More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0814 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_0814  protein of unknown function UPF0079  100 
 
 
161 aa  323  6e-88  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01950  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  42.48 
 
 
158 aa  121  3e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2160  hypothetical protein  40.26 
 
 
155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000258956 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0279  hypothetical protein  42.31 
 
 
157 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0308  conserved hypothetical protein TIGR00150  42.31 
 
 
157 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0236  hypothetical protein  41.54 
 
 
157 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000721135  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0244  hypothetical protein  42.31 
 
 
157 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0230  hypothetical protein  42.31 
 
 
157 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0258  hypothetical protein  42.31 
 
 
157 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0284  conserved hypothetical protein TIGR00150  42.31 
 
 
157 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0216  protein of unknown function UPF0079  39.86 
 
 
152 aa  107  5e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0232  P-loop hydrolase  41.54 
 
 
157 aa  107  6e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5035  hypothetical protein  41.54 
 
 
157 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0289  conserved hypothetical protein TIGR00150  41.54 
 
 
157 aa  107  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.023351  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0243  hypothetical protein  43.08 
 
 
157 aa  105  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3962  protein of unknown function UPF0079  39.86 
 
 
503 aa  104  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0396  hypothetical protein  40.97 
 
 
163 aa  103  7e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1005  hypothetical protein  40.28 
 
 
160 aa  103  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000601093  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0799  protein of unknown function UPF0079  40.3 
 
 
150 aa  102  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_339  hypothetical protein  39.58 
 
 
163 aa  102  2e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00581672  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1097  protein of unknown function UPF0079  35.71 
 
 
152 aa  102  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0713  hypothetical protein  42.52 
 
 
187 aa  102  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273172  normal  0.667416 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1469  hypothetical protein  44.86 
 
 
143 aa  101  3e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4289  protein of unknown function UPF0079  38.62 
 
 
505 aa  101  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0623599  normal  0.680884 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1635  protein of unknown function UPF0079  39.13 
 
 
173 aa  101  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2016  hypothetical protein  43.2 
 
 
158 aa  100  6e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0488  hypothetical protein  38.26 
 
 
153 aa  100  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.381265  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2519  protein of unknown function UPF0079  40.91 
 
 
159 aa  99.4  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4975  hypothetical protein  36.02 
 
 
171 aa  99.4  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0046  protein of unknown function UPF0079  37.93 
 
 
174 aa  98.6  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0375  hypothetical protein  38.19 
 
 
163 aa  99  3e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128461  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0376  hypothetical protein  40.69 
 
 
147 aa  98.6  3e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2781  hypothetical protein  35.76 
 
 
154 aa  98.2  5e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4357  hypothetical protein  38.26 
 
 
189 aa  97.4  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.282412 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4849  hypothetical protein  44 
 
 
150 aa  97.4  7e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366742  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0399  hypothetical protein  43.18 
 
 
152 aa  97.4  8e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0100312  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1800  hypothetical protein  39.16 
 
 
161 aa  97.1  9e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.009423  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2888  hypothetical protein  40.62 
 
 
161 aa  97.1  9e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000829466  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0444  protein of unknown function UPF0079  36.96 
 
 
157 aa  96.7  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2089  hypothetical protein  44.74 
 
 
164 aa  96.7  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.38888  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2126  hypothetical protein  44.74 
 
 
164 aa  96.7  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3739  protein of unknown function UPF0079  41.43 
 
 
159 aa  96.7  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.124017  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2422  hypothetical protein  37.31 
 
 
154 aa  96.7  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2132  hypothetical protein  37.31 
 
 
154 aa  96.7  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0408  hypothetical protein  36.73 
 
 
157 aa  96.7  1e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2261  hypothetical protein  36.42 
 
 
164 aa  96.3  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000158801  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2754  hypothetical protein  36.91 
 
 
188 aa  95.1  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000152007  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1881  hypothetical protein  36.62 
 
 
160 aa  95.1  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000937898  hitchhiker  0.0000223198 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1776  hypothetical protein  40.16 
 
 
161 aa  95.5  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00431445  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00098  hypothetical protein  41.04 
 
 
154 aa  95.1  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0562  hypothetical protein  39.57 
 
 
157 aa  94.7  4e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000200674  normal  0.209641 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2017  hypothetical protein  39.74 
 
 
513 aa  94.7  4e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2100  hypothetical protein  39.74 
 
