More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1926 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1926  conserved hypothetical protein TIGR00150  100 
 
 		 161 aa  330  4e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1598  protein of unknown function UPF0079  100 
 
 		 161 aa  330  4e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.86964  normal  0.106509 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3029  hypothetical protein  55.65 
 
 		 153 aa  128  3e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.63375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2754  hypothetical protein  46.76 
 
 		 188 aa  127  5.0000000000000004e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000152007  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2781  hypothetical protein  45.8 
 
 		 154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0531  protein of unknown function UPF0079  53.39 
 
 		 157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0352512  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5677  hypothetical protein  47.89 
 
 		 155 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.178555  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0594  hypothetical protein  52.17 
 
 		 152 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997285  hitchhiker  0.000000403865 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0488  protein of unknown function UPF0079  54.7 
 
 		 160 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000100685  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0593  hypothetical protein  52.17 
 
 		 152 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0559818  hitchhiker  0.0000222246 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0599  hypothetical protein  52.17 
 
 		 152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2636  hypothetical protein  47.66 
 
 		 153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00016395  hitchhiker  0.000000000107728 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3725  putative ATPase  52.03 
 
 		 160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0265653  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0519  hypothetical protein  50.43 
 
 		 143 aa  125  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0120244  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3923  putative ATPase  52.03 
 
 		 160 aa  125  3e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00130971  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3242  hypothetical protein  51.2 
 
 		 152 aa  125  3e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3897  hypothetical protein  49.59 
 
 		 152 aa  125  3e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000307374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3714  protein of unknown function UPF0079  49.59 
 
 		 152 aa  125  3e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3771  hypothetical protein  49.59 
 
 		 152 aa  125  3e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000107911  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0554  hypothetical protein  49.59 
 
 		 152 aa  125  3e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971051  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3209  hypothetical protein  52.5 
 
 		 157 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000564317  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0703  putative ATPase  54.7 
 
 		 156 aa  124  4.0000000000000003e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000204367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0631  hypothetical protein  46 
 
 		 155 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.40036 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3803  putative ATPase  54.7 
 
 		 156 aa  124  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000296648  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3284  hypothetical protein  51.75 
 
 		 152 aa  124  5e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000351541  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3436  hypothetical protein  52.21 
 
 		 152 aa  124  6e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000774396  normal  0.208239 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0568  hypothetical protein  42.66 
 
 		 143 aa  123  8.000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3315  hypothetical protein  52.54 
 
 		 152 aa  124  8.000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00300444  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3657  putative ATPase  53.85 
 
 		 156 aa  123  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000030083  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4689  hypothetical protein  51.26 
 
 		 157 aa  122  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65380  hypothetical protein  47.18 
 
 		 155 aa  123  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0610791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0427  putative ATPase  51.22 
 
 		 156 aa  122  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368421  hitchhiker  0.000000532779 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3544  hypothetical protein  45.74 
 
 		 160 aa  122  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3974  hypothetical protein  47.15 
 
 		 153 aa  122  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4950  hypothetical protein  50.42 
 
 		 157 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.070486  normal  0.198333 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4898  hypothetical protein  51.26 
 
 		 157 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.44547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4774  hypothetical protein  51.26 
 
 		 157 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.431591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00412  hypothetical protein  48 
 
 		 166 aa  121  3e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.238798  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0351  putative ATPase  52.14 
 
 		 153 aa  122  3e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000572111  hitchhiker  0.00108821 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00098  hypothetical protein  48.78 
 
 		 154 aa  121  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4946  hypothetical protein  42.25 
 
 		 142 aa  121  4e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0562  hypothetical protein  50.43 
 
 		 157 aa  121  4e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000200674  normal  0.209641 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4174  hypothetical protein  49.57 
 
 		 152 aa  121  4e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0793  hypothetical protein  47.73 
 
 		 152 aa  120  9e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.949281  hitchhiker  0.00232347 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4718  putative ATPase  50.43 
 
 		 153 aa  120  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.983496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4775  putative ATPase  50.43 
 
 		 152 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0594287 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0670  hypothetical protein  60.2 
 
 		 155 aa  119  9.999999999999999e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.169194  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4635  putative ATPase  50.43 
 
 		 153 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00161848  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4754  putative ATPase  50.43 
 
 		 152 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.382277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4625  putative ATPase  50.43 
 
 		 152 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002255  ATPase YjeE  47.97 
 
