More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_2018 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_2018  protein of unknown function UPF0079  100 
 
 		 175 aa  354  3.9999999999999996e-97  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00181  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2671  RNA binding S1  46.62 
 
 		 157 aa  131  3.9999999999999996e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.543969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0631  hypothetical protein  47.71 
 
 		 155 aa  131  6e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.40036 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3974  hypothetical protein  46.1 
 
 		 153 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0321  hypothetical protein  44.38 
 
 		 162 aa  126  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00098  hypothetical protein  47.3 
 
 		 154 aa  127  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2754  hypothetical protein  49.32 
 
 		 188 aa  127  1.0000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000152007  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3544  hypothetical protein  47.1 
 
 		 160 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002255  ATPase YjeE  47.3 
 
 		 154 aa  126  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000336436  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4898  hypothetical protein  45.64 
 
 		 157 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.44547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5677  hypothetical protein  48.3 
 
 		 155 aa  125  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.178555  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4774  hypothetical protein  45.64 
 
 		 157 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.431591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4689  hypothetical protein  43.87 
 
 		 157 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0893  protein of unknown function UPF0079  51.33 
 
 		 156 aa  124  5e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.419695  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0703  putative ATPase  54.1 
 
 		 156 aa  124  7e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000204367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3803  putative ATPase  54.1 
 
 		 156 aa  124  7e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000296648  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00645  ATP/GTP hydrolase  43.4 
 
 		 160 aa  124  7e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0488  protein of unknown function UPF0079  51.75 
 
 		 160 aa  124  9e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000100685  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3657  putative ATPase  54.1 
 
 		 156 aa  123  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000030083  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07500  ATPase, with role in cell wall biosynthesis  48.32 
 
 		 156 aa  124  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0610132  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0531  protein of unknown function UPF0079  48.95 
 
 		 157 aa  122  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0352512  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0492  protein of unknown function UPF0079  55.56 
 
 		 155 aa  122  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.069952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0583  hypothetical protein  48.45 
 
 		 176 aa  122  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65380  hypothetical protein  47.62 
 
 		 155 aa  122  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0610791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0427  putative ATPase  46.94 
 
 		 156 aa  121  4e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368421  hitchhiker  0.000000532779 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4950  hypothetical protein  44.3 
 
 		 157 aa  121  5e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.070486  normal  0.198333 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00412  hypothetical protein  47.95 
 
 		 166 aa  121  6e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.238798  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2004  hypothetical protein  47.4 
 
 		 162 aa  121  6e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2083  hypothetical protein  47.4 
 
 		 162 aa  120  8e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0569  hypothetical protein  52.94 
 
 		 167 aa  119  3e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000405356 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0519  hypothetical protein  44.83 
 
 		 143 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0120244  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0562  hypothetical protein  43.67 
 
 		 157 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000200674  normal  0.209641 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4946  hypothetical protein  47.89 
 
 		 142 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2756  protein of unknown function UPF0079  48.7 
 
 		 160 aa  118  4.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.938944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3315  hypothetical protein  44.59 
 
 		 152 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00300444  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3209  hypothetical protein  44.76 
 
 		 157 aa  117  7e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000564317  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3725  putative ATPase  51.56 
 
 		 160 aa  117  7.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0265653  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0568  hypothetical protein  47.52 
 
 		 143 aa  117  9e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2410  protein of unknown function UPF0079  49.04 
 
 		 192 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0351  putative ATPase  46.85 
 
 		 153 aa  116  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000572111  hitchhiker  0.00108821 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3923  putative ATPase  53.28 
 
 		 160 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00130971  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2781  hypothetical protein  48.76 
 
 		 154 aa  116  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0594  hypothetical protein  42.68 
 
 		 152 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997285  hitchhiker  0.000000403865 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0593  hypothetical protein  42.68 
 
 		 152 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0559818  hitchhiker  0.0000222246 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3242  hypothetical protein  44.44 
 
 		 152 aa  116  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0599  hypothetical protein  42.68 
 
 		 152 aa  115  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4635  putative ATPase  44.76 
 
 		 153 aa  115  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00161848  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3436  hypothetical protein  42.68 
 
 		 152 aa  115  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000774396  normal  0.208239 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4718  putative ATPase  44.76 
 
 		 153 aa  115  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.983496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3284  hypothetical protein  40.76 
 
 		 152 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000351541  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2816  protein of unknown function UPF0079  48.1 
 
