More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4849 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4849  hypothetical protein  100 
 
 
150 aa  299  9e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366742  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3438  hypothetical protein  56.76 
 
 
165 aa  156  7e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0159853  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3962  protein of unknown function UPF0079  57.25 
 
 
503 aa  141  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4289  protein of unknown function UPF0079  53.74 
 
 
505 aa  138  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0623599  normal  0.680884 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3245  hypothetical protein  53.1 
 
 
504 aa  135  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479121  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1298  protein of unknown function UPF0079  52.94 
 
 
161 aa  135  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2955  hypothetical protein  50.74 
 
 
161 aa  133  9e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.263755  normal  0.0249448 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1522  hypothetical protein  52.24 
 
 
161 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.229097  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0666  protein of unknown function UPF0079  49.31 
 
 
523 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.469867 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0174  hypothetical protein  52.24 
 
 
169 aa  128  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00309519  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0820  hypothetical protein  52.9 
 
 
509 aa  127  7.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0206  hypothetical protein  48.99 
 
 
505 aa  123  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0259343  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2100  hypothetical protein  49.63 
 
 
513 aa  122  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0625  hypothetical protein  51.39 
 
 
505 aa  122  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00759808  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2017  hypothetical protein  49.63 
 
 
513 aa  122  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0046  hypothetical protein  51.08 
 
 
507 aa  120  5e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.810658  normal  0.280558 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2842  hypothetical protein  47.76 
 
 
158 aa  120  6e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.523389 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0134  hypothetical protein  48 
 
 
164 aa  120  7e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1355  P-loop hydrolase/phosphotransferase  48.55 
 
 
497 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0383  hypothetical protein  49.64 
 
 
506 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0054  hypothetical protein  47.86 
 
 
507 aa  115  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.885213  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0081  protein of unknown function UPF0079  49.31 
 
 
506 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.428182  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1606  protein of unknown function UPF0079  51.7 
 
 
529 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0383764  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0493  aminoglycoside phosphotransferase  51.7 
 
 
514 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00248724 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4062  hypothetical protein  53.6 
 
 
176 aa  112  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.154683 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0082  hypothetical protein  48.32 
 
 
158 aa  110  5e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.659659 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4431  hypothetical protein  53.51 
 
 
549 aa  110  9e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.319947 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3434  protein of unknown function UPF0079  43.24 
 
 
165 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0051  hypothetical protein  50.77 
 
 
502 aa  109  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0587  hypothetical protein  47.22 
 
 
562 aa  109  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.977621 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4895  protein of unknown function UPF0079  53.51 
 
 
542 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.582734  normal  0.663902 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4941  protein of unknown function UPF0079  54.39 
 
 
540 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.267606 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3297  hypothetical protein  42.48 
 
 
523 aa  108  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.480432 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1776  hypothetical protein  43.2 
 
 
161 aa  107  5e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00431445  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0161  hypothetical protein  49.24 
 
 
164 aa  103  6e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2676  hypothetical protein  48.84 
 
 
157 aa  103  6e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2797  hypothetical protein  46.81 
 
 
472 aa  103  9e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2519  protein of unknown function UPF0079  45.67 
 
 
159 aa  103  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0562  hypothetical protein  41.43 
 
 
157 aa  103  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000200674  normal  0.209641 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2160  hypothetical protein  44.37 
 
 
155 aa  102  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000258956 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3578  hypothetical protein  56.92 
 
 
498 aa  102  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.303943  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3739  protein of unknown function UPF0079  44.03 
 
 
159 aa  101  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.124017  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0531  protein of unknown function UPF0079  45.21 
 
 
157 aa  101  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0352512  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1784  protein of unknown function UPF0079  40.82 
 
 
176 aa  100  6e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0485483  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0799  protein of unknown function UPF0079  38.81 
 
 
150 aa  99.4  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2888  hypothetical protein  42.74 
 
 
161 aa  100  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000829466  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01950  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  38.85 
 
 
158 aa  99.8  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2016  hypothetical protein  45.04 
 
 
158 aa  99.4  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4542  hypothetical protein  52.63 
 
 
529 aa  99  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4689  hypothetical protein  43.97 
 
 
157 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2452  protein of unknown function UPF0079  47.01 
 
 
183 aa  98.6  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0147  protein of unknown function UPF0079  42.75 
 
 
160 aa  99.4  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0643293  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1503  hypothetical protein  47.01 
 
