More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0051 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0051  hypothetical protein  100 
 
 		 502 aa  1010    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3962  protein of unknown function UPF0079  59.08 
 
 		 503 aa  587  1e-166  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3245  hypothetical protein  60.12 
 
 		 504 aa  582  1.0000000000000001e-165  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479121  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4289  protein of unknown function UPF0079  58.88 
 
 		 505 aa  567  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0623599  normal  0.680884 
 
 
-
 
NC_004310  BR2100  hypothetical protein  50.8 
 
 		 513 aa  453  1.0000000000000001e-126  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2017  hypothetical protein  50.6 
 
 		 513 aa  451  1e-125  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0820  hypothetical protein  49.02 
 
 		 509 aa  444  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3578  hypothetical protein  50.3 
 
 		 498 aa  412  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.303943  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0206  hypothetical protein  45.04 
 
 		 505 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0259343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1355  P-loop hydrolase/phosphotransferase  43.23 
 
 		 497 aa  398  1e-109  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0081  protein of unknown function UPF0079  44.69 
 
 		 506 aa  391  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.428182  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0625  hypothetical protein  44.58 
 
 		 505 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00759808  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0383  hypothetical protein  45 
 
 		 506 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0086  hypothetical protein  45 
 
 		 509 aa  379  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.522913  normal  0.567075 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0046  hypothetical protein  43.23 
 
 		 507 aa  369  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.810658  normal  0.280558 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4431  hypothetical protein  45.05 
 
 		 549 aa  367  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.319947 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0054  hypothetical protein  42.77 
 
 		 507 aa  365  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.885213  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4542  hypothetical protein  45.17 
 
 		 529 aa  365  1e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4941  protein of unknown function UPF0079  44.85 
 
 		 540 aa  365  2e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.267606 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1606  protein of unknown function UPF0079  45.45 
 
 		 529 aa  363  3e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0383764  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0666  protein of unknown function UPF0079  42.57 
 
 		 523 aa  363  4e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.469867 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3297  hypothetical protein  41.29 
 
 		 523 aa  360  4e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.480432 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0493  aminoglycoside phosphotransferase  45.53 
 
 		 514 aa  360  5e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248724 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4895  protein of unknown function UPF0079  45.45 
 
 		 542 aa  355  1e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.582734  normal  0.663902 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0587  hypothetical protein  40.94 
 
 		 562 aa  343  5e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.977621 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0135  aminoglycoside phosphotransferase  42.05 
 
 		 362 aa  246  8e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2797  hypothetical protein  35.22 
 
 		 472 aa  216  5.9999999999999996e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3437  aminoglycoside phosphotransferase  35.99 
 
 		 360 aa  170  6e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.17769  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4850  aminoglycoside phosphotransferase  34.46 
 
 		 363 aa  156  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.191997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0566  aminoglycoside phosphotransferase  34.01 
 
 		 358 aa  153  8e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2299  aminoglycoside phosphotransferase  33.33 
 
 		 328 aa  150  5e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.45511  normal  0.057046 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0160  aminoglycoside phosphotransferase  34.01 
 
 		 323 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.549928 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0083  aminoglycoside phosphotransferase  32.1 
 
 		 365 aa  148  2.0000000000000003e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.972168 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2000  aminoglycoside phosphotransferase  33.72 
 
 		 327 aa  146  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00692225  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2843  aminoglycoside phosphotransferase  32.14 
 
 		 332 aa  145  1e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2677  aminoglycoside phosphotransferase  33.92 
 
 		 328 aa  140  4.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0962  aminoglycoside phosphotransferase  32.1 
 
 		 340 aa  137  4e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.135258  hitchhiker  0.0017288 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4849  hypothetical protein  56.15 
 
 		 150 aa  130  7.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2954  aminoglycoside phosphotransferase  32.1 
 
 		 342 aa  126  8.000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.290607  normal  0.0281748 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0198  aminoglycoside phosphotransferase  33.73 
 
 		 336 aa  126  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.159421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0126  aminoglycoside phosphotransferase  31.66 
 
 		 344 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1453  aminoglycoside phosphotransferase  33.13 
 
 		 346 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.355309  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3435  aminoglycoside phosphotransferase  32.2 
 
 		 332 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2764  aminoglycoside phosphotransferase  31.81 
 
 		 349 aa  120  7e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2336  hypothetical protein  33.65 
 
 		 330 aa  119  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1019  aminoglycoside phosphotransferase  32.32 
 
 		 341 aa  119  9.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0435  aminoglycoside phosphotransferase  31.41 
 
 		 348 aa  116  7.999999999999999e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.625762  normal  0.267382 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1653  aminoglycoside phosphotransferase  31.41 
 
 		 340 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0201  hypothetical protein  32.21 
 
