More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3020 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3020  protein of unknown function UPF0079  100 
 
 		 153 aa  306  9e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1263  protein of unknown function UPF0079  96.08 
 
 		 153 aa  298  2e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00204178  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2319  hypothetical protein  59.21 
 
 		 162 aa  195  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000629849  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1881  hypothetical protein  55.26 
 
 		 160 aa  174  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000937898  hitchhiker  0.0000223198 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1800  hypothetical protein  53.33 
 
 		 161 aa  154  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.009423  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2261  hypothetical protein  50.34 
 
 		 164 aa  147  7e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000158801  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2888  hypothetical protein  46.75 
 
 		 161 aa  144  6e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000829466  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1005  hypothetical protein  48.65 
 
 		 160 aa  140  7e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000601093  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0488  hypothetical protein  48.3 
 
 		 153 aa  137  7e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.381265  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1097  protein of unknown function UPF0079  49.36 
 
 		 152 aa  135  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2519  protein of unknown function UPF0079  55.04 
 
 		 159 aa  133  9e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2016  hypothetical protein  46.98 
 
 		 158 aa  131  3e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2530  protein of unknown function UPF0079  44.59 
 
 		 176 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000117314  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0236  hypothetical protein  51.97 
 
 		 157 aa  127  7.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000721135  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2160  hypothetical protein  47.22 
 
 		 155 aa  126  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258956 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0289  conserved hypothetical protein TIGR00150  52.76 
 
 		 157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.023351  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3739  protein of unknown function UPF0079  52.38 
 
 		 159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.124017  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0216  protein of unknown function UPF0079  51.22 
 
 		 152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2452  protein of unknown function UPF0079  47.65 
 
 		 183 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01950  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  42 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0244  hypothetical protein  46.98 
 
 		 157 aa  125  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0258  hypothetical protein  46.98 
 
 		 157 aa  125  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0243  hypothetical protein  46.36 
 
 		 157 aa  124  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0230  hypothetical protein  51.18 
 
 		 157 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0284  conserved hypothetical protein TIGR00150  51.18 
 
 		 157 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5035  hypothetical protein  51.97 
 
 		 157 aa  124  5e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0799  protein of unknown function UPF0079  44.8 
 
 		 150 aa  124  5e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0279  hypothetical protein  51.18 
 
 		 157 aa  124  6e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0308  conserved hypothetical protein TIGR00150  51.18 
 
 		 157 aa  124  6e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19780  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  44.3 
 
 		 152 aa  124  6e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0805781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0399  protein of unknown function UPF0079  44 
 
 		 160 aa  123  8.000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0207503 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0232  P-loop hydrolase  51.18 
 
 		 157 aa  123  9e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1503  hypothetical protein  51.64 
 
 		 188 aa  122  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.170985  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2364  protein of unknown function UPF0079  50.82 
 
 		 183 aa  121  4e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.118731  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0399  hypothetical protein  43.14 
 
 		 152 aa  120  5e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0100312  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2855  protein of unknown function UPF0079  47.59 
 
 		 164 aa  120  7e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.314957 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1635  protein of unknown function UPF0079  44.59 
 
 		 173 aa  118  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2422  hypothetical protein  42.47 
 
 		 154 aa  118  3e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2132  hypothetical protein  42.47 
 
 		 154 aa  118  3e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1776  hypothetical protein  41.94 
 
 		 161 aa  117  3.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00431445  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0366  hypothetical protein  42.07 
 
 		 169 aa  116  9.999999999999999e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1243  protein of unknown function UPF0079  40.38 
 
 		 184 aa  116  9.999999999999999e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0713  hypothetical protein  43.05 
 
 		 187 aa  116  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273172  normal  0.667416 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4357  hypothetical protein  41.72 
 
 		 189 aa  115  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282412 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0376  hypothetical protein  38.78 
 
 		 147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2330  hypothetical protein  48.41 
 
 		 182 aa  114  5e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0147  protein of unknown function UPF0079  45.03 
 
 		 160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0643293  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0444  protein of unknown function UPF0079  38.56 
 
 		 157 aa  110  5e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2169  hypothetical protein  48.28 
 
 		 167 aa  109  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.884354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3245  hypothetical protein  42.11 
 
 		 504 aa  108  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0375  hypothetical protein  37.67 
 
 		 163 aa  107  5e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128461  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1869  hypothetical protein  41.45 
 
 		 158 aa  107  5e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000565626  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0965  protein of unknown function UPF0079  37.67 
 
