More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4289 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_3245  hypothetical protein  64.6 
 
 
504 aa  657    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479121  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4289  protein of unknown function UPF0079  100 
 
 
505 aa  1026    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0623599  normal  0.680884 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3962  protein of unknown function UPF0079  84.36 
 
 
503 aa  857    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0051  hypothetical protein  58.88 
 
 
502 aa  540  9.999999999999999e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0820  hypothetical protein  51.68 
 
 
509 aa  478  1e-133  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2100  hypothetical protein  51.52 
 
 
513 aa  476  1e-133  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2017  hypothetical protein  51.31 
 
 
513 aa  472  1e-132  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3578  hypothetical protein  50.81 
 
 
498 aa  432  1e-120  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.303943  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0081  protein of unknown function UPF0079  44.11 
 
 
506 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.428182  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0206  hypothetical protein  44.11 
 
 
505 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0259343  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0625  hypothetical protein  43.31 
 
 
505 aa  398  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00759808  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0054  hypothetical protein  43.91 
 
 
507 aa  390  1e-107  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.885213  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0086  hypothetical protein  43.34 
 
 
509 aa  386  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.522913  normal  0.567075 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0046  hypothetical protein  42.51 
 
 
507 aa  387  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.810658  normal  0.280558 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0383  hypothetical protein  43.03 
 
 
506 aa  385  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4941  protein of unknown function UPF0079  43.9 
 
 
540 aa  380  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.267606 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1355  P-loop hydrolase/phosphotransferase  41.73 
 
 
497 aa  380  1e-104  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1606  protein of unknown function UPF0079  45.12 
 
 
529 aa  376  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0383764  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0493  aminoglycoside phosphotransferase  44.72 
 
 
514 aa  374  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00248724 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4542  hypothetical protein  45.14 
 
 
529 aa  374  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4431  hypothetical protein  43.23 
 
 
549 aa  371  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.319947 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4895  protein of unknown function UPF0079  43.64 
 
 
542 aa  361  1e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.582734  normal  0.663902 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3297  hypothetical protein  40.64 
 
 
523 aa  360  2e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.480432 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0666  protein of unknown function UPF0079  39.92 
 
 
523 aa  354  2e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.469867 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0587  hypothetical protein  40.17 
 
 
562 aa  350  4e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.977621 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0135  aminoglycoside phosphotransferase  41.43 
 
 
362 aa  236  6e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2797  hypothetical protein  36.91 
 
 
472 aa  226  8e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0083  aminoglycoside phosphotransferase  38.66 
 
 
365 aa  166  1.0000000000000001e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.972168 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3437  aminoglycoside phosphotransferase  34.32 
 
 
360 aa  162  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.17769  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2299  aminoglycoside phosphotransferase  32.39 
 
 
328 aa  159  8e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.45511  normal  0.057046 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4850  aminoglycoside phosphotransferase  32.87 
 
 
363 aa  155  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.191997  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2843  aminoglycoside phosphotransferase  32.05 
 
 
332 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2000  aminoglycoside phosphotransferase  31.69 
 
 
327 aa  142  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00692225  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0962  aminoglycoside phosphotransferase  34.08 
 
 
340 aa  141  3e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.135258  hitchhiker  0.0017288 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4849  hypothetical protein  53.74 
 
 
150 aa  138  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366742  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0160  aminoglycoside phosphotransferase  32.26 
 
 
323 aa  137  4e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.549928 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0566  aminoglycoside phosphotransferase  33.13 
 
 
358 aa  137  5e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2677  aminoglycoside phosphotransferase  34.71 
 
 
328 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2954  aminoglycoside phosphotransferase  31.48 
 
 
342 aa  134  6e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.290607  normal  0.0281748 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1653  aminoglycoside phosphotransferase  30.35 
 
 
340 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0198  aminoglycoside phosphotransferase  32.47 
 
 
336 aa  128  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.159421  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3435  aminoglycoside phosphotransferase  30.46 
 
 
332 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4813  aminoglycoside phosphotransferase  30.42 
 
 
333 aa  127  4.0000000000000003e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0654401 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3438  hypothetical protein  50.33 
 
 
165 aa  125  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0159853  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0883  aminoglycoside phosphotransferase  29.64 
 
 
345 aa  125  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000858674  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0134  hypothetical protein  51.28 
 
 
164 aa  120  4.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46790  phosphotransferase  30.03 
 
 
340 aa  120  6e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3471  aminoglycoside phosphotransferase  29.52 
 
 
387 aa  119  9e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.161527  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0514  hypothetical protein  30.6 
 
