More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1005 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1005  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  324  3e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000601093  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3020  protein of unknown function UPF0079  48.65 
 
 		 153 aa  140  8e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1263  protein of unknown function UPF0079  47.97 
 
 		 153 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00204178  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2319  hypothetical protein  44.59 
 
 		 162 aa  134  6.0000000000000005e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000629849  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2160  hypothetical protein  46.15 
 
 		 155 aa  133  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258956 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2888  hypothetical protein  45.51 
 
 		 161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000829466  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1800  hypothetical protein  44.97 
 
 		 161 aa  128  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.009423  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0236  hypothetical protein  45.45 
 
 		 157 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000721135  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2519  protein of unknown function UPF0079  50.68 
 
 		 159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0399  protein of unknown function UPF0079  42.04 
 
 		 160 aa  126  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0207503 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_339  hypothetical protein  43.48 
 
 		 163 aa  124  4.0000000000000003e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00581672  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0289  conserved hypothetical protein TIGR00150  44.76 
 
 		 157 aa  124  5e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.023351  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0799  protein of unknown function UPF0079  45.45 
 
 		 150 aa  124  5e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0244  hypothetical protein  44.06 
 
 		 157 aa  124  6e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0258  hypothetical protein  44.06 
 
 		 157 aa  124  6e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2016  hypothetical protein  45.64 
 
 		 158 aa  124  6e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0230  hypothetical protein  44.06 
 
 		 157 aa  123  8.000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0284  conserved hypothetical protein TIGR00150  44.06 
 
 		 157 aa  123  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3739  protein of unknown function UPF0079  43.48 
 
 		 159 aa  124  8.000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.124017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0308  conserved hypothetical protein TIGR00150  44.76 
 
 		 157 aa  122  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0279  hypothetical protein  44.76 
 
 		 157 aa  122  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0243  hypothetical protein  41.25 
 
 		 157 aa  122  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0232  P-loop hydrolase  44.76 
 
 		 157 aa  122  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01950  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  41.72 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0375  hypothetical protein  44.44 
 
 		 163 aa  122  2e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128461  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2261  hypothetical protein  40 
 
 		 164 aa  122  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000158801  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2422  hypothetical protein  47.37 
 
 		 154 aa  121  3e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2132  hypothetical protein  47.37 
 
 		 154 aa  121  3e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5035  hypothetical protein  44.06 
 
 		 157 aa  121  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1881  hypothetical protein  45.14 
 
 		 160 aa  121  4e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000937898  hitchhiker  0.0000223198 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1097  protein of unknown function UPF0079  45.33 
 
 		 152 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0396  hypothetical protein  43.79 
 
 		 163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0488  hypothetical protein  45.21 
 
 		 153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.381265  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0216  protein of unknown function UPF0079  42.14 
 
 		 152 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19780  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  45.64 
 
 		 152 aa  119  1.9999999999999998e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0805781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1776  hypothetical protein  46.67 
 
 		 161 aa  115  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00431445  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0399  hypothetical protein  45.39 
 
 		 152 aa  113  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0100312  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0147  protein of unknown function UPF0079  40.76 
 
 		 160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0643293  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1243  protein of unknown function UPF0079  39.1 
 
 		 184 aa  112  2.0000000000000002e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0366  hypothetical protein  45.64 
 
 		 169 aa  111  3e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6124  protein of unknown function UPF0079  46.32 
 
 		 161 aa  111  5e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0433891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0376  hypothetical protein  44.52 
 
 		 147 aa  111  5e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0713  hypothetical protein  39.75 
 
 		 187 aa  108  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273172  normal  0.667416 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2855  protein of unknown function UPF0079  43.06 
 
 		 164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.314957 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0444  protein of unknown function UPF0079  37.33 
 
 		 157 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11800  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  51.22 
 
 		 163 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4357  hypothetical protein  40.37 
 
 		 189 aa  107  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282412 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2452  protein of unknown function UPF0079  41.89 
 
 		 183 aa  107  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0483  protein of unknown function UPF0079  43.24 
 
 		 149 aa  106  1e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.790809  normal  0.0607901 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0965  protein of unknown function UPF0079  38.93 
 
 		 156 aa  106  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0599  hypothetical protein  38.85 
 
 		 152 aa  104  4e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0118  hypothetical protein  48 
 