 
188 aa  99  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.170985  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2364  protein of unknown function UPF0079  47.01 
 
 
183 aa  99.4  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.118731  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4898  hypothetical protein  42.55 
 
 
157 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.44547  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4774  hypothetical protein  42.55 
 
 
157 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.431591  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0387  hypothetical protein  43.75 
 
 
168 aa  98.2  4e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.919602  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0008  P-loop hydrolase family protein  39.68 
 
 
155 aa  97.8  4e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  unclonable  0.00000890288  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3209  hypothetical protein  42.98 
 
 
157 aa  98.2  4e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000564317  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0569  hypothetical protein  48.12 
 
 
167 aa  97.8  4e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000405356 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0399  protein of unknown function UPF0079  40.88 
 
 
160 aa  97.8  4e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0207503 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0814  protein of unknown function UPF0079  44 
 
 
161 aa  97.4  5e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2754  hypothetical protein  41.96 
 
 
188 aa  97.4  5e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000152007  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2530  protein of unknown function UPF0079  42.07 
 
 
176 aa  97.8  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000117314  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0488  protein of unknown function UPF0079  47.41 
 
 
160 aa  97.8  5e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000100685  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4950  hypothetical protein  42.55 
 
 
157 aa  97.4  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.070486  normal  0.198333 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0086  hypothetical protein  50.83 
 
 
509 aa  97.4  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.522913  normal  0.567075 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0893  protein of unknown function UPF0079  47.18 
 
 
156 aa  97.1  8e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.419695  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3657  putative ATPase  43.38 
 
 
156 aa  96.3  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000030083  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07500  ATPase, with role in cell wall biosynthesis  43.97 
 
 
156 aa  96.7  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0610132  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2781  hypothetical protein  38.46 
 
 
154 aa  96.7  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1300  hypothetical protein  43.18 
 
 
144 aa  95.5  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0581872  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1263  protein of unknown function UPF0079  40.91 
 
 
153 aa  95.9  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00204178  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00098  hypothetical protein  41.73 
 
 
154 aa  95.9  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0703  putative ATPase  43.38 
 
 
156 aa  95.9  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000204367  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2422  hypothetical protein  34.75 
 
 
154 aa  95.9  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2132  hypothetical protein  34.75 
 
 
154 aa  95.9  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3803  putative ATPase  43.38 
 
 
156 aa  95.9  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000296648  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2773  hypothetical protein  42.75 
 
 
165 aa  95.9  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.018672  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1243  protein of unknown function UPF0079  41.98 
 
 
184 aa  95.1  3e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4635  putative ATPase  41.04 
 
 
153 aa  95.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00161848  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0793  hypothetical protein  37.16 
 
 
152 aa  95.1  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.949281  hitchhiker  0.00232347 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1531  ATPase or kinase  37.76 
 
 
149 aa  94.7  3e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0961  hypothetical protein  41.86 
 
 
163 aa  94.7  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.14989  hitchhiker  0.00154455 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5677  hypothetical protein  43.06 
 
 
155 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.178555  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4754  putative ATPase  41.04 
 
 
152 aa  94.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.382277  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4625  putative ATPase  41.04 
 
 
152 aa  94.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4775  putative ATPase  41.04 
 
 
152 aa  94.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0594287 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4718  putative ATPase  41.04 
 
 
153 aa  94.4  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.983496  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2330  hypothetical protein  45.54 
 
 
182 aa  94.4  5e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2001  hypothetical protein  51.82 
 
 
149 aa  94.4  5e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0195579  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2671  RNA binding S1  40.29 
 
 
157 aa  94.4  5e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.543969  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3923  putative ATPase  45.65 
 
 
160 aa  94  6e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00130971  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1273  hypothetical protein  45.52 
 
 
159 aa  94  6e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3725  putative ATPase  44.93 
 
 
160 aa  94  6e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0265653  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3825  protein of unknown function UPF0079  41.79 
 
 
153 aa  93.6  7e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000776436  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4725  putative ATPase  41.79 
 
 
153 aa  93.6  7e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000010993  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4410  putative ATPase  41.79 
 
 
153 aa  93.6  7e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000607313  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4699  putative ATPase  41.79 
 
 
153 aa  93.6  7e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000112747  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3029  hypothetical protein  37.67 
 
 
153 aa  93.6  7e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.63375  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>