More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3434 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3434  protein of unknown function UPF0079  100 
 
 		 165 aa  328  3e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2955  hypothetical protein  60.48 
 
 		 161 aa  140  6e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.263755  normal  0.0249448 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1522  hypothetical protein  59.68 
 
 		 161 aa  138  3e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.229097  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0174  hypothetical protein  59.68 
 
 		 169 aa  138  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00309519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2842  hypothetical protein  45.39 
 
 		 158 aa  120  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.523389 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3438  hypothetical protein  49.65 
 
 		 165 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0159853  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0082  hypothetical protein  44.78 
 
 		 158 aa  114  5e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.659659 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1355  P-loop hydrolase/phosphotransferase  46.38 
 
 		 497 aa  111  3e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4062  hypothetical protein  57.55 
 
 		 176 aa  109  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.154683 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4849  hypothetical protein  43.24 
 
 		 150 aa  109  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2797  hypothetical protein  46.71 
 
 		 472 aa  109  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0134  hypothetical protein  46.55 
 
 		 164 aa  104  6e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2160  hypothetical protein  43.84 
 
 		 155 aa  103  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258956 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0161  hypothetical protein  48.28 
 
 		 164 aa  103  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3029  hypothetical protein  46.43 
 
 		 153 aa  100  6e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.63375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3209  hypothetical protein  41.78 
 
 		 157 aa  100  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000564317  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2422  hypothetical protein  31.85 
 
 		 154 aa  100  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2132  hypothetical protein  31.85 
 
 		 154 aa  100  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0427  putative ATPase  37.75 
 
 		 156 aa  97.8  5e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368421  hitchhiker  0.000000532779 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1776  hypothetical protein  33.97 
 
 		 161 aa  97.8  6e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00431445  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0562  hypothetical protein  37.76 
 
 		 157 aa  97.4  7e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000200674  normal  0.209641 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2754  hypothetical protein  40.76 
 
 		 188 aa  97.1  9e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000152007  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4174  hypothetical protein  40.46 
 
 		 152 aa  96.7  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2676  hypothetical protein  43.07 
 
 		 157 aa  97.1  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3962  protein of unknown function UPF0079  41.5 
 
 		 503 aa  95.9  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0599  hypothetical protein  43.33 
 
 		 152 aa  94.7  4e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4289  protein of unknown function UPF0079  40.82 
 
 		 505 aa  95.1  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0623599  normal  0.680884 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3315  hypothetical protein  37.86 
 
 		 152 aa  95.1  4e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00300444  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3284  hypothetical protein  43.22 
 
 		 152 aa  94.7  5e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000351541  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0519  hypothetical protein  42.11 
 
 		 143 aa  94.7  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0120244  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3436  hypothetical protein  43.33 
 
 		 152 aa  94.4  6e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000774396  normal  0.208239 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0147  protein of unknown function UPF0079  37.06 
 
 		 160 aa  94.4  7e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0643293  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00098  hypothetical protein  35.62 
 
 		 154 aa  94.4  7e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0594  hypothetical protein  43.33 
 
 		 152 aa  94  8e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997285  hitchhiker  0.000000403865 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0666  protein of unknown function UPF0079  39.44 
 
 		 523 aa  94  8e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.469867 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0399  protein of unknown function UPF0079  37.5 
 
 		 160 aa  94  8e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0207503 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0593  hypothetical protein  43.33 
 
 		 152 aa  94  8e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0559818  hitchhiker  0.0000222246 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4941  protein of unknown function UPF0079  49.55 
 
 		 540 aa  93.6  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.267606 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00645  ATP/GTP hydrolase  39.84 
 
 		 160 aa  92.4  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1664  hypothetical protein  34.01 
 
 		 153 aa  92.4  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3245  hypothetical protein  44.26 
 
 		 504 aa  92.4  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0554  hypothetical protein  44.17 
 
 		 152 aa  92.8  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971051  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0793  hypothetical protein  42.15 
 
 		 152 aa  92.8  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.949281  hitchhiker  0.00232347 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3714  protein of unknown function UPF0079  44.17 
 
 		 152 aa  92.8  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2531  hypothetical protein  33.81 
 
 		 162 aa  92.8  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3897  hypothetical protein  44.17 
 
 		 152 aa  92.8  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000307374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3771  hypothetical protein  44.17 
 
 		 152 aa  92.8  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000107911  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01950  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  36.96 
 
 		 158 aa  92.4  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3544  hypothetical protein  42.86 
 
 		 160 aa  92.8  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002255  ATPase YjeE  35 
 
 		 154 aa  92.4  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000336436  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4431  hypothetical protein  49.55 
 