 		 152 aa  105  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.927124 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0346  hypothetical protein  48.84 
 
 		 143 aa  104  4e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.101542  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4455  hypothetical protein  45.99 
 
 		 152 aa  104  5e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2169  hypothetical protein  46.22 
 
 		 167 aa  104  5e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.884354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2639  protein of unknown function UPF0079  48.51 
 
 		 154 aa  104  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.266416 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0774  hypothetical protein  39.86 
 
 		 164 aa  104  6e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000567369  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1503  hypothetical protein  42.75 
 
 		 188 aa  104  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.170985  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0095  hypothetical protein  40.97 
 
 		 146 aa  103  7e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.442138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2364  protein of unknown function UPF0079  42.75 
 
 		 183 aa  103  8e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.118731  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0562  hypothetical protein  43.06 
 
 		 157 aa  103  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000200674  normal  0.209641 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0814  protein of unknown function UPF0079  40.28 
 
 		 161 aa  103  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3897  hypothetical protein  38.22 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000307374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3771  hypothetical protein  38.22 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000107911  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0554  hypothetical protein  38.22 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971051  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3714  protein of unknown function UPF0079  38.22 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2530  protein of unknown function UPF0079  34.81 
 
 		 176 aa  102  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000117314  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3284  hypothetical protein  38.06 
 
 		 152 aa  102  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000351541  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0594  hypothetical protein  38.22 
 
 		 152 aa  101  5e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997285  hitchhiker  0.000000403865 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0593  hypothetical protein  38.22 
 
 		 152 aa  101  5e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0559818  hitchhiker  0.0000222246 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0046  protein of unknown function UPF0079  39.61 
 
 		 174 aa  100  6e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3544  hypothetical protein  38.65 
 
 		 160 aa  100  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3281  hypothetical protein  42.96 
 
 		 144 aa  100  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2465  protein of unknown function UPF0079  42.47 
 
 		 152 aa  99.4  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0181492 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2408  protein of unknown function UPF0079  42.47 
 
 		 152 aa  99.8  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3436  hypothetical protein  38.22 
 
 		 152 aa  99.4  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000774396  normal  0.208239 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3315  hypothetical protein  36.94 
 
 		 152 aa  99.4  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00300444  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0100  protein of unknown function UPF0079  39.26 
 
 		 151 aa  97.1  8e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0009157  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2754  hypothetical protein  38.71 
 
 		 188 aa  96.3  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000152007  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1469  hypothetical protein  50.5 
 
 		 143 aa  95.5  2e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0793  hypothetical protein  39.04 
 
 		 152 aa  95.5  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.949281  hitchhiker  0.00232347 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5677  hypothetical protein  41.06 
 
 		 155 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.178555  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1869  hypothetical protein  39.22 
 
 		 158 aa  96.3  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000565626  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2157  hypothetical protein  45.67 
 
 		 165 aa  95.5  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0617  protein of unknown function UPF0079  40.54 
 
 		 150 aa  95.1  3e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.202797  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2089  hypothetical protein  36 
 
 		 164 aa  94.7  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.38888  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2126  hypothetical protein  36 
 
 		 164 aa  94.7  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65380  hypothetical protein  41.06 
 
 		 155 aa  94.7  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0610791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4975  hypothetical protein  37.16 
 
 		 171 aa  94.4  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2781  hypothetical protein  36.36 
 
 		 154 aa  94  7e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3209  hypothetical protein  36.94 
 
 		 157 aa  94  8e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000564317  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0961  hypothetical protein  44.44 
 
 		 163 aa  94  8e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.14989  hitchhiker  0.00154455 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00098  hypothetical protein  36.77 
 
 		 154 aa  93.2  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002255  ATPase YjeE  36.77 
 
 		 154 aa  92.4  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000336436  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1390  protein of unknown function UPF0079  39.72 
 
 		 167 aa  92.4  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.004631  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1926  conserved hypothetical protein TIGR00150  46.49 
 
 		 161 aa  91.7  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1598  protein of unknown function UPF0079  46.49 
 
 		 161 aa  91.7  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.86964  normal  0.106509 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3882  protein of unknown function UPF0079  44.78 
 
 		 152 aa  92.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.733817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0631  hypothetical protein  44.17 
 
 		 155 aa  92  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.40036 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1296  hypothetical protein  42.61 
 
 		 161 aa  91.7  4e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0433075  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>