80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_3190 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_3190  hydrogenase 3 maturation protease  100 
 
 
151 aa  306  5e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0972  hydrogenase maturation protease HycI  82.78 
 
 
156 aa  268  2e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02532  hypothetical protein  82.78 
 
 
156 aa  268  2e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3968  hydrogenase 3 maturation protease  82.78 
 
 
156 aa  268  2e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3159  hydrogenase 3 maturation protease  82.78 
 
 
156 aa  268  2e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2842  hydrogenase 3 maturation protease  82.78 
 
 
156 aa  268  2e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0786118 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0995  hydrogenase 3 maturation protease  82.78 
 
 
156 aa  268  2e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0451104 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3005  hydrogenase 3 maturation protease  82.78 
 
 
156 aa  268  2e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2853  hydrogenase 3 maturation protease  82.78 
 
 
156 aa  268  2e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02567  protease involved in processing C-terminal end of HycE  82.78 
 
 
156 aa  268  2e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2997  hydrogenase 3 maturation protease  83.44 
 
 
156 aa  268  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00982926 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3155  hydrogenase 3 maturation protease  82.12 
 
 
156 aa  266  5.9999999999999995e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.120666 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2966  hydrogenase 3 maturation protease  82.78 
 
 
156 aa  266  7e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3048  hydrogenase 3 maturation protease  82.12 
 
 
156 aa  266  7e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.171447 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3032  hydrogenase 3 maturation protease  81.46 
 
 
156 aa  265  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.228313  hitchhiker  0.0000962819 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2426  hydrogenase 3 maturation protease  60.26 
 
 
156 aa  202  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2717  hydrogenase 3 maturation protease  55.63 
 
 
165 aa  189  1e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.391136  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1276  hydrogenase 3 maturation protease  55.7 
 
 
159 aa  180  6e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.482581  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4566  hydrogenase 3 maturation protease  50.36 
 
 
161 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2182  hydrogenase 3 maturation protease  46.9 
 
 
158 aa  141  3e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.359585 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01030  hydrogenase 3 maturation protease  42.45 
 
 
172 aa  127  5.0000000000000004e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.184626  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2728  hydrogenase maturation protease HycI  39.86 
 
 
181 aa  88.2  4e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1136  hypothetical protein  39.85 
 
 
147 aa  87.8  4e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.999866 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0694  hydrogenase maturation protease  35.16 
 
 
147 aa  86.3  1e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0322  peptidase M52, hydrogen uptake protein  36.22 
 
 
154 aa  77  0.00000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1870  hydrogenase maturation protease  36.84 
 
 
148 aa  76.3  0.0000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1639  hydrogenase maturation protease superfamily  30.56 
 
 
150 aa  74.3  0.0000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00363597  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0598  hydrogenase maturation protease  35.51 
 
 
201 aa  72.8  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1127  hydrogenase maturation protease  31.06 
 
 
158 aa  67.8  0.00000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3521  hydrogenase maturation protease  31.08 
 
 
189 aa  67.8  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0123  hypothetical protein  27.78 
 
 
154 aa  67  0.00000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0715  hydrogenase maturation protease superfamily  27.78 
 
 
148 aa  66.6  0.0000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0859564  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0432  hydrogenase maturation protease HycI  27.63 
 
 
179 aa  66.2  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.632928  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0501  hydrogenase maturation protease HycI  28.67 
 
 
181 aa  59.7  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.812223  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1351  hydrogenase maturation protease HycI  26.43 
 
 
193 aa  58.9  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.648284  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0405  HycI peptidase  26.97 
 
 
179 aa  58.9  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.187336  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1488  hydrogenase maturation protease HycI  26.97 
 
 
179 aa  58.2  0.00000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2224  hydrogenase maturation protease  24.09 
 
 
165 aa  54.7  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2796  hydrogenase maturation protease  26.06 
 
 
167 aa  54.7  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0693  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  25.62 
 
 
171 aa  51.6  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.845339  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1290  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  27.1 
 
 
174 aa  50.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.673562  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1508  hydrogenase maturation protease  33.64 
 
 
163 aa  48.9  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.263436  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0616  hydrogenase maturation protease  28.03 
 
 
167 aa  48.5  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0648  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  29.73 
 
 
166 aa  48.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2606  hydrogenase maturation protease  28.37 
 
 
150 aa  48.1  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0209681  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0628  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  28.39 
 
 
174 aa  47.8  0.00006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.836359 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0834  hydrogenase maturation protease  26.09 
 
 
177 aa  47.4  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.850937  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1293  HyaD peptidase  30.07 
 
 
221 aa  47  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000175592  normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0195  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  26.45 
 
 
174 aa  47  0.00009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2175  hydrogenase maturation protease  27.21 
 
 
186 aa  46.6  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2740  hydrogenase maturation protease  27.27 
 
 
164 aa  45.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000112894  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3329  peptidase M52, hydrogenase maturation peptidase  30.63 
 
 
172 aa  45.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0589  hydrogenase maturation protease  26.28 
 
 
167 aa  45.1  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00428951  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1999  hydrogenase maturation  26.97 
 
 
195 aa  44.7  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.116789  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_554  hydrogenase maturation protease  29.27 
 
 
167 aa  44.3  0.0005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2331  peptidase M52, hydrogenase maturation peptidase  28.46 
 
 
183 aa  44.3  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0259  hydrogenase maturation protease  28.86 
 
 
160 aa  43.9  0.0007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0109  hydrogenase maturation protease  29.29 
 
 
160 aa  43.9  0.0008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3769  hydrogenase expression/formation protein  28.06 
 
 
209 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.645157  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_119  Ni/Fe hydrogenase maturation protease  28.19 
 
 
160 aa  43.5  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0173  hydrogenase maturation protease  27.81 
 
 
170 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2053  hydrogenase maturation protease  27.52 
 
 
152 aa  43.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52965  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1635  hydrogenase expression/formation protein  25.66 
 
 
202 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2257  hydrogenase maturation protease  24.34 
 
 
178 aa  42.4  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2822  Ni-Fe hydrogenase maturation factor-like protein  29.38 
 
 
224 aa  42.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3804  hydrogenase maturation protease  30.52 
 
 
157 aa  42.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1075  peptidase M52, hydrogen uptake protein  30.56 
 
 
188 aa  42.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0439307  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1648  hydrogenase expression/formation protein  25.66 
 
 
202 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1640  hydrogenase expression/formation protein  25.66 
 
 
202 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1800  hydrogenase expression/formation protein  25.66 
 
 
202 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16559  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1707  hydrogenase expression/formation protein  25.66 
 
 
202 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.460815  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3101  hydrogenase expression/formation protein  25.66 
 
 
222 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3225  hydrogenase maturation protease  31.03 
 
 
271 aa  41.6  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.679402  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3281  hydrogenase maturation protease  24.84 
 
 
158 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2879  hydrogenase maturation protease  24.84 
 
 
158 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.980378 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3530  hydrogenase maturation protease  26.06 
 
 
164 aa  41.2  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224586  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2367  hydrogenase maturation protease  29.86 
 
 
257 aa  40.8  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0307441 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0085  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  26.71 
 
 
181 aa  40.8  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0501687  normal  0.0549727 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4241  peptidase M52, hydrogen uptake protein  37.93 
 
 
182 aa  40.4  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00344  hydrogenase 2 maturation protease  25.17 
 
 
184 aa  40.4  0.01  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>