131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1488 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1488  hydrogenase maturation protease HycI  100 
 
 		 179 aa  352  1e-96  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0432  hydrogenase maturation protease HycI  89.39 
 
 		 179 aa  325  3e-88  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.632928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0405  HycI peptidase  92.74 
 
 		 179 aa  310  1e-83  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.187336  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0501  hydrogenase maturation protease HycI  72.63 
 
 		 181 aa  256  2e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.812223  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1351  hydrogenase maturation protease HycI  53.67 
 
 		 193 aa  186  1e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.648284  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0694  hydrogenase maturation protease  40.69 
 
 		 147 aa  104  6e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1136  hypothetical protein  34.39 
 
 		 147 aa  95.1  4e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.999866 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2224  hydrogenase maturation protease  30.82 
 
 		 165 aa  94.7  6e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3521  hydrogenase maturation protease  31.14 
 
 		 189 aa  89.7  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0598  hydrogenase maturation protease  29.83 
 
 		 201 aa  83.6  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1127  hydrogenase maturation protease  30.95 
 
 		 158 aa  83.2  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0322  peptidase M52, hydrogen uptake protein  28.85 
 
 		 154 aa  81.6  0.000000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2728  hydrogenase maturation protease HycI  33.11 
 
 		 181 aa  80.1  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2796  hydrogenase maturation protease  27.11 
 
 		 167 aa  75.1  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4566  hydrogenase 3 maturation protease  28.03 
 
 		 161 aa  72.4  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2182  hydrogenase 3 maturation protease  27.22 
 
 		 158 aa  67  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.359585 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00344  hydrogenase 2 maturation protease  28.48 
 
 		 184 aa  66.2  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2717  hydrogenase 3 maturation protease  26.32 
 
 		 165 aa  65.9  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.391136  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1276  hydrogenase 3 maturation protease  25 
 
 		 159 aa  63.5  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.482581  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3190  hydrogenase 3 maturation protease  26.97 
 
 		 151 aa  63.5  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3032  hydrogenase 3 maturation protease  28.17 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.228313  hitchhiker  0.0000962819 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3769  hydrogenase expression/formation protein  28.1 
 
 		 209 aa  60.8  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.645157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3048  hydrogenase 3 maturation protease  27.46 
 
 		 156 aa  60.8  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.171447 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3155  hydrogenase 3 maturation protease  27.46 
 
 		 156 aa  60.8  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.120666 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2966  hydrogenase 3 maturation protease  25.66 
 
 		 156 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02567  protease involved in processing C-terminal end of HycE  26.32 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0972  hydrogenase maturation protease HycI  26.32 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02532  hypothetical protein  26.32 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2139  hydrogenase expression/formation protein  26.79 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3968  hydrogenase 3 maturation protease  26.32 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2853  hydrogenase 3 maturation protease  26.32 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3005  hydrogenase 3 maturation protease  26.32 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0995  hydrogenase 3 maturation protease  26.32 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0451104 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2842  hydrogenase 3 maturation protease  26.32 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0786118 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3159  hydrogenase 3 maturation protease  26.32 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2997  hydrogenase 3 maturation protease  25 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00982926 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3970  HybD peptidase  26.38 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1999  hydrogenase maturation  27.45 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.116789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1157  hydrogenase expression/formation protein  28.57 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.486513  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1293  HyaD peptidase  23.7 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000175592  normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01030  hydrogenase 3 maturation protease  20.38 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.184626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0542  hydrogenase expression/formation protein  24.24 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.995345  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50560  hydrogenase expression/formation protein, HoxM  27.65 
 
 		 207 aa  54.3  0.0000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00480221  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2951  hydrogenase expression/formation protein  29.09 
 
 		 170 aa  52.8  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.585714 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1508  hydrogenase maturation protease  21.23 
 
 		 163 aa  53.5  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.263436  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2426  hydrogenase 3 maturation protease  23.03 
 
 		 156 aa  53.5  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2142  hydrogenase 1 maturation protease  25.32 
 
 		 195 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.152456  normal  0.47053 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0148  hydrogenase maturation protease  27.11 
 
 		 161 aa  53.1  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1211  hydrogenase 1 maturation protease  25.32 
 
 		 195 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2340  hydrogenase 1 maturation protease  25.32 
 
 		 195 aa  52.8  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.732485  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00978  HyaD  25.32 
 
 		 195 aa  52  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.106803  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2669  hydrogenase expression/formation protein  25.32 
 
 		 195 aa  52  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.112067  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0269  hydrogenase expression/formation protein  26.79 
 
 		 168 aa  52  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0820491 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00985  hypothetical protein  25.32 
 
