More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3462 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3462  protein of unknown function UPF0079  100 
 
 		 169 aa  340  8e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.191362  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5126  hypothetical protein  67.24 
 
 		 175 aa  226  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0575495  normal  0.912699 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0899  protein of unknown function UPF0079  68.32 
 
 		 169 aa  216  1e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3302  hypothetical protein  63.98 
 
 		 183 aa  198  3e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.749162  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1306  hypothetical protein  68.35 
 
 		 181 aa  188  4e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.134603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1712  hypothetical protein  62.05 
 
 		 173 aa  184  4e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1171  hypothetical protein  57.96 
 
 		 172 aa  182  2.0000000000000003e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00361416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3198  hypothetical protein  62.77 
 
 		 138 aa  175  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.250751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1130  hypothetical protein  58.82 
 
 		 160 aa  165  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.30959 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2026  hypothetical protein  60 
 
 		 156 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0596  hypothetical protein  43.4 
 
 		 176 aa  129  2.0000000000000002e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2531  hypothetical protein  45.03 
 
 		 162 aa  124  6e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2816  protein of unknown function UPF0079  48.55 
 
 		 192 aa  121  5e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.559153  normal  0.894815 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2410  protein of unknown function UPF0079  48.91 
 
 		 192 aa  121  5e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3974  hypothetical protein  44.67 
 
 		 153 aa  121  6e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1380  hypothetical protein  49.6 
 
 		 127 aa  120  7e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2754  hypothetical protein  43.12 
 
 		 188 aa  120  7e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000152007  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1951  hypothetical protein  48.41 
 
 		 171 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.286384  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2562  hypothetical protein  48.41 
 
 		 198 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2586  hypothetical protein  47.62 
 
 		 171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0365386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0520  hypothetical protein  49.21 
 
 		 184 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0734  hypothetical protein  45.45 
 
 		 184 aa  117  7e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00098  hypothetical protein  42.38 
 
 		 154 aa  117  7.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0583  hypothetical protein  48.87 
 
 		 176 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3544  hypothetical protein  43.71 
 
 		 160 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2781  hypothetical protein  42.76 
 
 		 154 aa  116  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0525  hypothetical protein  47.18 
 
 		 177 aa  116  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244934 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5894  hypothetical protein  44.76 
 
 		 184 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.51818 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002255  ATPase YjeE  42.38 
 
 		 154 aa  115  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000336436  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1784  protein of unknown function UPF0079  42.94 
 
 		 176 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0485483  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1261  protein of unknown function UPF0079  44.06 
 
 		 178 aa  115  1.9999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.810955  normal  0.0782471 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2540  hypothetical protein  48.87 
 
 		 198 aa  114  8.999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0793  hypothetical protein  41.06 
 
 		 152 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.949281  hitchhiker  0.00232347 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0723  hypothetical protein  46.03 
 
 		 184 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2481  hypothetical protein  44.76 
 
 		 183 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0482851 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2610  hypothetical protein  44.76 
 
 		 198 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4689  hypothetical protein  46.41 
 
 		 157 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0366  hypothetical protein  43.36 
 
 		 184 aa  112  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1065  hypothetical protein  43.36 
 
 		 184 aa  112  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0878118  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2501  hypothetical protein  43.36 
 
 		 184 aa  112  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0908  hypothetical protein  43.36 
 
 		 184 aa  112  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0115  hypothetical protein  43.36 
 
 		 184 aa  112  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0911  hypothetical protein  43.36 
 
 		 184 aa  112  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0666  hypothetical protein  43.36 
 
 		 184 aa  112  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.739663  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0427  putative ATPase  45.67 
 
 		 156 aa  111  6e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368421  hitchhiker  0.000000532779 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0562  hypothetical protein  41.72 
 
 		 157 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000200674  normal  0.209641 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1273  hypothetical protein  44.72 
 
 		 159 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3242  hypothetical protein  42.66 
 
 		 152 aa  109  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3315  hypothetical protein  40.54 
 
 		 152 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00300444  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4898  hypothetical protein  44.44 
 
 		 157 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.44547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3284  hypothetical protein  40 
 
 		 152 aa  108  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000351541  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0599  hypothetical protein  40.67 
 
