More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0961 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0961  hypothetical protein  100 
 
 
163 aa  323  8.000000000000001e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.14989  hitchhiker  0.00154455 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2888  hypothetical protein  43.4 
 
 
161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000829466  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00098  hypothetical protein  44.81 
 
 
154 aa  112  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002255  ATPase YjeE  46.58 
 
 
154 aa  110  6e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000336436  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0427  putative ATPase  45.75 
 
 
156 aa  109  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368421  hitchhiker  0.000000532779 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3803  putative ATPase  50.75 
 
 
156 aa  110  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000296648  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3657  putative ATPase  50.75 
 
 
156 aa  110  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000030083  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0703  putative ATPase  50.75 
 
 
156 aa  110  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000204367  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0531  protein of unknown function UPF0079  47.45 
 
 
157 aa  107  5e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0352512  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1531  ATPase or kinase  42.36 
 
 
149 aa  108  5e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3739  protein of unknown function UPF0079  44.27 
 
 
159 aa  107  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.124017  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3725  putative ATPase  43.42 
 
 
160 aa  105  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0265653  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2754  hypothetical protein  47.15 
 
 
188 aa  104  4e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000152007  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0488  protein of unknown function UPF0079  47.79 
 
 
160 aa  104  5e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000100685  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0713  hypothetical protein  48.8 
 
 
187 aa  104  6e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273172  normal  0.667416 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0399  protein of unknown function UPF0079  37.25 
 
 
160 aa  103  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0207503 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3923  putative ATPase  42.76 
 
 
160 aa  102  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00130971  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0562  hypothetical protein  41.22 
 
 
157 aa  102  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000200674  normal  0.209641 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0793  hypothetical protein  40.14 
 
 
152 aa  101  4e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.949281  hitchhiker  0.00232347 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2781  hypothetical protein  40.69 
 
 
154 aa  101  4e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3544  hypothetical protein  41.96 
 
 
160 aa  101  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1496  hypothetical protein  48 
 
 
179 aa  100  7e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00826257  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3974  hypothetical protein  49.02 
 
 
153 aa  100  8e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0599  hypothetical protein  40 
 
 
152 aa  100  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0351  putative ATPase  45.38 
 
 
153 aa  100  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000572111  hitchhiker  0.00108821 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5035  hypothetical protein  39.74 
 
 
157 aa  100  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4775  putative ATPase  44.62 
 
 
152 aa  99  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0594287 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0918  hypothetical protein  42.47 
 
 
175 aa  99.8  2e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4754  putative ATPase  44.62 
 
 
152 aa  99  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.382277  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4635  putative ATPase  44.62 
 
 
153 aa  99.4  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00161848  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2855  protein of unknown function UPF0079  44.52 
 
 
164 aa  99  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.314957 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2530  protein of unknown function UPF0079  39.1 
 
 
176 aa  99.4  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000117314  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0594  hypothetical protein  40 
 
 
152 aa  99.4  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997285  hitchhiker  0.000000403865 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4625  putative ATPase  44.62 
 
 
152 aa  99  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0593  hypothetical protein  40 
 
 
152 aa  99.4  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0559818  hitchhiker  0.0000222246 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4718  putative ATPase  44.62 
 
 
153 aa  99  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.983496  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04035  ATPase with strong ADP affinity  43.7 
 
 
153 aa  98.2  4e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000985798  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3825  protein of unknown function UPF0079  43.7 
 
 
153 aa  98.2  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000776436  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03997  hypothetical protein  43.7 
 
 
153 aa  98.2  4e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000527155  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4699  putative ATPase  43.7 
 
 
153 aa  98.2  4e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000112747  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1800  hypothetical protein  44.26 
 
 
161 aa  98.2  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.009423  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2627  hypothetical protein  36.24 
 
 
160 aa  98.2  4e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1097  protein of unknown function UPF0079  43.75 
 
 
152 aa  98.6  4e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4410  putative ATPase  43.7 
 
 
153 aa  98.2  4e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000607313  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4639  putative ATPase  43.7 
 
 
152 aa  98.2  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.162208  normal  0.0835245 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0289  conserved hypothetical protein TIGR00150  39.07 
 
 
157 aa  98.2  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.023351  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5684  putative ATPase  43.7 
 
 
152 aa  98.2  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000102371  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4725  putative ATPase  43.7 
 
 
153 aa  98.2  4e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000010993  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2422  hypothetical protein  38.84 
 
 
154 aa  98.2  4e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2132  hypothetical protein  38.84 
 