 		 195 aa  52  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112928  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1083  hydrogenase 1 maturation protease  25.32 
 
 		 195 aa  52  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2621  hydrogenase 1 maturation protease  25.32 
 
 		 195 aa  52  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00823631 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0173  hydrogenase maturation protease  25.32 
 
 		 170 aa  51.6  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2822  Ni-Fe hydrogenase maturation factor-like protein  25 
 
 		 224 aa  51.2  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1090  hydrogenase 1 maturation protease  25.32 
 
 		 195 aa  51.2  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0557672  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0267  hydrogenase expression/formation protein  26.04 
 
 		 165 aa  50.4  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.312911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1271  peptidase M52, hydrogen uptake protein  25 
 
 		 167 aa  50.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.813931  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1414  hydrogenase expression/formation protein  27.16 
 
 		 166 aa  50.4  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7262  hydrogenase expression/formation protein  26.97 
 
 		 214 aa  49.7  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.356245 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1244  hydrogenase expression/formation protein  28.47 
 
 		 165 aa  49.3  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.791163  normal  0.298279 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1345  hydrogenase 1 maturation protease  22.44 
 
 		 198 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2053  hydrogenase maturation protease  23.36 
 
 		 152 aa  48.9  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52965  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1529  hydrogenase 1 maturation protease  23.33 
 
 		 198 aa  48.9  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.468604  normal  0.329104 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3819  hydrogenase maturation protease  26.88 
 
 		 167 aa  48.5  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.704224  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1971  hydrogenase expression/formation protein  27.33 
 
 		 223 aa  48.1  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.814536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0857  hydrogenase maturation protease  25.69 
 
 		 157 aa  48.1  0.00006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.685665  normal  0.316463 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4597  hydrogenase maturation protease  22.89 
 
 		 187 aa  48.1  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3101  hydrogenase expression/formation protein  25.18 
 
 		 222 aa  48.1  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1153  hydrogenase expression/formation protein  23.35 
 
 		 218 aa  48.1  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.838065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1987  hydrogenase 1 maturation protease  22.44 
 
 		 198 aa  47.8  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1927  hydrogenase 1 maturation protease  23.33 
 
 		 198 aa  47.8  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.822664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1931  hydrogenase 1 maturation protease  23.33 
 
 		 198 aa  47.8  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0335  hydrogenase expression/formation protein  25.32 
 
 		 191 aa  47.4  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00352637  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0380  hydrogenase maturation protease  22.02 
 
 		 176 aa  47.4  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1380  peptidase M52, hydrogen uptake protein  25 
 
 		 156 aa  46.6  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0298181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3367  hydrogenase maturation protease  24.55 
 
 		 157 aa  46.6  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.239776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2026  HyaD peptidase  22.58 
 
 		 208 aa  46.2  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.462165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2740  hydrogenase maturation protease  26.35 
 
 		 164 aa  46.6  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000112894  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1072  hydrogenase maturation protease  29.59 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00076364  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1165  hydrogenase expression/formation protein  22.93 
 
 		 203 aa  45.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.464172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1139  hydrogenase maturation protease  23.12 
 
 		 157 aa  45.8  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1707  hydrogenase expression/formation protein  22.22 
 
 		 202 aa  45.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.460815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1233  hydrogenase maturation protease  26.32 
 
 		 172 aa  46.2  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.120838  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3986  HyaD peptidase  24.22 
 
 		 204 aa  45.4  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1044  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  27.82 
 
 		 182 aa  45.4  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2176  hydrogenase expression/formation protein  24.55 
 
 		 208 aa  45.4  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0123485  normal  0.201269 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1648  hydrogenase expression/formation protein  22.22 
 
 		 202 aa  45.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1640  hydrogenase expression/formation protein  22.22 
 
 		 202 aa  45.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1635  hydrogenase expression/formation protein  22.22 
 
 		 202 aa  45.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1800  hydrogenase expression/formation protein  22.22 
 
 		 202 aa  45.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3804  hydrogenase maturation protease  21.43 
 
 		 157 aa  45.4  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0259  hydrogenase maturation protease  26.06 
 
 		 160 aa  44.7  0.0006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1905  hydrogenase expression/formation protein  27.86 
 
 		 185 aa  44.7  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0136333 
 
 
-
 
NC_002936  DET0109  hydrogenase maturation protease  25.45 
 
 		 160 aa  44.3  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1020  hydrogenase maturation protease  20.48 
 
 		 180 aa  43.9  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00482421 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2322  hydrogenase expression/formation protein  22.22 
 
 		 166 aa  43.9  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.659738  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>