182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2591 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2591  hydrogenase maturation protease  100 
 
 		 149 aa  292  1e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.584226  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1139  hydrogenase maturation protease  48.61 
 
 		 157 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3415  peptidase M52, hydrogen uptake protein  42.47 
 
 		 166 aa  98.6  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.100638  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3478  hydrogenase maturation protease  42.47 
 
 		 166 aa  98.6  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.314685  normal  0.0224154 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1857  hydrogenase maturation protease  47.37 
 
 		 171 aa  96.3  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4495  peptidase M52, hydrogen uptake protein  45.74 
 
 		 177 aa  95.5  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4827  hydrogenase maturation protease  42.96 
 
 		 166 aa  94.7  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0508  hydrogenase maturation protease  41.1 
 
 		 180 aa  94.7  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3432  hydrogenase maturation protease  44.2 
 
 		 191 aa  89.4  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04410  soluble hydrogenase processing peptidase, HoxW  42.07 
 
 		 160 aa  87  8e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2659  hydrogenase maturation protease  34.06 
 
 		 148 aa  85.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.196186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3426  hydrogenase maturation protease  42.74 
 
 		 166 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.141018 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0542  hydrogenase expression/formation protein  33.11 
 
 		 169 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.995345  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1020  hydrogenase maturation protease  38.36 
 
 		 180 aa  73.6  0.0000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00482421 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1859  hydrogenase maturation protease  34.27 
 
 		 194 aa  72  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2740  hydrogenase maturation protease  33.11 
 
 		 164 aa  71.6  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000112894  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0857  hydrogenase maturation protease  31.79 
 
 		 157 aa  70.5  0.000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.685665  normal  0.316463 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_119  Ni/Fe hydrogenase maturation protease  31.51 
 
 		 160 aa  69.3  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0477  peptidase M52, hydrogen uptake protein  38.36 
 
 		 175 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4092  peptidase M52, hydrogen uptake protein  30.61 
 
 		 174 aa  68.6  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0783921  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2053  hydrogenase maturation protease  34.23 
 
 		 152 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52965  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0259  hydrogenase maturation protease  33.11 
 
 		 160 aa  68.2  0.00000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0109  hydrogenase maturation protease  32.19 
 
 		 160 aa  67.4  0.00000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1414  hydrogenase expression/formation protein  30.67 
 
 		 166 aa  67.4  0.00000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0120  hydrogenase maturation protease  36.03 
 
 		 144 aa  67  0.00000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2879  hydrogenase maturation protease  36.67 
 
 		 158 aa  67  0.00000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.980378 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3281  hydrogenase maturation protease  36.67 
 
 		 158 aa  67  0.00000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0975  hydrogenase maturation protease  32.62 
 
 		 167 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0660111  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2131  hydrogenase maturation protease  34.93 
 
 		 181 aa  65.1  0.0000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.829671 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0858  hydrogenase maturation protease  33.33 
 
 		 157 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2530  hydrogenase expression/formation protein  32.67 
 
 		 169 aa  64.7  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.780336  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3969  hydrogenase maturation protease  35.17 
 
 		 156 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000953733 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0148  hydrogenase maturation protease  30.63 
 
 		 161 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2322  hydrogenase expression/formation protein  34 
 
 		 166 aa  63.5  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.659738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3329  peptidase M52, hydrogenase maturation peptidase  32.21 
 
 		 172 aa  63.5  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3804  hydrogenase maturation protease  33.56 
 
 		 157 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3145  hydrogenase expression/formation protein  33.33 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00208925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2125  hydrogenase maturation protease  36.36 
 
 		 156 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.295921  normal  0.0277446 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3881  hydrogenase maturation protease  34.97 
 
 		 156 aa  62  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0051  hydrogenase maturation protease  26.11 
 
 		 166 aa  61.6  0.000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0212564  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3101  hydrogenase expression/formation protein  37.33 
 
 		 222 aa  61.2  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02869  predicted maturation element for hydrogenase 2  31.01 
 
 		 164 aa  60.8  0.000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02818  hypothetical protein  31.01 
 