 		 152 aa  108  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4774  hypothetical protein  44.44 
 
 		 157 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.431591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5677  hypothetical protein  47.62 
 
 		 155 aa  108  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.178555  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0351  putative ATPase  45.53 
 
 		 153 aa  108  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000572111  hitchhiker  0.00108821 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4174  hypothetical protein  38.41 
 
 		 152 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3436  hypothetical protein  40 
 
 		 152 aa  108  5e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000774396  normal  0.208239 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0594  hypothetical protein  40 
 
 		 152 aa  107  6e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997285  hitchhiker  0.000000403865 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0593  hypothetical protein  40 
 
 		 152 aa  107  6e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0559818  hitchhiker  0.0000222246 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2773  hypothetical protein  40.52 
 
 		 165 aa  107  7.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.018672  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4718  putative ATPase  45.53 
 
 		 153 aa  107  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.983496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4775  putative ATPase  45.53 
 
 		 152 aa  107  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0594287 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4754  putative ATPase  45.53 
 
 		 152 aa  107  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.382277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4625  putative ATPase  45.53 
 
 		 152 aa  107  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0747  hypothetical protein  42.31 
 
 		 192 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00645  ATP/GTP hydrolase  41.1 
 
 		 160 aa  107  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04035  ATPase with strong ADP affinity  45.53 
 
 		 153 aa  106  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000985798  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3825  protein of unknown function UPF0079  45.53 
 
 		 153 aa  106  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000776436  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4639  putative ATPase  45.53 
 
 		 152 aa  106  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.162208  normal  0.0835245 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0321  hypothetical protein  40.58 
 
 		 162 aa  106  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4725  putative ATPase  45.53 
 
 		 153 aa  106  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000010993  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5684  putative ATPase  45.53 
 
 		 152 aa  106  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000102371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4410  putative ATPase  45.53 
 
 		 153 aa  106  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000607313  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4635  putative ATPase  44.72 
 
 		 153 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00161848  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4699  putative ATPase  45.53 
 
 		 153 aa  106  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000112747  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65380  hypothetical protein  46.83 
 
 		 155 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0610791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3845  putative ATPase  45.53 
 
 		 153 aa  106  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000032368  hitchhiker  0.00000180276 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03997  hypothetical protein  45.53 
 
 		 153 aa  106  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000527155  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3050  hypothetical protein  45.53 
 
 		 153 aa  105  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.664938  normal  0.025275 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3215  protein of unknown function UPF0079  51.49 
 
 		 194 aa  105  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0631  hypothetical protein  50.86 
 
 		 155 aa  104  5e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.40036 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2636  hypothetical protein  44.78 
 
 		 153 aa  104  7e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00016395  hitchhiker  0.000000000107728 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3209  hypothetical protein  41.38 
 
 		 157 aa  103  9e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000564317  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3714  protein of unknown function UPF0079  39.33 
 
 		 152 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3897  hypothetical protein  39.33 
 
 		 152 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000307374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3771  hypothetical protein  39.33 
 
 		 152 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000107911  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0554  hypothetical protein  39.33 
 
 		 152 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971051  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0492  protein of unknown function UPF0079  44.88 
 
 		 155 aa  103  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.069952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4950  hypothetical protein  42.48 
 
 		 157 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.070486  normal  0.198333 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1300  hypothetical protein  44.53 
 
 		 144 aa  102  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0581872  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2018  protein of unknown function UPF0079  44.72 
 
 		 175 aa  102  3e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00181  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3725  putative ATPase  43.2 
 
 		 160 aa  102  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0265653  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0488  protein of unknown function UPF0079  41.67 
 
 		 160 aa  100  6e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000100685  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0519  hypothetical protein  47.46 
 
 		 143 aa  101  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0120244  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2671  RNA binding S1  41.38 
 
 		 157 aa  101  6e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.543969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3923  putative ATPase  42.4 
 
 		 160 aa  100  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00130971  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3029  hypothetical protein  37.84 
 
 		 153 aa  99  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.63375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0568  hypothetical protein  46.34 
 
 		 143 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1081  ATPase  36.96 
 
 		 156 aa  98.2  5e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0531  protein of unknown function UPF0079  40.94 
 
 		 157 aa  97.4  8e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0352512  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>