More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1713 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1713  protein of unknown function UPF0079  100 
 
 		 170 aa  326  9e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0880  protein of unknown function UPF0079  73.79 
 
 		 148 aa  149  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1486  hypothetical protein  57.82 
 
 		 154 aa  143  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48549  normal  0.495254 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0628  protein of unknown function UPF0079  60.98 
 
 		 181 aa  142  2e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00803153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04610  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  57.53 
 
 		 157 aa  142  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.343919 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3072  protein of unknown function UPF0079  62.1 
 
 		 160 aa  142  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.351219  normal  0.508247 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0357  hypothetical protein  58.59 
 
 		 179 aa  140  9e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.479824  normal  0.0878506 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4044  protein of unknown function UPF0079  54.17 
 
 		 170 aa  139  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.193855  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0611  hypothetical protein  57.48 
 
 		 153 aa  139  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.400731 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2599  protein of unknown function UPF0079  59.06 
 
 		 184 aa  137  6e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.063881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0729  protein of unknown function UPF0079  60.16 
 
 		 176 aa  135  3.0000000000000003e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00214278  normal  0.369364 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13456  hypothetical protein  54.55 
 
 		 168 aa  133  9.999999999999999e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00125594  hitchhiker  0.000164023 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1192  protein of unknown function UPF0079  62.41 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07470  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  58.77 
 
 		 170 aa  132  3e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.565446  normal  0.131404 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29240  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  54.76 
 
 		 196 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0674  protein of unknown function UPF0079  57.93 
 
 		 173 aa  127  6e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2605  hypothetical protein  54.4 
 
 		 165 aa  125  3e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4265  protein of unknown function UPF0079  59.68 
 
 		 163 aa  123  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3855  hypothetical protein  57.24 
 
 		 169 aa  121  4e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.955874 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0561  hypothetical protein  61.36 
 
 		 178 aa  118  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.969721  normal  0.678738 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1143  protein of unknown function UPF0079  55.91 
 
 		 147 aa  118  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.216548  normal  0.597291 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4932  hypothetical protein  56 
 
 		 154 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1175  hypothetical protein  57.05 
 
 		 155 aa  115  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208061  normal  0.0432668 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1148  hypothetical protein  57.05 
 
 		 155 aa  115  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0675046  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1165  hypothetical protein  57.05 
 
 		 155 aa  115  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.51545 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0626  hypothetical protein  58.06 
 
 		 157 aa  114  7.999999999999999e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.902087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6009  hypothetical protein  55.81 
 
 		 157 aa  111  6e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2605  protein of unknown function UPF0079  50.81 
 
 		 211 aa  110  9e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000205902 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2895  hypothetical protein  50.4 
 
 		 195 aa  108  5e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0902  hypothetical protein  63.16 
 
 		 148 aa  106  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.336942  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4459  protein of unknown function UPF0079  59.83 
 
 		 146 aa  104  5e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16710  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  47.69 
 
 		 207 aa  102  3e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.431986  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4245  hypothetical protein  61.79 
 
 		 164 aa  99  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.162484  hitchhiker  0.00436804 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6554  protein of unknown function UPF0079  65.19 
 
 		 159 aa  98.6  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.395144  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0940  ATPase, YjeE family  41.78 
 
 		 190 aa  96.3  2e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23150  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  59.8 
 
 		 205 aa  95.5  3e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.282088  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0998  protein of unknown function UPF0079  57.14 
 
 		 182 aa  95.5  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.146802 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1635  protein of unknown function UPF0079  45.38 
 
 		 173 aa  93.2  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3084  protein of unknown function UPF0079  42.54 
 
 		 141 aa  91.7  5e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.235796 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0333  putative ATPase  40.69 
 
 		 188 aa  91.3  6e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.825022  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2016  hypothetical protein  49.57 
 
 		 158 aa  88.6  4e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0147  protein of unknown function UPF0079  38.64 
 
 		 160 aa  88.6  4e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0643293  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1776  hypothetical protein  37.19 
 
 		 161 aa  87.8  6e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00431445  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2422  hypothetical protein  34.68 
 
 		 154 aa  86.7  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2132  hypothetical protein  34.68 
 
 		 154 aa  86.7  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0799  protein of unknown function UPF0079  35.42 
 
 		 150 aa  85.1  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3739  protein of unknown function UPF0079  39.23 
 
 		 159 aa  84.3  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.124017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2888  hypothetical protein  36.36 
 
 		 161 aa  84  9e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000829466  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2519  protein of unknown function UPF0079  45.3 
 
