More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0628 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0628  protein of unknown function UPF0079  100 
 
 
181 aa  355  2.9999999999999997e-97  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00803153  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29240  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  58.92 
 
 
196 aa  197  7e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3072  protein of unknown function UPF0079  66.88 
 
 
160 aa  196  2.0000000000000003e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.351219  normal  0.508247 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2599  protein of unknown function UPF0079  63.8 
 
 
184 aa  193  1e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.063881  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0729  protein of unknown function UPF0079  58.08 
 
 
176 aa  175  3e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00214278  normal  0.369364 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0674  protein of unknown function UPF0079  59.66 
 
 
173 aa  172  2.9999999999999996e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0611  hypothetical protein  55.48 
 
 
153 aa  164  5.9999999999999996e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.400731 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4265  protein of unknown function UPF0079  56.96 
 
 
163 aa  156  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0357  hypothetical protein  55.48 
 
 
179 aa  153  1e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.479824  normal  0.0878506 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4044  protein of unknown function UPF0079  64.41 
 
 
170 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.193855  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2895  hypothetical protein  54.29 
 
 
195 aa  146  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2605  protein of unknown function UPF0079  47.31 
 
 
211 aa  144  5e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000205902 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07470  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  61.54 
 
 
170 aa  143  1e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.565446  normal  0.131404 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0902  hypothetical protein  60.39 
 
 
148 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.336942  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2605  hypothetical protein  61.74 
 
 
165 aa  137  1e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16710  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  46.74 
 
 
207 aa  136  2e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.431986  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1143  protein of unknown function UPF0079  63.41 
 
 
147 aa  135  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.216548  normal  0.597291 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0998  protein of unknown function UPF0079  57.75 
 
 
182 aa  122  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.146802 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04610  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  50.76 
 
 
157 aa  120  9e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.343919 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1713  protein of unknown function UPF0079  60.98 
 
 
170 aa  118  4.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23150  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  63.64 
 
 
205 aa  117  6e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.282088  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0333  putative ATPase  40.22 
 
 
188 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.825022  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0940  ATPase, YjeE family  40.33 
 
 
190 aa  113  2.0000000000000002e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0561  hypothetical protein  59.52 
 
 
178 aa  112  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.969721  normal  0.678738 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3855  hypothetical protein  55.4 
 
 
169 aa  112  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.955874 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0626  hypothetical protein  50 
 
 
157 aa  109  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.902087  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1192  protein of unknown function UPF0079  56.1 
 
 
158 aa  107  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1486  hypothetical protein  51.85 
 
 
154 aa  103  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48549  normal  0.495254 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6009  hypothetical protein  47.27 
 
 
157 aa  100  9e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0880  protein of unknown function UPF0079  64.29 
 
 
148 aa  99  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13456  hypothetical protein  49.25 
 
 
168 aa  98.6  4e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00125594  hitchhiker  0.000164023 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4245  hypothetical protein  58.65 
 
 
164 aa  95.9  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.162484  hitchhiker  0.00436804 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4459  protein of unknown function UPF0079  55.74 
 
 
146 aa  95.5  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2160  hypothetical protein  48.76 
 
 
155 aa  94  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000258956 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0243  hypothetical protein  41.13 
 
 
157 aa  92  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2888  hypothetical protein  42.86 
 
 
161 aa  91.3  8e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000829466  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0366  hypothetical protein  42.37 
 
 
169 aa  90.1  1e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0147  protein of unknown function UPF0079  39.66 
 
 
160 aa  90.5  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0643293  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2855  protein of unknown function UPF0079  42.86 
 
 
164 aa  90.5  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.314957 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0244  hypothetical protein  38.13 
 
 
157 aa  89.7  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0230  hypothetical protein  37.67 
 
 
157 aa  89.4  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0258  hypothetical protein  38.13 
 
 
157 aa  89.7  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2016  hypothetical protein  41.98 
 
 
158 aa  89.4  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0284  conserved hypothetical protein TIGR00150  37.67 
 
 
157 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4455  hypothetical protein  38.71 
 
 
152 aa  89.4  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1531  ATPase or kinase  41.67 
 
 
149 aa  89  3e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3084  protein of unknown function UPF0079  39.26 
 
 
141 aa  89.4  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.235796 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1664  hypothetical protein  33.76 
 
 
153 aa  88.6  5e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0279  hypothetical protein  37.67 
 
 
157 aa  88.2  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0399  hypothetical protein  45.67 
 
 
152 aa  88.6  5e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0100312  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0308  conserved hypothetical protein TIGR00150  37.67 
 