 		 549 aa  92  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.319947 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3739  protein of unknown function UPF0079  35.48 
 
 		 159 aa  92  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.124017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4895  protein of unknown function UPF0079  49.55 
 
 		 542 aa  92  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.582734  normal  0.663902 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2855  protein of unknown function UPF0079  35.37 
 
 		 164 aa  91.7  4e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.314957 
 
 
-
 
NC_004310  BR2100  hypothetical protein  48.15 
 
 		 513 aa  91.7  5e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2017  hypothetical protein  48.15 
 
 		 513 aa  91.3  5e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1081  ATPase  39.53 
 
 		 156 aa  91.3  5e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1243  protein of unknown function UPF0079  39.06 
 
 		 184 aa  91.7  5e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0383  hypothetical protein  44.35 
 
 		 506 aa  90.9  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4898  hypothetical protein  39.31 
 
 		 157 aa  90.9  8e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.44547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4774  hypothetical protein  39.31 
 
 		 157 aa  90.9  8e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.431591  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4946  hypothetical protein  44.35 
 
 		 142 aa  90.5  9e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1300  hypothetical protein  43.22 
 
 		 144 aa  89.7  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0581872  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2089  hypothetical protein  35.81 
 
 		 164 aa  89.7  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.38888  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2018  protein of unknown function UPF0079  40.15 
 
 		 175 aa  90.1  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00181  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2519  protein of unknown function UPF0079  42.62 
 
 		 159 aa  90.1  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2126  hypothetical protein  35.81 
 
 		 164 aa  89.7  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3923  putative ATPase  39.53 
 
 		 160 aa  89.7  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00130971  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37266  predicted protein  39.58 
 
 		 172 aa  90.1  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2781  hypothetical protein  35.67 
 
 		 154 aa  90.1  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2627  hypothetical protein  35.06 
 
 		 160 aa  89.4  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0568  hypothetical protein  41.1 
 
 		 143 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3050  hypothetical protein  42.86 
 
 		 153 aa  89.4  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.664938  normal  0.025275 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1263  protein of unknown function UPF0079  41.41 
 
 		 153 aa  89.4  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00204178  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0587  hypothetical protein  41.79 
 
 		 562 aa  89.4  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.977621 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4689  hypothetical protein  40.8 
 
 		 157 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0206  hypothetical protein  39.1 
 
 		 505 aa  89.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0259343  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0531  protein of unknown function UPF0079  38.19 
 
 		 157 aa  89.4  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0352512  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1298  protein of unknown function UPF0079  46.85 
 
 		 161 aa  89.7  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2888  hypothetical protein  39.84 
 
 		 161 aa  89.4  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000829466  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1390  protein of unknown function UPF0079  39.74 
 
 		 167 aa  89  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.004631  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1800  hypothetical protein  35.03 
 
 		 161 aa  89  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.009423  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2754  hypothetical protein  35.06 
 
 		 160 aa  89  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0182  protein of unknown function UPF0079  35.29 
 
 		 148 aa  89  3e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0313363  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0081  protein of unknown function UPF0079  43.85 
 
 		 506 aa  89  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.428182  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3725  putative ATPase  39.53 
 
 		 160 aa  88.2  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0265653  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1273  hypothetical protein  41.27 
 
 		 159 aa  88.2  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1784  protein of unknown function UPF0079  35.25 
 
 		 176 aa  88.2  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0485483  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0617  protein of unknown function UPF0079  33.61 
 
 		 150 aa  87.8  5e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.202797  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0625  hypothetical protein  39.07 
 
 		 505 aa  87.8  6e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00759808  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0493  aminoglycoside phosphotransferase  47.2 
 
 		 514 aa  87.8  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248724 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0488  protein of unknown function UPF0079  44.17 
 
 		 160 aa  87.4  7e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000100685  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0820  hypothetical protein  44.44 
 
 		 509 aa  87.4  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0086  hypothetical protein  45.28 
 
 		 509 aa  87.4  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.522913  normal  0.567075 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0631  hypothetical protein  40 
 
 		 155 aa  87.4  8e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.40036 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0703  putative ATPase  36.67 
 
 		 156 aa  87.4  9e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000204367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3803  putative ATPase  36.67 
 
 		 156 aa  87.4  9e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000296648  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3020  protein of unknown function UPF0079  41.41 
 
 		 153 aa  87.4  9e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0046  hypothetical protein  38.71 
 
 		 507 aa  86.7  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.810658  normal  0.280558 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0488  hypothetical protein  35.42 
 
 		 153 aa  86.7  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.381265  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>