More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0134 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0134  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  318  1.9999999999999998e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0820  hypothetical protein  49.38 
 
 		 509 aa  125  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2100  hypothetical protein  54.26 
 
 		 513 aa  125  4.0000000000000003e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2017  hypothetical protein  54.26 
 
 		 513 aa  125  4.0000000000000003e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4289  protein of unknown function UPF0079  51.28 
 
 		 505 aa  120  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0623599  normal  0.680884 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4849  hypothetical protein  48 
 
 		 150 aa  120  9e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3962  protein of unknown function UPF0079  49.66 
 
 		 503 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0625  hypothetical protein  50 
 
 		 505 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00759808  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3245  hypothetical protein  50.34 
 
 		 504 aa  114  6e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0206  hypothetical protein  45.62 
 
 		 505 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0259343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0081  protein of unknown function UPF0079  51.16 
 
 		 506 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.428182  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3438  hypothetical protein  48.03 
 
 		 165 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0159853  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0174  hypothetical protein  51.85 
 
 		 169 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00309519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1522  hypothetical protein  51.85 
 
 		 161 aa  108  3e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.229097  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0383  hypothetical protein  48.67 
 
 		 506 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3297  hypothetical protein  45.06 
 
 		 523 aa  107  6e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.480432 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1355  P-loop hydrolase/phosphotransferase  44.37 
 
 		 497 aa  106  1e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0161  hypothetical protein  56.44 
 
 		 164 aa  106  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2955  hypothetical protein  55.45 
 
 		 161 aa  105  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.263755  normal  0.0249448 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0666  protein of unknown function UPF0079  45.33 
 
 		 523 aa  105  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.469867 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0054  hypothetical protein  49.61 
 
 		 507 aa  105  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.885213  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3434  protein of unknown function UPF0079  46.55 
 
 		 165 aa  104  6e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0086  hypothetical protein  56.6 
 
 		 509 aa  103  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.522913  normal  0.567075 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2842  hypothetical protein  41.18 
 
 		 158 aa  103  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.523389 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2797  hypothetical protein  54.55 
 
 		 472 aa  102  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0587  hypothetical protein  46.62 
 
 		 562 aa  102  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.977621 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0046  hypothetical protein  50 
 
 		 507 aa  101  4e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.810658  normal  0.280558 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0051  hypothetical protein  57.26 
 
 		 502 aa  101  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0082  hypothetical protein  42.41 
 
 		 158 aa  100  6e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.659659 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0713  hypothetical protein  42.28 
 
 		 187 aa  97.4  7e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273172  normal  0.667416 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4062  hypothetical protein  54.95 
 
 		 176 aa  96.3  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.154683 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3209  hypothetical protein  41.33 
 
 		 157 aa  96.3  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000564317  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2160  hypothetical protein  44.37 
 
 		 155 aa  95.5  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258956 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6124  protein of unknown function UPF0079  44.52 
 
 		 161 aa  94.7  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0433891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1298  protein of unknown function UPF0079  44.22 
 
 		 161 aa  95.1  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4357  hypothetical protein  40.38 
 
 		 189 aa  94  8e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282412 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0893  protein of unknown function UPF0079  46.62 
 
 		 156 aa  94  9e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.419695  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1926  conserved hypothetical protein TIGR00150  40.58 
 
 		 161 aa  93.6  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1598  protein of unknown function UPF0079  40.58 
 
 		 161 aa  93.6  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.86964  normal  0.106509 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2855  protein of unknown function UPF0079  41.96 
 
 		 164 aa  93.2  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.314957 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4431  hypothetical protein  48.28 
 
 		 549 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.319947 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00645  ATP/GTP hydrolase  40.69 
 
 		 160 aa  92.8  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4895  protein of unknown function UPF0079  48.28 
 
 		 542 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.582734  normal  0.663902 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4941  protein of unknown function UPF0079  50.46 
 
 		 540 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.267606 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0427  putative ATPase  39.86 
 
 		 156 aa  92.4  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368421  hitchhiker  0.000000532779 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0351  putative ATPase  40.65 
 
 		 153 aa  91.3  5e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000572111  hitchhiker  0.00108821 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4635  putative ATPase  38.19 
 
 		 153 aa  90.9  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00161848  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00098  hypothetical protein  40.91 
 
 		 154 aa  90.9  7e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4639  putative ATPase  39.35 
 
 		 152 aa  90.9  7e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.162208  normal  0.0835245 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5684  putative ATPase  39.35 
 
 		 152 aa  90.9  7e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000102371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4718  putative ATPase  38.19 
 
