More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_11800 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_11800  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  100 
 
 
163 aa  335  1.9999999999999998e-91  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2855  protein of unknown function UPF0079  56.16 
 
 
164 aa  159  1e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.314957 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19780  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  50 
 
 
152 aa  135  3.0000000000000003e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0805781  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2888  hypothetical protein  44.68 
 
 
161 aa  123  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000829466  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0399  protein of unknown function UPF0079  47.01 
 
 
160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0207503 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1243  protein of unknown function UPF0079  45.3 
 
 
184 aa  115  1.9999999999999998e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1005  hypothetical protein  45.03 
 
 
160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000601093  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2422  hypothetical protein  35.81 
 
 
154 aa  113  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2132  hypothetical protein  35.81 
 
 
154 aa  113  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3739  protein of unknown function UPF0079  39.87 
 
 
159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.124017  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0617  protein of unknown function UPF0079  40.8 
 
 
150 aa  111  3e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.202797  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2160  hypothetical protein  41.78 
 
 
155 aa  112  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000258956 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3020  protein of unknown function UPF0079  41.14 
 
 
153 aa  111  5e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1263  protein of unknown function UPF0079  42.86 
 
 
153 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00204178  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0134  protein of unknown function UPF0079  44.6 
 
 
146 aa  108  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01950  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  41.43 
 
 
158 aa  108  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6124  protein of unknown function UPF0079  43.23 
 
 
161 aa  108  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0433891  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0147  protein of unknown function UPF0079  43.84 
 
 
160 aa  108  3e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0643293  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1635  protein of unknown function UPF0079  36.97 
 
 
173 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5035  hypothetical protein  40.71 
 
 
157 aa  107  5e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0122  protein of unknown function UPF0079  41.91 
 
 
158 aa  107  6e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000147481  hitchhiker  0.00840651 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0236  hypothetical protein  40.29 
 
 
157 aa  106  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000721135  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0279  hypothetical protein  41.01 
 
 
157 aa  105  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0244  hypothetical protein  40.29 
 
 
157 aa  105  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0243  hypothetical protein  41.73 
 
 
157 aa  105  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0289  conserved hypothetical protein TIGR00150  40.29 
 
 
157 aa  106  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.023351  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0258  hypothetical protein  40.29 
 
 
157 aa  105  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0308  conserved hypothetical protein TIGR00150  41.01 
 
 
157 aa  105  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0216  protein of unknown function UPF0079  39.73 
 
 
152 aa  105  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0230  hypothetical protein  40.29 
 
 
157 aa  105  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0284  conserved hypothetical protein TIGR00150  40.29 
 
 
157 aa  105  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0046  protein of unknown function UPF0079  39.19 
 
 
174 aa  104  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0961  hypothetical protein  43.14 
 
 
163 aa  104  7e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.14989  hitchhiker  0.00154455 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0713  hypothetical protein  37.91 
 
 
187 aa  103  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273172  normal  0.667416 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0232  P-loop hydrolase  40.29 
 
 
157 aa  103  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2016  hypothetical protein  39.58 
 
 
158 aa  103  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2126  hypothetical protein  40 
 
 
164 aa  103  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2089  hypothetical protein  40 
 
 
164 aa  103  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.38888  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0488  hypothetical protein  37.33 
 
 
153 aa  103  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.381265  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0799  protein of unknown function UPF0079  36.81 
 
 
150 aa  102  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_339  hypothetical protein  38.46 
 
 
163 aa  102  2e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00581672  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2319  hypothetical protein  35.76 
 
 
162 aa  102  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000629849  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2465  protein of unknown function UPF0079  41.91 
 
 
152 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0181492 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0375  hypothetical protein  37.86 
 
 
163 aa  101  4e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128461  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0399  hypothetical protein  44.17 
 
 
152 aa  101  4e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0100312  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1097  protein of unknown function UPF0079  47.32 
 
 
152 aa  100  6e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2408  protein of unknown function UPF0079  41.91 
 
 
152 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2519  protein of unknown function UPF0079  47.2 
 
 
159 aa  100  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4849  hypothetical protein  44.85 
 
 
150 aa  100  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366742  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4455  hypothetical protein  37.5 
 
 
152 aa  99.4  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0346  hypothetical protein  39.67 
 
 
143 aa  99  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.101542  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0396  hypothetical protein  38.57 
 
