More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_19780 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_19780  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  100 
 
 		 152 aa  308  2e-83  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0805781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2855  protein of unknown function UPF0079  55.15 
 
 		 164 aa  150  5e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.314957 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0399  hypothetical protein  50 
 
 		 152 aa  137  6e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0100312  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2888  hypothetical protein  44.9 
 
 		 161 aa  130  5e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000829466  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2422  hypothetical protein  45.95 
 
 		 154 aa  130  6e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2132  hypothetical protein  45.95 
 
 		 154 aa  130  6e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11800  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  50 
 
 		 163 aa  127  6e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0375  hypothetical protein  46.67 
 
 		 163 aa  127  7.000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128461  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0236  hypothetical protein  47.52 
 
 		 157 aa  126  9.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000721135  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1263  protein of unknown function UPF0079  51.22 
 
 		 153 aa  125  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00204178  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0399  protein of unknown function UPF0079  42 
 
 		 160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0207503 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_339  hypothetical protein  45.33 
 
 		 163 aa  125  3e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00581672  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0244  hypothetical protein  46.81 
 
 		 157 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0258  hypothetical protein  46.81 
 
 		 157 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0289  conserved hypothetical protein TIGR00150  47.52 
 
 		 157 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.023351  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3020  protein of unknown function UPF0079  44.3 
 
 		 153 aa  124  6e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0284  conserved hypothetical protein TIGR00150  46.81 
 
 		 157 aa  123  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0230  hypothetical protein  46.81 
 
 		 157 aa  123  8.000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0279  hypothetical protein  46.1 
 
 		 157 aa  122  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0243  hypothetical protein  46.81 
 
 		 157 aa  122  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0308  conserved hypothetical protein TIGR00150  46.1 
 
 		 157 aa  122  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5035  hypothetical protein  46.81 
 
 		 157 aa  122  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1243  protein of unknown function UPF0079  45.6 
 
 		 184 aa  120  4e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0232  P-loop hydrolase  46.1 
 
 		 157 aa  120  5e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0396  hypothetical protein  44 
 
 		 163 aa  120  8e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2519  protein of unknown function UPF0079  46.67 
 
 		 159 aa  120  9e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1005  hypothetical protein  45.64 
 
 		 160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000601093  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1097  protein of unknown function UPF0079  45.33 
 
 		 152 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2319  hypothetical protein  41.1 
 
 		 162 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000629849  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0147  protein of unknown function UPF0079  39.1 
 
 		 160 aa  114  5e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0643293  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4357  hypothetical protein  39.33 
 
 		 189 aa  114  5e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282412 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0713  hypothetical protein  39.33 
 
 		 187 aa  113  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273172  normal  0.667416 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0617  protein of unknown function UPF0079  39.26 
 
 		 150 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.202797  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0216  protein of unknown function UPF0079  44.59 
 
 		 152 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2016  hypothetical protein  40.82 
 
 		 158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0799  protein of unknown function UPF0079  44.26 
 
 		 150 aa  110  5e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2126  hypothetical protein  39.16 
 
 		 164 aa  107  5e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2089  hypothetical protein  39.16 
 
 		 164 aa  107  5e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.38888  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2160  hypothetical protein  42.03 
 
 		 155 aa  107  5e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258956 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1531  ATPase or kinase  44.83 
 
 		 149 aa  107  7.000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1776  hypothetical protein  42.62 
 
 		 161 aa  107  8.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00431445  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0483  protein of unknown function UPF0079  39.1 
 
 		 149 aa  106  1e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.790809  normal  0.0607901 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01950  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  42.18 
 
 		 158 aa  105  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1881  hypothetical protein  39.86 
 
 		 160 aa  105  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000937898  hitchhiker  0.0000223198 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0488  hypothetical protein  37.41 
 
 		 153 aa  103  8e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.381265  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0122  protein of unknown function UPF0079  40.29 
 
 		 158 aa  103  9e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000147481  hitchhiker  0.00840651 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2169  hypothetical protein  43.88 
 
 		 167 aa  103  9e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.884354  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1800  hypothetical protein  39.33 
 
 		 161 aa  103  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.009423  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0134  protein of unknown function UPF0079  40.14 
 
 		 146 aa  103  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0100  protein of unknown function UPF0079  41.48 
 
 		 151 aa  102  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0009157  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1503  hypothetical protein  43.65 
 
 		 188 aa  101  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.170985  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0444  protein of unknown function UPF0079  37.93 
 
