94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_3426 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_3426  hydrogenase maturation protease  100 
 
 
166 aa  318  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.141018 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3478  hydrogenase maturation protease  98.8 
 
 
166 aa  315  1e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.314685  normal  0.0224154 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3415  peptidase M52, hydrogen uptake protein  98.8 
 
 
166 aa  315  1e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.100638  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3432  hydrogenase maturation protease  45.77 
 
 
191 aa  108  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1139  hydrogenase maturation protease  41.22 
 
 
157 aa  96.3  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1857  hydrogenase maturation protease  42.97 
 
 
171 aa  86.7  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0508  hydrogenase maturation protease  36.18 
 
 
180 aa  84.3  7e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2659  hydrogenase maturation protease  33.09 
 
 
148 aa  78.2  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.196186  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4827  hydrogenase maturation protease  35.48 
 
 
166 aa  77  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385637  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3760  hydrogenase maturation protease  36.36 
 
 
158 aa  74.3  0.0000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4495  peptidase M52, hydrogen uptake protein  38.58 
 
 
177 aa  73.6  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2591  hydrogenase maturation protease  42.47 
 
 
149 aa  68.2  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.584226  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0853  hydrogenase maturation protease  35.48 
 
 
157 aa  63.9  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0705  hydrogenase maturation protease  35.48 
 
 
157 aa  63.9  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.862619  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04410  soluble hydrogenase processing peptidase, HoxW  35.57 
 
 
160 aa  61.2  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2103  hydrogenase maturation protease  26.53 
 
 
159 aa  58.9  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0938724  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3225  hydrogenase maturation protease  32.62 
 
 
271 aa  58.2  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.679402  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2125  hydrogenase maturation protease  36.6 
 
 
156 aa  57.8  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.295921  normal  0.0277446 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3804  hydrogenase maturation protease  36.3 
 
 
157 aa  57.8  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3367  hydrogenase maturation protease  27.1 
 
 
157 aa  57  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.239776  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2951  hydrogenase expression/formation protein  30.67 
 
 
170 aa  55.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.585714 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1020  hydrogenase maturation protease  34.29 
 
 
180 aa  56.2  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00482421 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2367  hydrogenase maturation protease  32.5 
 
 
257 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0307441 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1075  peptidase M52, hydrogen uptake protein  33.56 
 
 
188 aa  55.5  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0439307  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2257  hydrogenase maturation protease  30.46 
 
 
178 aa  55.1  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3329  peptidase M52, hydrogenase maturation peptidase  29.25 
 
 
172 aa  54.3  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0477  peptidase M52, hydrogen uptake protein  30.72 
 
 
175 aa  54.3  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03840  hydrogenase maturation protease  26.61 
 
 
137 aa  53.5  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1054  hydrogenase maturation protease  29.53 
 
 
172 aa  53.9  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.402831 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0936  hydrogenase maturation protease  29.53 
 
 
172 aa  53.9  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4092  peptidase M52, hydrogen uptake protein  26.03 
 
 
174 aa  52.8  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0783921  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3681  hydrogenase maturation protease  27.89 
 
 
163 aa  52.4  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.157783  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1318  hydrogenase maturation protease  28.48 
 
 
157 aa  52.4  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0109  hydrogenase maturation protease  25.17 
 
 
160 aa  52  0.000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0472  hydrogenase maturation protease  31.47 
 
 
173 aa  51.6  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.196333 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2740  hydrogenase maturation protease  26.67 
 
 
164 aa  52  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000112894  n/a   
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3201  hydrogenase maturation protease  35.59 
 
 
161 aa  50.8  0.000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0333  hydrogenase maturation protease  23.84 
 
 
161 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.835463 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2184  peptidase M52, hydrogen uptake protein  39.64 
 
 
137 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.303394 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0326  hydrogenase maturation protease  23.84 
 
 
161 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2138  peptidase M52, hydrogen uptake protein  39.64 
 
 
137 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.577863  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_119  Ni/Fe hydrogenase maturation protease  24.66 
 
 
160 aa  50.4  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0085  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  29.87 
 
 
181 aa  50.1  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0501687  normal  0.0549727 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0259  hydrogenase maturation protease  24.66 
 
 
160 aa  49.7  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0113  HoxW protein  32.35 
 