 		 154 aa  119  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000336436  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0492  protein of unknown function UPF0079  58.76 
 
 		 155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.069952  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04035  ATPase with strong ADP affinity  50.43 
 
 		 153 aa  118  3e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000985798  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3825  protein of unknown function UPF0079  50.43 
 
 		 153 aa  118  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000776436  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4639  putative ATPase  50.43 
 
 		 152 aa  118  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.162208  normal  0.0835245 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4725  putative ATPase  50.43 
 
 		 153 aa  118  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000010993  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3845  putative ATPase  50.43 
 
 		 153 aa  118  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000032368  hitchhiker  0.00000180276 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4410  putative ATPase  50.43 
 
 		 153 aa  118  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000607313  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03997  hypothetical protein  50.43 
 
 		 153 aa  118  3e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000527155  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4699  putative ATPase  50.43 
 
 		 153 aa  118  3e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000112747  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5684  putative ATPase  50.43 
 
 		 152 aa  118  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000102371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1081  ATPase  49.14 
 
 		 156 aa  118  3.9999999999999996e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07500  ATPase, with role in cell wall biosynthesis  53.33 
 
 		 156 aa  117  4.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0610132  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2004  hypothetical protein  50 
 
 		 162 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2083  hypothetical protein  50 
 
 		 162 aa  115  3e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2754  hypothetical protein  43.65 
 
 		 160 aa  115  3e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2627  hypothetical protein  43.65 
 
 		 160 aa  115  3e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00645  ATP/GTP hydrolase  43.44 
 
 		 160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2756  protein of unknown function UPF0079  47.33 
 
 		 160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.938944  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0321  hypothetical protein  42.42 
 
 		 162 aa  109  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2773  hypothetical protein  45.83 
 
 		 165 aa  110  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.018672  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1082  hypothetical protein  51 
 
 		 183 aa  108  3e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.585915  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1300  hypothetical protein  45.53 
 
 		 144 aa  107  6e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0581872  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2671  RNA binding S1  42.19 
 
 		 157 aa  106  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.543969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1273  hypothetical protein  47.41 
 
 		 159 aa  106  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0569  hypothetical protein  52.54 
 
 		 167 aa  106  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000405356 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0893  protein of unknown function UPF0079  46.09 
 
 		 156 aa  105  4e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.419695  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2531  hypothetical protein  41.8 
 
 		 162 aa  104  6e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1306  hypothetical protein  52.04 
 
 		 181 aa  102  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.134603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2018  protein of unknown function UPF0079  49.55 
 
 		 175 aa  101  5e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00181  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0818  hypothetical protein  44.88 
 
 		 161 aa  100  8e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000019093  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2410  protein of unknown function UPF0079  44.09 
 
 		 192 aa  97.8  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2816  protein of unknown function UPF0079  43.41 
 
 		 192 aa  97.4  6e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.559153  normal  0.894815 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3084  protein of unknown function UPF0079  48.04 
 
 		 141 aa  97.1  9e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.235796 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1228  hypothetical protein  41.32 
 
 		 148 aa  96.3  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1380  hypothetical protein  49.48 
 
 		 127 aa  95.9  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0899  protein of unknown function UPF0079  40.52 
 
 		 169 aa  95.1  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3050  hypothetical protein  41.61 
 
 		 153 aa  94.7  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.664938  normal  0.025275 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1190  ATP/GTP hydrolase  37.59 
 
 		 148 aa  94.4  6e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.328809  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3198  hypothetical protein  42.98 
 
 		 138 aa  94.4  7e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.250751  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3462  protein of unknown function UPF0079  38.69 
 
 		 169 aa  94  8e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.191362  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0918  hypothetical protein  52.63 
 
 		 175 aa  94  8e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2540  hypothetical protein  43.41 
 
 		 198 aa  93.2  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3302  hypothetical protein  41.54 
 
 		 183 aa  93.6  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.749162  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1496  hypothetical protein  47.32 
 
 		 179 aa  93.2  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00826257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1171  hypothetical protein  39.19 
 
 		 172 aa  93.2  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00361416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0134  hypothetical protein  40.58 
 
 		 164 aa  93.6  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1130  hypothetical protein  49.04 
 
 		 160 aa  92.4  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.30959 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5126  hypothetical protein  40.87 
 
 		 175 aa  92.4  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0575495  normal  0.912699 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2160  hypothetical protein  38.76 
 
 		 155 aa  92  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258956 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>