More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2261 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2261  hypothetical protein  100 
 
 
164 aa  334  3.9999999999999995e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000158801  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2530  protein of unknown function UPF0079  51.97 
 
 
176 aa  159  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000117314  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1263  protein of unknown function UPF0079  51.68 
 
 
153 aa  149  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00204178  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3020  protein of unknown function UPF0079  50.34 
 
 
153 aa  147  8e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1881  hypothetical protein  47.65 
 
 
160 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000937898  hitchhiker  0.0000223198 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2319  hypothetical protein  42.5 
 
 
162 aa  140  7e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000629849  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1800  hypothetical protein  46.31 
 
 
161 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.009423  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2888  hypothetical protein  41.33 
 
 
161 aa  128  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000829466  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2519  protein of unknown function UPF0079  44.9 
 
 
159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3739  protein of unknown function UPF0079  50.83 
 
 
159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.124017  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5035  hypothetical protein  41.96 
 
 
157 aa  122  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1005  hypothetical protein  40 
 
 
160 aa  122  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000601093  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0284  conserved hypothetical protein TIGR00150  41.26 
 
 
157 aa  122  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0244  hypothetical protein  41.26 
 
 
157 aa  122  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0230  hypothetical protein  41.26 
 
 
157 aa  122  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0258  hypothetical protein  41.26 
 
 
157 aa  122  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0216  protein of unknown function UPF0079  42.28 
 
 
152 aa  122  3e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0289  conserved hypothetical protein TIGR00150  41.26 
 
 
157 aa  120  7e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.023351  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_339  hypothetical protein  37.82 
 
 
163 aa  120  8e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00581672  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0375  hypothetical protein  39.1 
 
 
163 aa  120  9e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128461  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1097  protein of unknown function UPF0079  40.52 
 
 
152 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0279  hypothetical protein  41.26 
 
 
157 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0232  P-loop hydrolase  41.26 
 
 
157 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0243  hypothetical protein  37.89 
 
 
157 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0308  conserved hypothetical protein TIGR00150  41.26 
 
 
157 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0236  hypothetical protein  40.56 
 
 
157 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000721135  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0488  hypothetical protein  40.91 
 
 
153 aa  118  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.381265  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0713  hypothetical protein  40.65 
 
 
187 aa  116  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273172  normal  0.667416 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2016  hypothetical protein  37.91 
 
 
158 aa  116  9.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3245  hypothetical protein  41.18 
 
 
504 aa  115  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479121  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0396  hypothetical protein  35.9 
 
 
163 aa  114  6.9999999999999995e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0965  protein of unknown function UPF0079  38.31 
 
 
156 aa  114  7.999999999999999e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1776  hypothetical protein  38.12 
 
 
161 aa  113  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00431445  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4357  hypothetical protein  39.35 
 
 
189 aa  112  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.282412 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01950  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  36.67 
 
 
158 aa  111  4.0000000000000004e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0346  hypothetical protein  40.43 
 
 
143 aa  110  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.101542  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0399  protein of unknown function UPF0079  39.74 
 
 
160 aa  110  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0207503 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2452  protein of unknown function UPF0079  43.48 
 
 
183 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2364  protein of unknown function UPF0079  43.48 
 
 
183 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.118731  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0147  protein of unknown function UPF0079  42.48 
 
 
160 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0643293  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1503  hypothetical protein  42.75 
 
 
188 aa  108  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.170985  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2330  hypothetical protein  48.25 
 
 
182 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0046  protein of unknown function UPF0079  37.5 
 
 
174 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0799  protein of unknown function UPF0079  37.76 
 
 
150 aa  107  9.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1635  protein of unknown function UPF0079  36.55 
 
 
173 aa  107  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2160  hypothetical protein  41.43 
 
 
155 aa  105  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000258956 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0483  protein of unknown function UPF0079  39.1 
 
 
149 aa  103  1e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.790809  normal  0.0607901 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1531  ATPase or kinase  41.73 
 
 
149 aa  103  1e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0399  hypothetical protein  36.88 
 
 
152 aa  102  3e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0100312  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4289  protein of unknown function UPF0079  41.13 
 
 
505 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0623599  normal  0.680884 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2169  hypothetical protein  37.16 
 
 
167 aa  99.8  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.884354  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0444  protein of unknown function UPF0079  37.86 
 