 		 164 aa  60.8  0.000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3420  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  31.01 
 
 		 164 aa  60.8  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0853  hydrogenase maturation protease  29.56 
 
 		 157 aa  60.5  0.000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0705  hydrogenase maturation protease  29.56 
 
 		 157 aa  60.5  0.000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.862619  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3372  hypothetical protein  35.14 
 
 		 206 aa  60.1  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.288217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3319  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  30.38 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00237916  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2422  hydrogenase maturation protease  36.13 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.873028  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1449  peptidase M52, hydrogen uptake protein  27.14 
 
 		 158 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.230112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3393  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  30.38 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.441153 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3328  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  30.38 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.581349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3494  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  30.38 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.627392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4305  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  30.38 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.227122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3399  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  30.38 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3462  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  30.38 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1153  hydrogenase expression/formation protein  33.33 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.838065  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0703  hydrogenase expression/formation protein  30.38 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2951  hydrogenase expression/formation protein  33.33 
 
 		 170 aa  59.3  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.585714 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3173  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  30.38 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0700  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  30.38 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3279  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  30.38 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1556  hydrogenase maturation protease  37.75 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0380  hydrogenase maturation protease  28.38 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1054  hydrogenase maturation protease  38.16 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.402831 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2103  hydrogenase maturation protease  29.41 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0938724  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0936  hydrogenase maturation protease  38.16 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4241  peptidase M52, hydrogen uptake protein  33.33 
 
 		 182 aa  57.4  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0522  hydrogenase maturation protease  33.33 
 
 		 177 aa  57.4  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2176  hydrogenase expression/formation protein  32.67 
 
 		 208 aa  57  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0123485  normal  0.201269 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0786  hydrogenase maturation protease  27.1 
 
 		 160 aa  57  0.00000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.177407  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2386  hypothetical protein  28.29 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3323  peptidase M52, hydrogen uptake protein  35.37 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0694  hydrogenase maturation protease  30 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1271  peptidase M52, hydrogen uptake protein  32.89 
 
 		 167 aa  55.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.813931  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0362  hydrogenase maturation protease  26.71 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120918 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1999  hydrogenase maturation  33.1 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.116789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2733  hydrogenase maturation protease  29.22 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1819  hydrogenase maturation protease  28.75 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00344  hydrogenase 2 maturation protease  29.63 
 
 		 184 aa  55.1  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1127  hydrogenase maturation protease  30.52 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3135  hydrogenase maturation protease  30.52 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0272  hydrogenase maturation protease  32.45 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.268401 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0472  hydrogenase maturation protease  31.68 
 
 		 173 aa  53.9  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.196333 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1233  hydrogenase maturation protease  31.97 
 
 		 172 aa  53.9  0.0000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.120838  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1947  hydrogenase maturation protease  26.11 
 
 		 166 aa  53.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03840  hydrogenase maturation protease  32.26 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3970  HybD peptidase  31.08 
 
 		 159 aa  52.4  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0499  HyaD peptidase  33.78 
 
 		 206 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2150  hydrogenase expression/formation protein  33.78 
 
 		 206 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.133093  normal  0.20367 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1876  hydrogenase maturation protease  29.05 
 
 		 165 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252899  normal  0.719205 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1650  hydrogenase maturation protease  34.13 
 
 		 161 aa  52.8  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7262  hydrogenase expression/formation protein  33.56 
 
 		 214 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.356245 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2890  peptidase M52, hydrogen uptake protein  34.69 
 
 		 1053 aa  52  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2139  hydrogenase expression/formation protein  31.13 
 
 		 165 aa  52  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1293  HyaD peptidase  29.29 
 
 		 221 aa  51.6  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000175592  normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2012  hydrogenase maturation protease  35 
 
 		 160 aa  51.6  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3760  hydrogenase maturation protease  30.6 
 
 		 158 aa  51.6  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0505  hydrogenase maturation protease  38.1 
 
 		 175 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0510  hydrogenase maturation protease  38.1 
 
 		 175 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>