81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1297 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1297  hydrogenase maturation protease  100 
 
 		 170 aa  340  5.999999999999999e-93  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.864934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0408  hydrogenase maturation protease  74.7 
 
 		 171 aa  254  4e-67  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.711224  normal  0.0552649 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1579  hydrogenase maturation protease  72.62 
 
 		 169 aa  252  1.0000000000000001e-66  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0196  hydrogenase maturation protease  71.08 
 
 		 171 aa  249  1e-65  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0455702 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0715  Ni/Fe hydrogenase, expression/formation protein  26.53 
 
 		 177 aa  51.2  0.000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.930335  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0162  hydrogenase expression/formation protein  27.63 
 
 		 201 aa  50.8  0.000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.793155  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0589  hydrogenase maturation protease  28.19 
 
 		 182 aa  50.1  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2796  hydrogenase maturation protease  30.87 
 
 		 167 aa  50.1  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0864  hydrogenase maturation protease HydD  26.06 
 
 		 181 aa  48.9  0.00004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0079  hydrogenase maturation protease  30 
 
 		 140 aa  48.1  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.882887  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2176  hydrogenase expression/formation protein  30.89 
 
 		 208 aa  48.1  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0123485  normal  0.201269 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1707  hydrogenase expression/formation protein  28.8 
 
 		 202 aa  47.8  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.460815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2150  hydrogenase expression/formation protein  26.61 
 
 		 206 aa  47.4  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.133093  normal  0.20367 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2340  hydrogenase 1 maturation protease  30.07 
 
 		 195 aa  47  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.732485  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1905  hydrogenase expression/formation protein  24.58 
 
 		 185 aa  47  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0136333 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0499  HyaD peptidase  26.61 
 
 		 206 aa  47.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2131  hydrogenase maturation protease  32.09 
 
 		 181 aa  47  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.829671 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1083  hydrogenase 1 maturation protease  34.78 
 
 		 195 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1090  hydrogenase 1 maturation protease  34.78 
 
 		 195 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0557672  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1640  hydrogenase expression/formation protein  28 
 
 		 202 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1999  hydrogenase maturation  26.58 
 
 		 195 aa  46.2  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.116789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3328  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  28.29 
 
 		 164 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.581349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2621  hydrogenase 1 maturation protease  34.78 
 
 		 195 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00823631 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3399  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  28.29 
 
 		 164 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1648  hydrogenase expression/formation protein  28 
 
 		 202 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1635  hydrogenase expression/formation protein  26.25 
 
 		 202 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0834  hydrogenase maturation protease  32.52 
 
 		 177 aa  46.6  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.850937  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00985  hypothetical protein  34.78 
 
 		 195 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112928  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2669  hydrogenase expression/formation protein  34.78 
 
 		 195 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.112067  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1800  hydrogenase expression/formation protein  28 
 
 		 202 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16559  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00978  HyaD  34.78 
 
 		 195 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.106803  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0937  hydrogenase maturation protease HydD  25.45 
 
 		 179 aa  46.2  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.353395  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3319  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  28.29 
 
 		 164 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00237916  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3372  hypothetical protein  26.4 
 
 		 206 aa  45.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.288217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2026  HyaD peptidase  29.84 
 
 		 208 aa  45.8  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.462165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3494  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  28.29 
 
 		 164 aa  45.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.627392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1211  hydrogenase 1 maturation protease  34.78 
 
 		 195 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3393  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  28.29 
 
 		 164 aa  45.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.441153 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2142  hydrogenase 1 maturation protease  34.78 
 
 		 195 aa  45.4  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.152456  normal  0.47053 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2106  hydrogenase maturation protease  21.23 
 
 		 184 aa  45.1  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2030  hydrogenase expression/formation protein  22.03 
 
 		 185 aa  45.1  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1037  hydrogenase expression/formation protein  26.83 
 
 		 161 aa  44.7  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0456714  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4305  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  28.29 
 
 		 164 aa  44.7  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.227122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1165  hydrogenase expression/formation protein  29.19 
 
 		 203 aa  44.7  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.464172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3462  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  28.29 
 
 		 164 aa  44.7  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1345  hydrogenase 1 maturation protease  33.7 
 
 		 198 aa  44.7  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1987  hydrogenase 1 maturation protease  33.7 
 
 		 198 aa  44.7  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1931  hydrogenase 1 maturation protease  33.7 
 
 		 198 aa  44.3  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02818  hypothetical protein  28.29 
 
 		 164 aa  44.3  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1529  hydrogenase 1 maturation protease  33.7 
 
 		 198 aa  44.3  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.468604  normal  0.329104 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1927  hydrogenase 1 maturation protease  33.7 
 
 		 198 aa  44.3  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.822664  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02869  predicted maturation element for hydrogenase 2  28.29 
 
 		 164 aa  44.3  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2951  hydrogenase expression/formation protein  25.53 
 
 		 170 aa  44.7  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.585714 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3101  hydrogenase expression/formation protein  27.42 
 
 		 222 aa  44.7  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3420  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  28.29 
 
 		 164 aa  44.3  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0916  hydrogenase maturation protease  25.95 
 
 		 170 aa  44.7  0.0007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.712591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3279  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  28.29 
 
 		 164 aa  44.3  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0700  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  28.29 
 
 		 164 aa  44.3  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3173  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  28.29 
 
 		 164 aa  44.3  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0703  hydrogenase expression/formation protein  28.29 
 
 		 164 aa  44.3  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1157  hydrogenase expression/formation protein  27.56 
 
 		 195 aa  44.3  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.486513  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1153  hydrogenase expression/formation protein  28.57 
 
 		 218 aa  42.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.838065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2136  peptidase M52, hydrogen uptake protein  28.14 
 
 		 156 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1293  HyaD peptidase  25.81 
 
 		 221 aa  43.5  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000175592  normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0765  hydrogenase expression/formation protein  27.64 
 
 		 161 aa  42.4  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1676  hydrogenase expression/formation protein  22.78 
 
 		 185 aa  42.4  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0975  hydrogenase maturation protease  26.06 
 
 		 167 aa  42.7  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0660111  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50560  hydrogenase expression/formation protein, HoxM  25.2 
 
 		 207 aa  42.4  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00480221  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1675  HoxW protein  31.58 
 
 		 181 aa  42.4  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.111038  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3819  hydrogenase maturation protease  30.52 
 
 		 167 aa  42  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.704224  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1400  hydrogenase maturation protease HydD  24.55 
 
 		 178 aa  42  0.004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1859  hydrogenase maturation protease  31.01 
 
 		 194 aa  41.6  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2053  hydrogenase maturation protease  30.72 
 
 		 152 aa  41.6  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52965  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2740  hydrogenase maturation protease  23.72 
 
 		 164 aa  41.2  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000112894  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1819  hydrogenase expression/formation protein  21.59 
 
 		 192 aa  41.2  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2158  hydrogenase expression/formation protein  21.59 
 
 		 192 aa  41.2  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.6852  normal  0.309785 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1877  hydrogenase expression/formation protein  21.59 
 
 		 192 aa  41.2  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2096  hydrogenase expression/formation protein  21.35 
 
 		 192 aa  41.2  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0462  hydrogenase maturation protease HydD  23.17 
 
 		 178 aa  41.2  0.007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000346095  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0322  peptidase M52, hydrogen uptake protein  30.82 
 
 		 154 aa  40.8  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0478  hydrogenase maturation protease  32.98 
 
 		 181 aa  40.8  0.01  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>