133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_2125 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_2125  hydrogenase maturation protease  100 
 
 		 156 aa  303  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.295921  normal  0.0277446 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2138  peptidase M52, hydrogen uptake protein  96.35 
 
 		 137 aa  257  3e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.577863  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2184  peptidase M52, hydrogen uptake protein  96.35 
 
 		 137 aa  257  3e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.303394 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2409  hydrogenase maturation protease  71.09 
 
 		 169 aa  181  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.520841 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4597  hydrogenase maturation protease  51.61 
 
 		 187 aa  135  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08060  hydrogenase maturation protease  48.17 
 
 		 176 aa  128  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3819  hydrogenase maturation protease  48 
 
 		 167 aa  117  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.704224  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1940  peptidase M52, hydrogen uptake protein  45.77 
 
 		 201 aa  103  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2487  hydrogenase maturation protease  47.71 
 
 		 170 aa  97.4  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2546  hydrogenase maturation protease  40.74 
 
 		 170 aa  94.7  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.316612  normal  0.0941351 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3101  hydrogenase expression/formation protein  32.28 
 
 		 222 aa  64.3  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0014  coenzyme F420-reducing hydrogenase, delta subunit  34.39 
 
 		 160 aa  63.9  0.0000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0975  hydrogenase maturation protease  31.29 
 
 		 167 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0660111  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3372  hypothetical protein  34.97 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.288217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3970  HybD peptidase  32.17 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2740  hydrogenase maturation protease  27.56 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000112894  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1859  hydrogenase maturation protease  29.8 
 
 		 194 aa  62  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1153  hydrogenase expression/formation protein  36.55 
 
 		 218 aa  61.2  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.838065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0272  hydrogenase maturation protease  33.1 
 
 		 159 aa  60.8  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.268401 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3432  hydrogenase maturation protease  32.88 
 
 		 191 aa  60.8  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0499  HyaD peptidase  33.12 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1233  hydrogenase maturation protease  28.57 
 
 		 172 aa  60.1  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.120838  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00344  hydrogenase 2 maturation protease  30 
 
 		 184 aa  59.7  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2150  hydrogenase expression/formation protein  33.12 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.133093  normal  0.20367 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0522  hydrogenase maturation protease  37.5 
 
 		 177 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0857  hydrogenase maturation protease  26.95 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.685665  normal  0.316463 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2331  peptidase M52, hydrogenase maturation peptidase  30.72 
 
 		 183 aa  58.5  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3415  peptidase M52, hydrogen uptake protein  36.6 
 
 		 166 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.100638  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3478  hydrogenase maturation protease  36.6 
 
 		 166 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.314685  normal  0.0224154 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2659  hydrogenase maturation protease  29.75 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.196186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0335  hydrogenase expression/formation protein  37.33 
 
 		 191 aa  58.2  0.00000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00352637  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0478  hydrogenase maturation protease  30 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3804  hydrogenase maturation protease  31.76 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0451  coenzyme F420-reducing hydrogenase, delta subunit  30.61 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3399  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  29.45 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3393  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  29.45 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.441153 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3328  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  29.45 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.581349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0051  hydrogenase maturation protease  26.53 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0212564  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1414  hydrogenase expression/formation protein  29.38 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3319  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  29.45 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00237916  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3494  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  29.45 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.627392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0858  hydrogenase maturation protease  29.45 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1157  hydrogenase expression/formation protein  29.61 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.486513  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0477  peptidase M52, hydrogen uptake protein  34.27 
 
 		 175 aa  54.3  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2176  hydrogenase expression/formation protein  33.1 
 
 		 208 aa  53.9  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0123485  normal  0.201269 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1271  peptidase M52, hydrogen uptake protein  34.72 
 
 		 167 aa  53.9  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.813931  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1247  hydrogenase maturation protease  29.08 
 
 		 156 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.188771 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1037  hydrogenase expression/formation protein  29.66 
 
 		 161 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0456714  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2733  hydrogenase maturation protease  30.77 
 
 		 165 aa  53.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02869  predicted maturation element for hydrogenase 2  27.4 
 
 		 164 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4092  peptidase M52, hydrogen uptake protein  27.1 
 
 		 174 aa  52.8  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0783921  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02818  hypothetical protein  27.4 
 
