More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3438 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3438  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  315  3e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0159853  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4849  hypothetical protein  56.76 
 
 		 150 aa  156  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2955  hypothetical protein  56.34 
 
 		 161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.263755  normal  0.0249448 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1522  hypothetical protein  60.71 
 
 		 161 aa  137  6e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.229097  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0174  hypothetical protein  60 
 
 		 169 aa  134  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00309519  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4289  protein of unknown function UPF0079  50.33 
 
 		 505 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0623599  normal  0.680884 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3962  protein of unknown function UPF0079  52.82 
 
 		 503 aa  124  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0666  protein of unknown function UPF0079  50 
 
 		 523 aa  118  3e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.469867 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3434  protein of unknown function UPF0079  49.65 
 
 		 165 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3245  hypothetical protein  48.53 
 
 		 504 aa  115  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0134  hypothetical protein  48.03 
 
 		 164 aa  108  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4062  hypothetical protein  62.16 
 
 		 176 aa  108  5e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.154683 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3657  putative ATPase  43.92 
 
 		 156 aa  107  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000030083  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0082  hypothetical protein  44.16 
 
 		 158 aa  106  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.659659 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4898  hypothetical protein  47.3 
 
 		 157 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.44547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0383  hypothetical protein  47.06 
 
 		 506 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4774  hypothetical protein  47.3 
 
 		 157 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.431591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1298  protein of unknown function UPF0079  45.95 
 
 		 161 aa  106  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0703  putative ATPase  43.24 
 
 		 156 aa  105  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000204367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3803  putative ATPase  43.24 
 
 		 156 aa  105  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000296648  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0081  protein of unknown function UPF0079  46.67 
 
 		 506 aa  105  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.428182  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0147  protein of unknown function UPF0079  44.44 
 
 		 160 aa  105  4e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0643293  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2842  hypothetical protein  47.2 
 
 		 158 aa  104  5e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.523389 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2676  hypothetical protein  47.44 
 
 		 157 aa  104  7e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4689  hypothetical protein  45.27 
 
 		 157 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2754  hypothetical protein  43.62 
 
 		 188 aa  103  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000152007  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0583  hypothetical protein  45.39 
 
 		 176 aa  102  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3897  hypothetical protein  42.95 
 
 		 152 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000307374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3714  protein of unknown function UPF0079  42.95 
 
 		 152 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0625  hypothetical protein  43.87 
 
 		 505 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00759808  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0554  hypothetical protein  42.95 
 
 		 152 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971051  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3771  hypothetical protein  42.95 
 
 		 152 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000107911  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2519  protein of unknown function UPF0079  48.33 
 
 		 159 aa  101  4e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2773  hypothetical protein  41.77 
 
 		 165 aa  101  5e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.018672  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3284  hypothetical protein  40.94 
 
 		 152 aa  100  9e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000351541  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0206  hypothetical protein  42.58 
 
 		 505 aa  100  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0259343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4950  hypothetical protein  45.27 
 
 		 157 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.070486  normal  0.198333 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2160  hypothetical protein  44.52 
 
 		 155 aa  100  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258956 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2888  hypothetical protein  45.6 
 
 		 161 aa  99.8  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000829466  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4431  hypothetical protein  48.7 
 
 		 549 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.319947 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0427  putative ATPase  42.28 
 
 		 156 aa  99.8  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368421  hitchhiker  0.000000532779 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0351  putative ATPase  41.61 
 
 		 153 aa  99  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000572111  hitchhiker  0.00108821 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4941  protein of unknown function UPF0079  50 
 
 		 540 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.267606 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4895  protein of unknown function UPF0079  48.7 
 
 		 542 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.582734  normal  0.663902 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0820  hypothetical protein  42.76 
 
 		 509 aa  99.4  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0594  hypothetical protein  41.72 
 
 		 152 aa  99.4  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997285  hitchhiker  0.000000403865 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0593  hypothetical protein  41.72 
 
 		 152 aa  99.4  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0559818  hitchhiker  0.0000222246 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00098  hypothetical protein  39.22 
 
 		 154 aa  99  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0531  protein of unknown function UPF0079  41.83 
 
 		 157 aa  98.2  4e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0352512  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002255  ATPase YjeE  39.22 
 
 		 154 aa  98.2  4e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000336436  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2017  hypothetical protein  45.65 
 
 		 513 aa  98.2  4e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0893  protein of unknown function UPF0079  46.31 
 
 		 156 aa  98.2  4e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.419695  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2100  hypothetical protein  45.65 
 