 
157 aa  99.8  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1869  hypothetical protein  36.77 
 
 
158 aa  97.4  8e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000565626  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2422  hypothetical protein  34.72 
 
 
154 aa  97.1  9e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2132  hypothetical protein  34.72 
 
 
154 aa  97.1  9e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0814  protein of unknown function UPF0079  36.42 
 
 
161 aa  96.3  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0961  hypothetical protein  39.62 
 
 
163 aa  97.1  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.14989  hitchhiker  0.00154455 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2781  hypothetical protein  34.19 
 
 
154 aa  96.3  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19780  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  33.33 
 
 
152 aa  95.9  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0805781  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1664  ATPase or kinase  39.87 
 
 
152 aa  96.3  2e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2855  protein of unknown function UPF0079  36.11 
 
 
164 aa  95.5  3e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.314957 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2531  hypothetical protein  40.43 
 
 
162 aa  95.1  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3803  putative ATPase  37.5 
 
 
156 aa  95.1  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000296648  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0703  putative ATPase  37.5 
 
 
156 aa  95.1  4e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000204367  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2754  hypothetical protein  38.03 
 
 
188 aa  94.4  6e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000152007  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4975  hypothetical protein  31.45 
 
 
171 aa  94.4  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3657  putative ATPase  37.5 
 
 
156 aa  94.4  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000030083  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0774  hypothetical protein  34.46 
 
 
164 aa  94  7e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000567369  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0562  hypothetical protein  35.06 
 
 
157 aa  93.6  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000200674  normal  0.209641 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0617  protein of unknown function UPF0079  36.72 
 
 
150 aa  93.2  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.202797  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0793  hypothetical protein  33.55 
 
 
152 aa  92  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.949281  hitchhiker  0.00232347 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3962  protein of unknown function UPF0079  36.69 
 
 
503 aa  90.9  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0376  hypothetical protein  32.87 
 
 
147 aa  90.9  7e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2842  hypothetical protein  37.76 
 
 
158 aa  89.7  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.523389 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3438  hypothetical protein  37.16 
 
 
165 aa  89  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0159853  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0134  protein of unknown function UPF0079  37.41 
 
 
146 aa  89  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0090  protein of unknown function UPF0079  34.56 
 
 
145 aa  89  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.184225  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2666  hypothetical protein  36.5 
 
 
143 aa  89  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0641125  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3029  hypothetical protein  33.77 
 
 
153 aa  88.6  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.63375  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2100  hypothetical protein  36.11 
 
 
513 aa  88.2  4e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0427  putative ATPase  34.16 
 
 
156 aa  88.6  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368421  hitchhiker  0.000000532779 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3544  hypothetical protein  31.68 
 
 
160 aa  87.8  5e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2773  hypothetical protein  39.23 
 
 
165 aa  87.8  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.018672  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2017  hypothetical protein  36.11 
 
 
513 aa  88.2  5e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00098  hypothetical protein  35.66 
 
 
154 aa  87.4  8e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1469  hypothetical protein  34.82 
 
 
143 aa  86.7  1e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1390  protein of unknown function UPF0079  35.48 
 
 
167 aa  86.7  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.004631  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002255  ATPase YjeE  36.36 
 
 
154 aa  87  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000336436  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1524  hypothetical protein  32.47 
 
 
159 aa  86.7  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.535681  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0408  hypothetical protein  32 
 
 
157 aa  86.3  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4849  hypothetical protein  39.69 
 
 
150 aa  86.3  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366742  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4174  hypothetical protein  31.51 
 
 
152 aa  85.5  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0321  hypothetical protein  33.96 
 
 
162 aa  85.5  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1784  protein of unknown function UPF0079  34.75 
 
 
176 aa  84.7  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0485483  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0100  protein of unknown function UPF0079  33.58 
 
 
151 aa  84.7  5e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0009157  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4283  protein of unknown function UPF0079  33.93 
 
 
138 aa  84.7  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3315  hypothetical protein  31.21 
 
 
152 aa  84.7  5e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00300444  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3462  protein of unknown function UPF0079  33.77 
 
 
169 aa  84.7  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.191362  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0631  hypothetical protein  34.39 
 
 
155 aa  84.3  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.40036 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3284  hypothetical protein  32.45 
 
 
152 aa  84  8e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000351541  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>