 		 153 aa  90.9  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.983496  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04035  ATPase with strong ADP affinity  39.35 
 
 		 153 aa  90.9  8e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000985798  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3825  protein of unknown function UPF0079  39.35 
 
 		 153 aa  90.9  8e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000776436  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03997  hypothetical protein  39.35 
 
 		 153 aa  90.9  8e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000527155  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4725  putative ATPase  39.35 
 
 		 153 aa  90.9  8e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000010993  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4410  putative ATPase  39.35 
 
 		 153 aa  90.9  8e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000607313  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3845  putative ATPase  39.35 
 
 		 153 aa  90.9  8e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000032368  hitchhiker  0.00000180276 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4699  putative ATPase  39.35 
 
 		 153 aa  90.9  8e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000112747  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3725  putative ATPase  44.55 
 
 		 160 aa  90.9  8e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0265653  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4625  putative ATPase  38.19 
 
 		 152 aa  90.5  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2676  hypothetical protein  49.09 
 
 		 157 aa  90.5  9e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4754  putative ATPase  38.19 
 
 		 152 aa  90.5  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.382277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4775  putative ATPase  38.19 
 
 		 152 aa  90.5  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0594287 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3050  hypothetical protein  49.51 
 
 		 153 aa  90.1  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.664938  normal  0.025275 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3923  putative ATPase  44.64 
 
 		 160 aa  90.1  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00130971  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0531  protein of unknown function UPF0079  40.27 
 
 		 157 aa  90.1  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0352512  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002255  ATPase YjeE  38.41 
 
 		 154 aa  90.1  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000336436  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0492  protein of unknown function UPF0079  52.73 
 
 		 155 aa  90.1  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.069952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1190  ATP/GTP hydrolase  40.87 
 
 		 148 aa  89  2e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.328809  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3578  hypothetical protein  55.86 
 
 		 498 aa  89.7  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.303943  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1228  hypothetical protein  40.87 
 
 		 148 aa  89.4  2e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0568  hypothetical protein  40.31 
 
 		 143 aa  89  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1784  protein of unknown function UPF0079  47.37 
 
 		 176 aa  88.6  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0485483  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4946  hypothetical protein  40.31 
 
 		 142 aa  88.2  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0488  protein of unknown function UPF0079  44.44 
 
 		 160 aa  88.2  5e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000100685  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2639  protein of unknown function UPF0079  40.82 
 
 		 154 aa  87.8  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.266416 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1606  protein of unknown function UPF0079  47.52 
 
 		 529 aa  87.8  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0383764  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2781  hypothetical protein  39.42 
 
 		 154 aa  87  9e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2754  hypothetical protein  41.96 
 
 		 188 aa  86.7  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000152007  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0936  hypothetical protein  37.27 
 
 		 155 aa  87  1e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000264552  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3803  putative ATPase  44.55 
 
 		 156 aa  87  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000296648  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0703  putative ATPase  44.55 
 
 		 156 aa  87  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000204367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3657  putative ATPase  44.55 
 
 		 156 aa  86.7  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000030083  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0569  hypothetical protein  50.45 
 
 		 167 aa  86.7  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000405356 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0493  aminoglycoside phosphotransferase  50 
 
 		 514 aa  86.3  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248724 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0599  hypothetical protein  41.54 
 
 		 152 aa  85.9  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2754  hypothetical protein  38.24 
 
 		 160 aa  86.3  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2627  hypothetical protein  36.55 
 
 		 160 aa  86.3  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0008  P-loop hydrolase family protein  40.65 
 
 		 155 aa  85.9  2e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  unclonable  0.00000890288  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0814  protein of unknown function UPF0079  38.73 
 
 		 161 aa  86.3  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3284  hypothetical protein  42.31 
 
 		 152 aa  85.1  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000351541  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3974  hypothetical protein  40 
 
 		 153 aa  85.5  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0399  protein of unknown function UPF0079  42.36 
 
 		 160 aa  85.5  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0207503 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3897  hypothetical protein  39.86 
 
 		 152 aa  85.1  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000307374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3714  protein of unknown function UPF0079  39.86 
 
 		 152 aa  85.1  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2001  hypothetical protein  47.32 
 
 		 149 aa  84.7  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0195579  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3436  hypothetical protein  41.54 
 
 		 152 aa  85.1  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000774396  normal  0.208239 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0554  hypothetical protein  39.86 
 
 		 152 aa  85.1  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971051  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3771  hypothetical protein  39.86 
 
 		 152 aa  85.1  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000107911  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2531  hypothetical protein  38.98 
 
 		 162 aa  84.3  6e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>