More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2422 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2422  hypothetical protein  100 
 
 
154 aa  311  1.9999999999999998e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2132  hypothetical protein  100 
 
 
154 aa  311  1.9999999999999998e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1776  hypothetical protein  54.17 
 
 
161 aa  161  3e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00431445  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0799  protein of unknown function UPF0079  53.57 
 
 
150 aa  152  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0346  hypothetical protein  55.47 
 
 
143 aa  140  6e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.101542  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2888  hypothetical protein  43.62 
 
 
161 aa  140  6e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000829466  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3739  protein of unknown function UPF0079  44.9 
 
 
159 aa  137  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.124017  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2016  hypothetical protein  40.67 
 
 
158 aa  135  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4357  hypothetical protein  40.94 
 
 
189 aa  131  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.282412 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2519  protein of unknown function UPF0079  47.01 
 
 
159 aa  130  5e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19780  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  45.95 
 
 
152 aa  130  6e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0805781  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01950  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  43.62 
 
 
158 aa  130  6.999999999999999e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0216  protein of unknown function UPF0079  46.26 
 
 
152 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0236  hypothetical protein  45.14 
 
 
157 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000721135  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0243  hypothetical protein  46.53 
 
 
157 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0399  protein of unknown function UPF0079  45.26 
 
 
160 aa  128  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0207503 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0289  conserved hypothetical protein TIGR00150  45.14 
 
 
157 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.023351  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0147  protein of unknown function UPF0079  44.2 
 
 
160 aa  128  4.0000000000000003e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0643293  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5035  hypothetical protein  45.14 
 
 
157 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0396  hypothetical protein  42.07 
 
 
163 aa  126  8.000000000000001e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0284  conserved hypothetical protein TIGR00150  44.44 
 
 
157 aa  127  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0230  hypothetical protein  44.44 
 
 
157 aa  127  8.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0279  hypothetical protein  43.75 
 
 
157 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0232  P-loop hydrolase  43.75 
 
 
157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_339  hypothetical protein  41.38 
 
 
163 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00581672  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0308  conserved hypothetical protein TIGR00150  43.75 
 
 
157 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0244  hypothetical protein  43.75 
 
 
157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0375  hypothetical protein  40.69 
 
 
163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128461  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0488  hypothetical protein  45.45 
 
 
153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.381265  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0258  hypothetical protein  43.75 
 
 
157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2319  hypothetical protein  43.75 
 
 
162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000629849  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0713  hypothetical protein  38.82 
 
 
187 aa  124  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273172  normal  0.667416 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2855  protein of unknown function UPF0079  43.48 
 
 
164 aa  124  6e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.314957 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2160  hypothetical protein  37.33 
 
 
155 aa  122  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000258956 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1005  hypothetical protein  47.37 
 
 
160 aa  121  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000601093  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0046  protein of unknown function UPF0079  39.73 
 
 
174 aa  121  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1263  protein of unknown function UPF0079  42.47 
 
 
153 aa  121  4e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00204178  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1097  protein of unknown function UPF0079  44.08 
 
 
152 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0399  hypothetical protein  41.43 
 
 
152 aa  119  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0100312  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0444  protein of unknown function UPF0079  42.57 
 
 
157 aa  118  3e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1243  protein of unknown function UPF0079  41.94 
 
 
184 aa  118  3e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3020  protein of unknown function UPF0079  42.47 
 
 
153 aa  118  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0483  protein of unknown function UPF0079  41.48 
 
 
149 aa  118  3e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.790809  normal  0.0607901 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1635  protein of unknown function UPF0079  39.33 
 
 
173 aa  117  3.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1881  hypothetical protein  47.58 
 
 
160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000937898  hitchhiker  0.0000223198 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0965  protein of unknown function UPF0079  41.67 
 
 
156 aa  114  6e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2666  hypothetical protein  40.28 
 
 
143 aa  111  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0641125  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0617  protein of unknown function UPF0079  40.58 
 
 
150 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.202797  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1531  ATPase or kinase  37.5 
 
 
149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1800  hypothetical protein  45.76 
 
 
161 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.009423  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0100  protein of unknown function UPF0079  38.1 
 
 
151 aa  108  3e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0009157  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2126  hypothetical protein  36.3 
 
 
164 aa  107  5e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2089  hypothetical protein  36.3 
 
