More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2671 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2671  RNA binding S1  100 
 
 		 157 aa  323  4.0000000000000003e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.543969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3657  putative ATPase  54 
 
 		 156 aa  166  9e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000030083  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0703  putative ATPase  54 
 
 		 156 aa  166  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000204367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002255  ATPase YjeE  54.05 
 
 		 154 aa  166  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000336436  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3803  putative ATPase  54 
 
 		 156 aa  166  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000296648  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00098  hypothetical protein  53.38 
 
 		 154 aa  165  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0427  putative ATPase  54.48 
 
 		 156 aa  164  2.9999999999999998e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368421  hitchhiker  0.000000532779 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3315  hypothetical protein  53.1 
 
 		 152 aa  163  9e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00300444  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0893  protein of unknown function UPF0079  50.98 
 
 		 156 aa  162  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.419695  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0568  hypothetical protein  56.49 
 
 		 143 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2754  hypothetical protein  55 
 
 		 188 aa  162  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000152007  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0488  protein of unknown function UPF0079  56.93 
 
 		 160 aa  162  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000100685  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3029  hypothetical protein  48.37 
 
 		 153 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.63375  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4898  hypothetical protein  50.68 
 
 		 157 aa  161  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.44547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4774  hypothetical protein  50.68 
 
 		 157 aa  161  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.431591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0562  hypothetical protein  50 
 
 		 157 aa  161  4.0000000000000004e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000200674  normal  0.209641 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2781  hypothetical protein  52.7 
 
 		 154 aa  160  7e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0531  protein of unknown function UPF0079  53.47 
 
 		 157 aa  160  7e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0352512  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3974  hypothetical protein  53.68 
 
 		 153 aa  160  8.000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4946  hypothetical protein  53.28 
 
 		 142 aa  160  9e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3923  putative ATPase  56.83 
 
 		 160 aa  160  9e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00130971  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4718  putative ATPase  50.69 
 
 		 153 aa  159  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.983496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2636  hypothetical protein  54.55 
 
 		 153 aa  159  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00016395  hitchhiker  0.000000000107728 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4635  putative ATPase  50.69 
 
 		 153 aa  159  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00161848  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4775  putative ATPase  51.05 
 
 		 152 aa  158  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0594287 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4754  putative ATPase  51.05 
 
 		 152 aa  158  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.382277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4625  putative ATPase  51.05 
 
 		 152 aa  158  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3725  putative ATPase  56.12 
 
 		 160 aa  158  3e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0265653  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4689  hypothetical protein  51.41 
 
 		 157 aa  158  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2773  hypothetical protein  49.67 
 
 		 165 aa  158  3e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.018672  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07500  ATPase, with role in cell wall biosynthesis  47.3 
 
 		 156 aa  157  4e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0610132  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04035  ATPase with strong ADP affinity  51.39 
 
 		 153 aa  157  6e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000985798  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3825  protein of unknown function UPF0079  51.39 
 
 		 153 aa  157  6e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000776436  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1300  hypothetical protein  54.61 
 
 		 144 aa  157  6e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0581872  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4410  putative ATPase  51.39 
 
 		 153 aa  157  6e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000607313  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0599  hypothetical protein  51.39 
 
 		 152 aa  157  6e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4725  putative ATPase  51.39 
 
 		 153 aa  157  6e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000010993  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3845  putative ATPase  51.39 
 
 		 153 aa  157  6e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000032368  hitchhiker  0.00000180276 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4699  putative ATPase  51.39 
 
 		 153 aa  157  6e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000112747  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3284  hypothetical protein  51.39 
 
 		 152 aa  157  6e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000351541  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03997  hypothetical protein  51.39 
 
 		 153 aa  157  6e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000527155  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4639  putative ATPase  51.75 
 
 		 152 aa  156  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.162208  normal  0.0835245 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5684  putative ATPase  51.75 
 
 		 152 aa  156  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000102371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3771  hypothetical protein  47.37 
 
 		 152 aa  155  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000107911  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3897  hypothetical protein  47.37 
 
 		 152 aa  155  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000307374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3714  protein of unknown function UPF0079  47.37 
 
 		 152 aa  155  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0594  hypothetical protein  50.69 
 
 		 152 aa  155  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997285  hitchhiker  0.000000403865 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0554  hypothetical protein  47.37 
 