 		 350 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.59437 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0374  hypothetical protein  27.55 
 
 		 325 aa  115  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0349  hypothetical protein  27.55 
 
 		 325 aa  115  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46790  phosphotransferase  32.28 
 
 		 340 aa  115  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2630  aminoglycoside phosphotransferase  31.23 
 
 		 349 aa  115  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.280943  normal  0.909879 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2148  aminoglycoside phosphotransferase  31.95 
 
 		 331 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0175  aminoglycoside phosphotransferase  32.93 
 
 		 341 aa  114  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00583599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0134  hypothetical protein  57.26 
 
 		 164 aa  113  6e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1523  hypothetical protein  32.32 
 
 		 341 aa  113  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.165776  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0883  aminoglycoside phosphotransferase  28.87 
 
 		 345 aa  113  8.000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000858674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1453  hypothetical protein  47.26 
 
 		 149 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2072  aminoglycoside phosphotransferase  27.18 
 
 		 312 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2739  aminoglycoside phosphotransferase  31.79 
 
 		 349 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2712  aminoglycoside phosphotransferase  31.79 
 
 		 349 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2100  aminoglycoside phosphotransferase  31.79 
 
 		 349 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4623  aminoglycoside phosphotransferase  31.23 
 
 		 340 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111315  normal  0.973044 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0514  hypothetical protein  31.89 
 
 		 352 aa  109  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0621374 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0555  hypothetical protein  31.55 
 
 		 341 aa  109  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4813  aminoglycoside phosphotransferase  30.82 
 
 		 333 aa  109  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0654401 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4797  aminoglycoside phosphotransferase  33.46 
 
 		 339 aa  109  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.318668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0968  aminoglycoside phosphotransferase  28.69 
 
 		 334 aa  109  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0389824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1871  aminoglycoside phosphotransferase  33.21 
 
 		 333 aa  108  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0587  aminoglycoside phosphotransferase  31.79 
 
 		 348 aa  108  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3308  aminoglycoside phosphotransferase  30.14 
 
 		 347 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.346966  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0600  hypothetical protein  31.19 
 
 		 341 aa  108  3e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0296  aminoglycoside phosphotransferase  29.82 
 
 		 338 aa  108  3e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.000010357  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0909  aminoglycoside phosphotransferase  29.92 
 
 		 363 aa  108  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00179002  normal  0.193933 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1050  aminoglycoside phosphotransferase  29.3 
 
 		 361 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00944447  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1575  aminoglycoside phosphotransferase  31.52 
 
 		 333 aa  107  4e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.775412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3205  aminoglycoside phosphotransferase  28.86 
 
 		 363 aa  107  4e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00746028  normal  0.846102 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1518  hypothetical protein  28.61 
 
 		 379 aa  107  4e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.422445 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0981  aminoglycoside phosphotransferase  28.61 
 
 		 361 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.125929  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1753  aminoglycoside phosphotransferase  29.6 
 
 		 384 aa  107  5e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000733825 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0496  aminoglycoside phosphotransferase  31.73 
 
 		 344 aa  107  7e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0550103  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6039  aminoglycoside phosphotransferase  31.07 
 
 		 349 aa  107  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1298  protein of unknown function UPF0079  46.38 
 
 		 161 aa  106  9e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2432  aminoglycoside phosphotransferase  30.84 
 
 		 323 aa  106  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0099  aminoglycoside phosphotransferase  30.79 
 
 		 362 aa  106  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4864  aminoglycoside phosphotransferase  28.5 
 
 		 388 aa  105  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.430535 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1083  aminoglycoside phosphotransferase  29.03 
 
 		 361 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0965455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4062  hypothetical protein  50.83 
 
 		 176 aa  105  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.154683 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3635  phosphotransferase  28.29 
 
 		 351 aa  105  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3438  hypothetical protein  51.56 
 
 		 165 aa  104  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0159853  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0395  aminoglycoside phosphotransferase  31.7 
 
 		 348 aa  105  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410154  normal  0.0724183 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0436  aminoglycoside phosphotransferase  32.96 
 
 		 339 aa  104  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.196256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0703  putative ATPase  41.56 
 
 		 156 aa  104  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000204367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5131  aminoglycoside phosphotransferase  28.89 
 
 		 339 aa  104  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.552611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1522  hypothetical protein  47.89 
 
 		 161 aa  104  4e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.229097  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1018  aminoglycoside phosphotransferase  27.49 
 
 		 334 aa  104  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.264433  normal  0.0137892 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4063  aminoglycoside phosphotransferase  31.23 
 
 		 308 aa  104  4e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.106064 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3803  putative ATPase  41.56 
 
 		 156 aa  104  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000296648  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0174  hypothetical protein  48.57 
 
 		 169 aa  103  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00309519  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>