 
164 aa  107  5e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.38888  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1469  hypothetical protein  44.6 
 
 
143 aa  106  9.000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0376  hypothetical protein  42.25 
 
 
147 aa  106  1e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2465  protein of unknown function UPF0079  44.12 
 
 
152 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0181492 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0134  protein of unknown function UPF0079  37.76 
 
 
146 aa  105  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2408  protein of unknown function UPF0079  44.12 
 
 
152 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2330  hypothetical protein  36.84 
 
 
182 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1390  protein of unknown function UPF0079  37.76 
 
 
167 aa  105  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.004631  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11800  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  35.81 
 
 
163 aa  104  5e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4283  protein of unknown function UPF0079  36.69 
 
 
138 aa  103  6e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2452  protein of unknown function UPF0079  35.17 
 
 
183 aa  103  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4975  hypothetical protein  36.81 
 
 
171 aa  103  8e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3771  hypothetical protein  36.3 
 
 
152 aa  102  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000107911  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3897  hypothetical protein  36.3 
 
 
152 aa  102  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000307374  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0554  hypothetical protein  36.3 
 
 
152 aa  102  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971051  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3714  protein of unknown function UPF0079  36.3 
 
 
152 aa  102  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160948  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2169  hypothetical protein  40.31 
 
 
167 aa  102  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.884354  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3284  hypothetical protein  37.4 
 
 
152 aa  102  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000351541  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0366  hypothetical protein  39.19 
 
 
169 aa  101  4e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0073  protein of unknown function UPF0079  48.04 
 
 
156 aa  101  4e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2364  protein of unknown function UPF0079  38.98 
 
 
183 aa  100  6e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.118731  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1503  hypothetical protein  36.43 
 
 
188 aa  100  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.170985  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6124  protein of unknown function UPF0079  35.33 
 
 
161 aa  100  7e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0433891  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1869  hypothetical protein  38.1 
 
 
158 aa  100  9e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000565626  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0182  protein of unknown function UPF0079  39.13 
 
 
148 aa  99.8  1e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0313363  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3434  protein of unknown function UPF0079  31.85 
 
 
165 aa  100  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4044  protein of unknown function UPF0079  35.14 
 
 
170 aa  99.8  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.193855  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0095  hypothetical protein  36.81 
 
 
146 aa  98.6  2e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.442138  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07500  ATPase, with role in cell wall biosynthesis  36.96 
 
 
156 aa  98.2  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0610132  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0599  hypothetical protein  36.59 
 
 
152 aa  98.2  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0122  protein of unknown function UPF0079  35.46 
 
 
158 aa  97.8  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000147481  hitchhiker  0.00840651 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0090  protein of unknown function UPF0079  33.8 
 
 
145 aa  98.2  4e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.184225  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0961  hypothetical protein  38.84 
 
 
163 aa  98.2  4e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.14989  hitchhiker  0.00154455 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2261  hypothetical protein  34.72 
 
 
164 aa  97.1  7e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000158801  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0814  protein of unknown function UPF0079  37.31 
 
 
161 aa  96.7  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2639  protein of unknown function UPF0079  39.58 
 
 
154 aa  96.7  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.266416 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2157  hypothetical protein  42.31 
 
 
165 aa  96.7  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0594  hypothetical protein  35.77 
 
 
152 aa  96.7  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997285  hitchhiker  0.000000403865 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3436  hypothetical protein  35.77 
 
 
152 aa  96.3  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000774396  normal  0.208239 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0593  hypothetical protein  35.77 
 
 
152 aa  96.7  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0559818  hitchhiker  0.0000222246 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4455  hypothetical protein  35.21 
 
 
152 aa  95.9  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4849  hypothetical protein  34.75 
 
 
150 aa  95.9  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366742  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3974  hypothetical protein  34.78 
 
 
153 aa  95.5  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2955  hypothetical protein  32.03 
 
 
161 aa  94.7  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.263755  normal  0.0249448 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2531  hypothetical protein  40 
 
 
162 aa  94.4  5e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0487  hypothetical protein  38.85 
 
 
148 aa  94.4  5e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2781  hypothetical protein  37.4 
 
 
154 aa  94.4  5e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3438  hypothetical protein  33.86 
 
 
165 aa  94  6e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0159853  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>