 
180 aa  49.7  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.486904  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2012  hydrogenase maturation protease  31.17 
 
 
160 aa  49.7  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1650  hydrogenase maturation protease  30.08 
 
 
161 aa  49.3  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0542  hydrogenase expression/formation protein  27.21 
 
 
169 aa  49.3  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.995345  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3947  peptidase M52, hydrogen uptake protein  26.8 
 
 
153 aa  49.3  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.974859  normal  0.0407707 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2053  hydrogenase maturation protease  26.32 
 
 
152 aa  49.3  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52965  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1247  hydrogenase maturation protease  26.49 
 
 
156 aa  49.3  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.188771 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08520  hydrogenase maturation protease  30.41 
 
 
175 aa  48.9  0.00003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1859  hydrogenase maturation protease  25.64 
 
 
194 aa  48.1  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3885  hydrogenase maturation protease  27.21 
 
 
158 aa  48.1  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.445128  normal  0.911983 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0975  hydrogenase maturation protease  27.08 
 
 
167 aa  48.1  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0660111  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1556  hydrogenase maturation protease  29.41 
 
 
176 aa  48.1  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2422  hydrogenase maturation protease  28.81 
 
 
155 aa  47.4  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.873028  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3319  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  27.59 
 
 
164 aa  47.4  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00237916  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2530  hydrogenase expression/formation protein  28.97 
 
 
169 aa  47.4  0.00009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.780336  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3399  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  27.59 
 
 
164 aa  47.4  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3328  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  27.59 
 
 
164 aa  47.4  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.581349  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0380  hydrogenase maturation protease  26.67 
 
 
176 aa  47.4  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3494  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  27.59 
 
 
164 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.627392  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3393  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  27.59 
 
 
164 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.441153 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00344  hydrogenase 2 maturation protease  28.28 
 
 
184 aa  47  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0272  hydrogenase maturation protease  27.67 
 
 
159 aa  47  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.268401 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2175  hydrogenase maturation protease  27.98 
 
 
186 aa  46.6  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2606  hydrogenase maturation protease  30.37 
 
 
150 aa  47  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0209681  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3970  HybD peptidase  27.52 
 
 
159 aa  47  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0335  hydrogenase expression/formation protein  31.97 
 
 
191 aa  46.6  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00352637  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1233  hydrogenase maturation protease  27.04 
 
 
172 aa  46.2  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.120838  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4665  hypothetical protein  31.37 
 
 
158 aa  46.2  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02818  hypothetical protein  26.8 
 
 
164 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2890  peptidase M52, hydrogen uptake protein  28.47 
 
 
1053 aa  45.8  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3420  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  26.8 
 
 
164 aa  45.8  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02869  predicted maturation element for hydrogenase 2  26.8 
 
 
164 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0478  hydrogenase maturation protease  26.99 
 
 
181 aa  45.1  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2136  peptidase M52, hydrogen uptake protein  28 
 
 
156 aa  44.7  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3462  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  26.8 
 
 
164 aa  44.3  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4305  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  26.8 
 
 
164 aa  44.3  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.227122  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0703  hydrogenase expression/formation protein  26.14 
 
 
164 aa  43.5  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08060  hydrogenase maturation protease  29.03 
 
 
176 aa  43.5  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0362  hydrogenase maturation protease  27.33 
 
 
176 aa  43.9  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120918 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3173  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  26.14 
 
 
164 aa  43.5  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0700  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  26.14 
 
 
164 aa  43.5  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3279  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  26.14 
 
 
164 aa  43.5  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1414  hydrogenase expression/formation protein  29.2 
 
 
166 aa  43.1  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2131  hydrogenase maturation protease  27.4 
 
 
181 aa  43.1  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.829671 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4161  peptidase M52, hydrogen uptake protein  32.29 
 
 
156 aa  42.4  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0284488  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1819  hydrogenase maturation protease  26.39 
 
 
157 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11780  hydrogenase maturation protease  28.57 
 
 
179 aa  41.2  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0353355 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0014  coenzyme F420-reducing hydrogenase, delta subunit  28.57 
 
 
160 aa  41.2  0.007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0451  coenzyme F420-reducing hydrogenase, delta subunit  25.48 
 
 
159 aa  40.8  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1244  hydrogenase expression/formation protein  28.67 
 
 
165 aa  40.8  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.791163  normal  0.298279 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>