 		 157 aa  100  6e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1635  protein of unknown function UPF0079  37.75 
 
 		 173 aa  100  7e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0774  hypothetical protein  41.1 
 
 		 164 aa  99  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000567369  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0046  protein of unknown function UPF0079  36.18 
 
 		 174 aa  98.6  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0961  hypothetical protein  46.56 
 
 		 163 aa  97.8  4e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.14989  hitchhiker  0.00154455 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2364  protein of unknown function UPF0079  42.06 
 
 		 183 aa  97.8  5e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.118731  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0965  protein of unknown function UPF0079  34.69 
 
 		 156 aa  97.1  7e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2842  hypothetical protein  41.67 
 
 		 158 aa  97.1  7e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.523389 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0376  hypothetical protein  41.13 
 
 		 147 aa  97.1  7e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2452  protein of unknown function UPF0079  38.51 
 
 		 183 aa  97.1  8e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3739  protein of unknown function UPF0079  38.57 
 
 		 159 aa  96.7  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.124017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0346  hypothetical protein  43.17 
 
 		 143 aa  95.9  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.101542  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0366  hypothetical protein  39.71 
 
 		 169 aa  95.5  2e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2261  hypothetical protein  33.33 
 
 		 164 aa  95.9  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000158801  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0611  hypothetical protein  36.05 
 
 		 153 aa  95.5  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.400731 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2530  protein of unknown function UPF0079  33.99 
 
 		 176 aa  95.1  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000117314  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2666  hypothetical protein  36.88 
 
 		 143 aa  95.1  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0641125  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4975  hypothetical protein  34.64 
 
 		 171 aa  94.7  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1664  hypothetical protein  35.66 
 
 		 153 aa  94.4  5e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0487  hypothetical protein  38.36 
 
 		 148 aa  94  7e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4044  protein of unknown function UPF0079  39.86 
 
 		 170 aa  93.6  9e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.193855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0561  hypothetical protein  41.67 
 
 		 178 aa  92.4  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.969721  normal  0.678738 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1869  hypothetical protein  33.33 
 
 		 158 aa  92  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000565626  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2508  hypothetical protein  37.12 
 
 		 144 aa  91.7  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0224892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6124  protein of unknown function UPF0079  41.18 
 
 		 161 aa  90.9  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0433891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1296  hypothetical protein  39.55 
 
 		 161 aa  90.1  9e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0433075  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1159  hypothetical protein  39.55 
 
 		 161 aa  90.1  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0147113  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0095  hypothetical protein  39.23 
 
 		 146 aa  89  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.442138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2330  hypothetical protein  40.54 
 
 		 182 aa  89.4  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2465  protein of unknown function UPF0079  40.43 
 
 		 152 aa  87.8  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0181492 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4849  hypothetical protein  38.64 
 
 		 150 aa  87.4  6e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65380  hypothetical protein  39.42 
 
 		 155 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0610791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1390  protein of unknown function UPF0079  33.33 
 
 		 167 aa  87.4  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.004631  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0090  protein of unknown function UPF0079  33.1 
 
 		 145 aa  87  7e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.184225  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2408  protein of unknown function UPF0079  41.73 
 
 		 152 aa  87  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4898  hypothetical protein  38.82 
 
 		 157 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.44547  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1469  hypothetical protein  42.45 
 
 		 143 aa  86.7  1e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1524  hypothetical protein  35.86 
 
 		 159 aa  86.3  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.535681  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4774  hypothetical protein  38.82 
 
 		 157 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.431591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0568  hypothetical protein  35.97 
 
 		 143 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3974  hypothetical protein  35.17 
 
 		 153 aa  85.1  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0033  protein of unknown function UPF0079  36.36 
 
 		 131 aa  85.1  3e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5677  hypothetical protein  38.41 
 
 		 155 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.178555  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0626  hypothetical protein  38.19 
 
 		 157 aa  84.7  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.902087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2605  hypothetical protein  37.59 
 
 		 165 aa  84.3  5e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4283  protein of unknown function UPF0079  32.59 
 
 		 138 aa  84  7e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04610  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  35.82 
 
 		 157 aa  84  7e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.343919 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1298  protein of unknown function UPF0079  37.69 
 
 		 161 aa  83.6  8e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07500  ATPase, with role in cell wall biosynthesis  36.18 
 
 		 156 aa  83.6  9e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0610132  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>