More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1082 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1082  hypothetical protein  100 
 
 		 183 aa  376  1e-103  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.585915  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2781  hypothetical protein  48 
 
 		 154 aa  139  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00098  hypothetical protein  48.37 
 
 		 154 aa  137  7e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002255  ATPase YjeE  47.06 
 
 		 154 aa  134  9e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000336436  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2754  hypothetical protein  41.52 
 
 		 188 aa  132  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000152007  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3923  putative ATPase  45.22 
 
 		 160 aa  131  5e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00130971  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0531  protein of unknown function UPF0079  45.51 
 
 		 157 aa  130  6.999999999999999e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0352512  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3725  putative ATPase  44.59 
 
 		 160 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0265653  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0793  hypothetical protein  43.79 
 
 		 152 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.949281  hitchhiker  0.00232347 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0703  putative ATPase  45.86 
 
 		 156 aa  128  5.0000000000000004e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000204367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3803  putative ATPase  45.86 
 
 		 156 aa  128  5.0000000000000004e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000296648  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1081  ATPase  41.67 
 
 		 156 aa  126  1.0000000000000001e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3657  putative ATPase  45.22 
 
 		 156 aa  127  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000030083  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4718  putative ATPase  42.76 
 
 		 153 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.983496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4754  putative ATPase  42.76 
 
 		 152 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.382277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0351  putative ATPase  48.82 
 
 		 153 aa  125  3e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000572111  hitchhiker  0.00108821 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4775  putative ATPase  42.76 
 
 		 152 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0594287 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4635  putative ATPase  42.76 
 
 		 153 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00161848  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4625  putative ATPase  42.76 
 
 		 152 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2671  RNA binding S1  42.86 
 
 		 157 aa  124  6e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.543969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3974  hypothetical protein  40.88 
 
 		 153 aa  124  6e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0427  putative ATPase  44.08 
 
 		 156 aa  122  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368421  hitchhiker  0.000000532779 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0599  hypothetical protein  47.11 
 
 		 152 aa  120  8e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04035  ATPase with strong ADP affinity  46.15 
 
 		 153 aa  120  9e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000985798  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3825  protein of unknown function UPF0079  46.15 
 
 		 153 aa  120  9e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000776436  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4410  putative ATPase  46.15 
 
 		 153 aa  120  9e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000607313  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3845  putative ATPase  46.15 
 
 		 153 aa  120  9e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000032368  hitchhiker  0.00000180276 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03997  hypothetical protein  46.15 
 
 		 153 aa  120  9e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000527155  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4699  putative ATPase  46.15 
 
 		 153 aa  120  9e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000112747  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4725  putative ATPase  46.15 
 
 		 153 aa  120  9e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000010993  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0488  protein of unknown function UPF0079  47.14 
 
 		 160 aa  120  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000100685  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5684  putative ATPase  46.15 
 
 		 152 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000102371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4639  putative ATPase  46.15 
 
 		 152 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.162208  normal  0.0835245 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0594  hypothetical protein  47.11 
 
 		 152 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997285  hitchhiker  0.000000403865 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3436  hypothetical protein  47.11 
 
 		 152 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000774396  normal  0.208239 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0593  hypothetical protein  47.11 
 
 		 152 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0559818  hitchhiker  0.0000222246 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3897  hypothetical protein  48.76 
 
 		 152 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000307374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3714  protein of unknown function UPF0079  48.76 
 
 		 152 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0554  hypothetical protein  48.76 
 
 		 152 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971051  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3771  hypothetical protein  48.76 
 
 		 152 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000107911  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0562  hypothetical protein  41.83 
 
 		 157 aa  117  6e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000200674  normal  0.209641 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3315  hypothetical protein  44 
 
 		 152 aa  117  6e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00300444  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2773  hypothetical protein  38.71 
 
 		 165 aa  117  7.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.018672  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3544  hypothetical protein  45.97 
 
 		 160 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3284  hypothetical protein  46.28 
 
 		 152 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000351541  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3029  hypothetical protein  40.65 
 
 		 153 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.63375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00645  ATP/GTP hydrolase  47.76 
 
 		 160 aa  116  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3242  hypothetical protein  48.76 
 
 		 152 aa  116  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1273  hypothetical protein  44.72 
 
 		 159 aa  115  3.9999999999999997e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4174  hypothetical protein  45.08 
 
 		 152 aa  115  5e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0893  protein of unknown function UPF0079  42.86 
 
