67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A3048 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A3048  hydrogenase 3 maturation protease  100 
 
 		 156 aa  317  6e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.171447 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3155  hydrogenase 3 maturation protease  99.36 
 
 		 156 aa  315  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.120666 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3032  hydrogenase 3 maturation protease  98.72 
 
 		 156 aa  313  5e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.228313  hitchhiker  0.0000962819 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2966  hydrogenase 3 maturation protease  98.08 
 
 		 156 aa  313  6e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2997  hydrogenase 3 maturation protease  97.44 
 
 		 156 aa  312  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00982926 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0972  hydrogenase maturation protease HycI  92.26 
 
 		 156 aa  292  1e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2853  hydrogenase 3 maturation protease  92.26 
 
 		 156 aa  292  1e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3005  hydrogenase 3 maturation protease  94.04 
 
 		 156 aa  292  1e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0995  hydrogenase 3 maturation protease  92.26 
 
 		 156 aa  292  1e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0451104 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2842  hydrogenase 3 maturation protease  92.26 
 
 		 156 aa  292  1e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0786118 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3159  hydrogenase 3 maturation protease  92.26 
 
 		 156 aa  292  1e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3968  hydrogenase 3 maturation protease  92.26 
 
 		 156 aa  292  1e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02532  hypothetical protein  92.26 
 
 		 156 aa  292  1e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02567  protease involved in processing C-terminal end of HycE  92.26 
 
 		 156 aa  292  1e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3190  hydrogenase 3 maturation protease  82.12 
 
 		 151 aa  266  8e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2426  hydrogenase 3 maturation protease  66.89 
 
 		 156 aa  216  1e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1276  hydrogenase 3 maturation protease  63.33 
 
 		 159 aa  202  1e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.482581  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2717  hydrogenase 3 maturation protease  60.26 
 
 		 165 aa  201  4e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.391136  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4566  hydrogenase 3 maturation protease  50.36 
 
 		 161 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2182  hydrogenase 3 maturation protease  47.52 
 
 		 158 aa  139  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.359585 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01030  hydrogenase 3 maturation protease  40.58 
 
 		 172 aa  123  1e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.184626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1136  hypothetical protein  41.67 
 
 		 147 aa  92  3e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.999866 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2728  hydrogenase maturation protease HycI  43.08 
 
 		 181 aa  85.9  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0694  hydrogenase maturation protease  35.16 
 
 		 147 aa  84  6e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1870  hydrogenase maturation protease  35.42 
 
 		 148 aa  79.7  0.00000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1127  hydrogenase maturation protease  34.97 
 
 		 158 aa  78.6  0.00000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0322  peptidase M52, hydrogen uptake protein  35.43 
 
 		 154 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1639  hydrogenase maturation protease superfamily  30.28 
 
 		 150 aa  75.1  0.0000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00363597  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0598  hydrogenase maturation protease  35.17 
 
 		 201 aa  73.9  0.0000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0123  hypothetical protein  29.37 
 
 		 154 aa  70.1  0.00000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0715  hydrogenase maturation protease superfamily  28.87 
 
 		 148 aa  68.2  0.00000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0859564  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3521  hydrogenase maturation protease  31.97 
 
 		 189 aa  68.2  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0432  hydrogenase maturation protease HycI  26.39 
 
 		 179 aa  63.5  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.632928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1351  hydrogenase maturation protease HycI  26.67 
 
 		 193 aa  61.2  0.000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.648284  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0405  HycI peptidase  26.39 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.187336  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1290  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  31.85 
 
 		 174 aa  56.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.673562  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1488  hydrogenase maturation protease HycI  27.46 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0693  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  28.03 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.845339  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0501  hydrogenase maturation protease HycI  26.39 
 
 		 181 aa  55.5  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.812223  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0628  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  31.85 
 
 		 174 aa  54.3  0.0000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.836359 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2796  hydrogenase maturation protease  26.95 
 
 		 167 aa  53.9  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2175  hydrogenase maturation protease  28.68 
 
 		 186 aa  53.9  0.0000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0195  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  31.21 
 
 		 174 aa  53.9  0.0000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2331  peptidase M52, hydrogenase maturation peptidase  30.2 
 
 		 183 aa  51.6  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1508  hydrogenase maturation protease  29.46 
 
 		 163 aa  50.8  0.000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.263436  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2224  hydrogenase maturation protease  24.81 
 
 		 165 aa  48.9  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0648  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  29.27 
 
 		 166 aa  45.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0616  hydrogenase maturation protease  25.64 
 
 		 167 aa  45.4  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1293  HyaD peptidase  28.39 
 
 		 221 aa  45.1  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000175592  normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2220  hydrogenase maturation protease  28.67 
 
 		 170 aa  44.3  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.861671  normal  0.717829 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2606  hydrogenase maturation protease  27.07 
 
 		 150 aa  43.9  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0209681  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0109  hydrogenase maturation protease  28.08 
 
 		 160 aa  43.1  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0834  hydrogenase maturation protease  36.11 
 
 		 177 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.850937  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0173  hydrogenase maturation protease  25.71 
 
 		 170 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0085  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  26.12 
 
 		 181 aa  42.7  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0501687  normal  0.0549727 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0589  hydrogenase maturation protease  26.23 
 
 		 167 aa  43.1  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00428951  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_119  Ni/Fe hydrogenase maturation protease  28.19 
 
 		 160 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_554  hydrogenase maturation protease  26.83 
 
 		 167 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0259  hydrogenase maturation protease  28.19 
 
 		 160 aa  43.1  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1044  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  25.16 
 
 		 182 aa  42  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2257  hydrogenase maturation protease  24.34 
 
 		 178 aa  42.4  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1347  hydrogenase maturation protease  28.16 
 
 		 153 aa  41.6  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0451  coenzyme F420-reducing hydrogenase, delta subunit  25.69 
 
 		 159 aa  41.6  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3769  hydrogenase expression/formation protein  24.46 
 
 		 209 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.645157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2822  Ni-Fe hydrogenase maturation factor-like protein  27.85 
 
 		 224 aa  41.6  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1971  hydrogenase expression/formation protein  26.28 
 
 		 223 aa  40.8  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.814536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1165  hydrogenase expression/formation protein  25 
 
 		 203 aa  40.4  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.464172  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>