More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4932 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4932  hypothetical protein  100 
 
 
154 aa  296  1e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1486  hypothetical protein  88.96 
 
 
154 aa  241  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48549  normal  0.495254 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1175  hypothetical protein  84.42 
 
 
155 aa  199  9e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208061  normal  0.0432668 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1148  hypothetical protein  84.42 
 
 
155 aa  199  9e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0675046  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1165  hypothetical protein  84.42 
 
 
155 aa  199  9e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.51545 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13456  hypothetical protein  74.5 
 
 
168 aa  188  2e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00125594  hitchhiker  0.000164023 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04610  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  57.25 
 
 
157 aa  137  3.9999999999999997e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.343919 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0611  hypothetical protein  51.49 
 
 
153 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.400731 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1713  protein of unknown function UPF0079  52.45 
 
 
170 aa  129  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0729  protein of unknown function UPF0079  55.81 
 
 
176 aa  123  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00214278  normal  0.369364 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4044  protein of unknown function UPF0079  54.03 
 
 
170 aa  120  7e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.193855  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1192  protein of unknown function UPF0079  57.24 
 
 
158 aa  120  9e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07470  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  50.39 
 
 
170 aa  119  1.9999999999999998e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.565446  normal  0.131404 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2605  hypothetical protein  51.16 
 
 
165 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0628  protein of unknown function UPF0079  53.17 
 
 
181 aa  116  9e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00803153  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3072  protein of unknown function UPF0079  54.62 
 
 
160 aa  116  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.351219  normal  0.508247 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2895  hypothetical protein  48.09 
 
 
195 aa  115  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1143  protein of unknown function UPF0079  50.37 
 
 
147 aa  113  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.216548  normal  0.597291 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3855  hypothetical protein  52.99 
 
 
169 aa  111  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.955874 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29240  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  46.81 
 
 
196 aa  110  5e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0561  hypothetical protein  49.24 
 
 
178 aa  110  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.969721  normal  0.678738 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2599  protein of unknown function UPF0079  51.88 
 
 
184 aa  110  8.000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.063881  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2605  protein of unknown function UPF0079  47.73 
 
 
211 aa  109  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000205902 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0357  hypothetical protein  48.48 
 
 
179 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.479824  normal  0.0878506 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0880  protein of unknown function UPF0079  47.02 
 
 
148 aa  108  3e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4265  protein of unknown function UPF0079  56.1 
 
 
163 aa  105  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16710  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  47.14 
 
 
207 aa  100  1e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.431986  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0626  hypothetical protein  52.27 
 
 
157 aa  99.4  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.902087  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1635  protein of unknown function UPF0079  47.73 
 
 
173 aa  97.4  7e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1243  protein of unknown function UPF0079  41.61 
 
 
184 aa  97.4  7e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0488  hypothetical protein  36.76 
 
 
153 aa  97.1  7e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.381265  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0674  protein of unknown function UPF0079  47.06 
 
 
173 aa  97.1  8e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6009  hypothetical protein  51.22 
 
 
157 aa  97.1  9e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4245  hypothetical protein  56.8 
 
 
164 aa  96.3  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.162484  hitchhiker  0.00436804 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1390  protein of unknown function UPF0079  42.86 
 
 
167 aa  95.9  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.004631  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0333  putative ATPase  42.47 
 
 
188 aa  94  6e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.825022  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0940  ATPase, YjeE family  41.67 
 
 
190 aa  93.2  1e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4459  protein of unknown function UPF0079  50.81 
 
 
146 aa  92  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0147  protein of unknown function UPF0079  39.69 
 
 
160 aa  90.1  9e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0643293  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1203  hypothetical protein  36.3 
 
 
174 aa  88.6  3e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20781  ATPase or kinase  36.3 
 
 
174 aa  87.8  5e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.645705  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0998  protein of unknown function UPF0079  48.15 
 
 
182 aa  87.4  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.146802 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0902  hypothetical protein  48.03 
 
 
148 aa  87  8e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.336942  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0366  hypothetical protein  36.72 
 
 
169 aa  86.3  1e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2016  hypothetical protein  40 
 
 
158 aa  85.9  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0799  protein of unknown function UPF0079  37.88 
 
 
150 aa  85.5  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0101  hypothetical protein  39.44 
 
 
163 aa  84.3  5e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.286215  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4975  hypothetical protein  40.77 
 
 
171 aa  84.3  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3739  protein of unknown function UPF0079  40.16 
 