 		 156 aa  114  6.9999999999999995e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.419695  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3209  hypothetical protein  48.65 
 
 		 157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000564317  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0568  hypothetical protein  43.09 
 
 		 143 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0670  hypothetical protein  53.61 
 
 		 155 aa  109  3e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.169194  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1598  protein of unknown function UPF0079  51 
 
 		 161 aa  108  4.0000000000000004e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.86964  normal  0.106509 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1926  conserved hypothetical protein TIGR00150  51 
 
 		 161 aa  108  4.0000000000000004e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0631  hypothetical protein  42.86 
 
 		 155 aa  108  6e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.40036 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4946  hypothetical protein  42.28 
 
 		 142 aa  108  6e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5677  hypothetical protein  43.9 
 
 		 155 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.178555  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0321  hypothetical protein  36.31 
 
 		 162 aa  107  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2636  hypothetical protein  39.46 
 
 		 153 aa  107  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00016395  hitchhiker  0.000000000107728 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65380  hypothetical protein  43.09 
 
 		 155 aa  104  8e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0610791  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4898  hypothetical protein  42.52 
 
 		 157 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.44547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4774  hypothetical protein  42.52 
 
 		 157 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.431591  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07500  ATPase, with role in cell wall biosynthesis  42.74 
 
 		 156 aa  103  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0610132  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4950  hypothetical protein  39.6 
 
 		 157 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.070486  normal  0.198333 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4689  hypothetical protein  42.06 
 
 		 157 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0569  hypothetical protein  45.37 
 
 		 167 aa  102  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000405356 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1300  hypothetical protein  43.09 
 
 		 144 aa  102  4e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0581872  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1380  hypothetical protein  42.62 
 
 		 127 aa  102  4e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0492  protein of unknown function UPF0079  47.47 
 
 		 155 aa  102  4e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.069952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0519  hypothetical protein  42.4 
 
 		 143 aa  101  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0120244  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1261  protein of unknown function UPF0079  41.18 
 
 		 178 aa  99.4  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.810955  normal  0.0782471 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5126  hypothetical protein  34.42 
 
 		 175 aa  96.7  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0575495  normal  0.912699 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0596  hypothetical protein  36.99 
 
 		 176 aa  95.9  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0899  protein of unknown function UPF0079  39.34 
 
 		 169 aa  95.1  4e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0961  hypothetical protein  42.11 
 
 		 163 aa  94  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.14989  hitchhiker  0.00154455 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00412  hypothetical protein  40.62 
 
 		 166 aa  92.8  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.238798  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3462  protein of unknown function UPF0079  35.06 
 
 		 169 aa  92  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.191362  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2754  hypothetical protein  41.82 
 
 		 160 aa  92  4e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2627  hypothetical protein  41.82 
 
 		 160 aa  92.4  4e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3198  hypothetical protein  43.22 
 
 		 138 aa  92  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.250751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2756  protein of unknown function UPF0079  37.8 
 
 		 160 aa  91.3  6e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.938944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2531  hypothetical protein  40.65 
 
 		 162 aa  91.3  7e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2018  protein of unknown function UPF0079  39.1 
 
 		 175 aa  90.5  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00181  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1306  hypothetical protein  41.41 
 
 		 181 aa  90.5  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.134603  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2540  hypothetical protein  39.13 
 
 		 198 aa  89  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3302  hypothetical protein  35.44 
 
 		 183 aa  88.6  5e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.749162  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0918  hypothetical protein  37.59 
 
 		 175 aa  87.4  9e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2026  hypothetical protein  39.67 
 
 		 156 aa  87.4  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2410  protein of unknown function UPF0079  39.13 
 
 		 192 aa  87.4  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0520  hypothetical protein  34.32 
 
 		 184 aa  87.4  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0908  hypothetical protein  34.55 
 
 		 184 aa  86.3  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2100  hypothetical protein  44.74 
 
 		 513 aa  86.7  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0366  hypothetical protein  34.55 
 
 		 184 aa  86.3  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0666  hypothetical protein  34.55 
 
 		 184 aa  86.3  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.739663  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2501  hypothetical protein  34.55 
 
 		 184 aa  86.3  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1171  hypothetical protein  39.67 
 
 		 172 aa  86.3  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00361416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0115  hypothetical protein  34.55 
 
 		 184 aa  86.3  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2017  hypothetical protein  44.74 
 
 		 513 aa  86.7  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>