More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1531 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1531  ATPase or kinase  100 
 
 
149 aa  307  4e-83  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2888  hypothetical protein  47.62 
 
 
161 aa  122  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000829466  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0399  hypothetical protein  42.22 
 
 
152 aa  121  3e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0100312  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1097  protein of unknown function UPF0079  45.74 
 
 
152 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0216  protein of unknown function UPF0079  45.45 
 
 
152 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0284  conserved hypothetical protein TIGR00150  42.03 
 
 
157 aa  115  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0244  hypothetical protein  41.73 
 
 
157 aa  115  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0230  hypothetical protein  42.03 
 
 
157 aa  115  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0258  hypothetical protein  41.73 
 
 
157 aa  115  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0236  hypothetical protein  42.03 
 
 
157 aa  115  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000721135  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0289  conserved hypothetical protein TIGR00150  42.42 
 
 
157 aa  115  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.023351  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0046  protein of unknown function UPF0079  42.25 
 
 
174 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1664  ATPase or kinase  48.59 
 
 
152 aa  114  5e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5035  hypothetical protein  41.67 
 
 
157 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0279  hypothetical protein  41.3 
 
 
157 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0308  conserved hypothetical protein TIGR00150  41.3 
 
 
157 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0488  hypothetical protein  36.11 
 
 
153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.381265  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0232  P-loop hydrolase  40.58 
 
 
157 aa  110  5e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0243  hypothetical protein  40.91 
 
 
157 aa  110  9e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2422  hypothetical protein  37.5 
 
 
154 aa  109  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2132  hypothetical protein  37.5 
 
 
154 aa  109  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2855  protein of unknown function UPF0079  41.91 
 
 
164 aa  108  3e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.314957 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0961  hypothetical protein  42.36 
 
 
163 aa  108  4.0000000000000004e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.14989  hitchhiker  0.00154455 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3739  protein of unknown function UPF0079  39.85 
 
 
159 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.124017  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19780  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  44.83 
 
 
152 aa  107  7.000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0805781  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0147  protein of unknown function UPF0079  38.69 
 
 
160 aa  106  9.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0643293  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0444  protein of unknown function UPF0079  34.51 
 
 
157 aa  106  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2089  hypothetical protein  39.13 
 
 
164 aa  106  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.38888  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2126  hypothetical protein  39.13 
 
 
164 aa  106  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2016  hypothetical protein  39.33 
 
 
158 aa  104  5e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0799  protein of unknown function UPF0079  37.76 
 
 
150 aa  103  7e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2261  hypothetical protein  41.73 
 
 
164 aa  103  8e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000158801  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01950  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  35 
 
 
158 aa  103  9e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0617  protein of unknown function UPF0079  41.54 
 
 
150 aa  103  9e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.202797  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1664  hypothetical protein  38.81 
 
 
153 aa  102  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2531  hypothetical protein  42.74 
 
 
162 aa  102  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0399  protein of unknown function UPF0079  39.69 
 
 
160 aa  101  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0207503 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2160  hypothetical protein  37.23 
 
 
155 aa  100  8e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000258956 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1800  hypothetical protein  40.58 
 
 
161 aa  99.4  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.009423  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2319  hypothetical protein  34.64 
 
 
162 aa  98.2  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000629849  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0965  protein of unknown function UPF0079  37.5 
 
 
156 aa  97.4  5e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1869  hypothetical protein  38.06 
 
 
158 aa  97.8  5e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000565626  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002255  ATPase YjeE  39.67 
 
 
154 aa  97.4  6e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000336436  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2530  protein of unknown function UPF0079  38.35 
 
 
176 aa  97.4  6e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000117314  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1776  hypothetical protein  35.29 
 
 
161 aa  97.1  7e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00431445  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2519  protein of unknown function UPF0079  37.98 
 
 
159 aa  96.3  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00098  hypothetical protein  38.84 
 
 
154 aa  96.3  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1881  hypothetical protein  38.89 
 
 
160 aa  96.3  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000937898  hitchhiker  0.0000223198 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4357  hypothetical protein  37.8 
 
 
189 aa  96.7  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.282412 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1263  protein of unknown function UPF0079  36.55 
 
 
153 aa  95.9  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00204178  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0346  hypothetical protein  37.5 
 
 
143 aa  95.9  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.101542  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1295  ATPase or kinase  38.89 
 
