140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0501 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_0501  hydrogenase maturation protease HycI  100 
 
 
181 aa  350  4e-96  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.812223  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0432  hydrogenase maturation protease HycI  72.07 
 
 
179 aa  270  1e-71  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.632928  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0405  HycI peptidase  74.3 
 
 
179 aa  256  1e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.187336  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1488  hydrogenase maturation protease HycI  72.63 
 
 
179 aa  256  1e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1351  hydrogenase maturation protease HycI  48.26 
 
 
193 aa  161  4.0000000000000004e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.648284  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0694  hydrogenase maturation protease  41.1 
 
 
147 aa  105  5e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1136  hypothetical protein  35.71 
 
 
147 aa  92.8  2e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.999866 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2224  hydrogenase maturation protease  28.21 
 
 
165 aa  84.7  6e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0322  peptidase M52, hydrogen uptake protein  28.3 
 
 
154 aa  84.7  7e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3521  hydrogenase maturation protease  32.43 
 
 
189 aa  83.2  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1127  hydrogenase maturation protease  30.64 
 
 
158 aa  81.3  0.000000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0598  hydrogenase maturation protease  30.5 
 
 
201 aa  79  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2728  hydrogenase maturation protease HycI  33.1 
 
 
181 aa  77.8  0.00000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2796  hydrogenase maturation protease  26.95 
 
 
167 aa  75.1  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4566  hydrogenase 3 maturation protease  29.85 
 
 
161 aa  72.4  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2717  hydrogenase 3 maturation protease  28.12 
 
 
165 aa  72  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.391136  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2139  hydrogenase expression/formation protein  27.22 
 
 
165 aa  69.3  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3190  hydrogenase 3 maturation protease  28.67 
 
 
151 aa  68.6  0.00000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1276  hydrogenase 3 maturation protease  26.25 
 
 
159 aa  65.9  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.482581  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2182  hydrogenase 3 maturation protease  26.85 
 
 
158 aa  65.5  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.359585 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3032  hydrogenase 3 maturation protease  27.08 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.228313  hitchhiker  0.0000962819 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3155  hydrogenase 3 maturation protease  26.39 
 
 
156 aa  63.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.120666 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3048  hydrogenase 3 maturation protease  26.39 
 
 
156 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.171447 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02567  protease involved in processing C-terminal end of HycE  27.08 
 
 
156 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0972  hydrogenase maturation protease HycI  27.08 
 
 
156 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2853  hydrogenase 3 maturation protease  27.08 
 
 
156 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3005  hydrogenase 3 maturation protease  27.08 
 
 
156 aa  62.4  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0995  hydrogenase 3 maturation protease  27.08 
 
 
156 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0451104 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2842  hydrogenase 3 maturation protease  27.08 
 
 
156 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0786118 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02532  hypothetical protein  27.08 
 
 
156 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3159  hydrogenase 3 maturation protease  27.08 
 
 
156 aa  62.8  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2966  hydrogenase 3 maturation protease  25.69 
 
 
156 aa  62.8  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3968  hydrogenase 3 maturation protease  27.08 
 
 
156 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2997  hydrogenase 3 maturation protease  25.69 
 
 
156 aa  62.4  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00982926 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0542  hydrogenase expression/formation protein  24.24 
 
 
169 aa  61.2  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.995345  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00344  hydrogenase 2 maturation protease  26.85 
 
 
184 aa  61.2  0.000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1293  HyaD peptidase  24.86 
 
 
221 aa  61.2  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000175592  normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2426  hydrogenase 3 maturation protease  24.5 
 
 
156 aa  60.5  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3769  hydrogenase expression/formation protein  26.04 
 
 
209 aa  58.9  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.645157  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3970  HybD peptidase  25.15 
 
 
159 aa  58.5  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1999  hydrogenase maturation  24.53 
 
 
195 aa  54.7  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.116789  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1971  hydrogenase expression/formation protein  26.9 
 
 
223 aa  53.9  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.814536  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0380  hydrogenase maturation protease  23.95 
 
 
176 aa  53.5  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1380  peptidase M52, hydrogen uptake protein  26.39 
 
 
156 aa  52.4  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0298181  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1345  hydrogenase 1 maturation protease  27.22 
 
 
198 aa  52.8  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1529  hydrogenase 1 maturation protease  27.22 
 
 
198 aa  52  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.468604  normal  0.329104 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50560  hydrogenase expression/formation protein, HoxM  25.95 
 
 
207 aa  51.6  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00480221  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2142  hydrogenase 1 maturation protease  24.03 
 
 
195 aa  52  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.152456  normal  0.47053 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2340  hydrogenase 1 maturation protease  22.49 
 
 
195 aa  52  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.732485  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1157  hydrogenase expression/formation protein  24.84 
 
