More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6124 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_6124  protein of unknown function UPF0079  100 
 
 
161 aa  318  1.9999999999999998e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0433891  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1005  hypothetical protein  46.32 
 
 
160 aa  111  5e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000601093  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1881  hypothetical protein  47.86 
 
 
160 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000937898  hitchhiker  0.0000223198 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2519  protein of unknown function UPF0079  46.62 
 
 
159 aa  108  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2855  protein of unknown function UPF0079  43.33 
 
 
164 aa  107  5e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.314957 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3281  hypothetical protein  42.86 
 
 
144 aa  107  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223285  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0488  hypothetical protein  42.48 
 
 
153 aa  105  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.381265  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0399  protein of unknown function UPF0079  42.54 
 
 
160 aa  103  7e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0207503 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2888  hypothetical protein  50.44 
 
 
161 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000829466  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2160  hypothetical protein  44.14 
 
 
155 aa  102  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000258956 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11800  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  43.23 
 
 
163 aa  102  3e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2319  hypothetical protein  43.38 
 
 
162 aa  101  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000629849  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2016  hypothetical protein  45.83 
 
 
158 aa  100  7e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2422  hypothetical protein  35.33 
 
 
154 aa  100  8e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2132  hypothetical protein  35.33 
 
 
154 aa  100  8e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1635  protein of unknown function UPF0079  39.24 
 
 
173 aa  97.1  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2465  protein of unknown function UPF0079  47.79 
 
 
152 aa  97.1  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0181492 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2408  protein of unknown function UPF0079  47.79 
 
 
152 aa  96.7  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0774  hypothetical protein  37.01 
 
 
164 aa  95.9  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000567369  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0147  protein of unknown function UPF0079  41.5 
 
 
160 aa  95.5  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0643293  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0134  hypothetical protein  44.52 
 
 
164 aa  94.7  4e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4455  hypothetical protein  41.18 
 
 
152 aa  95.1  4e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1263  protein of unknown function UPF0079  44.44 
 
 
153 aa  95.1  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00204178  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0399  hypothetical protein  40.14 
 
 
152 aa  94  8e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0100312  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0118  hypothetical protein  44.92 
 
 
152 aa  94  9e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.927124 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0820  hypothetical protein  47.41 
 
 
509 aa  94  9e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1800  hypothetical protein  45.71 
 
 
161 aa  93.2  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.009423  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0216  protein of unknown function UPF0079  40.69 
 
 
152 aa  93.2  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1776  hypothetical protein  36.42 
 
 
161 aa  93.6  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00431445  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4975  hypothetical protein  37.25 
 
 
171 aa  93.2  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01950  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  38.71 
 
 
158 aa  92.4  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2639  protein of unknown function UPF0079  40.6 
 
 
154 aa  92  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.266416 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3020  protein of unknown function UPF0079  42.96 
 
 
153 aa  91.7  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1503  hypothetical protein  48.57 
 
 
188 aa  91.7  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.170985  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_339  hypothetical protein  40 
 
 
163 aa  91.7  4e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00581672  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2364  protein of unknown function UPF0079  48.57 
 
 
183 aa  91.3  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.118731  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0396  hypothetical protein  41.38 
 
 
163 aa  91.3  6e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2666  hypothetical protein  42.86 
 
 
143 aa  91.3  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0641125  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19780  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  41.18 
 
 
152 aa  90.9  7e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0805781  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2452  protein of unknown function UPF0079  43.97 
 
 
183 aa  90.1  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0375  hypothetical protein  39.29 
 
 
163 aa  90.1  1e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128461  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0666  protein of unknown function UPF0079  39.75 
 
 
523 aa  88.6  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.469867 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0008  P-loop hydrolase family protein  40 
 
 
155 aa  88.6  3e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  unclonable  0.00000890288  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0383  hypothetical protein  53 
 
 
506 aa  88.6  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0100  protein of unknown function UPF0079  36.18 
 
 
151 aa  88.6  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0009157  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0799  protein of unknown function UPF0079  46.53 
 
 
150 aa  88.2  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4357  hypothetical protein  36.65 
 
 
189 aa  88.2  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.282412 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0713  hypothetical protein  38.06 
 
 
187 aa  87.4  7e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273172  normal  0.667416 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3739  protein of unknown function UPF0079  45.37 
 