 		 513 aa  98.2  5e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2671  RNA binding S1  41.67 
 
 		 157 aa  98.2  5e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.543969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1606  protein of unknown function UPF0079  47.33 
 
 		 529 aa  97.8  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0383764  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0599  hypothetical protein  41.06 
 
 		 152 aa  97.4  7e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0046  hypothetical protein  45.57 
 
 		 507 aa  97.4  7e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.810658  normal  0.280558 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4635  putative ATPase  40.85 
 
 		 153 aa  97.4  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00161848  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0631  hypothetical protein  46.32 
 
 		 155 aa  97.4  8e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.40036 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0488  hypothetical protein  36.84 
 
 		 153 aa  97.4  8e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.381265  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0488  protein of unknown function UPF0079  42.58 
 
 		 160 aa  97.4  8e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000100685  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3739  protein of unknown function UPF0079  45.45 
 
 		 159 aa  97.1  9e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.124017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3436  hypothetical protein  40.27 
 
 		 152 aa  97.1  9e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000774396  normal  0.208239 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4775  putative ATPase  40.85 
 
 		 152 aa  96.7  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0594287 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2364  protein of unknown function UPF0079  46.77 
 
 		 183 aa  96.7  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.118731  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4718  putative ATPase  40.85 
 
 		 153 aa  97.1  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.983496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4754  putative ATPase  40.85 
 
 		 152 aa  96.7  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.382277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0961  hypothetical protein  46.46 
 
 		 163 aa  97.1  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.14989  hitchhiker  0.00154455 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4625  putative ATPase  40.85 
 
 		 152 aa  96.7  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0493  aminoglycoside phosphotransferase  47.33 
 
 		 514 aa  97.1  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248724 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5684  putative ATPase  40.85 
 
 		 152 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000102371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4639  putative ATPase  40.85 
 
 		 152 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.162208  normal  0.0835245 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1503  hypothetical protein  46.77 
 
 		 188 aa  95.9  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.170985  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3725  putative ATPase  42.76 
 
 		 160 aa  95.9  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0265653  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04035  ATPase with strong ADP affinity  40.85 
 
 		 153 aa  95.5  3e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000985798  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3825  protein of unknown function UPF0079  40.85 
 
 		 153 aa  95.5  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000776436  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03997  hypothetical protein  40.85 
 
 		 153 aa  95.5  3e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000527155  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4699  putative ATPase  40.85 
 
 		 153 aa  95.5  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000112747  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3845  putative ATPase  40.85 
 
 		 153 aa  95.5  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000032368  hitchhiker  0.00000180276 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0713  hypothetical protein  40.58 
 
 		 187 aa  95.5  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273172  normal  0.667416 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4725  putative ATPase  40.85 
 
 		 153 aa  95.5  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000010993  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4410  putative ATPase  40.85 
 
 		 153 aa  95.5  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000607313  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07500  ATPase, with role in cell wall biosynthesis  42.58 
 
 		 156 aa  95.5  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0610132  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0617  protein of unknown function UPF0079  38.28 
 
 		 150 aa  95.1  4e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.202797  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1390  protein of unknown function UPF0079  43.97 
 
 		 167 aa  95.1  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.004631  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2797  hypothetical protein  43.92 
 
 		 472 aa  94.4  6e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3923  putative ATPase  42.76 
 
 		 160 aa  94.4  7e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00130971  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0054  hypothetical protein  43.62 
 
 		 507 aa  94  8e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.885213  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2422  hypothetical protein  33.86 
 
 		 154 aa  94  8e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2132  hypothetical protein  33.86 
 
 		 154 aa  94  8e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3029  hypothetical protein  39.47 
 
 		 153 aa  94  9e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.63375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5677  hypothetical protein  43.38 
 
 		 155 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.178555  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4946  hypothetical protein  42.96 
 
 		 142 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0587  hypothetical protein  47.66 
 
 		 562 aa  93.6  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.977621 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2452  protein of unknown function UPF0079  45.97 
 
 		 183 aa  92.8  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3974  hypothetical protein  39.61 
 
 		 153 aa  92.4  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2410  protein of unknown function UPF0079  44.2 
 
 		 192 aa  93.2  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65380  hypothetical protein  42.65 
 
 		 155 aa  92  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0610791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1776  hypothetical protein  37.5 
 
 		 161 aa  92  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00431445  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2530  protein of unknown function UPF0079  35.71 
 
 		 176 aa  91.3  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000117314  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>