155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1014 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1014  hydrogenase maturation protease  100 
 
 		 158 aa  312  9.999999999999999e-85  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00768049  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1650  hydrogenase maturation protease  34.06 
 
 		 161 aa  73.2  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2012  hydrogenase maturation protease  32 
 
 		 160 aa  73.2  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3909  hydrogenase maturation protease  33.58 
 
 		 168 aa  72  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0380  hydrogenase maturation protease  37.4 
 
 		 176 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0542  hydrogenase expression/formation protein  31.58 
 
 		 169 aa  67  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.995345  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3329  peptidase M52, hydrogenase maturation peptidase  32.24 
 
 		 172 aa  61.2  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7262  hydrogenase expression/formation protein  27.45 
 
 		 214 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.356245 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2257  hydrogenase maturation protease  30.72 
 
 		 178 aa  60.5  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0975  hydrogenase maturation protease  31.65 
 
 		 167 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0660111  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1971  hydrogenase expression/formation protein  26.99 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.814536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2822  Ni-Fe hydrogenase maturation factor-like protein  26.49 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2131  hydrogenase maturation protease  29.56 
 
 		 181 aa  59.3  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.829671 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1844  hydrogenase expression/formation protein  30.07 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1139  hydrogenase maturation protease  30.99 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0857  hydrogenase maturation protease  27.56 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.685665  normal  0.316463 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1233  hydrogenase maturation protease  28.03 
 
 		 172 aa  57.8  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.120838  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1075  peptidase M52, hydrogen uptake protein  36.54 
 
 		 188 aa  57  0.00000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0439307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2740  hydrogenase maturation protease  28.69 
 
 		 164 aa  57  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000112894  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0477  peptidase M52, hydrogen uptake protein  28.19 
 
 		 175 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2106  hydrogenase maturation protease  21.94 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3372  hypothetical protein  30.52 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.288217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0259  hydrogenase maturation protease  28.66 
 
 		 160 aa  57  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3281  hydrogenase maturation protease  28.95 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2879  hydrogenase maturation protease  28.95 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.980378 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2340  hydrogenase 1 maturation protease  26.11 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.732485  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2890  peptidase M52, hydrogen uptake protein  29.53 
 
 		 1053 aa  55.8  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3406  hydrogenase maturation protease  29.14 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2053  hydrogenase maturation protease  29.41 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52965  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1859  hydrogenase maturation protease  27.67 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0858  hydrogenase maturation protease  29.59 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0173  hydrogenase maturation protease  29.63 
 
 		 170 aa  55.1  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1090  hydrogenase 1 maturation protease  25.48 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0557672  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1590  hydrogenase maturation protease  29.38 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1707  hydrogenase expression/formation protein  26.97 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.460815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0522  hydrogenase maturation protease  30.83 
 
 		 177 aa  54.7  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1414  hydrogenase expression/formation protein  24.84 
 
 		 166 aa  54.3  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1800  hydrogenase expression/formation protein  26.97 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1640  hydrogenase expression/formation protein  26.97 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1900  hydrogenase maturation protease superfamily  24.84 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1648  hydrogenase expression/formation protein  26.97 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0834  hydrogenase maturation protease  31.13 
 
 		 177 aa  53.9  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.850937  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1635  hydrogenase expression/formation protein  26.97 
 
 		 202 aa  53.9  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_119  Ni/Fe hydrogenase maturation protease  26.8 
 
 		 160 aa  53.1  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3947  peptidase M52, hydrogen uptake protein  27.74 
 
 		 153 aa  53.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.974859  normal  0.0407707 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2176  hydrogenase expression/formation protein  29.3 
 
 		 208 aa  53.5  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0123485  normal  0.201269 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02869  predicted maturation element for hydrogenase 2  26.49 
 
 		 164 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0109  hydrogenase maturation protease  29.58 
 
 		 160 aa  53.1  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3319  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  25.66 
 
 		 164 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00237916  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3328  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  25.66 
 
 		 164 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.581349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3367  hydrogenase maturation protease  29.8 
 
 		 157 aa  53.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.239776  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02818  hypothetical protein  26.49 
 
 		 164 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3420  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  26.49 
 