 
513 aa  94.7  5e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3771  hypothetical protein  37.41 
 
 
152 aa  94.4  6e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000107911  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3897  hypothetical protein  37.41 
 
 
152 aa  94.4  6e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000307374  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3714  protein of unknown function UPF0079  37.41 
 
 
152 aa  94.4  6e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160948  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0554  hypothetical protein  37.41 
 
 
152 aa  94.4  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971051  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3029  hypothetical protein  34.64 
 
 
153 aa  94  9e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.63375  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0427  putative ATPase  35.1 
 
 
156 aa  93.2  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368421  hitchhiker  0.000000532779 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0147  protein of unknown function UPF0079  38.93 
 
 
160 aa  93.6  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0643293  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3923  putative ATPase  34.87 
 
 
160 aa  93.6  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00130971  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2531  hypothetical protein  35.37 
 
 
162 aa  93.2  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2530  protein of unknown function UPF0079  40.48 
 
 
176 aa  93.2  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000117314  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3245  hypothetical protein  38.69 
 
 
504 aa  93.6  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479121  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002255  ATPase YjeE  41.04 
 
 
154 aa  93.2  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000336436  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0366  hypothetical protein  36.91 
 
 
169 aa  92.8  2e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2319  hypothetical protein  33.55 
 
 
162 aa  92.4  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000629849  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0321  hypothetical protein  38.97 
 
 
162 aa  92  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2639  protein of unknown function UPF0079  40.56 
 
 
154 aa  92  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.266416 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0351  putative ATPase  35.86 
 
 
153 aa  92  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000572111  hitchhiker  0.00108821 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3242  hypothetical protein  40.31 
 
 
152 aa  91.7  4e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0961  hypothetical protein  36.91 
 
 
163 aa  90.9  7e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.14989  hitchhiker  0.00154455 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07500  ATPase, with role in cell wall biosynthesis  41.73 
 
 
156 aa  90.5  9e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0610132  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3284  hypothetical protein  35.25 
 
 
152 aa  90.5  9e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000351541  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1784  protein of unknown function UPF0079  37.14 
 
 
176 aa  90.1  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0485483  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4625  putative ATPase  35.17 
 
 
152 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4635  putative ATPase  35.17 
 
 
153 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00161848  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1604  protein of unknown function UPF0079  37.01 
 
 
135 aa  89.4  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4775  putative ATPase  35.17 
 
 
152 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0594287 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4718  putative ATPase  35.17 
 
 
153 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.983496  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0399  protein of unknown function UPF0079  44.33 
 
 
160 aa  89.7  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0207503 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3281  hypothetical protein  41.73 
 
 
144 aa  89  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223285  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2330  hypothetical protein  38.39 
 
 
182 aa  89.4  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4754  putative ATPase  35.17 
 
 
152 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.382277  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1531  ATPase or kinase  35.92 
 
 
149 aa  89  2e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0599  hypothetical protein  39.72 
 
 
152 aa  89  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0594  hypothetical protein  39.72 
 
 
152 aa  88.6  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997285  hitchhiker  0.000000403865 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3315  hypothetical protein  33.79 
 
 
152 aa  88.6  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00300444  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0593  hypothetical protein  39.72 
 
 
152 aa  88.6  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0559818  hitchhiker  0.0000222246 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2773  hypothetical protein  40.91 
 
 
165 aa  88.2  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.018672  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0008  P-loop hydrolase family protein  33.56 
 
 
155 aa  88.2  4e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  unclonable  0.00000890288  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3436  hypothetical protein  39.72 
 
 
152 aa  88.2  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000774396  normal  0.208239 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3725  putative ATPase  32.89 
 
 
160 aa  88.2  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0265653  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0346  hypothetical protein  39.32 
 
 
143 aa  87.8  6e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.101542  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0793  hypothetical protein  36.51 
 
 
152 aa  87.8  6e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.949281  hitchhiker  0.00232347 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04035  ATPase with strong ADP affinity  35.86 
 
 
153 aa  87.4  8e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000985798  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3825  protein of unknown function UPF0079  35.86 
 
 
153 aa  87.4  8e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000776436  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3845  putative ATPase  35.86 
 
 
153 aa  87.4  8e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000032368  hitchhiker  0.00000180276 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4699  putative ATPase  35.86 
 
 
153 aa  87.4  8e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000112747  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4410  putative ATPase  35.86 
 
 
153 aa  87.4  8e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000607313  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>