 
157 aa  88.2  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0289  conserved hypothetical protein TIGR00150  40.32 
 
 
157 aa  88.6  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.023351  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0236  hypothetical protein  39.52 
 
 
157 aa  87.8  9e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000721135  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0232  P-loop hydrolase  37.67 
 
 
157 aa  87  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0216  protein of unknown function UPF0079  36.6 
 
 
152 aa  87  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3739  protein of unknown function UPF0079  37.59 
 
 
159 aa  86.3  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.124017  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1635  protein of unknown function UPF0079  43.59 
 
 
173 aa  86.3  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5035  hypothetical protein  40.32 
 
 
157 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1175  hypothetical protein  50 
 
 
155 aa  85.9  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208061  normal  0.0432668 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1243  protein of unknown function UPF0079  42.86 
 
 
184 aa  85.9  3e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1148  hypothetical protein  50 
 
 
155 aa  85.9  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0675046  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2157  hypothetical protein  41.46 
 
 
165 aa  85.9  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1165  hypothetical protein  50 
 
 
155 aa  85.9  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.51545 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2126  hypothetical protein  40 
 
 
164 aa  85.1  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2089  hypothetical protein  40 
 
 
164 aa  85.1  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.38888  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0046  protein of unknown function UPF0079  35.95 
 
 
174 aa  85.1  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3436  hypothetical protein  34.15 
 
 
152 aa  84.7  6e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000774396  normal  0.208239 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0046  hypothetical protein  38.41 
 
 
141 aa  84.7  7e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3284  hypothetical protein  42.24 
 
 
152 aa  84  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000351541  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2465  protein of unknown function UPF0079  35.62 
 
 
152 aa  83.2  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0181492 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2408  protein of unknown function UPF0079  35.9 
 
 
152 aa  82.8  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2639  protein of unknown function UPF0079  41.18 
 
 
154 aa  83.2  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.266416 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0599  hypothetical protein  42.24 
 
 
152 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0793  hypothetical protein  36.6 
 
 
152 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.949281  hitchhiker  0.00232347 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0799  protein of unknown function UPF0079  36.97 
 
 
150 aa  82  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0594  hypothetical protein  41.38 
 
 
152 aa  82  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997285  hitchhiker  0.000000403865 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0593  hypothetical protein  41.38 
 
 
152 aa  82  0.000000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0559818  hitchhiker  0.0000222246 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3897  hypothetical protein  41.38 
 
 
152 aa  81.6  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000307374  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3771  hypothetical protein  41.38 
 
 
152 aa  81.6  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000107911  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3714  protein of unknown function UPF0079  41.38 
 
 
152 aa  81.6  0.000000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160948  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0554  hypothetical protein  41.38 
 
 
152 aa  81.6  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971051  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0134  hypothetical protein  41.55 
 
 
164 aa  81.6  0.000000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0893  protein of unknown function UPF0079  43.44 
 
 
156 aa  81.6  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.419695  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2422  hypothetical protein  35.25 
 
 
154 aa  81.3  0.000000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2132  hypothetical protein  35.25 
 
 
154 aa  81.3  0.000000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0488  hypothetical protein  34.92 
 
 
153 aa  80.9  0.000000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.381265  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0408  hypothetical protein  36.07 
 
 
157 aa  80.1  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1390  protein of unknown function UPF0079  40.68 
 
 
167 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.004631  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0396  hypothetical protein  42.48 
 
 
163 aa  80.1  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1097  protein of unknown function UPF0079  42.37 
 
 
152 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0383  hypothetical protein  35.29 
 
 
506 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3438  hypothetical protein  36.88 
 
 
165 aa  78.6  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0159853  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0965  protein of unknown function UPF0079  30.87 
 
 
156 aa  79  0.00000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2955  hypothetical protein  38.93 
 
 
161 aa  78.2  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.263755  normal  0.0249448 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0375  hypothetical protein  40.71 
 
 
163 aa  78.2  0.00000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128461  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4849  hypothetical protein  37.09 
 
 
150 aa  78.2  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366742  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0974  protein of unknown function UPF0079  46.02 
 
 
168 aa  78.2  0.00000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000133858  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0774  hypothetical protein  38.66 
 
 
164 aa  77.8  0.00000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000567369  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1800  hypothetical protein  39.23 
 
 
161 aa  77.8  0.00000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.009423  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1784  protein of unknown function UPF0079  42.06 
 
 
176 aa  77.8  0.00000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0485483  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>