 
154 aa  98.2  4e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3845  putative ATPase  43.7 
 
 
153 aa  98.2  4e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000032368  hitchhiker  0.00000180276 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2754  hypothetical protein  36.24 
 
 
160 aa  98.2  5e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3436  hypothetical protein  40 
 
 
152 aa  97.8  5e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000774396  normal  0.208239 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19780  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  46.56 
 
 
152 aa  97.8  5e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0805781  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0216  protein of unknown function UPF0079  45.83 
 
 
152 aa  97.8  6e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3245  hypothetical protein  47.33 
 
 
504 aa  97.4  7e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479121  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0244  hypothetical protein  44.63 
 
 
157 aa  97.4  8e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0258  hypothetical protein  44.63 
 
 
157 aa  97.4  8e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0230  hypothetical protein  44.63 
 
 
157 aa  97.1  9e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0284  conserved hypothetical protein TIGR00150  44.63 
 
 
157 aa  97.1  9e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0147  protein of unknown function UPF0079  39.39 
 
 
160 aa  97.1  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0643293  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3438  hypothetical protein  46.46 
 
 
165 aa  97.1  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0159853  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0243  hypothetical protein  41.18 
 
 
157 aa  97.1  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2261  hypothetical protein  39.62 
 
 
164 aa  97.1  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000158801  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0046  protein of unknown function UPF0079  38.89 
 
 
174 aa  95.9  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00645  ATP/GTP hydrolase  39.72 
 
 
160 aa  95.9  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0236  hypothetical protein  42.11 
 
 
157 aa  95.9  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000721135  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3315  hypothetical protein  41.79 
 
 
152 aa  96.3  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00300444  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0279  hypothetical protein  43.8 
 
 
157 aa  95.1  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0232  P-loop hydrolase  43.8 
 
 
157 aa  95.1  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4849  hypothetical protein  41.86 
 
 
150 aa  94.7  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366742  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4357  hypothetical protein  44 
 
 
189 aa  94.7  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.282412 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0308  conserved hypothetical protein TIGR00150  43.8 
 
 
157 aa  95.1  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3714  protein of unknown function UPF0079  41.04 
 
 
152 aa  94.7  5e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160948  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3771  hypothetical protein  41.04 
 
 
152 aa  94.7  5e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000107911  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3897  hypothetical protein  41.04 
 
 
152 aa  94.7  5e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000307374  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0554  hypothetical protein  41.04 
 
 
152 aa  94.7  5e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971051  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1005  hypothetical protein  44.44 
 
 
160 aa  94  9e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000601093  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1082  hypothetical protein  42.11 
 
 
183 aa  94  9e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.585915  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3029  hypothetical protein  39.55 
 
 
153 aa  93.6  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.63375  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0383  hypothetical protein  45.45 
 
 
506 aa  93.2  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3209  hypothetical protein  34.84 
 
 
157 aa  93.2  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000564317  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07500  ATPase, with role in cell wall biosynthesis  42.96 
 
 
156 aa  93.6  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0610132  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4289  protein of unknown function UPF0079  44.06 
 
 
505 aa  93.6  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0623599  normal  0.680884 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0631  hypothetical protein  42.36 
 
 
155 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.40036 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3242  hypothetical protein  39.86 
 
 
152 aa  92.8  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4946  hypothetical protein  42.31 
 
 
142 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3962  protein of unknown function UPF0079  44.06 
 
 
503 aa  92.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3284  hypothetical protein  37.5 
 
 
152 aa  92.4  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000351541  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1881  hypothetical protein  38.51 
 
 
160 aa  92.8  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000937898  hitchhiker  0.0000223198 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2160  hypothetical protein  36.81 
 
 
155 aa  93.2  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000258956 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11800  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  44.59 
 
 
163 aa  92.8  2e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0346  hypothetical protein  42.75 
 
 
143 aa  92.4  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.101542  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01950  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  35.76 
 
 
158 aa  92  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3020  protein of unknown function UPF0079  40.43 
 
 
153 aa  92  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4174  hypothetical protein  36.05 
 
 
152 aa  92  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0799  protein of unknown function UPF0079  39.52 
 
 
150 aa  91.7  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0568  hypothetical protein  41.86 
 
 
143 aa  91.3  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0814  protein of unknown function UPF0079  36.91 
 
 
161 aa  90.9  7e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1635  protein of unknown function UPF0079  39.61 
 
 
173 aa  90.9  7e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>