More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0626 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0626  hypothetical protein  100 
 
 		 157 aa  304  3e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.902087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6009  hypothetical protein  66.43 
 
 		 157 aa  165  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0611  hypothetical protein  58.11 
 
 		 153 aa  156  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.400731 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04610  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  53.64 
 
 		 157 aa  144  3e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.343919 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1143  protein of unknown function UPF0079  65.73 
 
 		 147 aa  144  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.216548  normal  0.597291 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0561  hypothetical protein  64.29 
 
 		 178 aa  142  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.969721  normal  0.678738 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4044  protein of unknown function UPF0079  57.93 
 
 		 170 aa  141  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.193855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0357  hypothetical protein  54.67 
 
 		 179 aa  140  5e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.479824  normal  0.0878506 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3072  protein of unknown function UPF0079  57.24 
 
 		 160 aa  139  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.351219  normal  0.508247 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29240  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  59.38 
 
 		 196 aa  137  4.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4265  protein of unknown function UPF0079  58.78 
 
 		 163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0729  protein of unknown function UPF0079  60.34 
 
 		 176 aa  129  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00214278  normal  0.369364 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2605  hypothetical protein  55.17 
 
 		 165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2605  protein of unknown function UPF0079  55.73 
 
 		 211 aa  129  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000205902 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0628  protein of unknown function UPF0079  50 
 
 		 181 aa  124  5e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00803153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0674  protein of unknown function UPF0079  59.85 
 
 		 173 aa  124  6e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2599  protein of unknown function UPF0079  56.3 
 
 		 184 aa  122  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.063881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3855  hypothetical protein  56.49 
 
 		 169 aa  122  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.955874 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1192  protein of unknown function UPF0079  53.69 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4459  protein of unknown function UPF0079  59.54 
 
 		 146 aa  121  4e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07470  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  53.28 
 
 		 170 aa  119  1.9999999999999998e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.565446  normal  0.131404 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2895  hypothetical protein  49.62 
 
 		 195 aa  119  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16710  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  51.75 
 
 		 207 aa  118  3e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.431986  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0902  hypothetical protein  59.29 
 
 		 148 aa  117  4.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.336942  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0998  protein of unknown function UPF0079  56.58 
 
 		 182 aa  112  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.146802 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0940  ATPase, YjeE family  41.95 
 
 		 190 aa  108  2.0000000000000002e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1713  protein of unknown function UPF0079  58.06 
 
 		 170 aa  109  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0333  putative ATPase  40.22 
 
 		 188 aa  104  4e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.825022  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2855  protein of unknown function UPF0079  44.29 
 
 		 164 aa  104  4e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.314957 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2888  hypothetical protein  40.14 
 
 		 161 aa  104  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000829466  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23150  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  56.25 
 
 		 205 aa  103  8e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.282088  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1635  protein of unknown function UPF0079  46.05 
 
 		 173 aa  101  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1243  protein of unknown function UPF0079  38.82 
 
 		 184 aa  101  5e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2016  hypothetical protein  45.32 
 
 		 158 aa  100  5e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3739  protein of unknown function UPF0079  46.62 
 
 		 159 aa  100  7e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.124017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1486  hypothetical protein  53.38 
 
 		 154 aa  100  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48549  normal  0.495254 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0799  protein of unknown function UPF0079  42.86 
 
 		 150 aa  99.4  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2126  hypothetical protein  36.99 
 
 		 164 aa  98.2  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2089  hypothetical protein  36.99 
 
 		 164 aa  98.2  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.38888  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0366  hypothetical protein  42.98 
 
 		 169 aa  96.3  1e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1097  protein of unknown function UPF0079  37.97 
 
 		 152 aa  94.7  5e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19780  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  38.19 
 
 		 152 aa  94  7e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0805781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0399  hypothetical protein  36.77 
 
 		 152 aa  94  8e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0100312  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1263  protein of unknown function UPF0079  40.51 
 
 		 153 aa  93.2  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00204178  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1664  hypothetical protein  39.84 
 
 		 153 aa  92.8  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3020  protein of unknown function UPF0079  42.18 
 
 		 153 aa  92  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4245  hypothetical protein  53.9 
 
 		 164 aa  92.8  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.162484  hitchhiker  0.00436804 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2160  hypothetical protein  49.56 
 
 		 155 aa  92.4  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258956 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2319  hypothetical protein  39.71 
 
 		 162 aa  92.8  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000629849  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0145  hypothetical protein  46.22 
 