 		 164 aa  52.4  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3399  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  25.66 
 
 		 164 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0703  hydrogenase expression/formation protein  26.49 
 
 		 164 aa  52  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3494  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  26.32 
 
 		 164 aa  52.4  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.627392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3393  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  26.32 
 
 		 164 aa  52.4  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.441153 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3804  hydrogenase maturation protease  35.06 
 
 		 157 aa  52  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3173  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  26.49 
 
 		 164 aa  52  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0700  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  26.49 
 
 		 164 aa  52  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3279  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  26.49 
 
 		 164 aa  52  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0162  hydrogenase expression/formation protein  27.1 
 
 		 201 aa  51.6  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.793155  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2606  hydrogenase maturation protease  28.76 
 
 		 150 aa  52  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0209681  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0916  hydrogenase maturation protease  47.46 
 
 		 170 aa  51.6  0.000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.712591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4305  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  26.49 
 
 		 164 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.227122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1676  hydrogenase expression/formation protein  23.46 
 
 		 185 aa  51.2  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3462  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  26.49 
 
 		 164 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2367  hydrogenase maturation protease  33.12 
 
 		 257 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0307441 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1293  HyaD peptidase  26.95 
 
 		 221 aa  50.4  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000175592  normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2091  hydrogenase expression/formation protein  23.68 
 
 		 187 aa  50.4  0.000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.910871  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0051  hydrogenase maturation protease  27.87 
 
 		 166 aa  50.4  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0212564  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1999  hydrogenase maturation  27.16 
 
 		 195 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.116789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1103  hydrogenase maturation protease  24.68 
 
 		 179 aa  49.7  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0120  hydrogenase maturation protease  29.29 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50560  hydrogenase expression/formation protein, HoxM  25.93 
 
 		 207 aa  49.7  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00480221  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0937  hydrogenase maturation protease HydD  24.03 
 
 		 179 aa  49.3  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.353395  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3885  hydrogenase maturation protease  23.75 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.445128  normal  0.911983 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4495  peptidase M52, hydrogen uptake protein  25.76 
 
 		 177 aa  48.9  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1819  hydrogenase expression/formation protein  23.03 
 
 		 192 aa  48.9  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2158  hydrogenase expression/formation protein  23.03 
 
 		 192 aa  48.9  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.6852  normal  0.309785 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1877  hydrogenase expression/formation protein  23.03 
 
 		 192 aa  48.9  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1762  hydrogenase expression/formation protein  22.88 
 
 		 187 aa  48.5  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1345  hydrogenase 1 maturation protease  26.72 
 
 		 198 aa  48.9  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1318  hydrogenase maturation protease  26.45 
 
 		 157 aa  48.5  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1857  hydrogenase maturation protease  31.11 
 
 		 171 aa  48.5  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3101  hydrogenase expression/formation protein  26.14 
 
 		 222 aa  48.5  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1529  hydrogenase 1 maturation protease  26.72 
 
 		 198 aa  48.1  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.468604  normal  0.329104 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2733  hydrogenase maturation protease  26.62 
 
 		 165 aa  48.1  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3969  hydrogenase maturation protease  30.52 
 
 		 156 aa  48.1  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000953733 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3986  HyaD peptidase  25.95 
 
 		 204 aa  47.8  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1211  hydrogenase 1 maturation protease  29.84 
 
 		 195 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3145  hydrogenase expression/formation protein  26.32 
 
 		 159 aa  47.4  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00208925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1987  hydrogenase 1 maturation protease  28.23 
 
 		 198 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1931  hydrogenase 1 maturation protease  28.23 
 
 		 198 aa  47.4  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1927  hydrogenase 1 maturation protease  28.23 
 
 		 198 aa  47.4  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.822664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2036  peptidase M52, hydrogen uptake protein  28.08 
 
 		 190 aa  47.4  0.00009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1819  hydrogenase maturation protease  27.1 
 
 		 157 aa  47.4  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2669  hydrogenase expression/formation protein  27.42 
 
 		 195 aa  47  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.112067  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2150  hydrogenase expression/formation protein  27.45 
 
 		 206 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.133093  normal  0.20367 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00985  hypothetical protein  27.42 
 
 		 195 aa  47  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112928  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>