 		 192 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.559153  normal  0.894815 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4775  putative ATPase  44.76 
 
 		 152 aa  114  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0594287 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4625  putative ATPase  44.76 
 
 		 152 aa  114  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4754  putative ATPase  44.76 
 
 		 152 aa  114  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.382277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2636  hypothetical protein  45.07 
 
 		 153 aa  114  6e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00016395  hitchhiker  0.000000000107728 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1300  hypothetical protein  50 
 
 		 144 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0581872  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3302  hypothetical protein  45.7 
 
 		 183 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.749162  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1081  ATPase  42.34 
 
 		 156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04035  ATPase with strong ADP affinity  44.76 
 
 		 153 aa  112  3e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000985798  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3825  protein of unknown function UPF0079  44.76 
 
 		 153 aa  112  3e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000776436  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0670  hypothetical protein  59.22 
 
 		 155 aa  112  3e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.169194  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4410  putative ATPase  44.76 
 
 		 153 aa  112  3e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000607313  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4725  putative ATPase  44.76 
 
 		 153 aa  112  3e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000010993  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03997  hypothetical protein  44.76 
 
 		 153 aa  112  3e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000527155  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4699  putative ATPase  44.76 
 
 		 153 aa  112  3e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000112747  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3845  putative ATPase  44.76 
 
 		 153 aa  112  3e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000032368  hitchhiker  0.00000180276 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4639  putative ATPase  44.76 
 
 		 152 aa  112  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.162208  normal  0.0835245 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5684  putative ATPase  44.76 
 
 		 152 aa  112  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000102371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3714  protein of unknown function UPF0079  40.76 
 
 		 152 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0554  hypothetical protein  40.76 
 
 		 152 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971051  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3897  hypothetical protein  40.76 
 
 		 152 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000307374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3771  hypothetical protein  40.76 
 
 		 152 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000107911  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2540  hypothetical protein  46.2 
 
 		 198 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2531  hypothetical protein  41.77 
 
 		 162 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2773  hypothetical protein  47.68 
 
 		 165 aa  109  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.018672  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0793  hypothetical protein  42.75 
 
 		 152 aa  107  6e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.949281  hitchhiker  0.00232347 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1273  hypothetical protein  43.95 
 
 		 159 aa  107  7.000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3462  protein of unknown function UPF0079  44.06 
 
 		 169 aa  107  9.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.191362  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0525  hypothetical protein  45.52 
 
 		 177 aa  106  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244934 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3029  hypothetical protein  50 
 
 		 153 aa  106  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.63375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4174  hypothetical protein  41.61 
 
 		 152 aa  104  6e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1598  protein of unknown function UPF0079  46.09 
 
 		 161 aa  104  7e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.86964  normal  0.106509 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1926  conserved hypothetical protein TIGR00150  46.09 
 
 		 161 aa  104  7e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1784  protein of unknown function UPF0079  41.26 
 
 		 176 aa  103  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0485483  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5126  hypothetical protein  42.66 
 
 		 175 aa  102  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0575495  normal  0.912699 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0918  hypothetical protein  43.06 
 
 		 175 aa  101  6e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0818  hypothetical protein  46.83 
 
 		 161 aa  100  8e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000019093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3050  hypothetical protein  41.04 
 
 		 153 aa  100  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.664938  normal  0.025275 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1380  hypothetical protein  44.88 
 
 		 127 aa  100  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0596  hypothetical protein  41.33 
 
 		 176 aa  98.6  4e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1496  hypothetical protein  46.73 
 
 		 179 aa  98.6  4e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00826257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1190  ATP/GTP hydrolase  40.71 
 
 		 148 aa  98.2  6e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.328809  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1171  hypothetical protein  39.87 
 
 		 172 aa  97.8  8e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00361416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1228  hypothetical protein  40.71 
 
 		 148 aa  96.7  1e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1306  hypothetical protein  43.08 
 
 		 181 aa  96.7  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.134603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3198  hypothetical protein  40.16 
 
 		 138 aa  95.5  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.250751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1130  hypothetical protein  46.34 
 
 		 160 aa  95.1  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.30959 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0082  hypothetical protein  47.66 
 
 		 158 aa  95.1  4e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.659659 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0899  protein of unknown function UPF0079  40.28 
 
 		 169 aa  95.1  5e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1065  hypothetical protein  39.86 
 
 		 184 aa  94  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0878118  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>