183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0256 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0256  coenzyme F420-reducing hydrogenase, delta subunit  100 
 
 		 160 aa  317  3e-86  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1336  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  95.62 
 
 		 160 aa  286  9e-77  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.291091  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0582  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  93.67 
 
 		 159 aa  279  1e-74  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.724194  normal  0.0407733 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0648  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  80 
 
 		 160 aa  248  3e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.194531  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0777  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  67.72 
 
 		 158 aa  223  9e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.470969  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0648  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  49.4 
 
 		 166 aa  159  2e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0693  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  45.34 
 
 		 171 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.845339  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0195  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  43.03 
 
 		 174 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1290  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  43.03 
 
 		 174 aa  137  4.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.673562  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0085  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  47.02 
 
 		 181 aa  137  7e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0501687  normal  0.0549727 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0628  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  42.42 
 
 		 174 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.836359 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1044  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  45.96 
 
 		 182 aa  133  9.999999999999999e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2175  hydrogenase maturation protease  45.81 
 
 		 186 aa  130  9e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0074  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  45.78 
 
 		 166 aa  127  6e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0451  coenzyme F420-reducing hydrogenase, delta subunit  43.87 
 
 		 159 aa  123  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2331  peptidase M52, hydrogenase maturation peptidase  42.58 
 
 		 183 aa  121  5e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0478  hydrogenase maturation protease  40.76 
 
 		 181 aa  113  8.999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0014  coenzyme F420-reducing hydrogenase, delta subunit  38.12 
 
 		 160 aa  94.7  4e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2220  hydrogenase maturation protease  35.48 
 
 		 170 aa  84  8e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.861671  normal  0.717829 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3101  hydrogenase expression/formation protein  31.52 
 
 		 222 aa  80.5  0.000000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50560  hydrogenase expression/formation protein, HoxM  32.05 
 
 		 207 aa  78.6  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00480221  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3530  hydrogenase maturation protease  33.74 
 
 		 164 aa  77  0.00000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4597  hydrogenase maturation protease  32.45 
 
 		 187 aa  75.5  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3372  hypothetical protein  30.67 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.288217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1293  HyaD peptidase  31.61 
 
 		 221 aa  72  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000175592  normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1153  hydrogenase expression/formation protein  33.97 
 
 		 218 aa  69.7  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.838065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1999  hydrogenase maturation  31.21 
 
 		 195 aa  68.2  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.116789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7262  hydrogenase expression/formation protein  29.3 
 
 		 214 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.356245 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0499  HyaD peptidase  30.49 
 
 		 206 aa  67.8  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2150  hydrogenase expression/formation protein  30.49 
 
 		 206 aa  67  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.133093  normal  0.20367 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1157  hydrogenase expression/formation protein  27.39 
 
 		 195 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.486513  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2136  peptidase M52, hydrogen uptake protein  30.97 
 
 		 156 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0589  hydrogenase maturation protease  26.11 
 
 		 167 aa  66.2  0.0000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00428951  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0272  hydrogenase maturation protease  30.32 
 
 		 159 aa  65.1  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.268401 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1707  hydrogenase expression/formation protein  30.57 
 
 		 202 aa  64.7  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.460815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2822  Ni-Fe hydrogenase maturation factor-like protein  29.93 
 
 		 224 aa  64.3  0.0000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_554  hydrogenase maturation protease  27.7 
 
 		 167 aa  63.9  0.0000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1971  hydrogenase expression/formation protein  29.49 
 
 		 223 aa  63.9  0.0000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.814536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3329  peptidase M52, hydrogenase maturation peptidase  30.52 
 
 		 172 aa  62.8  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1165  hydrogenase expression/formation protein  28.57 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.464172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1800  hydrogenase expression/formation protein  29.94 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1635  hydrogenase expression/formation protein  30.57 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1640  hydrogenase expression/formation protein  29.94 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1648  hydrogenase expression/formation protein  29.94 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3769  hydrogenase expression/formation protein  32 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.645157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1650  hydrogenase maturation protease  32.31 
 