 
195 aa  52  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.486513  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01030  hydrogenase 3 maturation protease  24.75 
 
 
172 aa  51.6  0.000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.184626  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2822  Ni-Fe hydrogenase maturation factor-like protein  23.72 
 
 
224 aa  51.6  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1090  hydrogenase 1 maturation protease  21.89 
 
 
195 aa  51.2  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0557672  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1211  hydrogenase 1 maturation protease  24.03 
 
 
195 aa  51.2  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3101  hydrogenase expression/formation protein  22.73 
 
 
222 aa  51.2  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7262  hydrogenase expression/formation protein  22.78 
 
 
214 aa  51.2  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.356245 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0451  coenzyme F420-reducing hydrogenase, delta subunit  29.92 
 
 
159 aa  50.8  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0173  hydrogenase maturation protease  23.49 
 
 
170 aa  50.8  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1987  hydrogenase 1 maturation protease  27.22 
 
 
198 aa  50.8  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00978  HyaD  24.03 
 
 
195 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.106803  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2669  hydrogenase expression/formation protein  24.03 
 
 
195 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.112067  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00985  hypothetical protein  24.03 
 
 
195 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112928  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1020  hydrogenase maturation protease  22.41 
 
 
180 aa  50.4  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00482421 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1083  hydrogenase 1 maturation protease  24.03 
 
 
195 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2621  hydrogenase 1 maturation protease  24.03 
 
 
195 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00823631 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1927  hydrogenase 1 maturation protease  27.22 
 
 
198 aa  50.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.822664  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1931  hydrogenase 1 maturation protease  27.22 
 
 
198 aa  50.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2220  hydrogenase maturation protease  24.82 
 
 
170 aa  49.7  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.861671  normal  0.717829 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1508  hydrogenase maturation protease  23.26 
 
 
163 aa  50.1  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.263436  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1072  hydrogenase maturation protease  25.66 
 
 
154 aa  49.7  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00076364  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0362  hydrogenase maturation protease  22.62 
 
 
176 aa  50.1  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120918 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3819  hydrogenase maturation protease  24.38 
 
 
167 aa  49.7  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.704224  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2322  hydrogenase expression/formation protein  22.81 
 
 
166 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.659738  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0267  hydrogenase expression/formation protein  22.56 
 
 
165 aa  49.7  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.312911  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1244  hydrogenase expression/formation protein  23.67 
 
 
165 aa  49.3  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.791163  normal  0.298279 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0269  hydrogenase expression/formation protein  25 
 
 
168 aa  49.7  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0820491 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2176  hydrogenase expression/formation protein  23.45 
 
 
208 aa  49.3  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0123485  normal  0.201269 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3145  hydrogenase expression/formation protein  22.29 
 
 
159 aa  49.7  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00208925  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1165  hydrogenase expression/formation protein  24.65 
 
 
203 aa  48.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.464172  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2951  hydrogenase expression/formation protein  30.49 
 
 
170 aa  48.5  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.585714 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1414  hydrogenase expression/formation protein  22.22 
 
 
166 aa  48.5  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1233  hydrogenase maturation protease  25.14 
 
 
172 aa  48.1  0.00007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.120838  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2733  hydrogenase maturation protease  22.29 
 
 
165 aa  48.1  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1271  peptidase M52, hydrogen uptake protein  23.65 
 
 
167 aa  47.8  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.813931  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3329  peptidase M52, hydrogenase maturation peptidase  21.6 
 
 
172 aa  47.8  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0272  hydrogenase maturation protease  25.6 
 
 
159 aa  47  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.268401 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2026  HyaD peptidase  21.74 
 
 
208 aa  47  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.462165  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0148  hydrogenase maturation protease  25.3 
 
 
161 aa  47.4  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2053  hydrogenase maturation protease  24.26 
 
 
152 aa  47.8  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52965  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0786  hydrogenase maturation protease  23.35 
 
 
160 aa  46.6  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.177407  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1037  hydrogenase expression/formation protein  24.82 
 
 
161 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0456714  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3530  hydrogenase maturation protease  24.44 
 
 
164 aa  45.8  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224586  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1139  hydrogenase maturation protease  22.56 
 
 
157 aa  45.8  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3986  HyaD peptidase  21.88 
 
 
204 aa  45.1  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1044  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  24.32 
 
 
182 aa  45.1  0.0005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3372  hypothetical protein  22.99 
 
 
206 aa  45.1  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.288217  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0109  hydrogenase maturation protease  25.15 
 
 
160 aa  44.7  0.0008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2331  peptidase M52, hydrogenase maturation peptidase  30.83 
 
 
183 aa  44.7  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0335  hydrogenase expression/formation protein  25 
 
 
191 aa  44.7  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00352637  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0857  hydrogenase maturation protease  22.6 
 
 
157 aa  44.3  0.0008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.685665  normal  0.316463 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>