 
159 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.124017  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4455  hypothetical protein  36.69 
 
 
152 aa  81.6  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0399  hypothetical protein  39.71 
 
 
152 aa  82  0.000000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0100312  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2160  hypothetical protein  39.55 
 
 
155 aa  81.6  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000258956 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0408  hypothetical protein  29.37 
 
 
157 aa  81.6  0.000000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2319  hypothetical protein  35.42 
 
 
162 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000629849  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0399  protein of unknown function UPF0079  36.3 
 
 
160 aa  81.6  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0207503 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1263  protein of unknown function UPF0079  36.67 
 
 
153 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00204178  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0713  hypothetical protein  42.42 
 
 
187 aa  80.9  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273172  normal  0.667416 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2671  RNA binding S1  39.83 
 
 
157 aa  80.5  0.000000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.543969  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2855  protein of unknown function UPF0079  35.29 
 
 
164 aa  80.5  0.000000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.314957 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6554  protein of unknown function UPF0079  57.97 
 
 
159 aa  80.1  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.395144  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1776  hypothetical protein  32.81 
 
 
161 aa  79  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00431445  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0145  hypothetical protein  41.53 
 
 
166 aa  79.3  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.550915  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23150  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  50.46 
 
 
205 aa  79.3  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.282088  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0376  hypothetical protein  36.92 
 
 
147 aa  79.3  0.00000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2842  hypothetical protein  37.01 
 
 
158 aa  79  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.523389 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3020  protein of unknown function UPF0079  39.39 
 
 
153 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3084  protein of unknown function UPF0079  40.6 
 
 
141 aa  78.2  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.235796 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0375  hypothetical protein  35.46 
 
 
163 aa  78.2  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128461  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_339  hypothetical protein  35.46 
 
 
163 aa  78.2  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00581672  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1005  hypothetical protein  40.77 
 
 
160 aa  77.8  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000601093  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18151  ATPase or kinase  30.37 
 
 
145 aa  77.8  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.343625  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0216  protein of unknown function UPF0079  31.88 
 
 
152 aa  77.4  0.00000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1881  hypothetical protein  37.23 
 
 
160 aa  77  0.00000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000937898  hitchhiker  0.0000223198 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2888  hypothetical protein  32.61 
 
 
161 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000829466  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1157  hypothetical protein  34.03 
 
 
152 aa  75.9  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0965  protein of unknown function UPF0079  32 
 
 
156 aa  75.5  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2530  protein of unknown function UPF0079  35.29 
 
 
176 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000117314  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0134  protein of unknown function UPF0079  35.48 
 
 
146 aa  75.1  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0046  protein of unknown function UPF0079  29.93 
 
 
174 aa  75.1  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4849  hypothetical protein  37.78 
 
 
150 aa  74.7  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366742  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0118  hypothetical protein  35.94 
 
 
152 aa  74.7  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.927124 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1159  hypothetical protein  43.86 
 
 
161 aa  74.3  0.0000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0147113  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1522  hypothetical protein  38.36 
 
 
161 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.229097  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0369  protein of unknown function UPF0079  40.31 
 
 
161 aa  74.7  0.0000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1296  hypothetical protein  43.86 
 
 
161 aa  74.3  0.0000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0433075  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1295  ATPase or kinase  36.5 
 
 
158 aa  74.3  0.0000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0346  hypothetical protein  32.33 
 
 
143 aa  73.9  0.0000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.101542  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0046  hypothetical protein  40.32 
 
 
141 aa  74.3  0.0000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0396  hypothetical protein  35.46 
 
 
163 aa  73.9  0.0000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4357  hypothetical protein  39.23 
 
 
189 aa  73.9  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.282412 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0100  protein of unknown function UPF0079  32.37 
 
 
151 aa  72.8  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0009157  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2676  hypothetical protein  38.89 
 
 
157 aa  72  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2465  protein of unknown function UPF0079  34.01 
 
 
152 aa  71.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0181492 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2408  protein of unknown function UPF0079  33.78 
 
 
152 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2422  hypothetical protein  26.92 
 
 
154 aa  71.6  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2132  hypothetical protein  26.92 
 
 
154 aa  71.6  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2519  protein of unknown function UPF0079  40.14 
 
 
159 aa  71.6  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0174  hypothetical protein  37.67 
 
 
169 aa  71.6  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00309519  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0258  hypothetical protein  32.61 
 
 
157 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1719  hypothetical protein  34.26 
 
 
145 aa  71.2  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.266415  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>