More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1800 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1800  hypothetical protein  100 
 
 
161 aa  325  1.0000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.009423  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1881  hypothetical protein  68.12 
 
 
160 aa  220  4.9999999999999996e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000937898  hitchhiker  0.0000223198 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2319  hypothetical protein  53.95 
 
 
162 aa  166  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000629849  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1263  protein of unknown function UPF0079  54.67 
 
 
153 aa  157  6e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00204178  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3020  protein of unknown function UPF0079  53.33 
 
 
153 aa  154  4e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2888  hypothetical protein  50.32 
 
 
161 aa  153  9e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000829466  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3739  protein of unknown function UPF0079  51.32 
 
 
159 aa  144  5e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.124017  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0488  hypothetical protein  53.1 
 
 
153 aa  144  6e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.381265  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2016  hypothetical protein  51.01 
 
 
158 aa  142  2e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2261  hypothetical protein  46.31 
 
 
164 aa  139  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000158801  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1635  protein of unknown function UPF0079  45.39 
 
 
173 aa  133  8e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0216  protein of unknown function UPF0079  45.39 
 
 
152 aa  131  5e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1097  protein of unknown function UPF0079  45.7 
 
 
152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0236  hypothetical protein  42.04 
 
 
157 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000721135  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0289  conserved hypothetical protein TIGR00150  42.68 
 
 
157 aa  128  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.023351  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1005  hypothetical protein  44.97 
 
 
160 aa  128  3e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000601093  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0279  hypothetical protein  42.04 
 
 
157 aa  127  6e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0308  conserved hypothetical protein TIGR00150  42.04 
 
 
157 aa  127  6e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0965  protein of unknown function UPF0079  41.56 
 
 
156 aa  127  8.000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0244  hypothetical protein  41.4 
 
 
157 aa  127  9.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0232  P-loop hydrolase  42.04 
 
 
157 aa  127  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0258  hypothetical protein  41.4 
 
 
157 aa  127  9.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0230  hypothetical protein  41.4 
 
 
157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5035  hypothetical protein  42.04 
 
 
157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0284  conserved hypothetical protein TIGR00150  41.4 
 
 
157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2530  protein of unknown function UPF0079  44.67 
 
 
176 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000117314  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0243  hypothetical protein  42.68 
 
 
157 aa  125  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0774  hypothetical protein  44.74 
 
 
164 aa  123  9e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000567369  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0375  hypothetical protein  38.36 
 
 
163 aa  123  1e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128461  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0396  hypothetical protein  39.62 
 
 
163 aa  122  2e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0399  hypothetical protein  44.44 
 
 
152 aa  122  2e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0100312  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_339  hypothetical protein  38.36 
 
 
163 aa  122  3e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00581672  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0713  hypothetical protein  42.48 
 
 
187 aa  121  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273172  normal  0.667416 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0399  protein of unknown function UPF0079  40.4 
 
 
160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0207503 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4357  hypothetical protein  41.51 
 
 
189 aa  119  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.282412 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2169  hypothetical protein  44.22 
 
 
167 aa  118  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.884354  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0346  hypothetical protein  48.39 
 
 
143 aa  117  6e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.101542  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4975  hypothetical protein  38.06 
 
 
171 aa  115  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0147  protein of unknown function UPF0079  45.1 
 
 
160 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0643293  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2160  hypothetical protein  46.43 
 
 
155 aa  112  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000258956 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0799  protein of unknown function UPF0079  42.86 
 
 
150 aa  112  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2519  protein of unknown function UPF0079  47.93 
 
 
159 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2422  hypothetical protein  45.76 
 
 
154 aa  108  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2132  hypothetical protein  45.76 
 
 
154 aa  108  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4289  protein of unknown function UPF0079  48.33 
 
 
505 aa  108  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0623599  normal  0.680884 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3962  protein of unknown function UPF0079  45.67 
 
 
503 aa  107  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01950  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  40.65 
 
 
158 aa  107  6e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0118  hypothetical protein  42.07 
 
 
152 aa  106  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.927124 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3245  hypothetical protein  45.04 
 
 
504 aa  106  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479121  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1776  hypothetical protein  42.65 
 
 
161 aa  105  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00431445  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2855  protein of unknown function UPF0079  43.07 
 
