More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0161 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0161  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  319  9.999999999999999e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2676  hypothetical protein  60.31 
 
 		 157 aa  147  9e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2001  hypothetical protein  53.21 
 
 		 149 aa  110  9e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0195579  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0174  hypothetical protein  46.72 
 
 		 169 aa  106  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00309519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1522  hypothetical protein  46.72 
 
 		 161 aa  106  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.229097  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0134  hypothetical protein  56.44 
 
 		 164 aa  106  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2955  hypothetical protein  45.26 
 
 		 161 aa  105  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.263755  normal  0.0249448 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4849  hypothetical protein  49.24 
 
 		 150 aa  103  8e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3434  protein of unknown function UPF0079  48.28 
 
 		 165 aa  103  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3245  hypothetical protein  44.53 
 
 		 504 aa  100  9e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2797  hypothetical protein  43.05 
 
 		 472 aa  99.4  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3050  hypothetical protein  41.46 
 
 		 153 aa  95.5  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.664938  normal  0.025275 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0488  protein of unknown function UPF0079  45.38 
 
 		 160 aa  95.1  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000100685  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0082  hypothetical protein  50.47 
 
 		 158 aa  94.7  5e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.659659 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4431  hypothetical protein  50 
 
 		 549 aa  94  7e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.319947 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0666  protein of unknown function UPF0079  46.83 
 
 		 523 aa  94  8e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.469867 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4895  protein of unknown function UPF0079  50 
 
 		 542 aa  94  9e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.582734  normal  0.663902 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0625  hypothetical protein  48.12 
 
 		 505 aa  92.8  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00759808  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0383  hypothetical protein  49.58 
 
 		 506 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0520  hypothetical protein  41.91 
 
 		 184 aa  92.8  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4941  protein of unknown function UPF0079  50.49 
 
 		 540 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.267606 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0206  hypothetical protein  50.41 
 
 		 505 aa  91.3  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0259343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1784  protein of unknown function UPF0079  43.43 
 
 		 176 aa  91.3  5e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0485483  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0366  hypothetical protein  43.97 
 
 		 184 aa  91.3  6e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1065  hypothetical protein  43.97 
 
 		 184 aa  91.3  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0878118  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0908  hypothetical protein  43.97 
 
 		 184 aa  91.3  6e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0666  hypothetical protein  43.97 
 
 		 184 aa  91.3  6e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.739663  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2501  hypothetical protein  43.97 
 
 		 184 aa  91.3  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0115  hypothetical protein  43.97 
 
 		 184 aa  91.3  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0911  hypothetical protein  43.97 
 
 		 184 aa  91.3  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3029  hypothetical protein  39.1 
 
 		 153 aa  90.9  8e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.63375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0799  protein of unknown function UPF0079  38.94 
 
 		 150 aa  90.1  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4289  protein of unknown function UPF0079  40.85 
 
 		 505 aa  90.1  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0623599  normal  0.680884 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0820  hypothetical protein  41.5 
 
 		 509 aa  89.7  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0531  protein of unknown function UPF0079  41.43 
 
 		 157 aa  90.5  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0352512  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3438  hypothetical protein  42.55 
 
 		 165 aa  89.7  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0159853  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3209  hypothetical protein  39.1 
 
 		 157 aa  90.1  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000564317  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3962  protein of unknown function UPF0079  47.32 
 
 		 503 aa  90.1  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2100  hypothetical protein  41.5 
 
 		 513 aa  89.4  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3544  hypothetical protein  43.69 
 
 		 160 aa  89.4  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2017  hypothetical protein  41.5 
 
 		 513 aa  89.4  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01950  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  41.58 
 
 		 158 aa  89.4  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0723  hypothetical protein  41.43 
 
 		 184 aa  89  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002255  ATPase YjeE  36.57 
 
 		 154 aa  89  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000336436  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4542  hypothetical protein  46.77 
 
 		 529 aa  89  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0793  hypothetical protein  37.04 
 
 		 152 aa  89  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.949281  hitchhiker  0.00232347 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2160  hypothetical protein  37.88 
 
 		 155 aa  88.2  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258956 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4174  hypothetical protein  39.47 
 
 		 152 aa  88.2  5e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00098  hypothetical protein  36.57 
 
 		 154 aa  87.8  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1453  hypothetical protein  49.18 
 
 		 149 aa  87.4  7e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4062  hypothetical protein  50.85 
 
