77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2224 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2224  hydrogenase maturation protease  100 
 
 
165 aa  322  1e-87  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0432  hydrogenase maturation protease HycI  29.88 
 
 
179 aa  95.1  4e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.632928  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0405  HycI peptidase  30.49 
 
 
179 aa  88.6  4e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.187336  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1488  hydrogenase maturation protease HycI  30.82 
 
 
179 aa  88.2  5e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3521  hydrogenase maturation protease  35.46 
 
 
189 aa  85.1  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0694  hydrogenase maturation protease  35.38 
 
 
147 aa  84  9e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0598  hydrogenase maturation protease  33.54 
 
 
201 aa  83.6  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0501  hydrogenase maturation protease HycI  28.21 
 
 
181 aa  78.6  0.00000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.812223  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1351  hydrogenase maturation protease HycI  28.57 
 
 
193 aa  77.4  0.00000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.648284  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2182  hydrogenase 3 maturation protease  30.88 
 
 
158 aa  70.9  0.000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.359585 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2796  hydrogenase maturation protease  32.41 
 
 
167 aa  68.6  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1127  hydrogenase maturation protease  28.57 
 
 
158 aa  67.8  0.00000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0322  peptidase M52, hydrogen uptake protein  32.87 
 
 
154 aa  66.6  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00344  hydrogenase 2 maturation protease  31.01 
 
 
184 aa  60.5  0.000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4566  hydrogenase 3 maturation protease  30.3 
 
 
161 aa  59.7  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01030  hydrogenase 3 maturation protease  31.03 
 
 
172 aa  58.5  0.00000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.184626  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1136  hypothetical protein  28.24 
 
 
147 aa  58.2  0.00000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.999866 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2426  hydrogenase 3 maturation protease  27.74 
 
 
156 aa  56.2  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2728  hydrogenase maturation protease HycI  31.72 
 
 
181 aa  54.7  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3190  hydrogenase 3 maturation protease  24.09 
 
 
151 aa  54.7  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0123  hypothetical protein  37.84 
 
 
154 aa  53.9  0.0000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1870  hydrogenase maturation protease  33.91 
 
 
148 aa  53.1  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1639  hydrogenase maturation protease superfamily  38.79 
 
 
150 aa  52  0.000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00363597  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1139  hydrogenase maturation protease  29.14 
 
 
157 aa  51.2  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3005  hydrogenase 3 maturation protease  24.26 
 
 
156 aa  50.8  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1020  hydrogenase maturation protease  31.33 
 
 
180 aa  50.8  0.000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00482421 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0995  hydrogenase 3 maturation protease  24.26 
 
 
156 aa  50.8  0.000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0451104 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2842  hydrogenase 3 maturation protease  24.26 
 
 
156 aa  50.8  0.000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0786118 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3159  hydrogenase 3 maturation protease  24.26 
 
 
156 aa  50.8  0.000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3968  hydrogenase 3 maturation protease  24.26 
 
 
156 aa  50.8  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02532  hypothetical protein  24.26 
 
 
156 aa  50.8  0.000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0972  hydrogenase maturation protease HycI  24.26 
 
 
156 aa  50.8  0.000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2853  hydrogenase 3 maturation protease  24.26 
 
 
156 aa  50.8  0.000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02567  protease involved in processing C-terminal end of HycE  24.26 
 
 
156 aa  50.8  0.000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0173  hydrogenase maturation protease  27.97 
 
 
170 aa  50.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2997  hydrogenase 3 maturation protease  24.44 
 
 
156 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00982926 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2606  hydrogenase maturation protease  29.73 
 
 
150 aa  49.7  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0209681  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1276  hydrogenase 3 maturation protease  27.82 
 
 
159 aa  49.3  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.482581  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0834  hydrogenase maturation protease  26.49 
 
 
177 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.850937  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2966  hydrogenase 3 maturation protease  24.44 
 
 
156 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3819  hydrogenase maturation protease  31.82 
 
 
167 aa  48.9  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.704224  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0472  hydrogenase maturation protease  32.26 
 
 
173 aa  48.9  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.196333 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3048  hydrogenase 3 maturation protease  24.81 
 
 
156 aa  48.9  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.171447 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3155  hydrogenase 3 maturation protease  24.81 
 
 
156 aa  48.9  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.120666 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2822  Ni-Fe hydrogenase maturation factor-like protein  26.28 
 
 
224 aa  48.9  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3804  hydrogenase maturation protease  30.07 
 
 
157 aa  48.5  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2717  hydrogenase 3 maturation protease  25.19 
 
 
165 aa  48.5  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.391136  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0477  peptidase M52, hydrogen uptake protein  31.13 
 
 
175 aa  47.8  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3032  hydrogenase 3 maturation protease  23.85 
 
 
156 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.228313  hitchhiker  0.0000962819 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0148  hydrogenase maturation protease  29.87 
 
 
161 aa  47  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0014  coenzyme F420-reducing hydrogenase, delta subunit  29.17 
 
 
160 aa  47  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1233  hydrogenase maturation protease  25.48 
 
 
172 aa  47  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.120838  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1271  peptidase M52, hydrogen uptake protein  27.78 
 
 
167 aa  47  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.813931  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0715  hydrogenase maturation protease superfamily  32.76 
 
 
148 aa  45.4  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0859564  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0522  hydrogenase maturation protease  28.03 
 
 
177 aa  45.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2740  hydrogenase maturation protease  25.34 
 
 
164 aa  45.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000112894  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0510  hydrogenase maturation protease  31.3 
 
 
175 aa  45.4  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0505  hydrogenase maturation protease  31.3 
 
 
175 aa  45.4  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4241  peptidase M52, hydrogen uptake protein  29.41 
 
 
182 aa  44.7  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1293  HyaD peptidase  25.49 
 
 
221 aa  43.9  0.0009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000175592  normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04410  soluble hydrogenase processing peptidase, HoxW  32.24 
 
 
160 aa  43.5  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3135  hydrogenase maturation protease  24.84 
 
 
159 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3225  hydrogenase maturation protease  30.07 
 
 
271 aa  43.5  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.679402  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2103  hydrogenase maturation protease  31.58 
 
 
159 aa  43.5  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0938724  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1127  hydrogenase maturation protease  24.2 
 
 
159 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3970  HybD peptidase  25.69 
 
 
159 aa  43.1  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2125  hydrogenase maturation protease  31.3 
 
 
156 aa  42.4  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.295921  normal  0.0277446 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1508  hydrogenase maturation protease  33.56 
 
 
163 aa  42.4  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.263436  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0269  hydrogenase expression/formation protein  26.81 
 
 
168 aa  42.4  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0820491 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1072  hydrogenase maturation protease  26.03 
 
 
154 aa  42.4  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00076364  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08060  hydrogenase maturation protease  28.48 
 
 
176 aa  41.6  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1947  hydrogenase maturation protease  26.45 
 
 
166 aa  41.6  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0542  hydrogenase expression/formation protein  30.67 
 
 
169 aa  41.2  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.995345  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2012  hydrogenase maturation protease  38.54 
 
 
160 aa  41.2  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03840  hydrogenase maturation protease  28.91 
 
 
137 aa  41.2  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1857  hydrogenase maturation protease  30.34 
 
 
171 aa  40.8  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3947  peptidase M52, hydrogen uptake protein  25.71 
 
 
153 aa  40.8  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.974859  normal  0.0407707 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>