More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1881 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1881  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  322  1e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000937898  hitchhiker  0.0000223198 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1800  hypothetical protein  68.12 
 
 		 161 aa  220  4.9999999999999996e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.009423  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1263  protein of unknown function UPF0079  56.58 
 
 		 153 aa  177  5.999999999999999e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00204178  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3020  protein of unknown function UPF0079  55.26 
 
 		 153 aa  174  3e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2319  hypothetical protein  52.67 
 
 		 162 aa  169  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000629849  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2016  hypothetical protein  48.99 
 
 		 158 aa  150  7e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2530  protein of unknown function UPF0079  47.44 
 
 		 176 aa  147  4e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000117314  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2261  hypothetical protein  47.65 
 
 		 164 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000158801  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2888  hypothetical protein  49.34 
 
 		 161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000829466  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1635  protein of unknown function UPF0079  47.3 
 
 		 173 aa  142  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0488  hypothetical protein  53.52 
 
 		 153 aa  139  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.381265  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0774  hypothetical protein  46.26 
 
 		 164 aa  134  6.0000000000000005e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000567369  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1097  protein of unknown function UPF0079  46.36 
 
 		 152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3739  protein of unknown function UPF0079  45.81 
 
 		 159 aa  131  5e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.124017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0713  hypothetical protein  44.3 
 
 		 187 aa  130  6e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273172  normal  0.667416 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2169  hypothetical protein  42.14 
 
 		 167 aa  127  4.0000000000000003e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.884354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4357  hypothetical protein  43.23 
 
 		 189 aa  125  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282412 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0216  protein of unknown function UPF0079  45.45 
 
 		 152 aa  125  3e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0965  protein of unknown function UPF0079  40 
 
 		 156 aa  124  5e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0799  protein of unknown function UPF0079  50.41 
 
 		 150 aa  123  9e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01950  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  43.4 
 
 		 158 aa  122  3e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2519  protein of unknown function UPF0079  46.38 
 
 		 159 aa  121  4e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1005  hypothetical protein  45.14 
 
 		 160 aa  121  4e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000601093  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0399  protein of unknown function UPF0079  43.24 
 
 		 160 aa  121  4e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0207503 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4975  hypothetical protein  37.42 
 
 		 171 aa  121  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0236  hypothetical protein  46.97 
 
 		 157 aa  120  6e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000721135  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0289  conserved hypothetical protein TIGR00150  47.73 
 
 		 157 aa  120  7e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.023351  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5035  hypothetical protein  46.97 
 
 		 157 aa  118  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0147  protein of unknown function UPF0079  43.71 
 
 		 160 aa  118  3.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0643293  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0279  hypothetical protein  46.21 
 
 		 157 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0308  conserved hypothetical protein TIGR00150  46.21 
 
 		 157 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2160  hypothetical protein  44.29 
 
 		 155 aa  117  7.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258956 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0244  hypothetical protein  45.45 
 
 		 157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0230  hypothetical protein  45.45 
 
 		 157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0232  P-loop hydrolase  46.21 
 
 		 157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0284  conserved hypothetical protein TIGR00150  45.45 
 
 		 157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0258  hypothetical protein  45.45 
 
 		 157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2422  hypothetical protein  47.58 
 
 		 154 aa  115  3e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2132  hypothetical protein  47.58 
 
 		 154 aa  115  3e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0399  hypothetical protein  43.87 
 
 		 152 aa  114  3.9999999999999997e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0100312  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0375  hypothetical protein  39.62 
 
 		 163 aa  115  3.9999999999999997e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128461  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_339  hypothetical protein  39.62 
 
 		 163 aa  114  5e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00581672  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0243  hypothetical protein  47.33 
 
 		 157 aa  114  7.999999999999999e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1776  hypothetical protein  44.88 
 
 		 161 aa  112  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00431445  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0396  hypothetical protein  38.99 
 
 		 163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1243  protein of unknown function UPF0079  39.74 
 
 		 184 aa  111  4.0000000000000004e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6124  protein of unknown function UPF0079  47.86 
 
 		 161 aa  108  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0433891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0046  protein of unknown function UPF0079  39.22 
 
 		 174 aa  108  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2330  hypothetical protein  41.67 
 
 		 182 aa  107  6e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2452  protein of unknown function UPF0079  40.82 
 
 		 183 aa  107  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0346  hypothetical protein  42.86 
 
 		 143 aa  107  9.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.101542  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4289  protein of unknown function UPF0079  47.32 
 