 
159 aa  87.4  8e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.124017  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2100  hypothetical protein  45.61 
 
 
513 aa  87  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2017  hypothetical protein  45.61 
 
 
513 aa  86.7  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0243  hypothetical protein  38.73 
 
 
157 aa  86.7  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0236  hypothetical protein  44.44 
 
 
157 aa  85.9  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000721135  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1097  protein of unknown function UPF0079  40.79 
 
 
152 aa  86.3  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0587  hypothetical protein  45.83 
 
 
562 aa  86.3  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.977621 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2169  hypothetical protein  41.01 
 
 
167 aa  85.5  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.884354  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0617  protein of unknown function UPF0079  37.5 
 
 
150 aa  85.5  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.202797  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4283  protein of unknown function UPF0079  35.88 
 
 
138 aa  85.5  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3438  hypothetical protein  40.74 
 
 
165 aa  85.5  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0159853  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3245  hypothetical protein  40.13 
 
 
504 aa  85.5  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479121  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1469  hypothetical protein  42.34 
 
 
143 aa  84.7  5e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0284  conserved hypothetical protein TIGR00150  44.44 
 
 
157 aa  84.7  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0244  hypothetical protein  44.44 
 
 
157 aa  84.7  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0230  hypothetical protein  44.44 
 
 
157 aa  84.7  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0258  hypothetical protein  44.44 
 
 
157 aa  84.7  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0046  protein of unknown function UPF0079  40.58 
 
 
174 aa  84.7  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0232  P-loop hydrolase  45.37 
 
 
157 aa  84.3  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0936  hypothetical protein  38.4 
 
 
155 aa  84.3  6e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000264552  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0965  protein of unknown function UPF0079  29.75 
 
 
156 aa  84.3  6e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0387  hypothetical protein  46.55 
 
 
168 aa  84  9e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.919602  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0090  protein of unknown function UPF0079  37.4 
 
 
145 aa  83.2  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.184225  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1355  P-loop hydrolase/phosphotransferase  40 
 
 
497 aa  83.6  0.000000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0289  conserved hypothetical protein TIGR00150  44.44 
 
 
157 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.023351  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5035  hypothetical protein  48.48 
 
 
157 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0279  hypothetical protein  44.44 
 
 
157 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0366  hypothetical protein  34.64 
 
 
169 aa  82.8  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2089  hypothetical protein  33.33 
 
 
164 aa  82.4  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.38888  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0308  conserved hypothetical protein TIGR00150  44.44 
 
 
157 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2157  hypothetical protein  37.41 
 
 
165 aa  82.8  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2126  hypothetical protein  33.33 
 
 
164 aa  82.4  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1664  hypothetical protein  33.56 
 
 
153 aa  82  0.000000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0374  protein of unknown function UPF0079  38.74 
 
 
149 aa  82  0.000000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2261  hypothetical protein  37.5 
 
 
164 aa  82  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000158801  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2330  hypothetical protein  45 
 
 
182 aa  81.3  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2754  hypothetical protein  41 
 
 
160 aa  80.1  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2627  hypothetical protein  41 
 
 
160 aa  80.1  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0625  hypothetical protein  45.71 
 
 
505 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00759808  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1243  protein of unknown function UPF0079  32.69 
 
 
184 aa  80.1  0.00000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2676  hypothetical protein  45.75 
 
 
157 aa  79.3  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0408  hypothetical protein  35.07 
 
 
157 aa  79.3  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4941  protein of unknown function UPF0079  47.96 
 
 
540 aa  79  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.267606 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4849  hypothetical protein  39.04 
 
 
150 aa  78.6  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366742  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0095  hypothetical protein  42.86 
 
 
146 aa  78.6  0.00000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.442138  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4431  hypothetical protein  46.46 
 
 
549 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.319947 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0814  protein of unknown function UPF0079  39.19 
 
 
161 aa  78.6  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4895  protein of unknown function UPF0079  46.46 
 
 
542 aa  78.6  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.582734  normal  0.663902 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4062  hypothetical protein  48.94 
 
 
176 aa  78.2  0.00000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.154683 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2530  protein of unknown function UPF0079  35.81 
 
 
176 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000117314  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0086  hypothetical protein  49.51 
 
 
509 aa  77.8  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.522913  normal  0.567075 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0206  hypothetical protein  41.55 
 
 
505 aa  77.8  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0259343  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>