 
164 aa  104  5e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.314957 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19780  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  39.33 
 
 
152 aa  103  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0805781  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2330  hypothetical protein  48.28 
 
 
182 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0444  protein of unknown function UPF0079  37.41 
 
 
157 aa  103  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1469  hypothetical protein  45.74 
 
 
143 aa  102  2e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4455  hypothetical protein  47.22 
 
 
152 aa  100  6e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0046  protein of unknown function UPF0079  40.94 
 
 
174 aa  100  7e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2452  protein of unknown function UPF0079  40.27 
 
 
183 aa  100  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0376  hypothetical protein  40.15 
 
 
147 aa  100  1e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1503  hypothetical protein  43.65 
 
 
188 aa  99  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.170985  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1531  ATPase or kinase  40.58 
 
 
149 aa  99.4  2e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2465  protein of unknown function UPF0079  44.19 
 
 
152 aa  98.6  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0181492 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2408  protein of unknown function UPF0079  44.19 
 
 
152 aa  98.6  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0961  hypothetical protein  44.26 
 
 
163 aa  98.2  4e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.14989  hitchhiker  0.00154455 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1869  hypothetical protein  40.79 
 
 
158 aa  97.4  6e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000565626  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2364  protein of unknown function UPF0079  42.74 
 
 
183 aa  97.4  7e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.118731  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0814  protein of unknown function UPF0079  39.16 
 
 
161 aa  97.1  9e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0366  hypothetical protein  37.76 
 
 
169 aa  96.7  1e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0617  protein of unknown function UPF0079  36.8 
 
 
150 aa  96.7  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.202797  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0408  hypothetical protein  39.04 
 
 
157 aa  95.1  3e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0483  protein of unknown function UPF0079  37.23 
 
 
149 aa  94.7  4e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.790809  normal  0.0607901 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1664  hypothetical protein  35.33 
 
 
153 aa  94  8e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2157  hypothetical protein  50.94 
 
 
165 aa  94  8e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1243  protein of unknown function UPF0079  41.18 
 
 
184 aa  94  9e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0487  hypothetical protein  41.27 
 
 
148 aa  93.6  9e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5677  hypothetical protein  39.58 
 
 
155 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.178555  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6124  protein of unknown function UPF0079  45.71 
 
 
161 aa  93.2  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0433891  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65380  hypothetical protein  39.58 
 
 
155 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0610791  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2089  hypothetical protein  34.53 
 
 
164 aa  92.4  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.38888  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2126  hypothetical protein  34.53 
 
 
164 aa  92.4  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2639  protein of unknown function UPF0079  47.17 
 
 
154 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.266416 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11800  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  39.07 
 
 
163 aa  91.7  4e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07500  ATPase, with role in cell wall biosynthesis  44.36 
 
 
156 aa  91.3  5e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0610132  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2627  hypothetical protein  39.5 
 
 
160 aa  89.4  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0387  hypothetical protein  49.06 
 
 
168 aa  89.4  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.919602  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1295  ATPase or kinase  34.42 
 
 
158 aa  89  2e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2754  hypothetical protein  39.5 
 
 
160 aa  89  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1390  protein of unknown function UPF0079  38.46 
 
 
167 aa  88.6  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.004631  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3434  protein of unknown function UPF0079  35.03 
 
 
165 aa  89  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00098  hypothetical protein  37.01 
 
 
154 aa  89  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0134  protein of unknown function UPF0079  40.17 
 
 
146 aa  88.6  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0073  protein of unknown function UPF0079  37.69 
 
 
156 aa  89  3e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2531  hypothetical protein  41.18 
 
 
162 aa  88.2  4e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0100  protein of unknown function UPF0079  37.78 
 
 
151 aa  88.2  4e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0009157  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002255  ATPase YjeE  37.01 
 
 
154 aa  87.8  5e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000336436  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4283  protein of unknown function UPF0079  37.84 
 
 
138 aa  87.8  6e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0051  hypothetical protein  47.01 
 
 
502 aa  87  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1664  ATPase or kinase  39.58 
 
 
152 aa  86.3  1e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18361  ATPase or kinase  41.9 
 
 
145 aa  86.3  2e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.130336  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0369  protein of unknown function UPF0079  39.07 
 
 
161 aa  86.3  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>