 		 164 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4305  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  28.08 
 
 		 164 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.227122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3462  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  28.08 
 
 		 164 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1139  hydrogenase maturation protease  32.64 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3420  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  27.4 
 
 		 164 aa  52.4  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0472  hydrogenase maturation protease  35.46 
 
 		 173 aa  52.8  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.196333 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0703  hydrogenase expression/formation protein  27.4 
 
 		 164 aa  52  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2175  hydrogenase maturation protease  27.54 
 
 		 186 aa  52  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3173  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  27.4 
 
 		 164 aa  52  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0700  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  27.4 
 
 		 164 aa  52  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3279  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  27.4 
 
 		 164 aa  52  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1165  hydrogenase expression/formation protein  29.86 
 
 		 203 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.464172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0542  hydrogenase expression/formation protein  30.07 
 
 		 169 aa  51.6  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.995345  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1999  hydrogenase maturation  28.67 
 
 		 195 aa  51.6  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.116789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2606  hydrogenase maturation protease  30.56 
 
 		 150 aa  51.6  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0209681  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2951  hydrogenase expression/formation protein  29.86 
 
 		 170 aa  51.2  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.585714 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1449  peptidase M52, hydrogen uptake protein  27.63 
 
 		 158 aa  50.8  0.000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.230112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3329  peptidase M52, hydrogenase maturation peptidase  31.47 
 
 		 172 aa  50.8  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0267  hydrogenase expression/formation protein  28.3 
 
 		 165 aa  50.4  0.000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.312911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1293  HyaD peptidase  29.17 
 
 		 221 aa  50.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000175592  normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3530  hydrogenase maturation protease  33.1 
 
 		 164 aa  50.1  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0777  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  29.05 
 
 		 158 aa  50.1  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.470969  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3281  hydrogenase maturation protease  30.71 
 
 		 158 aa  49.7  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2530  hydrogenase expression/formation protein  30.14 
 
 		 169 aa  49.3  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.780336  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2026  HyaD peptidase  32.88 
 
 		 208 aa  49.3  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.462165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0085  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  29.25 
 
 		 181 aa  49.3  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0501687  normal  0.0549727 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2322  hydrogenase expression/formation protein  29.17 
 
 		 166 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.659738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2131  hydrogenase maturation protease  28.57 
 
 		 181 aa  48.9  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.829671 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2879  hydrogenase maturation protease  30.71 
 
 		 158 aa  49.7  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.980378 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0162  hydrogenase expression/formation protein  30.07 
 
 		 201 aa  48.9  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.793155  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3769  hydrogenase expression/formation protein  28.47 
 
 		 209 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.645157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0648  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  27.92 
 
 		 166 aa  48.9  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3145  hydrogenase expression/formation protein  29.66 
 
 		 159 aa  48.5  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00208925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7262  hydrogenase expression/formation protein  30.99 
 
 		 214 aa  48.5  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.356245 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0074  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  25.97 
 
 		 166 aa  47.8  0.00005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2136  peptidase M52, hydrogen uptake protein  29.45 
 
 		 156 aa  47.8  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2053  hydrogenase maturation protease  29.17 
 
 		 152 aa  47.4  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52965  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0786  hydrogenase maturation protease  27.21 
 
 		 160 aa  46.6  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.177407  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2890  peptidase M52, hydrogen uptake protein  32.64 
 
 		 1053 aa  47  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0173  hydrogenase maturation protease  29.2 
 
 		 170 aa  46.2  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0648  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  27.33 
 
 		 160 aa  47  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.194531  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1707  hydrogenase expression/formation protein  29.03 
 
 		 202 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.460815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1075  peptidase M52, hydrogen uptake protein  38.46 
 
 		 188 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0439307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4241  peptidase M52, hydrogen uptake protein  28.47 
 
 		 182 aa  46.2  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1127  hydrogenase maturation protease  31.16 
 
 		 158 aa  46.2  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1648  hydrogenase expression/formation protein  29.03 
 
 		 202 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1640  hydrogenase expression/formation protein  29.03 
 
 		 202 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1635  hydrogenase expression/formation protein  29.93 
 
 		 202 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1800  hydrogenase expression/formation protein  29.03 
 
 		 202 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16559  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>