 		 161 aa  60.8  0.000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2176  hydrogenase expression/formation protein  37.93 
 
 		 208 aa  60.5  0.000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0123485  normal  0.201269 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1037  hydrogenase expression/formation protein  26.06 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0456714  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2012  hydrogenase maturation protease  28.48 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2026  HyaD peptidase  36.36 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.462165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08060  hydrogenase maturation protease  29.52 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1233  hydrogenase maturation protease  29.11 
 
 		 172 aa  58.5  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.120838  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0616  hydrogenase maturation protease  27.03 
 
 		 167 aa  58.9  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3393  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  28.03 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.441153 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3494  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  28.03 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.627392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3986  HyaD peptidase  26.11 
 
 		 204 aa  57.8  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3328  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  28.03 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.581349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3399  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  28.03 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3319  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  28.03 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00237916  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0380  hydrogenase maturation protease  31.45 
 
 		 176 aa  57.8  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0542  hydrogenase expression/formation protein  32.43 
 
 		 169 aa  57.8  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.995345  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0522  hydrogenase maturation protease  27.74 
 
 		 177 aa  57.4  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2053  hydrogenase maturation protease  30.07 
 
 		 152 aa  57.4  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52965  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1414  hydrogenase expression/formation protein  25.16 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3819  hydrogenase maturation protease  31.85 
 
 		 167 aa  57  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.704224  normal  0.0594228 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02869  predicted maturation element for hydrogenase 2  28.03 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0703  hydrogenase expression/formation protein  28.03 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0162  hydrogenase expression/formation protein  31.68 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.793155  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1211  hydrogenase 1 maturation protease  28.46 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4305  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  28.03 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.227122  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02818  hypothetical protein  28.03 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3173  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  28.03 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3462  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  28.03 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3420  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  28.03 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0700  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  28.03 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3279  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  28.03 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1940  peptidase M52, hydrogen uptake protein  29.85 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2340  hydrogenase 1 maturation protease  28.46 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.732485  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1127  hydrogenase maturation protease  27.39 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00978  HyaD  28.46 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.106803  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2669  hydrogenase expression/formation protein  28.46 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.112067  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00985  hypothetical protein  28.46 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112928  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3225  hydrogenase maturation protease  28.03 
 
 		 271 aa  54.7  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.679402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1083  hydrogenase 1 maturation protease  28.46 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1090  hydrogenase 1 maturation protease  28.46 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0557672  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2621  hydrogenase 1 maturation protease  28.46 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00823631 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0858  hydrogenase maturation protease  32.45 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3135  hydrogenase maturation protease  27.39 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3804  hydrogenase maturation protease  31.53 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1987  hydrogenase 1 maturation protease  26.83 
 
 		 198 aa  54.3  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1345  hydrogenase 1 maturation protease  26.83 
 
 		 198 aa  54.3  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1247  hydrogenase maturation protease  33.33 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.188771 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1529  hydrogenase 1 maturation protease  26.83 
 
 		 198 aa  54.3  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.468604  normal  0.329104 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1931  hydrogenase 1 maturation protease  26.83 
 
 		 198 aa  54.3  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1927  hydrogenase 1 maturation protease  26.83 
 
 		 198 aa  54.3  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.822664  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2530  hydrogenase expression/formation protein  23.87 
 
 		 169 aa  54.3  0.0000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.780336  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2951  hydrogenase expression/formation protein  30.72 
 
 		 170 aa  53.9  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.585714 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0267  hydrogenase expression/formation protein  28.85 
 
 		 165 aa  53.5  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.312911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0477  peptidase M52, hydrogen uptake protein  29.03 
 
 		 175 aa  53.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1127  hydrogenase maturation protease  29.22 
 
 		 158 aa  52.4  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>