 		 156 aa  107  5e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0617  protein of unknown function UPF0079  40.98 
 
 		 150 aa  107  7.000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.202797  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0396  hypothetical protein  38.36 
 
 		 163 aa  106  1e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4975  hypothetical protein  38.1 
 
 		 171 aa  105  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4289  protein of unknown function UPF0079  40.54 
 
 		 505 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0623599  normal  0.680884 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_339  hypothetical protein  36.3 
 
 		 163 aa  105  2e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00581672  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1469  hypothetical protein  47.75 
 
 		 143 aa  103  1e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0346  hypothetical protein  42.62 
 
 		 143 aa  103  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.101542  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11800  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  44.09 
 
 		 163 aa  103  1e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0100  protein of unknown function UPF0079  40.46 
 
 		 151 aa  102  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0009157  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0487  hypothetical protein  38.93 
 
 		 148 aa  101  4e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3029  hypothetical protein  38.62 
 
 		 153 aa  100  6e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.63375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0774  hypothetical protein  41.8 
 
 		 164 aa  99.8  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000567369  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3962  protein of unknown function UPF0079  37.84 
 
 		 503 aa  99  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0483  protein of unknown function UPF0079  40.91 
 
 		 149 aa  99  2e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.790809  normal  0.0607901 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0090  protein of unknown function UPF0079  38.28 
 
 		 145 aa  98.2  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.184225  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0122  protein of unknown function UPF0079  40.74 
 
 		 158 aa  98.6  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000147481  hitchhiker  0.00840651 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3050  hypothetical protein  38.73 
 
 		 153 aa  98.2  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.664938  normal  0.025275 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0562  hypothetical protein  37.16 
 
 		 157 aa  96.3  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000200674  normal  0.209641 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2842  hypothetical protein  40.94 
 
 		 158 aa  96.3  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.523389 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1664  ATPase or kinase  37.91 
 
 		 152 aa  96.3  1e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00098  hypothetical protein  37.24 
 
 		 154 aa  95.5  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2671  RNA binding S1  39.23 
 
 		 157 aa  95.5  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.543969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0408  hypothetical protein  38.35 
 
 		 157 aa  95.5  2e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0793  hypothetical protein  35.95 
 
 		 152 aa  95.5  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.949281  hitchhiker  0.00232347 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0046  protein of unknown function UPF0079  38 
 
 		 174 aa  94.4  5e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0134  protein of unknown function UPF0079  40.77 
 
 		 146 aa  94  7e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4849  hypothetical protein  40.15 
 
 		 150 aa  94  7e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1531  ATPase or kinase  35.86 
 
 		 149 aa  93.6  9e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002255  ATPase YjeE  37.24 
 
 		 154 aa  93.2  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000336436  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1390  protein of unknown function UPF0079  39.44 
 
 		 167 aa  93.2  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.004631  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0599  hypothetical protein  32.21 
 
 		 152 aa  92  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2754  hypothetical protein  37.41 
 
 		 188 aa  92.8  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000152007  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1522  hypothetical protein  42.86 
 
 		 161 aa  92.8  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.229097  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6124  protein of unknown function UPF0079  42.96 
 
 		 161 aa  91.7  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0433891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0568  hypothetical protein  38.17 
 
 		 143 aa  92  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0961  hypothetical protein  40.43 
 
 		 163 aa  92  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.14989  hitchhiker  0.00154455 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2666  hypothetical protein  37.21 
 
 		 143 aa  91.3  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0641125  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0594  hypothetical protein  31.54 
 
 		 152 aa  90.9  5e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997285  hitchhiker  0.000000403865 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0593  hypothetical protein  31.54 
 
 		 152 aa  90.9  5e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0559818  hitchhiker  0.0000222246 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0427  putative ATPase  38.57 
 
 		 156 aa  90.9  6e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368421  hitchhiker  0.000000532779 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2955  hypothetical protein  40 
 
 		 161 aa  90.5  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.263755  normal  0.0249448 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3544  hypothetical protein  37.32 
 
 		 160 aa  90.5  8e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2639  protein of unknown function UPF0079  39.13 
 
 		 154 aa  90.5  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.266416 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4898  hypothetical protein  36.62 
 
 		 157 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.44547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0118  hypothetical protein  39.71 
 
 		 152 aa  89.4  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.927124 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4689  hypothetical protein  37.32 
 
 		 157 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0174  hypothetical protein  42.14 
 
 		 169 aa  89.4  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00309519  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>