 
352 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0621374 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0968  aminoglycoside phosphotransferase  27.43 
 
 
334 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0389824  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0741  hypothetical protein  30.74 
 
 
356 aa  118  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4113  aminoglycoside phosphotransferase  29.22 
 
 
387 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.567269  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0555  hypothetical protein  29.41 
 
 
341 aa  117  5e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2336  hypothetical protein  31.29 
 
 
330 aa  117  6e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0349  hypothetical protein  28.18 
 
 
325 aa  116  7.999999999999999e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0866  aminoglycoside phosphotransferase  28.06 
 
 
348 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000878468  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4623  aminoglycoside phosphotransferase  29.19 
 
 
340 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111315  normal  0.973044 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3308  aminoglycoside phosphotransferase  26.14 
 
 
347 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.346966  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0374  hypothetical protein  27.58 
 
 
325 aa  115  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0496  aminoglycoside phosphotransferase  30.45 
 
 
344 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0550103  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1018  aminoglycoside phosphotransferase  27.42 
 
 
334 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.264433  normal  0.0137892 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0600  hypothetical protein  31 
 
 
341 aa  114  3e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5131  aminoglycoside phosphotransferase  29.32 
 
 
339 aa  114  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.552611  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1050  aminoglycoside phosphotransferase  26.14 
 
 
361 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00944447  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0435  aminoglycoside phosphotransferase  28.7 
 
 
348 aa  113  8.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.625762  normal  0.267382 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0201  hypothetical protein  32.21 
 
 
350 aa  113  8.000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.59437 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0981  aminoglycoside phosphotransferase  25.85 
 
 
361 aa  113  9e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.125929  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6036  aminoglycoside phosphotransferase  29.17 
 
 
427 aa  113  9e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0405  aminoglycoside phosphotransferase  27.97 
 
 
339 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0427  putative ATPase  44.52 
 
 
156 aa  112  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368421  hitchhiker  0.000000532779 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0439  aminoglycoside phosphotransferase  27.97 
 
 
339 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1453  aminoglycoside phosphotransferase  28.27 
 
 
346 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.355309  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3511  aminoglycoside phosphotransferase  32.74 
 
 
346 aa  110  6e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0175  aminoglycoside phosphotransferase  31.94 
 
 
341 aa  110  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00583599  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1753  aminoglycoside phosphotransferase  28.61 
 
 
384 aa  110  7.000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000733825 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2955  hypothetical protein  46.1 
 
 
161 aa  110  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.263755  normal  0.0249448 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0488  protein of unknown function UPF0079  45.27 
 
 
160 aa  109  9.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000100685  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1523  hypothetical protein  31.64 
 
 
341 aa  109  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.165776  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0405  aminoglycoside phosphotransferase  29.27 
 
 
357 aa  109  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4864  aminoglycoside phosphotransferase  28.25 
 
 
388 aa  109  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.430535 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3725  putative ATPase  46.81 
 
 
160 aa  109  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0265653  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3111  aminoglycoside phosphotransferase  26.42 
 
 
363 aa  109  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.034337  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3075  aminoglycoside phosphotransferase  29.39 
 
 
342 aa  109  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1083  aminoglycoside phosphotransferase  25.57 
 
 
361 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0965455  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1800  hypothetical protein  48.33 
 
 
161 aa  108  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.009423  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3635  phosphotransferase  26 
 
 
351 aa  108  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0174  hypothetical protein  49.62 
 
 
169 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00309519  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0436  aminoglycoside phosphotransferase  27.01 
 
 
339 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.196256  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0531  protein of unknown function UPF0079  45.64 
 
 
157 aa  108  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0352512  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0099  aminoglycoside phosphotransferase  29.34 
 
 
362 aa  108  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1453  hypothetical protein  49.66 
 
 
149 aa  108  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2319  hypothetical protein  40.13 
 
 
162 aa  108  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000629849  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2432  aminoglycoside phosphotransferase  29.41 
 
 
323 aa  108  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1522  hypothetical protein  49.62 
 
 
161 aa  108  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.229097  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1263  protein of unknown function UPF0079  39.86 
 
 
153 aa  108  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00204178  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0390  aminoglycoside phosphotransferase  29.27 
 
 
357 aa  107  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4062  hypothetical protein  49.62 
 
 
176 aa  107  4e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.154683 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4009  aminoglycoside phosphotransferase  28.26 
 
 
341 aa  107  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3771  hypothetical protein  38.67 
 
 
152 aa  107  7e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000107911  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2754  hypothetical protein  46.27 
 
 
188 aa  107  7e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000152007  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>