161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0074 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_0074  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  100 
 
 
166 aa  327  3e-89  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0648  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  83.13 
 
 
166 aa  278  2e-74  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0777  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  46.95 
 
 
158 aa  159  2e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.470969  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1044  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  45.28 
 
 
182 aa  144  7.0000000000000006e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0195  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  45.18 
 
 
174 aa  143  1e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0628  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  45.18 
 
 
174 aa  143  1e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.836359 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1290  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  44.58 
 
 
174 aa  143  1e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.673562  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0693  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  44.05 
 
 
171 aa  138  3e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.845339  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0648  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  48.8 
 
 
160 aa  133  9.999999999999999e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.194531  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1336  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  45.78 
 
 
160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.291091  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0256  coenzyme F420-reducing hydrogenase, delta subunit  45.78 
 
 
160 aa  127  6e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0582  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  46.06 
 
 
159 aa  123  1e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.724194  normal  0.0407733 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0085  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  40.99 
 
 
181 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0501687  normal  0.0549727 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2175  hydrogenase maturation protease  38.27 
 
 
186 aa  111  5e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0451  coenzyme F420-reducing hydrogenase, delta subunit  39.75 
 
 
159 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2331  peptidase M52, hydrogenase maturation peptidase  39.62 
 
 
183 aa  99  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0014  coenzyme F420-reducing hydrogenase, delta subunit  38.32 
 
 
160 aa  95.9  2e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2220  hydrogenase maturation protease  32.32 
 
 
170 aa  95.5  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.861671  normal  0.717829 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0589  hydrogenase maturation protease  30.86 
 
 
167 aa  81.6  0.000000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00428951  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_554  hydrogenase maturation protease  30.86 
 
 
167 aa  79  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0478  hydrogenase maturation protease  31.9 
 
 
181 aa  77.8  0.00000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0616  hydrogenase maturation protease  30.25 
 
 
167 aa  75.9  0.0000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2822  Ni-Fe hydrogenase maturation factor-like protein  32.3 
 
 
224 aa  73.6  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1293  HyaD peptidase  30.3 
 
 
221 aa  69.7  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000175592  normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3530  hydrogenase maturation protease  29.01 
 
 
164 aa  68.9  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224586  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1971  hydrogenase expression/formation protein  29.19 
 
 
223 aa  62.4  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.814536  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3372  hypothetical protein  25.75 
 
 
206 aa  61.2  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.288217  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1165  hydrogenase expression/formation protein  28.66 
 
 
203 aa  61.2  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.464172  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1999  hydrogenase maturation  32.03 
 
 
195 aa  60.1  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.116789  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_119  Ni/Fe hydrogenase maturation protease  29.81 
 
 
160 aa  59.7  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0259  hydrogenase maturation protease  29.81 
 
 
160 aa  59.3  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1153  hydrogenase expression/formation protein  28.57 
 
 
218 aa  59.3  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.838065  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0109  hydrogenase maturation protease  29.81 
 
 
160 aa  58.9  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3101  hydrogenase expression/formation protein  27.22 
 
 
222 aa  58.9  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2026  HyaD peptidase  28.4 
 
 
208 aa  58.2  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.462165  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0857  hydrogenase maturation protease  32.93 
 
 
157 aa  58.2  0.00000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.685665  normal  0.316463 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1844  hydrogenase expression/formation protein  31.1 
 
 
161 aa  57.8  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0542  hydrogenase expression/formation protein  27.22 
 
 
169 aa  57.4  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.995345  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7262  hydrogenase expression/formation protein  27.16 
 
 
214 aa  57.4  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.356245 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2733  hydrogenase maturation protease  30.19 
 
 
165 aa  56.6  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3329  peptidase M52, hydrogenase maturation peptidase  25.32 
 
 
172 aa  55.8  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1707  hydrogenase expression/formation protein  29.41 
 
 
202 aa  55.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.460815  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2125  hydrogenase maturation protease  26.62 
 
 
156 aa  55.1  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.295921  normal  0.0277446 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4597  hydrogenase maturation protease  27.33 
 
 
187 aa  54.7  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0499  HyaD peptidase  25.75 
 
 
206 aa  54.3  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2176  hydrogenase expression/formation protein  25.9 
 
 
208 aa  54.3  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0123485  normal  0.201269 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1414  hydrogenase expression/formation protein  25.77 
 
 
166 aa  54.3  0.0000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1640  hydrogenase expression/formation protein  28.76 
 