 
163 aa  99  3e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1664  hypothetical protein  36.55 
 
 
153 aa  98.6  3e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1776  hypothetical protein  37.5 
 
 
161 aa  98.6  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00431445  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0483  protein of unknown function UPF0079  39.2 
 
 
149 aa  98.2  4e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.790809  normal  0.0607901 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0100  protein of unknown function UPF0079  42.14 
 
 
151 aa  98.2  5e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0009157  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1800  hypothetical protein  39.07 
 
 
161 aa  97.8  6e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.009423  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4357  hypothetical protein  37.66 
 
 
189 aa  97.8  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.282412 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0095  hypothetical protein  38.73 
 
 
146 aa  97.8  6e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.442138  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1531  ATPase or kinase  39.29 
 
 
149 aa  97.8  6e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0118  hypothetical protein  39.26 
 
 
152 aa  96.3  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.927124 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2364  protein of unknown function UPF0079  46.15 
 
 
183 aa  96.3  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.118731  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1503  hypothetical protein  46.15 
 
 
188 aa  95.9  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.170985  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2452  protein of unknown function UPF0079  41.55 
 
 
183 aa  95.9  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2639  protein of unknown function UPF0079  39.44 
 
 
154 aa  95.5  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.266416 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1881  hypothetical protein  38.57 
 
 
160 aa  95.1  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000937898  hitchhiker  0.0000223198 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2666  hypothetical protein  41.23 
 
 
143 aa  95.1  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0641125  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1869  hypothetical protein  41.67 
 
 
158 aa  94.7  5e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000565626  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2169  hypothetical protein  42.22 
 
 
167 aa  94.4  5e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.884354  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6009  hypothetical protein  42.07 
 
 
157 aa  94  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2531  hypothetical protein  40.16 
 
 
162 aa  94  8e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0965  protein of unknown function UPF0079  34.87 
 
 
156 aa  93.6  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0366  hypothetical protein  35.62 
 
 
169 aa  92.8  2e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2330  hypothetical protein  43.75 
 
 
182 aa  92.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1295  ATPase or kinase  40.62 
 
 
158 aa  92.4  2e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0090  protein of unknown function UPF0079  38.03 
 
 
145 aa  92.4  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.184225  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1719  hypothetical protein  35.88 
 
 
145 aa  92  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.266415  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0444  protein of unknown function UPF0079  36.11 
 
 
157 aa  91.7  4e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2157  hypothetical protein  37.01 
 
 
165 aa  91.7  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1469  hypothetical protein  41.22 
 
 
143 aa  90.5  9e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0369  protein of unknown function UPF0079  34.59 
 
 
161 aa  90.1  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0145  hypothetical protein  41.61 
 
 
166 aa  90.1  1e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.550915  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4289  protein of unknown function UPF0079  39.87 
 
 
505 aa  89.4  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0623599  normal  0.680884 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0774  hypothetical protein  36.3 
 
 
164 aa  89.4  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000567369  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3974  hypothetical protein  36.24 
 
 
153 aa  89.7  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3882  protein of unknown function UPF0079  40.71 
 
 
152 aa  89.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.733817  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3962  protein of unknown function UPF0079  39.87 
 
 
503 aa  88.6  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3050  hypothetical protein  48.39 
 
 
153 aa  88.6  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.664938  normal  0.025275 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0387  hypothetical protein  43.75 
 
 
168 aa  88.2  4e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.919602  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0374  protein of unknown function UPF0079  34.88 
 
 
149 aa  87.8  6e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18361  ATPase or kinase  33.85 
 
 
145 aa  86.7  1e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.130336  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0809  hypothetical protein  43.81 
 
 
148 aa  87  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0376  hypothetical protein  34.44 
 
 
147 aa  86.7  1e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0611  hypothetical protein  42.28 
 
 
153 aa  87  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.400731 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18181  ATPase or kinase  34.35 
 
 
145 aa  86.3  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3434  protein of unknown function UPF0079  37.86 
 
 
165 aa  86.3  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0487  hypothetical protein  36 
 
 
148 aa  86.3  2e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1987  hypothetical protein  42.48 
 
 
145 aa  85.5  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2530  protein of unknown function UPF0079  36.31 
 
 
176 aa  85.1  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000117314  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4044  protein of unknown function UPF0079  39.73 
 
 
170 aa  85.1  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.193855  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>