aa  90.9  6e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.861671  normal  0.717829 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3530  hydrogenase maturation protease  38.04 
 
 		 164 aa  83.2  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0589  hydrogenase maturation protease  33.56 
 
 		 167 aa  71.6  0.000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00428951  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0616  hydrogenase maturation protease  30.52 
 
 		 167 aa  66.2  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_554  hydrogenase maturation protease  33.33 
 
 		 167 aa  65.5  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3819  hydrogenase maturation protease  31.68 
 
 		 167 aa  64.3  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.704224  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4597  hydrogenase maturation protease  33.56 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0322  peptidase M52, hydrogen uptake protein  29.53 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1999  hydrogenase maturation  41.67 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.116789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1211  hydrogenase 1 maturation protease  39.53 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2142  hydrogenase 1 maturation protease  39.53 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.152456  normal  0.47053 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2340  hydrogenase 1 maturation protease  39.53 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.732485  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00978  HyaD  39.53 
 
 		 195 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.106803  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2669  hydrogenase expression/formation protein  39.53 
 
 		 195 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.112067  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1083  hydrogenase 1 maturation protease  39.53 
 
 		 195 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1090  hydrogenase 1 maturation protease  39.53 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0557672  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00985  hypothetical protein  39.53 
 
 		 195 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112928  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2621  hydrogenase 1 maturation protease  39.53 
 
 		 195 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00823631 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08060  hydrogenase maturation protease  28.85 
 
 		 176 aa  57.8  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0472  hydrogenase maturation protease  36.36 
 
 		 173 aa  56.6  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.196333 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1075  peptidase M52, hydrogen uptake protein  32.69 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0439307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2125  hydrogenase maturation protease  30.61 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.295921  normal  0.0277446 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2487  hydrogenase maturation protease  32.79 
 
 		 170 aa  55.8  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3225  hydrogenase maturation protease  30.48 
 
 		 271 aa  55.1  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.679402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3804  hydrogenase maturation protease  36.59 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1037  hydrogenase expression/formation protein  28 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0456714  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3769  hydrogenase expression/formation protein  40.24 
 
 		 209 aa  54.3  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.645157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1157  hydrogenase expression/formation protein  38.1 
 
 		 195 aa  54.3  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.486513  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1345  hydrogenase 1 maturation protease  36.05 
 
 		 198 aa  53.9  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1529  hydrogenase 1 maturation protease  36.05 
 
 		 198 aa  53.9  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.468604  normal  0.329104 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1987  hydrogenase 1 maturation protease  36.05 
 
 		 198 aa  53.9  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2409  hydrogenase maturation protease  34 
 
 		 169 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.520841 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1931  hydrogenase 1 maturation protease  36.05 
 
 		 198 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1927  hydrogenase 1 maturation protease  36.05 
 
 		 198 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.822664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2546  hydrogenase maturation protease  37.18 
 
 		 170 aa  52.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.316612  normal  0.0941351 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7262  hydrogenase expression/formation protein  42.35 
 
 		 214 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.356245 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1293  HyaD peptidase  33.71 
 
 		 221 aa  52  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000175592  normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0542  hydrogenase expression/formation protein  38.1 
 
 		 169 aa  52.4  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.995345  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2053  hydrogenase maturation protease  37.36 
 
 		 152 aa  52  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52965  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2890  peptidase M52, hydrogen uptake protein  32.14 
 
 		 1053 aa  52  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1153  hydrogenase expression/formation protein  39.53 
 
 		 218 aa  51.6  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.838065  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50560  hydrogenase expression/formation protein, HoxM  34.94 
 
 		 207 aa  51.2  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00480221  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3986  HyaD peptidase  36.47 
 
 		 204 aa  50.8  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2606  hydrogenase maturation protease  36.36 
 
 		 150 aa  50.8  0.000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0209681  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3372  hypothetical protein  33.71 
 
 		 206 aa  50.4  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.288217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1648  hydrogenase expression/formation protein  37.21 
 
 		 202 aa  50.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1800  hydrogenase expression/formation protein  37.21 
 
 		 202 aa  50.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1707  hydrogenase expression/formation protein  37.21 
 
 		 202 aa  50.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.460815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1640  hydrogenase expression/formation protein  37.21 
 
 		 202 aa  50.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0162  hydrogenase expression/formation protein  40 
 
 		 201 aa  50.4  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.793155  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3329  peptidase M52, hydrogenase maturation peptidase  36.96 
 
 		 172 aa  49.7  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0267  hydrogenase expression/formation protein  27.22 
 
 		 165 aa  50.1  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.312911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0173  hydrogenase maturation protease  34.26 
 
 		 170 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2176  hydrogenase expression/formation protein  38.82 
 
 		 208 aa  50.4  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0123485  normal  0.201269 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1635  hydrogenase expression/formation protein  37.21 
 
 		 202 aa  50.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2717  hydrogenase 3 maturation protease  28.78 
 
 		 165 aa  50.1  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.391136  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3101  hydrogenase expression/formation protein  37.21 
 
 		 222 aa  49.3  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0272  hydrogenase maturation protease  28.95 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.268401 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1971  hydrogenase expression/formation protein  33.73 
 
 		 223 aa  49.7  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.814536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2012  hydrogenase maturation protease  30.49 
 
 		 160 aa  48.5  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2139  hydrogenase expression/formation protein  32.08 
 
 		 165 aa  48.9  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1940  peptidase M52, hydrogen uptake protein  30.66 
 
 		 201 aa  48.9  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1276  hydrogenase 3 maturation protease  31.53 
 
 		 159 aa  48.9  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.482581  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0522  hydrogenase maturation protease  30.72 
 
 		 177 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1556  hydrogenase maturation protease  35.92 
 
 		 176 aa  48.1  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1165  hydrogenase expression/formation protein  36.9 
 
 		 203 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.464172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0380  hydrogenase maturation protease  36.9 
 
 		 176 aa  47.8  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2367  hydrogenase maturation protease  35.82 
 
 		 257 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0307441 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2951  hydrogenase expression/formation protein  32.48 
 
 		 170 aa  47.8  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.585714 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3760  hydrogenase maturation protease  39.02 
 
 		 158 aa  47.4  0.00008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2822  Ni-Fe hydrogenase maturation factor-like protein  32.53 
 
 		 224 aa  47.4  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0499  HyaD peptidase  33.72 
 
 		 206 aa  47.4  0.00009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3201  hydrogenase maturation protease  34.38 
 
 		 161 aa  47  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3135  hydrogenase maturation protease  33.77 
 
 		 159 aa  47  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2150  hydrogenase expression/formation protein  33.72 
 
 		 206 aa  47  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.133093  normal  0.20367 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0432  hydrogenase maturation protease HycI  30.16 
 
 		 179 aa  47  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.632928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0834  hydrogenase maturation protease  35.14 
 
 		 177 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.850937  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1127  hydrogenase maturation protease  24.77 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1247  hydrogenase maturation protease  32.93 
 
 		 156 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.188771 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1233  hydrogenase maturation protease  31.82 
 
 		 172 aa  45.4  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.120838  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3909  hydrogenase maturation protease  36.36 
 
 		 168 aa  45.4  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08520  hydrogenase maturation protease  28.76 
 
 		 175 aa  45.4  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.326718 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>