 		 159 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2855  protein of unknown function UPF0079  42.02 
 
 		 164 aa  82.8  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.314957 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0046  hypothetical protein  42.99 
 
 		 141 aa  82  0.000000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1243  protein of unknown function UPF0079  36.49 
 
 		 184 aa  81.6  0.000000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0399  hypothetical protein  39.69 
 
 		 152 aa  79.3  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0100312  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0366  hypothetical protein  36.44 
 
 		 169 aa  79.3  0.00000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0174  hypothetical protein  41.67 
 
 		 169 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00309519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2160  hypothetical protein  38.02 
 
 		 155 aa  79  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258956 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4455  hypothetical protein  36.23 
 
 		 152 aa  79  0.00000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1522  hypothetical protein  41.67 
 
 		 161 aa  78.6  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.229097  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0408  hypothetical protein  34.21 
 
 		 157 aa  78.6  0.00000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2089  hypothetical protein  35.77 
 
 		 164 aa  78.2  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.38888  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2126  hypothetical protein  35.77 
 
 		 164 aa  78.2  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0145  hypothetical protein  37.59 
 
 		 166 aa  77.4  0.00000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.550915  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0134  protein of unknown function UPF0079  35.92 
 
 		 146 aa  77.4  0.00000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1664  hypothetical protein  34.56 
 
 		 153 aa  76.6  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1390  protein of unknown function UPF0079  41.18 
 
 		 167 aa  77  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.004631  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2676  hypothetical protein  38.84 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0369  protein of unknown function UPF0079  38.58 
 
 		 161 aa  75.5  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0244  hypothetical protein  32.59 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0258  hypothetical protein  32.59 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2530  protein of unknown function UPF0079  38.4 
 
 		 176 aa  75.1  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000117314  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3438  hypothetical protein  36.8 
 
 		 165 aa  74.7  0.0000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0159853  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0284  conserved hypothetical protein TIGR00150  33.08 
 
 		 157 aa  74.7  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0230  hypothetical protein  33.08 
 
 		 157 aa  74.7  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0101  hypothetical protein  41.53 
 
 		 163 aa  73.9  0.0000000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.286215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01741  ATPase or kinase  38.39 
 
 		 172 aa  73.2  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4895  protein of unknown function UPF0079  38.51 
 
 		 542 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.582734  normal  0.663902 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1800  hypothetical protein  38.64 
 
 		 161 aa  72  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.009423  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0488  hypothetical protein  33.59 
 
 		 153 aa  72  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.381265  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2955  hypothetical protein  38.52 
 
 		 161 aa  72  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.263755  normal  0.0249448 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0216  protein of unknown function UPF0079  33.9 
 
 		 152 aa  72.4  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0232  P-loop hydrolase  33.08 
 
 		 157 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0974  protein of unknown function UPF0079  43.93 
 
 		 168 aa  71.6  0.000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000133858  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19780  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  37.1 
 
 		 152 aa  72  0.000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0805781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2465  protein of unknown function UPF0079  35.45 
 
 		 152 aa  72  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0181492 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0243  hypothetical protein  32.76 
 
 		 157 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2408  protein of unknown function UPF0079  35.45 
 
 		 152 aa  71.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5035  hypothetical protein  32.48 
 
 		 157 aa  71.6  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2896  protein of unknown function UPF0079  46.23 
 
 		 149 aa  71.6  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.166162  normal  0.455404 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0100  protein of unknown function UPF0079  34.75 
 
 		 151 aa  71.6  0.000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0009157  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0399  protein of unknown function UPF0079  32.82 
 
 		 160 aa  71.6  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0207503 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2773  hypothetical protein  37.4 
 
 		 165 aa  71.6  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.018672  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0308  conserved hypothetical protein TIGR00150  32.31 
 
 		 157 aa  71.2  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0279  hypothetical protein  32.31 
 
 		 157 aa  71.2  0.000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0289  conserved hypothetical protein TIGR00150  32.76 
 
 		 157 aa  71.2  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.023351  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0161  hypothetical protein  40.38 
 
 		 164 aa  71.2  0.000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4431  hypothetical protein  44.25 
 
 		 549 aa  71.2  0.000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.319947 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18151  ATPase or kinase  29.1 
 
 		 145 aa  70.9  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.343625  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0053  hypothetical protein  35.25 
 
 		 149 aa  70.9  0.000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1469  hypothetical protein  39.45 
 
 		 143 aa  70.5  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1203  hypothetical protein  33.93 
 
 		 174 aa  70.5  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>