 		 176 aa  87.8  7e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.154683 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0147  protein of unknown function UPF0079  40.78 
 
 		 160 aa  87.4  8e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0643293  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1635  protein of unknown function UPF0079  36.23 
 
 		 173 aa  87  9e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0599  hypothetical protein  39.82 
 
 		 152 aa  86.7  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4946  hypothetical protein  40.3 
 
 		 142 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0081  protein of unknown function UPF0079  53.47 
 
 		 506 aa  87  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.428182  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1355  P-loop hydrolase/phosphotransferase  43.33 
 
 		 497 aa  87  1e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5677  hypothetical protein  46.3 
 
 		 155 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.178555  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3284  hypothetical protein  38.52 
 
 		 152 aa  86.3  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000351541  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0594  hypothetical protein  39.82 
 
 		 152 aa  86.3  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997285  hitchhiker  0.000000403865 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3436  hypothetical protein  39.82 
 
 		 152 aa  85.9  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000774396  normal  0.208239 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2452  protein of unknown function UPF0079  47.54 
 
 		 183 aa  86.3  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0593  hypothetical protein  39.82 
 
 		 152 aa  86.3  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0559818  hitchhiker  0.0000222246 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2530  protein of unknown function UPF0079  40.16 
 
 		 176 aa  85.5  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000117314  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2754  hypothetical protein  44.34 
 
 		 160 aa  85.5  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2627  hypothetical protein  44.34 
 
 		 160 aa  85.5  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2364  protein of unknown function UPF0079  46.72 
 
 		 183 aa  85.1  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.118731  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1300  hypothetical protein  44.55 
 
 		 144 aa  85.1  4e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0581872  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3923  putative ATPase  45.37 
 
 		 160 aa  84.7  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00130971  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3974  hypothetical protein  35.11 
 
 		 153 aa  85.1  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3725  putative ATPase  45.37 
 
 		 160 aa  85.1  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0265653  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1298  protein of unknown function UPF0079  40.13 
 
 		 161 aa  85.1  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2888  hypothetical protein  39.42 
 
 		 161 aa  85.1  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000829466  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1664  hypothetical protein  38.84 
 
 		 153 aa  84.7  5e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0893  protein of unknown function UPF0079  47.37 
 
 		 156 aa  84.7  5e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.419695  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0700  hypothetical protein  36.36 
 
 		 139 aa  84.7  5e-16  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.725805  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1776  hypothetical protein  41.24 
 
 		 161 aa  84.3  6e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00431445  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0562  hypothetical protein  37.14 
 
 		 157 aa  84.3  7e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000200674  normal  0.209641 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0670  hypothetical protein  51.14 
 
 		 155 aa  84  8e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.169194  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0583  hypothetical protein  46.73 
 
 		 176 aa  84  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2636  hypothetical protein  41.51 
 
 		 153 aa  84  8e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00016395  hitchhiker  0.000000000107728 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65380  hypothetical protein  42.98 
 
 		 155 aa  84  8e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0610791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00645  ATP/GTP hydrolase  38.66 
 
 		 160 aa  84  9e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0747  hypothetical protein  43.97 
 
 		 192 aa  84  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0054  hypothetical protein  47.11 
 
 		 507 aa  84  9e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.885213  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2018  protein of unknown function UPF0079  46.15 
 
 		 175 aa  84  9e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00181  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0519  hypothetical protein  42.28 
 
 		 143 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0120244  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0554  hypothetical protein  39.05 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971051  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0631  hypothetical protein  45.9 
 
 		 155 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.40036 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3714  protein of unknown function UPF0079  39.05 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3771  hypothetical protein  39.05 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000107911  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3897  hypothetical protein  39.05 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000307374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4357  hypothetical protein  37.69 
 
 		 189 aa  82.8  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282412 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3657  putative ATPase  40.94 
 
 		 156 aa  82.4  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000030083  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0046  hypothetical protein  47.11 
 
 		 507 aa  83.2  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.810658  normal  0.280558 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2531  hypothetical protein  40.2 
 
 		 162 aa  82.8  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0399  protein of unknown function UPF0079  41.18 
 
 		 160 aa  83.2  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0207503 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0427  putative ATPase  37.69 
 
 		 156 aa  82.4  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368421  hitchhiker  0.000000532779 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0033  protein of unknown function UPF0079  30.71 
 
 		 131 aa  82.8  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0703  putative ATPase  40.94 
 
 		 156 aa  82.8  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000204367  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>