 
158 aa  95.5  2e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4849  hypothetical protein  37.76 
 
 
150 aa  94.7  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366742  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1784  protein of unknown function UPF0079  35.92 
 
 
176 aa  94.7  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0485483  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2754  hypothetical protein  37.4 
 
 
160 aa  94.4  5e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2627  hypothetical protein  37.4 
 
 
160 aa  94.4  5e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0713  hypothetical protein  37.8 
 
 
187 aa  94.4  5e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273172  normal  0.667416 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1635  protein of unknown function UPF0079  37.01 
 
 
173 aa  94.4  5e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3020  protein of unknown function UPF0079  35.86 
 
 
153 aa  93.6  8e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2754  hypothetical protein  37.78 
 
 
188 aa  93.6  8e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000152007  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0596  hypothetical protein  37.34 
 
 
176 aa  93.6  9e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0366  hypothetical protein  39.34 
 
 
169 aa  92.8  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0375  hypothetical protein  35.97 
 
 
163 aa  93.2  1e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128461  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04035  ATPase with strong ADP affinity  37.59 
 
 
153 aa  92  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000985798  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3825  protein of unknown function UPF0079  37.59 
 
 
153 aa  92  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000776436  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_339  hypothetical protein  34.67 
 
 
163 aa  92.4  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00581672  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0562  hypothetical protein  40.98 
 
 
157 aa  92  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000200674  normal  0.209641 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03997  hypothetical protein  37.59 
 
 
153 aa  92  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000527155  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3050  hypothetical protein  36.64 
 
 
153 aa  92  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.664938  normal  0.025275 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0427  putative ATPase  37.12 
 
 
156 aa  92.8  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368421  hitchhiker  0.000000532779 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4725  putative ATPase  37.59 
 
 
153 aa  92  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000010993  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4283  protein of unknown function UPF0079  34.81 
 
 
138 aa  92.8  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4410  putative ATPase  37.59 
 
 
153 aa  92  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000607313  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3845  putative ATPase  37.59 
 
 
153 aa  92  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000032368  hitchhiker  0.00000180276 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5684  putative ATPase  37.59 
 
 
152 aa  92  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000102371  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4699  putative ATPase  37.59 
 
 
153 aa  92  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000112747  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4455  hypothetical protein  37.06 
 
 
152 aa  92.4  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4639  putative ATPase  37.59 
 
 
152 aa  92  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.162208  normal  0.0835245 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0351  putative ATPase  39.37 
 
 
153 aa  92  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000572111  hitchhiker  0.00108821 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1005  hypothetical protein  36.24 
 
 
160 aa  91.3  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000601093  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3315  hypothetical protein  36.84 
 
 
152 aa  91.3  4e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00300444  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3725  putative ATPase  38.64 
 
 
160 aa  90.9  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0265653  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4775  putative ATPase  37.8 
 
 
152 aa  90.9  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0594287 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4718  putative ATPase  37.8 
 
 
153 aa  90.9  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.983496  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5126  hypothetical protein  34.53 
 
 
175 aa  90.9  6e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0575495  normal  0.912699 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4625  putative ATPase  37.8 
 
 
152 aa  90.9  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3974  hypothetical protein  38.81 
 
 
153 aa  90.5  6e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4754  putative ATPase  37.8 
 
 
152 aa  90.9  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.382277  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4635  putative ATPase  37.8 
 
 
153 aa  90.5  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00161848  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3242  hypothetical protein  38.46 
 
 
152 aa  90.5  8e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0899  protein of unknown function UPF0079  38.06 
 
 
169 aa  90.1  9e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0611  hypothetical protein  32.39 
 
 
153 aa  90.1  9e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.400731 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0134  protein of unknown function UPF0079  35 
 
 
146 aa  89.7  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2773  hypothetical protein  37.3 
 
 
165 aa  89.7  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.018672  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0488  protein of unknown function UPF0079  37.78 
 
 
160 aa  89.4  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000100685  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0628  protein of unknown function UPF0079  41.67 
 
 
181 aa  89  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00803153  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0531  protein of unknown function UPF0079  37.4 
 
 
157 aa  88.6  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0352512  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0814  protein of unknown function UPF0079  35.92 
 
 
161 aa  89  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2781  hypothetical protein  42.34 
 
 
154 aa  88.6  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2452  protein of unknown function UPF0079  35.92 
 
 
183 aa  88.6  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>