62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3521 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_3521  hydrogenase maturation protease  100 
 
 		 189 aa  382  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0598  hydrogenase maturation protease  56.02 
 
 		 201 aa  184  9e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1351  hydrogenase maturation protease HycI  35.14 
 
 		 193 aa  93.6  2e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.648284  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0694  hydrogenase maturation protease  37.5 
 
 		 147 aa  92  4e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0432  hydrogenase maturation protease HycI  31.74 
 
 		 179 aa  90.5  1e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.632928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1136  hypothetical protein  39.37 
 
 		 147 aa  86.7  2e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.999866 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2224  hydrogenase maturation protease  35.46 
 
 		 165 aa  85.1  5e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0405  HycI peptidase  31.74 
 
 		 179 aa  80.9  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.187336  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1488  hydrogenase maturation protease HycI  31.14 
 
 		 179 aa  79.7  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2717  hydrogenase 3 maturation protease  34.51 
 
 		 165 aa  75.1  0.0000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.391136  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2426  hydrogenase 3 maturation protease  37.76 
 
 		 156 aa  73.9  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2182  hydrogenase 3 maturation protease  36.81 
 
 		 158 aa  73.6  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.359585 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1276  hydrogenase 3 maturation protease  33.99 
 
 		 159 aa  72.4  0.000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.482581  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0501  hydrogenase maturation protease HycI  32.43 
 
 		 181 aa  71.6  0.000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.812223  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2966  hydrogenase 3 maturation protease  32.65 
 
 		 156 aa  69.7  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2997  hydrogenase 3 maturation protease  31.97 
 
 		 156 aa  69.3  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00982926 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3155  hydrogenase 3 maturation protease  31.21 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.120666 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3048  hydrogenase 3 maturation protease  31.97 
 
 		 156 aa  68.2  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.171447 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3190  hydrogenase 3 maturation protease  31.08 
 
 		 151 aa  67.8  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01030  hydrogenase 3 maturation protease  31.47 
 
 		 172 aa  67  0.0000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.184626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3968  hydrogenase 3 maturation protease  31.47 
 
 		 156 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3032  hydrogenase 3 maturation protease  30.57 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.228313  hitchhiker  0.0000962819 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02532  hypothetical protein  31.47 
 
 		 156 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3159  hydrogenase 3 maturation protease  31.47 
 
 		 156 aa  67  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2842  hydrogenase 3 maturation protease  31.47 
 
 		 156 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0786118 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0995  hydrogenase 3 maturation protease  31.47 
 
 		 156 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0451104 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02567  protease involved in processing C-terminal end of HycE  31.47 
 
 		 156 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3005  hydrogenase 3 maturation protease  31.47 
 
 		 156 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2853  hydrogenase 3 maturation protease  31.47 
 
 		 156 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0972  hydrogenase maturation protease HycI  31.47 
 
 		 156 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4566  hydrogenase 3 maturation protease  33.8 
 
 		 161 aa  64.7  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1127  hydrogenase maturation protease  29.03 
 
 		 158 aa  64.7  0.0000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0322  peptidase M52, hydrogen uptake protein  31.01 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2728  hydrogenase maturation protease HycI  34.03 
 
 		 181 aa  58.5  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0173  hydrogenase maturation protease  29.38 
 
 		 170 aa  58.2  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2796  hydrogenase maturation protease  26.62 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1233  hydrogenase maturation protease  27.67 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.120838  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1271  peptidase M52, hydrogen uptake protein  26.55 
 
 		 167 aa  50.1  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.813931  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00344  hydrogenase 2 maturation protease  22.88 
 
 		 184 aa  48.5  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1529  hydrogenase 1 maturation protease  26.9 
 
 		 198 aa  47.8  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.468604  normal  0.329104 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1870  hydrogenase maturation protease  32.41 
 
 		 148 aa  47.8  0.00009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1345  hydrogenase 1 maturation protease  28.26 
 
 		 198 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1927  hydrogenase 1 maturation protease  26.9 
 
 		 198 aa  46.2  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.822664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1931  hydrogenase 1 maturation protease  26.9 
 
 		 198 aa  46.2  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1508  hydrogenase maturation protease  29.38 
 
 		 163 aa  45.8  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.263436  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0380  hydrogenase maturation protease  26.52 
 
 		 176 aa  46.2  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1987  hydrogenase 1 maturation protease  27.78 
 
 		 198 aa  45.1  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0123  hypothetical protein  29.36 
 
 		 154 aa  44.3  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1639  hydrogenase maturation protease superfamily  32.41 
 
 		 150 aa  43.5  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00363597  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0085  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  26.62 
 
 		 181 aa  43.5  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0501687  normal  0.0549727 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0259  hydrogenase maturation protease  26.42 
 
 		 160 aa  42.7  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2340  hydrogenase 1 maturation protease  25 
 
 		 195 aa  42.4  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.732485  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2669  hydrogenase expression/formation protein  25 
 
 		 195 aa  42.4  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.112067  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00978  HyaD  25 
 
 		 195 aa  42.4  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.106803  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00985  hypothetical protein  25 
 
 		 195 aa  42.4  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112928  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1083  hydrogenase 1 maturation protease  25 
 
 		 195 aa  42.4  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2621  hydrogenase 1 maturation protease  25 
 
 		 195 aa  42.4  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00823631 
 
 
-
 
NC_002936  DET0616  hydrogenase maturation protease  29.66 
 
 		 167 aa  41.6  0.006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3819  hydrogenase maturation protease  26.62 
 
 		 167 aa  41.6  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.704224  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1090  hydrogenase 1 maturation protease  25.17 
 
 		 195 aa  41.6  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0557672  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2142  hydrogenase 1 maturation protease  25 
 
 		 195 aa  41.2  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.152456  normal  0.47053 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2053  hydrogenase maturation protease  25 
 
 		 152 aa  40.8  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52965  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>