 
202 aa  53.9  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1648  hydrogenase expression/formation protein  28.76 
 
 
202 aa  53.9  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1800  hydrogenase expression/formation protein  28.76 
 
 
202 aa  53.9  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16559  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1635  hydrogenase expression/formation protein  28.76 
 
 
202 aa  53.9  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0322  peptidase M52, hydrogen uptake protein  26.83 
 
 
154 aa  53.5  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2150  hydrogenase expression/formation protein  25.75 
 
 
206 aa  53.9  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.133093  normal  0.20367 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1211  hydrogenase 1 maturation protease  27.66 
 
 
195 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00978  HyaD  27.66 
 
 
195 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.106803  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2669  hydrogenase expression/formation protein  27.66 
 
 
195 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.112067  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50560  hydrogenase expression/formation protein, HoxM  26.09 
 
 
207 aa  53.1  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00480221  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00985  hypothetical protein  27.66 
 
 
195 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112928  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1931  hydrogenase 1 maturation protease  26.24 
 
 
198 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1987  hydrogenase 1 maturation protease  26.24 
 
 
198 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1529  hydrogenase 1 maturation protease  26.24 
 
 
198 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.468604  normal  0.329104 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1927  hydrogenase 1 maturation protease  26.24 
 
 
198 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.822664  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1083  hydrogenase 1 maturation protease  27.66 
 
 
195 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1090  hydrogenase 1 maturation protease  27.66 
 
 
195 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0557672  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2621  hydrogenase 1 maturation protease  27.66 
 
 
195 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00823631 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1345  hydrogenase 1 maturation protease  26.24 
 
 
198 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2340  hydrogenase 1 maturation protease  27.66 
 
 
195 aa  53.1  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.732485  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1127  hydrogenase maturation protease  28.85 
 
 
158 aa  51.6  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0380  hydrogenase maturation protease  25.15 
 
 
176 aa  51.6  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4305  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  29.63 
 
 
164 aa  50.8  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.227122  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3494  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  28.4 
 
 
164 aa  50.8  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.627392  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01030  hydrogenase 3 maturation protease  27.15 
 
 
172 aa  50.8  0.000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.184626  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3393  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  28.4 
 
 
164 aa  50.8  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.441153 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3462  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  29.63 
 
 
164 aa  50.8  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02869  predicted maturation element for hydrogenase 2  29.63 
 
 
164 aa  50.8  0.000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0975  hydrogenase maturation protease  28.1 
 
 
167 aa  50.8  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0660111  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02818  hypothetical protein  29.63 
 
 
164 aa  50.8  0.000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3420  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  29.63 
 
 
164 aa  50.8  0.000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0703  hydrogenase expression/formation protein  29.63 
 
 
164 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2012  hydrogenase maturation protease  30.49 
 
 
160 aa  50.1  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3319  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  28.4 
 
 
164 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00237916  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3399  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  28.4 
 
 
164 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3173  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  29.63 
 
 
164 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3328  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  28.4 
 
 
164 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.581349  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1859  hydrogenase maturation protease  27.27 
 
 
194 aa  50.4  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0700  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  29.63 
 
 
164 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2142  hydrogenase 1 maturation protease  26.95 
 
 
195 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.152456  normal  0.47053 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3279  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  29.63 
 
 
164 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1590  hydrogenase maturation protease  29.94 
 
 
160 aa  50.4  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0834  hydrogenase maturation protease  24.39 
 
 
177 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.850937  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4092  peptidase M52, hydrogen uptake protein  25.48 
 
 
174 aa  49.7  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0783921  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0051  hydrogenase maturation protease  27.22 
 
 
166 aa  48.9  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0212564  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3986  HyaD peptidase  28.47 
 
 
204 aa  48.9  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3769  hydrogenase expression/formation protein  25 
 
 
209 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.645157  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3367  hydrogenase maturation protease  25.32 
 
 
157 aa  48.9  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.239776  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0858  hydrogenase maturation protease  28.1 
 
 
157 aa  48.9  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3970  HybD peptidase  25 
 
 
159 aa  48.9  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2053  hydrogenase maturation protease  25.32 
 
 
152 aa  47.8  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52965  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1449  peptidase M52, hydrogen uptake protein  28.85 
 
 
158 aa  47.8  0.00008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.230112  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0335  hydrogenase expression/formation protein  28.24 
 
 
191 aa  47.4  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00352637  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>