 		 152 aa  155  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971051  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0593  hypothetical protein  50.69 
 
 		 152 aa  155  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0559818  hitchhiker  0.0000222246 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0351  putative ATPase  50.69 
 
 		 153 aa  155  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000572111  hitchhiker  0.00108821 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1273  hypothetical protein  51.7 
 
 		 159 aa  155  3e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4950  hypothetical protein  48.65 
 
 		 157 aa  154  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.070486  normal  0.198333 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3436  hypothetical protein  50.69 
 
 		 152 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000774396  normal  0.208239 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0631  hypothetical protein  48.68 
 
 		 155 aa  154  6e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.40036 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3544  hypothetical protein  49.66 
 
 		 160 aa  152  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0793  hypothetical protein  46.62 
 
 		 152 aa  150  5.9999999999999996e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.949281  hitchhiker  0.00232347 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5677  hypothetical protein  49.65 
 
 		 155 aa  150  8.999999999999999e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.178555  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0321  hypothetical protein  48.97 
 
 		 162 aa  149  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3242  hypothetical protein  52.08 
 
 		 152 aa  149  2e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4174  hypothetical protein  49.29 
 
 		 152 aa  148  3e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00645  ATP/GTP hydrolase  56.25 
 
 		 160 aa  147  7e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3209  hypothetical protein  46.21 
 
 		 157 aa  147  8e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000564317  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65380  hypothetical protein  48.25 
 
 		 155 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0610791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0519  hypothetical protein  49.62 
 
 		 143 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0120244  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1081  ATPase  55.08 
 
 		 156 aa  145  2.0000000000000003e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2531  hypothetical protein  46.85 
 
 		 162 aa  140  9e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1380  hypothetical protein  49.59 
 
 		 127 aa  135  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0569  hypothetical protein  49.29 
 
 		 167 aa  135  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000405356 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0492  protein of unknown function UPF0079  52.07 
 
 		 155 aa  130  7.999999999999999e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.069952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1082  hypothetical protein  42.86 
 
 		 183 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.585915  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0338  hypothetical protein  53.33 
 
 		 152 aa  124  7e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000369784  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00412  hypothetical protein  41.56 
 
 		 166 aa  123  1e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.238798  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1784  protein of unknown function UPF0079  40.97 
 
 		 176 aa  122  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0485483  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2627  hypothetical protein  44.53 
 
 		 160 aa  121  3e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2754  hypothetical protein  44.53 
 
 		 160 aa  121  4e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2018  protein of unknown function UPF0079  47.33 
 
 		 175 aa  120  9.999999999999999e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00181  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2816  protein of unknown function UPF0079  44.2 
 
 		 192 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.559153  normal  0.894815 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2410  protein of unknown function UPF0079  45.65 
 
 		 192 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133622  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2540  hypothetical protein  44.44 
 
 		 198 aa  118  3.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3050  hypothetical protein  46.15 
 
 		 153 aa  116  9e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.664938  normal  0.025275 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0670  hypothetical protein  52.83 
 
 		 155 aa  115  1.9999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.169194  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0366  hypothetical protein  41.14 
 
 		 184 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0908  hypothetical protein  41.14 
 
 		 184 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1065  hypothetical protein  41.14 
 
 		 184 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0878118  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2501  hypothetical protein  41.14 
 
 		 184 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0911  hypothetical protein  41.14 
 
 		 184 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0115  hypothetical protein  41.14 
 
 		 184 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0666  hypothetical protein  41.14 
 
 		 184 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.739663  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3302  hypothetical protein  44.9 
 
 		 183 aa  114  5e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.749162  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2481  hypothetical protein  40 
 
 		 183 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0482851 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0723  hypothetical protein  40.51 
 
 		 184 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2610  hypothetical protein  41.25 
 
 		 198 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2586  hypothetical protein  38.41 
 
 		 171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0365386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0583  hypothetical protein  40.48 
 
 		 176 aa  111  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1951  hypothetical protein  38.41 
 
 		 171 aa  111  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.286384  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1190  ATP/GTP hydrolase  47.58 
 
 		 148 aa  111  5e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.328809  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2562  hypothetical protein  38.75 
 
 		 198 aa  110  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1228  hypothetical protein  48.36 
 
 		 148 aa  110  6e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0734  hypothetical protein  39.38 
 
 		 184 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0520  hypothetical protein  40.4 
 
 		 184 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>