 		 505 aa  106  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0623599  normal  0.680884 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0487  hypothetical protein  40.82 
 
 		 148 aa  106  1e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3962  protein of unknown function UPF0079  43.9 
 
 		 503 aa  106  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2465  protein of unknown function UPF0079  48.46 
 
 		 152 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0181492 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2408  protein of unknown function UPF0079  48.46 
 
 		 152 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19780  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  39.86 
 
 		 152 aa  105  4e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0805781  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0444  protein of unknown function UPF0079  36.24 
 
 		 157 aa  104  4e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2364  protein of unknown function UPF0079  43.9 
 
 		 183 aa  104  6e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.118731  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1503  hypothetical protein  44.44 
 
 		 188 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.170985  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0408  hypothetical protein  39.06 
 
 		 157 aa  102  2e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1869  hypothetical protein  39.47 
 
 		 158 aa  101  5e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000565626  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2855  protein of unknown function UPF0079  39.87 
 
 		 164 aa  100  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.314957 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0366  hypothetical protein  36.49 
 
 		 169 aa  98.6  3e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3281  hypothetical protein  40.3 
 
 		 144 aa  98.6  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0376  hypothetical protein  40.4 
 
 		 147 aa  98.2  4e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0483  protein of unknown function UPF0079  38.24 
 
 		 149 aa  97.8  5e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.790809  normal  0.0607901 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0090  protein of unknown function UPF0079  37.78 
 
 		 145 aa  97.4  6e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.184225  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1469  hypothetical protein  43.51 
 
 		 143 aa  97.4  7e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0134  protein of unknown function UPF0079  37.04 
 
 		 146 aa  97.4  7e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65380  hypothetical protein  39.73 
 
 		 155 aa  97.1  9e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0610791  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1664  hypothetical protein  35.26 
 
 		 153 aa  96.7  1e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0122  protein of unknown function UPF0079  37.14 
 
 		 158 aa  96.7  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000147481  hitchhiker  0.00840651 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0100  protein of unknown function UPF0079  36.3 
 
 		 151 aa  96.3  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0009157  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4455  hypothetical protein  47.01 
 
 		 152 aa  96.3  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1531  ATPase or kinase  38.89 
 
 		 149 aa  96.3  1e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2531  hypothetical protein  41.94 
 
 		 162 aa  96.3  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5677  hypothetical protein  39.73 
 
 		 155 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.178555  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0814  protein of unknown function UPF0079  36.62 
 
 		 161 aa  95.1  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2671  RNA binding S1  42.06 
 
 		 157 aa  94.7  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.543969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2639  protein of unknown function UPF0079  42.03 
 
 		 154 aa  94.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.266416 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3245  hypothetical protein  40.16 
 
 		 504 aa  93.2  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0118  hypothetical protein  49.07 
 
 		 152 aa  92.8  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.927124 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18361  ATPase or kinase  45.79 
 
 		 145 aa  92.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.130336  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0961  hypothetical protein  38.51 
 
 		 163 aa  92.8  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.14989  hitchhiker  0.00154455 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0051  hypothetical protein  52 
 
 		 502 aa  91.7  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0369  protein of unknown function UPF0079  38.67 
 
 		 161 aa  91.7  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0562  hypothetical protein  37.84 
 
 		 157 aa  91.3  5e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000200674  normal  0.209641 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4849  hypothetical protein  38.62 
 
 		 150 aa  90.1  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4283  protein of unknown function UPF0079  32.84 
 
 		 138 aa  90.1  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07500  ATPase, with role in cell wall biosynthesis  42.22 
 
 		 156 aa  89.4  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0610132  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3050  hypothetical protein  48 
 
 		 153 aa  89.7  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.664938  normal  0.025275 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1719  hypothetical protein  43.93 
 
 		 145 aa  89.4  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.266415  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1784  protein of unknown function UPF0079  40.87 
 
 		 176 aa  89.4  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0485483  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0793  hypothetical protein  40.85 
 
 		 152 aa  89  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.949281  hitchhiker  0.00232347 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1664  ATPase or kinase  36.36 
 
 		 152 aa  89  3e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0927  hypothetical protein  34.29 
 
 		 138 aa  88.2  4e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.641059 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1522  hypothetical protein  47.22 
 
 		 161 aa  88.2  4e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.229097  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2157  hypothetical protein  50 
 
 		 165 aa  88.2  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3315  hypothetical protein  34.51 
 
 		 152 aa  88.6  4e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00300444  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>