 		 166 aa  91.3  5e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.550915  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1776  hypothetical protein  34.23 
 
 		 161 aa  90.9  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00431445  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0243  hypothetical protein  39.33 
 
 		 157 aa  90.9  6e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0147  protein of unknown function UPF0079  42.11 
 
 		 160 aa  89.7  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0643293  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13456  hypothetical protein  52.5 
 
 		 168 aa  90.1  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00125594  hitchhiker  0.000164023 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0375  hypothetical protein  39.24 
 
 		 163 aa  89.4  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128461  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18361  ATPase or kinase  40.38 
 
 		 145 aa  89  2e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.130336  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0244  hypothetical protein  37.33 
 
 		 157 aa  88.2  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0258  hypothetical protein  37.33 
 
 		 157 aa  88.2  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3434  protein of unknown function UPF0079  38 
 
 		 165 aa  88.2  4e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2422  hypothetical protein  34.71 
 
 		 154 aa  88.2  4e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2132  hypothetical protein  34.71 
 
 		 154 aa  88.2  4e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0376  hypothetical protein  40.56 
 
 		 147 aa  88.2  4e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0053  hypothetical protein  48.04 
 
 		 149 aa  87.8  5e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0230  hypothetical protein  37.33 
 
 		 157 aa  87.4  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0284  conserved hypothetical protein TIGR00150  37.33 
 
 		 157 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0488  hypothetical protein  37.23 
 
 		 153 aa  87.4  6e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.381265  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0232  P-loop hydrolase  37.33 
 
 		 157 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_339  hypothetical protein  41.04 
 
 		 163 aa  87  1e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00581672  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1719  hypothetical protein  39.42 
 
 		 145 aa  86.3  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.266415  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0396  hypothetical protein  43.75 
 
 		 163 aa  85.9  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1881  hypothetical protein  41.27 
 
 		 160 aa  85.9  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000937898  hitchhiker  0.0000223198 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0236  hypothetical protein  36.67 
 
 		 157 aa  85.9  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000721135  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2519  protein of unknown function UPF0079  48.57 
 
 		 159 aa  85.9  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0101  hypothetical protein  42.14 
 
 		 163 aa  85.1  3e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.286215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18181  ATPase or kinase  37.6 
 
 		 145 aa  85.1  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2465  protein of unknown function UPF0079  35.67 
 
 		 152 aa  85.5  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0181492 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0483  protein of unknown function UPF0079  40.71 
 
 		 149 aa  85.1  4e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.790809  normal  0.0607901 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0289  conserved hypothetical protein TIGR00150  37.33 
 
 		 157 aa  85.1  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.023351  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2408  protein of unknown function UPF0079  35.67 
 
 		 152 aa  84.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0880  protein of unknown function UPF0079  56 
 
 		 148 aa  84.7  5e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1800  hypothetical protein  40.14 
 
 		 161 aa  84.3  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.009423  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0279  hypothetical protein  36.67 
 
 		 157 aa  84.3  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1005  hypothetical protein  37.5 
 
 		 160 aa  84.3  6e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000601093  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0308  conserved hypothetical protein TIGR00150  36.67 
 
 		 157 aa  84.3  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1175  hypothetical protein  56.63 
 
 		 155 aa  84  7e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208061  normal  0.0432668 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0216  protein of unknown function UPF0079  38.1 
 
 		 152 aa  84.3  7e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01741  ATPase or kinase  49.4 
 
 		 172 aa  84  7e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1148  hypothetical protein  56.63 
 
 		 155 aa  84  7e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0675046  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1165  hypothetical protein  56.63 
 
 		 155 aa  84  7e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.51545 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3084  protein of unknown function UPF0079  38.3 
 
 		 141 aa  83.2  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.235796 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4849  hypothetical protein  40.15 
 
 		 150 aa  83.2  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11800  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  44.12 
 
 		 163 aa  83.6  0.000000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4975  hypothetical protein  38.67 
 
 		 171 aa  83.2  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01950  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  38.71 
 
 		 158 aa  83.2  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5035  hypothetical protein  38.41 
 
 		 157 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6554  protein of unknown function UPF0079  55.26 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.395144  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0487  hypothetical protein  36.62 
 
 		 148 aa  82.8  0.000000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18151  ATPase or kinase  41.24 
 
 		 145 aa  82.8  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.343625  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0399  protein of unknown function UPF0079  38.56 
 
 		 160 aa  82  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0207503 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4455  hypothetical protein  39.5 
 
 		 152 aa  81.6  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>